Farm Przegl Nauk, 2009,11, 20-25Ekspresja genów związanych z opornością na lekiw komórkach białaczki promielocytarnej HL-60eksponowanych na cisplatynęExpression of genes associated with drug resistancein promyelotic leukemia cells HL-60 exposed to cisplatinAdam Wilczok 1 , Alicja Zajdel 1 , Jakub Wilczok 2 , Monika Paul-Samojedny 31Katedra i Zakład Biofarmacji; Wydział <strong>Farmaceutyczny</strong> z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej,Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach2Apteka „Grand” w Chorzowie3Katedra i Zakład Genetyki Medycznej; Wydział <strong>Farmaceutyczny</strong> z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej,Śląski Uniwersytet Medyczny w KatowicachStreszczenieEfekt terapeutyczny cisplatyny jest wynikiem wytworzeniainter- i intramolekularnych wiązań z DNA i najczęściejprowadzi do śmierci komórki nowotworowejw drodze apoptozy. Jednocześnie koordynacja cisplatynydo DNA uaktywnia szereg mechanizmów prowadzącychdo powstawania oporności takich jak: zmniejszenie transportuleku do komórki, usuwanie z komórki, sekwestracjaz udziałem glutationu i metalotionein, naprawa DNA,hamowanie apoptozy. Stosując technikę mikromacierzyoligonukleotydowych (Affymetrix) porównano ekspresjęgenów związanych z procesami odpowiedzialnymi za powstawanieoporności na lek w komórkach białaczki promielocytarnejHL-60 eksponowanych na cisplatynę orazw komórkach kontrolnych. Analizując sygnały fluorescencji770 sond, wyselekcjonowanych z bazy NetAffxAnalysis Center, reprezentujących ekspresję 412 genów,wykazano najsilniejszy wzrost ekspresji genów TOP2A,TOP1, KRAS, BIK, BAX, TFAM, GTSE1, CASP6 orazzmniejszenie ekspresji genów SLC7A11, CD70, MTF1,ABCC3. Poznanie efektów zmienionej ekspresji tychgenów jest istotne zwłaszcza dla projektowania nowychpochodnych platyny charakteryzujących się zwiększonąskutecznością, które ponadto nie będą wywoływały narastaniaoporności na lek.AbstractTherapeutic effect of cisplatin results from formation ofinter- and intrastrand DNA crosslinks and usually leads todeath of tumour cells through apoptosis. At the same timeits incorporation and binding to DNA activate mechanismswhich cause resistance to the drug, such as decreased uptake,removal from the cell, sequestration by glutathioneand metallothionein, DNA repair, and inhibition of apoptosis.Using oligonucleotide microarray technique (Affymetrix)the expression of genes involved in developmentof drug resistance in promyelocytic leukemia HL-60cells exposed to cisplatin and control cells was compared.Analysis of the fluorescence signals of 770 probes, whichrepresented 412 genes selected from the NetAffx AnalysisCenter database showed highest expression increase ofTOP2A, TOP1, KRAS, BIK, BAX, TFAM, GTSE1, CASP6,and inhibition of SLC7A11, CD70, MTF1, ABCC3. Elucidationof these genes altered expression effects seemsto be important, particularly in synthesis of new cisplatinanalogs, which besides increased efficiency, overcomedrug resistance.Key words: cisplatin, gene expression, drug resistance,promyelocytic leukemia cells, HL-60Słowa kluczowe: cisplatyna, ekspresja genów, opornośćna lek, komórki białaczki promielocytarnej, HL-60WstępEfekt terapeutyczny cisplatyny, powszechnie stosowanegoleku przeciwnowotworowego, jest wynikiem wytworzeniainter- i intramolekularnych wiązań z DNA. Mechanizmdziałania cisplatyny polega przede wszystkim na jejaktywacji wewnątrz komórki poprzez zastąpienie dwóchatomów chloru grupami hydroksylowymi, co w konsekwencjiumożliwia wiązanie do DNA i tworzenie adduktów[1], które powodują lokalne zaburzenie struktury podwójnejhelisy i blokowanie procesów replikacji i transkrypcji,co w konsekwencji prowadzi do zaburzeń w szlakach sygnałowychkontrolujących wzrost, różnicowanie czy odpowiedźna stres oksydacyjny wywoływany przez ten lek[2]. Addukty cisplatyny z DNA są rozpoznawane przezszereg białek komórkowych związanych, np. z szlakami na-20
copyright © 2009 Grupa dr. A. R. Kwiecińskiego ISSN 1425-5073prawy DNA, co najczęściej prowadzi do śmierci komórkiw drodze apoptozy [3]. Z drugiej strony wiązanie cisplatynydo DNA uaktywnia cały szereg mechanizmów prowadzącychdo powstawania oporności i braku wrażliwości na tenlek. Za oporność na cisplatynę odpowiedzialny jest przedewszystkim niewystarczający transport do komórki [4]. Istniejądoniesienia o udziale w usuwaniu cisplatyny z komórkizależnych od ATP białek MDR1, MRP1, MRP2, MRP3,jednakże późniejsze prace przypisują funkcję usuwania tegoleku przede wszystkim białkom związanym z transportemmiedzi, ATP-azom ATP7A oraz ATP7B [5]. Również nadekspresjaglutationu oraz niektórych białek zawierającychgrupy tiolowe, jak metalotioneina, powoduje oporność nacisplatynę [6]. Wiązanie glutationu i cisplatyny jest katalizowaneprzez transferazy S-glutationowe, które zwiększającwłaściwości anionowe związku, zwiększają jego usuwaniez komórki poprzez zależną od ATP pompę S-koniugatów glutationu[7]. Oprócz niewystarczającej akumulacji cisplatynywewnątrz komórek, główną przyczyną braku wrażliwościnowotworu na ten lek są procesy związane z możliwościąnaprawy DNA oraz usuwaniem adduktów cisplatyna-DNA[8]. W odróżnieniu od niewrażliwych komórek wielu guzówwykazujących wzrost zdolności naprawczych polekowychuszkodzeń DNA, znaczna wrażliwość komórek, np. raka jądra,wynika z upośledzenia ich zdolności do naprawy DNA.Podstawowymi mechanizmami usuwającymi spowodowaneprzez cisplatynę uszkodzenia DNA są: naprawa przez wycinanienukleotydów (NER), naprawa przez wycinanie zasad(BER), naprawa źle sparowanych zasad (MMR) i naprawapęknięć DNA. Zwiększona tolerancja na wywołane przezcisplatynę uszkodzenia DNA może także wystąpić na skutekutraty funkcji szlaku MMR. Pochodna cisplatyny, Eloxatinnie wywołuje powstawania oporności, gdyż mechanizmjej akumulacji nie zależy w tak znacznym stopniu odtransportera miedzi CTR1 [9]. Ponadto połączenia tego lekuz DNA nie są rozpoznawane przez białka MMR, podczasgdy addukty cisplatyna - DNA są rozpoznawane przez białkaMSH2, MSH3 i MSH6. Gdy komórki podlegają kolejnymbezskutecznym cyklom naprawy DNA, poziom uszkodzeńpozostaje wystarczający do uruchomienia mechanizmówapoptozy. Kolejny z mechanizmów oporności związany jestz omijaniem podczas replikacji przez polimerazy DNA βi η miejsc w DNA, do których przyłączona jest cisplatyna[10]. Tolerancja na cisplatynę może również być wynikiemzmniejszonej ekspresji, albo utraty szlaków apoptozy, zarównowewnętrznego jak i zewnętrznego, na skutek zmienionejaktywności białek takich jak P53, anty- i proapoptotycznychbiałek rodziny BCL2 oraz JNK [11].W przedstawianej pracy, w celu pełniejszego wyjaśnieniamechanizmów molekularnych decydujących o wrażliwościkomórek nowotworowych na cisplatynę, poddaliśmy oceniezmiany profilu ekspresji genów kodujących białka uczestniczącew transporcie wielolekowym, syntezie glutationui metalotionein, naprawie DNA oraz zmniejszaniu aktywacjii hamowaniu indukcji szlaków apoptozy pod wpływem tegoleku. Do badań wykorzystaliśmy hodowane w warunkachlaboratoryjnych komórki ludzkiej linii nowotworowej białaczkipromielocytarnej HL-60. Do analizy ekspresji genówzastosowano technikę mikromacierzy oligonukleotydowychHG-U133A (Affymetrix).Materiał i metodyHodowle komórkoweMateriał do badań stanowiły hodowane komórki ludzkiejlinii nowotworowej białaczki promielocytarnej HL-60.Komórki hodowano, zgodnie z zaleceniami ATCC, w standardowychwarunkach (w temperaturze 37°C, w atmosferze5% CO 2), w pożywce hodowlanej RPMI-1640 (Gibco)z dodatkiem 10% bydlęcej surowicy płodowej (FBS; Sigma),100 µg /ml streptomycyny, 100 U/ml penicyliny (Sigma),2 mM glutaminy (Sigma), 1 mM pirogronianu sodu (Sigma)i 4,5 g/l glukozy. Po 48 godzinach inkubacji do hodowli dodawanoroztwór cisplatyny (Sigma) rozpuszczonej w DMSO(Sigma) tak, aby uzyskać stężenie 0,22 µg/ml, odpowiadającewartości ID30 (Inhibitory Dose 30%). Hodowle kontrolneprowadzono w identyczny sposób, dodając po 48 godzinachczysty DMSO, stosowany ze względu na ograniczoną rozpuszczalnośćcisplatyny. Po sześcio godzinnej inkubacji komórkizbierano i przygotowywano do ekstrakcji RNA.Ekstrakcja całkowitego RNARNA ekstrahowano z użyciem odczynnika TRIZOL(Invitrogen Life Technologies), zgodnie z protokołem producenta.Ekstrakty całkowitego RNA oczyszczono z wykorzystaniemzestawu RNeasy Mini Kit (Qiagen). EkstraktyRNA oceniano jakościowo techniką elektroforezy w 1%żelu agarozowym barwionym bromkiem etydyny oraz ilościowoprzy użyciu spektrofotometru GeneQuant II (PharmaciaBiotech).Analiza aktywności transkrypcyjnej genów technikąmikromacierzy oligonukleotydowychCałkowite RNA (8µg) zostało wykorzystane do syntezydwuniciowego cDNA (Gibco BRL SuperScript Choice system),które stanowiło matrycę do syntezy biotynylowanegocRNA (reakcja transkrypcji in vitro, Enzo kit). Po fragmentacjibiotynylowanego cRNA przeprowadzono hybrydyzacjęz mikromacierzą Test3, a następnie po pozytywnej weryfikacjiz mikromacierzą HG-U133A (Affymetrix). Znakowanieproduktów hybrydyzacji przeprowadzono kilkustopniowokompleksem streptawidyna – fikoerytryna, znakowanymiprzeciwciałami przeciw biotynie oraz przeciwciałami przeciwkompleksowi streptawidyna – fikoerytryna zgodniez protokołem EukGEWS2v4 zalecanym dla mikromacierzyoligonukleotydowej HG–U133A w przewodniku GeneExpression Analysis Technical Manual (Affymetrix). Następniepłytki mikromacierzy odczytywano używając skaneraAgilent GeneArray Scanner G2500A (Agilent Technologies).Otrzymane wyniki intensywności fluorescencjizapisano i zarchiwizowano w programie Microarray Suiteoraz specjalnie do tego celu przygotowanej bazie danych.Analizę porównawczą transkryptomów przeprowadzonopo normalizacji wyników w programie RMA Express polegającejna przekształceniu logarytmicznym wartości sygnałufluorescencji dla każdego transkryptu (log 2) wykorzystującprogramy komputerowe: Statistica v.7,0, G<strong>numer</strong>ic, orazMicrosoft Excel. Wyodrębnienia grup genów związanych21
- Page 1: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 4 and 5: Zdj. Zygmunt WieczorekSzanowni Pań
- Page 7 and 8: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 10 and 11: Farm Przegl Nauk, 2009,11Scheduled
- Page 12 and 13: Farm Przegl Nauk, 2009,112) inhibit
- Page 14 and 15: Farm Przegl Nauk, 2009,1113. Jiang
- Page 16 and 17: Farm Przegl Nauk, 2009,11Tab. I. Ch
- Page 18 and 19: Farm Przegl Nauk, 2009,11rensu woln
- Page 22 and 23: Farm Przegl Nauk, 2009,11z powstawa
- Page 24 and 25: Farm Przegl Nauk, 2009,11kaspazy 6
- Page 26: Farm Przegl Nauk, 2009,11, 26-32Pos
- Page 31 and 32: na farmaceutę obowiązekudziału w
- Page 35 and 36: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 37 and 38: Farm Przegl Nauk, 2009,11, 37-41cop
- Page 39 and 40: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 41 and 42: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 43 and 44: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 45 and 46: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 47 and 48: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K
- Page 49 and 50: copyright © 2009 Grupa dr. A. R. K