ab ZÁŘÍ 2008 - Akademický bulletin - Akademie věd ČR

Podpora zásadních zařízení a vybavení pro výzkumv Evropě by měla být realizována v nejbližšíchdesetiletích v projektech ESFRI, které byly původněiniciovány především fyzikálními obory. V Evropě sevýzkum v oblasti strukturní biologie doposud odehrávalzejména v rámci individuálních institucí jednotlivýchzemí, ať již za národní nebo evropské podpory.Přitom zřízení a podpora např. velkých zdrojů synchrotronovéhozáření (synchrotronů) byla a je v posledníchdvou desetiletích výborným příkladem výzkumnéinfrastruktury, která umožnila rozvoj různýchvědních oborů. Mezi nimi také strukturní biologie, ježvyužívá synchrotronu především jako stabilního zdrojemonochromatického rentgenového záření definovanýchvlastností pro difrakční experimenty.Strukturní biologie se snaží objasnit základní principyfunkce živých systémů s využitím informací o jednorozměrnéaž třírozměrné struktuře biologických mopř e d s t a v u j e m eINTEGROVANĚPRO STRUKTURNÍ BIOLOGII V EVROPĚAktivity Evropského fóra strategie výzkumných infrastruktur (ESFRI – European StrategyForum on Research Infrastructures) v oblasti biolékařských a biologických věd jsouv současném stavu pokryty šesti projekty. Jedním z nich je Integrovaná infrastruktura prostrukturní biologii – INSTRUCT (Integrated Infrastructure for Structural Biology).Iniciátorem a koordinátorem projektu INSTRUCT je prof. David I. Stuart z Oxfordskéuniverzity a Centra lidské genetiky Wellcome Trust.3D strukturachemosensorickéhoproteinu CSP-1bource morušovéhourčená pomocíNMR spektroskopie.Tento proteino molekulovéhmotnosti 12,5 kDapatří do třídybílkovin vázajícíchmolekuly,které sloužík přenosusignálů u hmyzu.Hydrofóbní kavityindikující možnávazebná místachemosensorickýchmolekul jsouvybarveny modře.akademickýbulletinab 20p r o j e k t ylekul a systémů. Experimentální techniky využívanépři tomto studiu zahrnují rentgenovou a neutronovoudifrakci, nukleární magnetickou rezonanci (NMR),elektronovou mikroskopii (EM), výpočetní metody a počítačovémodelování společně s celou řadou charakterizačníchtechnik, jako jsou hmotnostní spektrometrie,techniky světelného rozptylu, kalorimetrické metody,metody vedoucí k optimalizaci prostředí prodaný molekulární systém a jiné.Metody určení třírozměrné struktury biologickýchmolekul pomocí rentgenové difrakční analýzy a nukleárnímagnetické rezonance zaznamenaly v přibližněposledních 20 letech rozmach, který vedl společněs aktivitami strukturně-genomických center k exponenciálnímunárůstu počtu deponovaných struktur v databáziPDB (viz Protein Data Bank, wwPDB,http://www.wwpdb.org/). Využití 3D souřadnic proteinů,nukleových kyselin a jejich komplexů při studiuOBĚ FOTA: ARCHIV BTÚ AV ČR