Poročilo 2005 - 1 UVOD - Biotehniška fakulteta - Univerza v Ljubljani
Poročilo 2005 - 1 UVOD - Biotehniška fakulteta - Univerza v Ljubljani Poročilo 2005 - 1 UVOD - Biotehniška fakulteta - Univerza v Ljubljani
UL BF POROČILO ZA LETO 2005 _________________________________________________________________________ 110 kg/ha) ob pogoju, da redimo 1GVŽ/ha in imamo triletni kolobar koruza-pšenicaječmen. Oddelek za biologijo Katedra za biokemijo Težišče raziskav je bilo na biokemijskih, biofizikalnih in molekulsko-bioloških raziskavah citolitičnih proteinov ekvinatoksina iz konjske vetrnice in ostreolizina iz gobe bukovega ostrigarja. S pomočjo mutantov ekvinatoksina smo preučevali molekulski mehanizem mehanizem vezave toksina na modelne lipidne membrane. Za ostreolizin smo ugotovili, da gre za novi tip proteina, in da tvori pore v lipidnim membranah le če vsebujejo značilne holesterolne lipidne domene. Sodelovali smo tudi pri študiju vezave amiloidnih fibril na lipidne membrane. Katedra za molekularno genetiko in Katedra za biologijo mikroorganizmov Eden of ciljev raziskovalnega programa Molekularno-biološke raziskave mikroorganizmov je razjasnitev mehanizmov uravnavanja sinteze bakteriocinov vrste Escherichia coli imenovane kolicini. Kolicini so antibiotiki ozkega območja delovanja. V letu 2005 smo se osredotočili na proučevanje od temperature odvisne sinteze kolicina K saj je sinteza optimalna pri 37°C, temperaturi toplokrvnih gostiteljev bakterije E. coli. Raziskovalne cilje za leto 2005 smo realizirali saj smo dokazali, da je uravnavanje vzpostavljeno na ravni transkripcije, zelo verjetno zaradi vezave represorja na promotorsko regijo gena cka. Poleg tega so raziskave v letu 2005 bile usmerjene v proučevanje ekstremofilnih gliv, izoliranih iz solin in iz arktičnega ledu, na nivoju taksonomije, fizioloških, biokemijskih in molekularnih mehanizmov adaptacije ne skrajnostna okolja ter analie ter aplikacije antibiotične aktivnosti ekskretov ličink muh Lucilia sericata in zmrzovanju njihovih embrijev. Katedra za nevroetologijo Raziskovalna skupina deluje v okviru programske skupine »Zoološke in speleobiološke raziskave«. Skupina raziskuje vohalna čutila rib, somičev in cebric. Uspela so nam naslednja pomembna odkritja: - povezava aktivnosti receptorskih celic z aktivnostjo celotnega vohalnega organa, povezava aktivnosti receptorskih celic in kemotopičnih slik aminokislin na površini vohalnega bulbusa in povezava kemotopičnih slik z vohalnim razlikovanjem aminokislin pri ribah. S tem pomembnim problemom sodobne vohalne znanosti se ukvarjamo tudi sedaj. Na genetsko spremenjenih cebricah poskušamo ugotoviti ali kemotopične, ki so enake (L-Phe in L-Tyr) v celotnem času percepcije (2200 milisekund) res pomenijo nesposobnost razlikovanja med tema dvema aminokislinama. V okviru raziskovalne skupine so bile izvajane tudi etološke in fiziološke raziskave čebel. Ker so čebele eden možnih modelnih organizmov za vpliv etanola na ljudi, smo raziskovali vplivov etanola na socialno vedenje čebel (temeljna raziskava). Raziskovalka iz Argentine dr. Adriana Pereyra Gonzales je sodelovala z laboratorijem prof. Golobove pri analizi sladkorjev in ostalih sestavin medu (HPLC). Raziskave barvila rdeče pese v medu, ki so potekale v okviru aplikativnega projekta, napovedujejo možnost proizvodnje medu, ki vsebuje antioksidante. 98
POROČILO ZA LETO 2005 UL BF _________________________________________________________________________ Katedra za zoologijo Raziskovalna skupina za zoologijo in speleobiologijo: Nadaljevali smo z raziskavami filogenetskih odnosov pri nekaterih bolj razširjenih skupinah na širšem dinarskem območju in tudi širše. Splošno evropska vrsta, ki pa na krasu poseljuje tudi jame, je vodni osliček (Asellus aquaticus). Slepe postranice (rod Niphargus) so s približno 300 vrstami, večinoma podzemeljskimi, najobsežnejši rod amfipodov, s podobno evropsko razširjenostjo. Jamske kozice rodu Troglocaris poseljujejo kras med Francijo in Gruzijo. Človeška ribica (Proteus anguinus) poseljuje jamske vode vsega dinarskega krasa. Pri vseh raziskujemo intra- in interspecijske filogenetske odnose na osnovi morfološke analize in z analizo DNA. Vse študije so še v teku, predvidoma bodo zaključene v 2006. Nadaljevali smo z urejanjem in dopolnjevanje zbirke podatkov o razširjenosti podzemne favne na Dinarskem območju. Tovrstna zbirka podatkov nam služi za biogeografske in bodiverzitetne študije. Pripravljamo ustrezna poglavja za Encyclopedia biospeologica. Nadaljevali smo individualno genotipizacijo medvedov s pomočjo neinvazivnega genetskega vzorčenja. Obdelali smo vzorce z Ribniško-kočevskega območja. Raziskovalno delo Skupine za funkcionalno morfološke raziskave vretenčarjev je zajemalo: · spremljanje kopičenja težkih kovin in drugih polutantov na posameznih lokalitetah močerila, · proučevanje sinteze metalotioneinov pri ameriškem sorodniku nekturu (Necturus maculosus, Amphibia, Protidae) po izpostavitvi živali določenim subletalnim koncentracijam kovinskih ionov, · izolacijo in vzpostavitev primarnih celičnih kultur jetrnih celic močerila in nektura. Izolirani hepatociti močerila in nektura so bili v primarnih kulturah vzdrževani do 14 dni, njihove značilnosti v kulturi smo analizirali s pomočjo elektronsko-mikroskopskih in biokemijskih metod, · pripravo metodike za oceno starosti dvoživk s pomočjo skeletokronologije. Metodo skeletokronološke ocene starosti smo uspešno preizkusili z ustrezno prilagojeno metodiko tudi pri močerilu in s tem je dana možnost, da bomo v letošnjem in naslednjih letih lahko začeli z ocenjevanjem starosti posameznih osebkov v okviru posameznih populacij na različnih lokalitetah, . v projektu “promocije znanosti” smo v letu 2005 pripravili zasnovo posebne poljudnoznanstvene predstavitvene zgoščenke s poudarkom na črni človeški ribici za šole in širšo javnost, v sodelovanju z RTV in založniško hišo MK. Raziskovalno delo na področju funkcionalne morfologije nevretenčarjev in ekotoksikologije je obsegalo raziskave strukturnih posebnosti embrijev ter ličink mokric v zvezi z difrenciacijo prebavila in integumenta, raziskave bakterij v prebavilu mokric, raziskave dinamike bakra in kalcija v organskih sistemih rakov ter vrednotenje vedenjskih odzivov mokric, ko jih izpostavimo učinku kovin in pesticidov. Testirali smo uporabo fokusiranega ionskega snopa (FIB) kot dodatka vrstičnemu elektronskemu mikroskopu (SEM), za pripravo in analizo tkiv v prebavnem sistemu rakov. Delo na področju funkcionalne morfologije nevretenčarjev in ekotoksikologije je obsegalo raziskave strukturnih posebnosti embrijev mokric v zvezi z difrenciacijo prebavila in integumenta, raziskave bakterij v prebavilu mokric, raziskave dinamike bakra in kalcija v organskih sistemih mokric in vrednotenje vedenjskih odzivov mokric izpostavljenih učinku kovin in pesticidov. Testirali smo uporabo fokusiranega ionskega snopa (FIB) kot dodatka vrstičnemu elektronskemu mikroskopu (SEM) za pripravo in analizo tkiv mokric. 99
- Page 47 and 48: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 49 and 50: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 51 and 52: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 53 and 54: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 55 and 56: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 57 and 58: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 59 and 60: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 61 and 62: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 63 and 64: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 65 and 66: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 67 and 68: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 69 and 70: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 71 and 72: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 73 and 74: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 75 and 76: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 77 and 78: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 79 and 80: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 81 and 82: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 83 and 84: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 85 and 86: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 87 and 88: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 89 and 90: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 91 and 92: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 93 and 94: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 95 and 96: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 97: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 101 and 102: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 103 and 104: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 105 and 106: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 107 and 108: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 109 and 110: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 111 and 112: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 113 and 114: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 115 and 116: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 117 and 118: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 119 and 120: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 121 and 122: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 123 and 124: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 125 and 126: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 127 and 128: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 129 and 130: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 131 and 132: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 133 and 134: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 135 and 136: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 137 and 138: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 139 and 140: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 141 and 142: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 143 and 144: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 145 and 146: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
- Page 147 and 148: POROČILO ZA LETO 2005 UL BF ______
POROČILO ZA LETO <strong>2005</strong> UL BF<br />
_________________________________________________________________________<br />
Katedra za zoologijo<br />
Raziskovalna skupina za zoologijo in speleobiologijo: Nadaljevali smo z raziskavami<br />
filogenetskih odnosov pri nekaterih bolj razširjenih skupinah na širšem dinarskem območju<br />
in tudi širše. Splošno evropska vrsta, ki pa na krasu poseljuje tudi jame, je vodni osliček<br />
(Asellus aquaticus). Slepe postranice (rod Niphargus) so s približno 300 vrstami, večinoma<br />
podzemeljskimi, najobsežnejši rod amfipodov, s podobno evropsko razširjenostjo. Jamske<br />
kozice rodu Troglocaris poseljujejo kras med Francijo in Gruzijo. Človeška ribica (Proteus<br />
anguinus) poseljuje jamske vode vsega dinarskega krasa. Pri vseh raziskujemo intra- in<br />
interspecijske filogenetske odnose na osnovi morfološke analize in z analizo DNA. Vse<br />
študije so še v teku, predvidoma bodo zaključene v 2006.<br />
Nadaljevali smo z urejanjem in dopolnjevanje zbirke podatkov o razširjenosti podzemne<br />
favne na Dinarskem območju. Tovrstna zbirka podatkov nam služi za biogeografske in<br />
bodiverzitetne študije. Pripravljamo ustrezna poglavja za Encyclopedia biospeologica.<br />
Nadaljevali smo individualno genotipizacijo medvedov s pomočjo neinvazivnega<br />
genetskega vzorčenja. Obdelali smo vzorce z Ribniško-kočevskega območja.<br />
Raziskovalno delo Skupine za funkcionalno morfološke raziskave vretenčarjev je<br />
zajemalo:<br />
· spremljanje kopičenja težkih kovin in drugih polutantov na posameznih lokalitetah<br />
močerila,<br />
· proučevanje sinteze metalotioneinov pri ameriškem sorodniku nekturu (Necturus<br />
maculosus, Amphibia, Protidae) po izpostavitvi živali določenim subletalnim<br />
koncentracijam kovinskih ionov,<br />
· izolacijo in vzpostavitev primarnih celičnih kultur jetrnih celic močerila in nektura.<br />
Izolirani hepatociti močerila in nektura so bili v primarnih kulturah vzdrževani do 14 dni,<br />
njihove značilnosti v kulturi smo analizirali s pomočjo elektronsko-mikroskopskih in<br />
biokemijskih metod,<br />
· pripravo metodike za oceno starosti dvoživk s pomočjo skeletokronologije. Metodo<br />
skeletokronološke ocene starosti smo uspešno preizkusili z ustrezno prilagojeno metodiko<br />
tudi pri močerilu in s tem je dana možnost, da bomo v letošnjem in naslednjih letih lahko<br />
začeli z ocenjevanjem starosti posameznih osebkov v okviru posameznih populacij na<br />
različnih lokalitetah,<br />
. v projektu “promocije znanosti” smo v letu <strong>2005</strong> pripravili zasnovo posebne<br />
poljudnoznanstvene predstavitvene zgoščenke s poudarkom na črni človeški ribici za šole<br />
in širšo javnost, v sodelovanju z RTV in založniško hišo MK.<br />
Raziskovalno delo na področju funkcionalne morfologije nevretenčarjev in<br />
ekotoksikologije je obsegalo raziskave strukturnih posebnosti embrijev ter ličink mokric v<br />
zvezi z difrenciacijo prebavila in integumenta, raziskave bakterij v prebavilu mokric,<br />
raziskave dinamike bakra in kalcija v organskih sistemih rakov ter vrednotenje vedenjskih<br />
odzivov mokric, ko jih izpostavimo učinku kovin in pesticidov. Testirali smo uporabo<br />
fokusiranega ionskega snopa (FIB) kot dodatka vrstičnemu elektronskemu mikroskopu<br />
(SEM), za pripravo in analizo tkiv v prebavnem sistemu rakov.<br />
Delo na področju funkcionalne morfologije nevretenčarjev in ekotoksikologije je obsegalo<br />
raziskave strukturnih posebnosti embrijev mokric v zvezi z difrenciacijo prebavila in<br />
integumenta, raziskave bakterij v prebavilu mokric, raziskave dinamike bakra in kalcija v<br />
organskih sistemih mokric in vrednotenje vedenjskih odzivov mokric izpostavljenih učinku<br />
kovin in pesticidov. Testirali smo uporabo fokusiranega ionskega snopa (FIB) kot dodatka<br />
vrstičnemu elektronskemu mikroskopu (SEM) za pripravo in analizo tkiv mokric.<br />
99