Pokaż cały numer - FPN - Farmaceutyczny Przegląd Naukowy

Pokaż cały numer - FPN - Farmaceutyczny Przegląd Naukowy Pokaż cały numer - FPN - Farmaceutyczny Przegląd Naukowy

fpn.sum.edu.pl
from fpn.sum.edu.pl More from this publisher
29.11.2014 Views

Farm Przegl Nauk, 2010,12, 34-42 Zastosowanie analizy QSAR w badaniach leków o działaniu serotoninergicznym. I Application of QSAR analysis in the studies of serotoninergic drugs. I Grażyna Żydek, Elżbieta Brzezińska Zakład Chemii Analitycznej, Katedra Chemii Medycznej, Wydział Farmaceutyczny, Uniwersytet Medyczny w Łodzi Streszczenie Przeprowadzono analizę ilościowej zależności pomiędzy strukturą i działaniem (QSAR) wybranych 20 leków działających na receptory serotoninowe (5-HT). W analizie zastosowano parametry fizykochemiczne badanych związków obliczone przy użyciu programu HyperChem 7.0 oraz dane chromatograficzne. Przeprowadzono chromatografię cienkowarstwową na płytkach pokrytych silikażelem NP 60F 254 , impregnowanych roztworami pochodnych aminokwasów wiążących w kompleksie lek-receptor serotoninowy oraz ich mieszanin (S1-S7), w obecności dwóch faz rozwijających – w celu uzyskania modelu interakcji lek-receptor 5-HT. Związek pomiędzy aktywnością biologiczną a danymi chromatograficznymi i deskryptorami molekularnymi badano analizą regresji wielokrotnej. Ustalono modele analityczne zależności pomiędzy działaniem badanych związków i ich interakcją ze środowiskiem biochromatograficznym (S1-S7). Zaproponowane równania regresji oparte na wynikach badań biochromatograficznych, mogą służyć jako skuteczne narzędzie analizy QSAR do wstępnego przewidywania kierunku działania związków w obrębie receptorów serotoninowych. Słowa kluczowe: receptory serotoninowe, biochromatografia, chromatografia cienkowarstwowa, analiza QSAR, analiza regresji Abstract Quantitative structure-activity relationships (QSAR) analysis of the selected 20 drugs with serotonin (5-HT) receptors affinities was carried out. A set of physicochemical parameters calculated by HyperChem 7.0 program and chromatographic data were applied in this analysis. Thin layer chromatography was performed on silica gel NP 60F 254 plates impregnated with solutions of amino acids analogues and their mixtures (S1-S7), with two mobile phases – the system were chosen as models of drug-5-HT receptor interaction. Relationships between chromatographic data and molecular descriptors and biological activity data were found by use of regression analysis. The correlations obtained for the compounds with serotoninergic activity represent their interaction with the proposed biochromatographic models (S1–S7). The presented regression models based on biochromatographic studies can be an efficient tool in the QSAR analysis for initial prediction of compound activity direction within 5-HT receptors. Keywords: serotonin receptors, biochromatography, thin layer chromatography, QSAR analysis, regression analysis Wstęp Znajomość budowy i funkcji farmakodynamicznej określonego celu biologicznego może być podstawą poszukiwania modelu analitycznego do pośredniej obserwacji zachowania związków chemicznych w warunkach fizjologicznym. Do tego celu służyć może tak zwane środowisko biochromatograficzne, wykorzystujące funkcjonalne elementy struktury celu biologicznego. Stanowi ono, w pewnym sensie, laboratoryjną imitację środowiska naturalnego działania potencjalnego leku. Dostępne informacje na temat miejsc wiążących ligandy w obrębie receptora serotoninowego (5-HT) pozwalają na wyposażenie modelu biochromatograficznego w elementy chemiczne środowiska biologicznego, bezpośrednio odpowiedzialne za tworzenie kompleksu lek-receptor. Informacje te stwarzały możliwość zbudowania analitycznego modelu interakcji związków chemicznych z tym receptorem, dla wstępnego przewidywania aktywności biologicznej potencjalnych jego ligandów. Receptory serotoninowe to długie, nierozgałęzione, zbudowane z kilkuset reszt aminokwasowych, łańcuchy białkowe. Dowody na istnienie różnych typów (klas) receptorów serotoninergicznych zostały przedstawione przez J. H. Gadduma i Z. Picarellego w 1957 roku [1]. Obecnie receptory te dzielimy na 7 typów, które dalej dzielą się na podtypy: 5-HT 1 (5-HT 1A , 5-HT 1B , 5-HT 1D , 5-HT 1E , 5-HT 1F ), 5-HT 2 (5-HT 2A , 5-HT 2B , 5-HT 2C ), 5-HT 3 , 5-HT 4 (5-HT 4(a) , 5-HT 4(b) , 5-HT 4(c) , 5-HT 4(d) ), 5-HT 5 (5-HT 5A , 5-HT 5B ), 5-HT 6 , 5-HT 7 . Wszystkie należą do receptorów metabotropowych z wyjątkiem rodziny 5-HT 3 , która zaliczana jest do klasy receptorów jonotropowych. Obecnie wiadomo, że reszta kwasu asparaginowego (Asp155), znajdująca się w III domenie trans 34

C H 3 N N N CH 3 H 3 C O S O 1. Tiapryd N CH 3 O NH 6. Risperidon CH 3 O O H 3 C 8. Tropisetron N N 11 . Mianseryna N NH O CH 3 O S N N OH 2. Klopentiksol S N O N CH 3 12 . Pizotifen membranowej (TM3), tworzy wiązania jonowe z grupami aminowymi ligandów [2-8]. Udział w tworzeniu kompleksu z cząsteczkami bierze również reszta seryny (Ser159), zlokalizowana w TM5, która tworzy wiązanie wodorowe z grupami hydroksylowymi ligandów [9] oraz reszta fenyloalaniny (Phe340) w TM6, która poprzez pierścień aromatyczny stabilizuje cząsteczkę serotoniny [10-11]. Stabilizowanie pierścieni aromatycznych w receptorach metabotropowych (GPCR) odbywa się również poprzez reszty aminokwasowe tryptofanu (Trp200, Trp336, Trp367) i tyrozyny (Tyr370). Stabilizacja ta jest zwykle oparta na prostych oddziaływaniach hydrofobowych. W przypadku tryptofanu sugeruje się również możliwość stabilizacji podstawników dodatnio naładowanych amin alifatycznych [12-15]. W niektórych odmianach receptora serotoninowego (5-HT 6 ) zaobserwo- Cl F S N F N 3. Flupentiksol Cl CH 3 N 9. Cyproheptadyna H 3 C N N 13 . Mirtazapina H H H N N O N NH 3 C S N O N 15 . Sumatriptan N CH 3 16 . Rizatriptan H 3 C F O H 3 C 18 . Cisaprid N O NH CH 3 O NH 2 Ryc. 1. Struktury badanych związków 1-20. O Cl HO F F N N H OH C H 3 N 5. Klozapina N CH 3 N H N 19 . Serotonina CH 3 O NH 2 N O copyright © 2010 Grupa dr. A. R. Kwiecińskiego ISSN 1425-5073 N CH 3 N N N H O O N O N N N S 4. Trifluoperazyna N N H N S 7. Olanzapina N N 10 . Trazodon N N 14 . Buspiron H N 17 . Zolmitriptan F CH 3 N Cl N N N CH 3 F CH 3 F CH 3 wano również elementy wiążące ligandy związane z TM5. Była to treonina (Thr196) [16]. W innych odmianach receptora 5-HT treoninie odpowiadała alanina (Ala). W obu przypadkach sugeruje się tworzenie wiązania wodorowego z atomem azotu liganda. Oddziaływania z receptorami 5-HT umożliwia również reszta asparaginy (Asn333). Poznanie dokładnej sekwencji aminokwasów w łańcuchu białkowym receptorów oraz przeprowadzanie ich mutacji, pozwala na dokładne zbadanie ich powinowactwa do poszczególnych neuroprzekaźników oraz ligandów [17-24]. Ułatwia to znacznie procesy projektowania nowych leków. Celem przeprowadzonych badań w niniejszej pracy jest określenie możliwości wykorzystania techniki chromatograficznej oraz analizy QSAR do opracowania równań matematycznych, umożliwiających wstępne przewidywanie wiązalność z receptorem (pK i ), aktywność agonistyczną (pD 2 ) oraz antagonistyczną (pA 2 ) związków o potencjalnym działaniu na receptory serotoninowe. Materiał i metody Substancje badane Oznaczeń dokonano na grupie znanych leków (zw. 1-20; C NH O Ryc. 1), będących w sprzedaży OH aptecznej, o aktywności skierowanej na receptory serotoninowe. Izolowanie substancji 20 . Propranolol aktywnych z preparatów farmaceutycznych przeprowadzono metodami opisanymi według monografii szczegółowych przedstawionych w FP i informacji dostępnych w The Merck Index Twelfth Edition, 1996. Dane o właściwościach farmakologicznych i kierunku działania poszczególnych związków, zaczerpnięte z baz danych (PubMed, DrugBank, ChemBank, Organon), przedstawiono w Tabeli I. H 3 CH 3 Analiza chromatograficzna Substancje badane 1-20 zostały poddane analizie chromatograficznej w powtarzalnych warunkach. Podczas doświadczeń został ustalony skład fazy organicznej mieszaniny. Fazę wodną stanowi bufor (octan amonu 0,02 mol/L) o pH 7,4, zgodnym z warunkami badań biologicznych. Chromatografię przeprowadzono przy użyciu dwóch rodzajów fazy ruchomej: 35

Farm Przegl Nauk, 2010,12, 34-42<br />

Zastosowanie analizy QSAR w badaniach leków<br />

o działaniu serotoninergicznym. I<br />

Application of QSAR analysis in the studies of serotoninergic drugs. I<br />

Grażyna Żydek, Elżbieta Brzezińska<br />

Zakład Chemii Analitycznej, Katedra Chemii Medycznej, Wydział <strong>Farmaceutyczny</strong>,<br />

Uniwersytet Medyczny w Łodzi<br />

Streszczenie<br />

Przeprowadzono analizę ilościowej zależności pomiędzy<br />

strukturą i działaniem (QSAR) wybranych 20 leków<br />

działających na receptory serotoninowe (5-HT). W analizie<br />

zastosowano parametry fizykochemiczne badanych<br />

związków obliczone przy użyciu programu HyperChem<br />

7.0 oraz dane chromatograficzne. Przeprowadzono chromatografię<br />

cienkowarstwową na płytkach pokrytych silikażelem<br />

NP 60F 254<br />

, impregnowanych roztworami pochodnych<br />

aminokwasów wiążących w kompleksie lek-receptor<br />

serotoninowy oraz ich mieszanin (S1-S7), w obecności<br />

dwóch faz rozwijających – w celu uzyskania modelu interakcji<br />

lek-receptor 5-HT. Związek pomiędzy aktywnością<br />

biologiczną a danymi chromatograficznymi i deskryptorami<br />

molekularnymi badano analizą regresji wielokrotnej.<br />

Ustalono modele analityczne zależności pomiędzy działaniem<br />

badanych związków i ich interakcją ze środowiskiem<br />

biochromatograficznym (S1-S7). Zaproponowane<br />

równania regresji oparte na wynikach badań biochromatograficznych,<br />

mogą służyć jako skuteczne narzędzie analizy<br />

QSAR do wstępnego przewidywania kierunku działania<br />

związków w obrębie receptorów serotoninowych.<br />

Słowa kluczowe: receptory serotoninowe, biochromatografia,<br />

chromatografia cienkowarstwowa, analiza QSAR,<br />

analiza regresji<br />

Abstract<br />

Quantitative structure-activity relationships (QSAR) analysis<br />

of the selected 20 drugs with serotonin (5-HT) receptors<br />

affinities was carried out. A set of physicochemical<br />

parameters calculated by HyperChem 7.0 program and<br />

chromatographic data were applied in this analysis. Thin<br />

layer chromatography was performed on silica gel NP<br />

60F 254<br />

plates impregnated with solutions of amino acids<br />

analogues and their mixtures (S1-S7), with two mobile<br />

phases – the system were chosen as models of drug-5-HT<br />

receptor interaction. Relationships between chromatographic<br />

data and molecular descriptors and biological activity<br />

data were found by use of regression analysis. The<br />

correlations obtained for the compounds with serotoninergic<br />

activity represent their interaction with the proposed<br />

biochromatographic models (S1–S7). The presented regression<br />

models based on biochromatographic studies<br />

can be an efficient tool in the QSAR analysis for initial<br />

prediction of compound activity direction within 5-HT<br />

receptors.<br />

Keywords: serotonin receptors, biochromatography, thin<br />

layer chromatography, QSAR analysis, regression analysis<br />

Wstęp<br />

Znajomość budowy i funkcji farmakodynamicznej określonego<br />

celu biologicznego może być podstawą poszukiwania<br />

modelu analitycznego do pośredniej obserwacji zachowania<br />

związków chemicznych w warunkach fizjologicznym.<br />

Do tego celu służyć może tak zwane środowisko biochromatograficzne,<br />

wykorzystujące funkcjonalne elementy<br />

struktury celu biologicznego. Stanowi ono, w pewnym sensie,<br />

laboratoryjną imitację środowiska naturalnego działania<br />

potencjalnego leku. Dostępne informacje na temat miejsc<br />

wiążących ligandy w obrębie receptora serotoninowego<br />

(5-HT) pozwalają na wyposażenie modelu biochromatograficznego<br />

w elementy chemiczne środowiska biologicznego,<br />

bezpośrednio odpowiedzialne za tworzenie kompleksu lek-receptor.<br />

Informacje te stwarzały możliwość zbudowania<br />

analitycznego modelu interakcji związków chemicznych<br />

z tym receptorem, dla wstępnego przewidywania aktywności<br />

biologicznej potencjalnych jego ligandów.<br />

Receptory serotoninowe to długie, nierozgałęzione, zbudowane<br />

z kilkuset reszt aminokwasowych, łańcuchy białkowe.<br />

Dowody na istnienie różnych typów (klas) receptorów<br />

serotoninergicznych zostały przedstawione przez J. H. Gadduma<br />

i Z. Picarellego w 1957 roku [1]. Obecnie receptory<br />

te dzielimy na 7 typów, które dalej dzielą się na podtypy:<br />

5-HT 1<br />

(5-HT 1A<br />

, 5-HT 1B<br />

, 5-HT 1D<br />

, 5-HT 1E<br />

, 5-HT 1F<br />

), 5-HT 2<br />

(5-HT 2A<br />

, 5-HT 2B<br />

, 5-HT 2C<br />

), 5-HT 3<br />

, 5-HT 4<br />

(5-HT 4(a)<br />

, 5-HT 4(b)<br />

,<br />

5-HT 4(c)<br />

, 5-HT 4(d)<br />

), 5-HT 5<br />

(5-HT 5A<br />

, 5-HT 5B<br />

), 5-HT 6<br />

, 5-HT 7<br />

.<br />

Wszystkie należą do receptorów metabotropowych z wyjątkiem<br />

rodziny 5-HT 3<br />

, która zaliczana jest do klasy receptorów<br />

jonotropowych. Obecnie wiadomo, że reszta kwasu asparaginowego<br />

(Asp155), znajdująca się w III domenie trans<br />

34

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!