Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici

KAZALO VSEBINE
ZAHVALA........................................................................................................ I
OKRAJŠAVE IN SIMBOLI ..........................................................................V
1. UVOD ........................................................................................................1
2. TEORETIČNE OSNOVE .......................................................................3
2.1. Ožigalkarji in njihova telesna zgradba ...................................................3
2.2. Klobučnjaki (Scyphozoa)..........................................................................4
2.3. Množična pojavljanja klobučnjaških meduz..........................................4
2.4. Klasična taksonomska uvrstitev velikega klobučnjaka (Rhizostoma
pulmo)................................................................................................................7
2.4.1 Opis vrste veliki klobučnjak...................................................................8
2.5. Uporaba mitohondrijske DNA v filogenetskih študijah........................9
2.5.1. Zgradba mitohondrijske DNA pri klobučnjakih ................................9
2.6. Sodobna filogenetska analiza klobučnjakov.........................................10
2.7. PCR reakcija............................................................................................11
2.8. Postopek ugotavljanja nukleotidnih zaporedij (sekvenciranje) .........12
2.9. Agarozna elektroforeza ..........................................................................12
3. EKSPERIMENTALNI DEL.................................................................14
3.1. Označevanje vzorcev...............................................................................14
3.2. Recepti za pripravo osnovnih raztopin in njihove koncentracije.......14
3.2.1. Puferske raztopine ...............................................................................14
3.2.2. Encimi: ..................................................................................................15
3.2.3. Velikostni standardi DNA:..................................................................16
3.2.4. Aparature..............................................................................................16
3.3. Vzorčenje na terenu ................................................................................16
3.4. Izolacija DNA ..........................................................................................17
VII