Pokaż cały numer - FPN - Farmaceutyczny PrzeglÄ d Naukowy

ANALIZA POLIMORFIZMU GENU 16S rRNA SZCZEPÓW MYCOBAC-TERIUM TUBERCULOSIS COMPLEX Z WYKORZYSTANIEM TECHNI-KI ARDRAAnalysis of polimorphism of 16S rRNA gene in strains of Mycobacteriumtuberculosis complex by ARDRA methodRobert D. Wojtyczka, Danuta Idzik, Małgorzata Kępa, Michał Wieczorek, Jerzy PachaKatedra i Zakład Mikrobiologii Wydziału Farmaceutycznego z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej w Sosnowcu,Śląskiego Uniwersytetu Medycznego w KatowicachStreszczenieW rutynowej diagnostyce mikrobiologicznej, jedyniestwierdzenie obecności prątków w badanym materialemetodą hodowli potwierdza istnienie procesu chorobowego.Obecnie coraz częściej poszukuje się różnychtechnik molekularnych, które umożliwiłyby nie tylkoidentyfikację, ale także różnicowanie prątków w obrębierodzaju.Celem badań było określenie przydatności techniki AR-DRA do identyfikacji prątków gruźlicy i ich różnicowaniawewnątrzgatunkowego.Badania przeprowadzono na 30 szczepach Mycobacteriumtuberculosis complex z użyciem starterów opartychna genie 16S rRNA, oraz trzech enzymów restrykcyjnych:HindIII, EcoRI i HaeIII. Warunki reakcji dobranodoświadczalnie.Analizując otrzymane wyniki największą różnorodnośćw profilach restrykcyjnych uzyskano w przypadku enzymuHaeIII, mniejszą przy zastosowaniu enzymu Eco-RI, a najsłabszą dla enzymu HindIII.Podsumowując, można stwierdzić, że technika ARDRAprzy doborze szerokiego panelu różnych enzymów restrykcyjnychmoże stanowić skuteczne narzędzie diagnostycznedo identyfikacji szczepów Mycobacteriumsp., oraz ich różnicowania.Summary:In routine microbiological diagnostics, detection of mycobacteriain examined material, through the cultivation,confirms morbidity. In our paper we tested usefulness ofARDRA for identification of tubercule bacilli and theirdifferentiation inside species. Experiments were carriedout with Mycobacterium tuberculosis complex andstarters based on 16S rRNA and 3 restriction enzymesHindIII, EcoRI and well as HaeIII. Reaction conditionswere got experimentally.It was observed that restriction profiles were most diversewhen HaeIII was used and the most weak for HindIII. So we showed that ARDRA can be a useful diagnostictool for identification of Mycobacterium as well astheir species differentiation.Key words: ARDRA, Mycobacterium tuberculosis complex,16sRNASłowa kluczowe: ARDRA, Mycobacterium tuberculosiscomplex, 16sRNA54 FarmaceutycznyPrzegląd Naukowycopyright © 2008 Grupa dr. A. R. KwiecińskiegoISSN 1425-5073