Bioinformatika KFC/BIN I. PÅehled - Univerzita Palackého v Olomouci
Bioinformatika KFC/BIN I. PÅehled - Univerzita Palackého v Olomouci
Bioinformatika KFC/BIN I. PÅehled - Univerzita Palackého v Olomouci
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Biologická data<br />
Zdroj dat Velikost dat <strong>Bioinformatika</strong><br />
DNA sekvence<br />
Proteinová<br />
sekvence<br />
Makromolekulární<br />
struktura<br />
Genomy<br />
Exprese<br />
(genů, proteinů, …)<br />
195 milionů sekvencí<br />
(300·10 9 nukleotidů)<br />
18 milionů sekvencí<br />
(~300 AA)<br />
70 000 struktur<br />
(~1500 koordinát)<br />
1000 genomů<br />
(~1·10 9 bp)<br />
čipy<br />
(obrazové info:TB/den)<br />
Introny a exony<br />
Predikce produktu genů<br />
Forenzní analýza<br />
Porovnávání sekvencí (párové, 1:n)<br />
Konzervované sekvenční motivy<br />
Predikce sekundární a terciární struktury<br />
3D strukturní alignment<br />
Geometrie molekuly a její interakce<br />
Molekulární simulace (MD, ligand docking)<br />
Charakterizace opakování<br />
Dohledávání struktur ke genům<br />
Fylogenetická analýza<br />
Genomic-scale census<br />
(obsah proteinů, metabolické dráhy)<br />
Identifikace genetických chorob<br />
Mapování expresních dat na sekvenční a<br />
biochemické data<br />
Biol. literatura 20 milionů citací Hledání, digitální knihovny Tvorba znalostních<br />
databází – data mining
Change language