Pokaż caÅy numer - FPN - Farmaceutyczny PrzeglÄ d Naukowy
Pokaż caÅy numer - FPN - Farmaceutyczny PrzeglÄ d Naukowy Pokaż caÅy numer - FPN - Farmaceutyczny PrzeglÄ d Naukowy
Farm Przegl Nauk, 2010,12, 34-42 Zastosowanie analizy QSAR w badaniach leków o działaniu serotoninergicznym. I Application of QSAR analysis in the studies of serotoninergic drugs. I Grażyna Żydek, Elżbieta Brzezińska Zakład Chemii Analitycznej, Katedra Chemii Medycznej, Wydział Farmaceutyczny, Uniwersytet Medyczny w Łodzi Streszczenie Przeprowadzono analizę ilościowej zależności pomiędzy strukturą i działaniem (QSAR) wybranych 20 leków działających na receptory serotoninowe (5-HT). W analizie zastosowano parametry fizykochemiczne badanych związków obliczone przy użyciu programu HyperChem 7.0 oraz dane chromatograficzne. Przeprowadzono chromatografię cienkowarstwową na płytkach pokrytych silikażelem NP 60F 254 , impregnowanych roztworami pochodnych aminokwasów wiążących w kompleksie lek-receptor serotoninowy oraz ich mieszanin (S1-S7), w obecności dwóch faz rozwijających – w celu uzyskania modelu interakcji lek-receptor 5-HT. Związek pomiędzy aktywnością biologiczną a danymi chromatograficznymi i deskryptorami molekularnymi badano analizą regresji wielokrotnej. Ustalono modele analityczne zależności pomiędzy działaniem badanych związków i ich interakcją ze środowiskiem biochromatograficznym (S1-S7). Zaproponowane równania regresji oparte na wynikach badań biochromatograficznych, mogą służyć jako skuteczne narzędzie analizy QSAR do wstępnego przewidywania kierunku działania związków w obrębie receptorów serotoninowych. Słowa kluczowe: receptory serotoninowe, biochromatografia, chromatografia cienkowarstwowa, analiza QSAR, analiza regresji Abstract Quantitative structure-activity relationships (QSAR) analysis of the selected 20 drugs with serotonin (5-HT) receptors affinities was carried out. A set of physicochemical parameters calculated by HyperChem 7.0 program and chromatographic data were applied in this analysis. Thin layer chromatography was performed on silica gel NP 60F 254 plates impregnated with solutions of amino acids analogues and their mixtures (S1-S7), with two mobile phases – the system were chosen as models of drug-5-HT receptor interaction. Relationships between chromatographic data and molecular descriptors and biological activity data were found by use of regression analysis. The correlations obtained for the compounds with serotoninergic activity represent their interaction with the proposed biochromatographic models (S1–S7). The presented regression models based on biochromatographic studies can be an efficient tool in the QSAR analysis for initial prediction of compound activity direction within 5-HT receptors. Keywords: serotonin receptors, biochromatography, thin layer chromatography, QSAR analysis, regression analysis Wstęp Znajomość budowy i funkcji farmakodynamicznej określonego celu biologicznego może być podstawą poszukiwania modelu analitycznego do pośredniej obserwacji zachowania związków chemicznych w warunkach fizjologicznym. Do tego celu służyć może tak zwane środowisko biochromatograficzne, wykorzystujące funkcjonalne elementy struktury celu biologicznego. Stanowi ono, w pewnym sensie, laboratoryjną imitację środowiska naturalnego działania potencjalnego leku. Dostępne informacje na temat miejsc wiążących ligandy w obrębie receptora serotoninowego (5-HT) pozwalają na wyposażenie modelu biochromatograficznego w elementy chemiczne środowiska biologicznego, bezpośrednio odpowiedzialne za tworzenie kompleksu lek-receptor. Informacje te stwarzały możliwość zbudowania analitycznego modelu interakcji związków chemicznych z tym receptorem, dla wstępnego przewidywania aktywności biologicznej potencjalnych jego ligandów. Receptory serotoninowe to długie, nierozgałęzione, zbudowane z kilkuset reszt aminokwasowych, łańcuchy białkowe. Dowody na istnienie różnych typów (klas) receptorów serotoninergicznych zostały przedstawione przez J. H. Gadduma i Z. Picarellego w 1957 roku [1]. Obecnie receptory te dzielimy na 7 typów, które dalej dzielą się na podtypy: 5-HT 1 (5-HT 1A , 5-HT 1B , 5-HT 1D , 5-HT 1E , 5-HT 1F ), 5-HT 2 (5-HT 2A , 5-HT 2B , 5-HT 2C ), 5-HT 3 , 5-HT 4 (5-HT 4(a) , 5-HT 4(b) , 5-HT 4(c) , 5-HT 4(d) ), 5-HT 5 (5-HT 5A , 5-HT 5B ), 5-HT 6 , 5-HT 7 . Wszystkie należą do receptorów metabotropowych z wyjątkiem rodziny 5-HT 3 , która zaliczana jest do klasy receptorów jonotropowych. Obecnie wiadomo, że reszta kwasu asparaginowego (Asp155), znajdująca się w III domenie trans 34
C H 3 N N N CH 3 H 3 C O S O 1. Tiapryd N CH 3 O NH 6. Risperidon CH 3 O O H 3 C 8. Tropisetron N N 11 . Mianseryna N NH O CH 3 O S N N OH 2. Klopentiksol S N O N CH 3 12 . Pizotifen membranowej (TM3), tworzy wiązania jonowe z grupami aminowymi ligandów [2-8]. Udział w tworzeniu kompleksu z cząsteczkami bierze również reszta seryny (Ser159), zlokalizowana w TM5, która tworzy wiązanie wodorowe z grupami hydroksylowymi ligandów [9] oraz reszta fenyloalaniny (Phe340) w TM6, która poprzez pierścień aromatyczny stabilizuje cząsteczkę serotoniny [10-11]. Stabilizowanie pierścieni aromatycznych w receptorach metabotropowych (GPCR) odbywa się również poprzez reszty aminokwasowe tryptofanu (Trp200, Trp336, Trp367) i tyrozyny (Tyr370). Stabilizacja ta jest zwykle oparta na prostych oddziaływaniach hydrofobowych. W przypadku tryptofanu sugeruje się również możliwość stabilizacji podstawników dodatnio naładowanych amin alifatycznych [12-15]. W niektórych odmianach receptora serotoninowego (5-HT 6 ) zaobserwo- Cl F S N F N 3. Flupentiksol Cl CH 3 N 9. Cyproheptadyna H 3 C N N 13 . Mirtazapina H H H N N O N NH 3 C S N O N 15 . Sumatriptan N CH 3 16 . Rizatriptan H 3 C F O H 3 C 18 . Cisaprid N O NH CH 3 O NH 2 Ryc. 1. Struktury badanych związków 1-20. O Cl HO F F N N H OH C H 3 N 5. Klozapina N CH 3 N H N 19 . Serotonina CH 3 O NH 2 N O copyright © 2010 Grupa dr. A. R. Kwiecińskiego ISSN 1425-5073 N CH 3 N N N H O O N O N N N S 4. Trifluoperazyna N N H N S 7. Olanzapina N N 10 . Trazodon N N 14 . Buspiron H N 17 . Zolmitriptan F CH 3 N Cl N N N CH 3 F CH 3 F CH 3 wano również elementy wiążące ligandy związane z TM5. Była to treonina (Thr196) [16]. W innych odmianach receptora 5-HT treoninie odpowiadała alanina (Ala). W obu przypadkach sugeruje się tworzenie wiązania wodorowego z atomem azotu liganda. Oddziaływania z receptorami 5-HT umożliwia również reszta asparaginy (Asn333). Poznanie dokładnej sekwencji aminokwasów w łańcuchu białkowym receptorów oraz przeprowadzanie ich mutacji, pozwala na dokładne zbadanie ich powinowactwa do poszczególnych neuroprzekaźników oraz ligandów [17-24]. Ułatwia to znacznie procesy projektowania nowych leków. Celem przeprowadzonych badań w niniejszej pracy jest określenie możliwości wykorzystania techniki chromatograficznej oraz analizy QSAR do opracowania równań matematycznych, umożliwiających wstępne przewidywanie wiązalność z receptorem (pK i ), aktywność agonistyczną (pD 2 ) oraz antagonistyczną (pA 2 ) związków o potencjalnym działaniu na receptory serotoninowe. Materiał i metody Substancje badane Oznaczeń dokonano na grupie znanych leków (zw. 1-20; C NH O Ryc. 1), będących w sprzedaży OH aptecznej, o aktywności skierowanej na receptory serotoninowe. Izolowanie substancji 20 . Propranolol aktywnych z preparatów farmaceutycznych przeprowadzono metodami opisanymi według monografii szczegółowych przedstawionych w FP i informacji dostępnych w The Merck Index Twelfth Edition, 1996. Dane o właściwościach farmakologicznych i kierunku działania poszczególnych związków, zaczerpnięte z baz danych (PubMed, DrugBank, ChemBank, Organon), przedstawiono w Tabeli I. H 3 CH 3 Analiza chromatograficzna Substancje badane 1-20 zostały poddane analizie chromatograficznej w powtarzalnych warunkach. Podczas doświadczeń został ustalony skład fazy organicznej mieszaniny. Fazę wodną stanowi bufor (octan amonu 0,02 mol/L) o pH 7,4, zgodnym z warunkami badań biologicznych. Chromatografię przeprowadzono przy użyciu dwóch rodzajów fazy ruchomej: 35
- Page 1: copyright © 2010 Grupa dr. A. R. K
- Page 4 and 5: Szanowni Państwo, Koleżanki i Kol
- Page 6 and 7: 6-10 Slovenian Pharmaceutical Socie
- Page 8 and 9: Invited speakers Dr. Scott Boyer As
- Page 10 and 11: Farm Przegl Nauk, 2010,12, 10-13 Bi
- Page 12 and 13: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 XIAP, Li
- Page 14 and 15: Farm Przegl Nauk, 2010,12, 14-20 Zm
- Page 16 and 17: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 rodzin,
- Page 18 and 19: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Ryc. 3.
- Page 20 and 21: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 24. Bels
- Page 22 and 23: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 podczas
- Page 24 and 25: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Wyniki b
- Page 26 and 27: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 z białk
- Page 28 and 29: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Pierwszy
- Page 30 and 31: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 zmian w
- Page 32 and 33: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 różnic
- Page 36 and 37: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Tab. I.
- Page 38 and 39: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Tab. III
- Page 40 and 41: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 jąc wp
- Page 42 and 43: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 27. Kira
- Page 44 and 45: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Wstęp W
- Page 46 and 47: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Poprzez
- Page 48 and 49: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Tab. III
- Page 50 and 51: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Lek Opis
- Page 52 and 53: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Lek Opis
- Page 54 and 55: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Lek Opis
- Page 56 and 57: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Lek Opis
- Page 58 and 59: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 17. Wise
- Page 60 and 61: Farm Przegl Nauk, 2010,12, 60-67 Fa
- Page 62 and 63: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 Tab. II.
- Page 64 and 65: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 teinaz m
- Page 66 and 67: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 no w sta
- Page 68 and 69: Farm Przegl Nauk, 2010, 12 INFORMAT
Farm Przegl Nauk, 2010,12, 34-42<br />
Zastosowanie analizy QSAR w badaniach leków<br />
o działaniu serotoninergicznym. I<br />
Application of QSAR analysis in the studies of serotoninergic drugs. I<br />
Grażyna Żydek, Elżbieta Brzezińska<br />
Zakład Chemii Analitycznej, Katedra Chemii Medycznej, Wydział <strong>Farmaceutyczny</strong>,<br />
Uniwersytet Medyczny w Łodzi<br />
Streszczenie<br />
Przeprowadzono analizę ilościowej zależności pomiędzy<br />
strukturą i działaniem (QSAR) wybranych 20 leków<br />
działających na receptory serotoninowe (5-HT). W analizie<br />
zastosowano parametry fizykochemiczne badanych<br />
związków obliczone przy użyciu programu HyperChem<br />
7.0 oraz dane chromatograficzne. Przeprowadzono chromatografię<br />
cienkowarstwową na płytkach pokrytych silikażelem<br />
NP 60F 254<br />
, impregnowanych roztworami pochodnych<br />
aminokwasów wiążących w kompleksie lek-receptor<br />
serotoninowy oraz ich mieszanin (S1-S7), w obecności<br />
dwóch faz rozwijających – w celu uzyskania modelu interakcji<br />
lek-receptor 5-HT. Związek pomiędzy aktywnością<br />
biologiczną a danymi chromatograficznymi i deskryptorami<br />
molekularnymi badano analizą regresji wielokrotnej.<br />
Ustalono modele analityczne zależności pomiędzy działaniem<br />
badanych związków i ich interakcją ze środowiskiem<br />
biochromatograficznym (S1-S7). Zaproponowane<br />
równania regresji oparte na wynikach badań biochromatograficznych,<br />
mogą służyć jako skuteczne narzędzie analizy<br />
QSAR do wstępnego przewidywania kierunku działania<br />
związków w obrębie receptorów serotoninowych.<br />
Słowa kluczowe: receptory serotoninowe, biochromatografia,<br />
chromatografia cienkowarstwowa, analiza QSAR,<br />
analiza regresji<br />
Abstract<br />
Quantitative structure-activity relationships (QSAR) analysis<br />
of the selected 20 drugs with serotonin (5-HT) receptors<br />
affinities was carried out. A set of physicochemical<br />
parameters calculated by HyperChem 7.0 program and<br />
chromatographic data were applied in this analysis. Thin<br />
layer chromatography was performed on silica gel NP<br />
60F 254<br />
plates impregnated with solutions of amino acids<br />
analogues and their mixtures (S1-S7), with two mobile<br />
phases – the system were chosen as models of drug-5-HT<br />
receptor interaction. Relationships between chromatographic<br />
data and molecular descriptors and biological activity<br />
data were found by use of regression analysis. The<br />
correlations obtained for the compounds with serotoninergic<br />
activity represent their interaction with the proposed<br />
biochromatographic models (S1–S7). The presented regression<br />
models based on biochromatographic studies<br />
can be an efficient tool in the QSAR analysis for initial<br />
prediction of compound activity direction within 5-HT<br />
receptors.<br />
Keywords: serotonin receptors, biochromatography, thin<br />
layer chromatography, QSAR analysis, regression analysis<br />
Wstęp<br />
Znajomość budowy i funkcji farmakodynamicznej określonego<br />
celu biologicznego może być podstawą poszukiwania<br />
modelu analitycznego do pośredniej obserwacji zachowania<br />
związków chemicznych w warunkach fizjologicznym.<br />
Do tego celu służyć może tak zwane środowisko biochromatograficzne,<br />
wykorzystujące funkcjonalne elementy<br />
struktury celu biologicznego. Stanowi ono, w pewnym sensie,<br />
laboratoryjną imitację środowiska naturalnego działania<br />
potencjalnego leku. Dostępne informacje na temat miejsc<br />
wiążących ligandy w obrębie receptora serotoninowego<br />
(5-HT) pozwalają na wyposażenie modelu biochromatograficznego<br />
w elementy chemiczne środowiska biologicznego,<br />
bezpośrednio odpowiedzialne za tworzenie kompleksu lek-receptor.<br />
Informacje te stwarzały możliwość zbudowania<br />
analitycznego modelu interakcji związków chemicznych<br />
z tym receptorem, dla wstępnego przewidywania aktywności<br />
biologicznej potencjalnych jego ligandów.<br />
Receptory serotoninowe to długie, nierozgałęzione, zbudowane<br />
z kilkuset reszt aminokwasowych, łańcuchy białkowe.<br />
Dowody na istnienie różnych typów (klas) receptorów<br />
serotoninergicznych zostały przedstawione przez J. H. Gadduma<br />
i Z. Picarellego w 1957 roku [1]. Obecnie receptory<br />
te dzielimy na 7 typów, które dalej dzielą się na podtypy:<br />
5-HT 1<br />
(5-HT 1A<br />
, 5-HT 1B<br />
, 5-HT 1D<br />
, 5-HT 1E<br />
, 5-HT 1F<br />
), 5-HT 2<br />
(5-HT 2A<br />
, 5-HT 2B<br />
, 5-HT 2C<br />
), 5-HT 3<br />
, 5-HT 4<br />
(5-HT 4(a)<br />
, 5-HT 4(b)<br />
,<br />
5-HT 4(c)<br />
, 5-HT 4(d)<br />
), 5-HT 5<br />
(5-HT 5A<br />
, 5-HT 5B<br />
), 5-HT 6<br />
, 5-HT 7<br />
.<br />
Wszystkie należą do receptorów metabotropowych z wyjątkiem<br />
rodziny 5-HT 3<br />
, która zaliczana jest do klasy receptorów<br />
jonotropowych. Obecnie wiadomo, że reszta kwasu asparaginowego<br />
(Asp155), znajdująca się w III domenie trans<br />
34