Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici

Pomnoževanje COI v naslednjih vzorcih iz Koprskega zaliva (11/06/RH5,
11/06/RH6, 11/06/RH5 redčenje (1:10), 11/06/RH6 redčenje (1:10) in v vzorcih iz
Črnega morja (08/05/RH3, 08/05/RH16, 08/05/RH B, 08/05/RH H, 08/05/RH N,
08/05/RH27, 08/05/RH31, 08/05/RH33, 08/05/RH C, 08/05/RH D, 08/05/RH E,
08/05/RH G) ni bilo uspešno. Rezultat pomnoževanja so nespecifični pomnožki, ki
so na sliki vidni kot lise. Pogoji pomnoževanja so bili naslednji: temperatura
naleganja 40º C, koncentraciji MgCl 2 1,5 mM in koncentracija začetnih
oligonukleotidov 0,5µM.
Slika 16: Pomnoževanje COI s PCR v vzorcih velikega klobučnjaka.
Rezultat PCR reakcije vzorcev z oznakami (od leve proti desni): 11/06/RH5,
11/06/RH6, 11/06/RH5 redčenje (1:10), 11/06/RH6 redčenje (1:10), 08/05/RH3,
08/05/RH16, 08/05/RH B, 08/05/RH H, 08/05/RH N, 08/05/RH27, 08/05/RH31,
08/05/RH33, 08/05/RH C, 08/05/RH D, 08/05/RH E, 08/05/RH G, velikostni standard
100bp DNA.
COI smo uspešno pomnožili (glej sliko 17) vzorcih: 07/05/RH3, 08/05/RH B,
08/05/RH H, 08/05/RH N, 08/05/RH C, 08/05/RH D, 08/05/RH E, 08/05/RH K.
Jakost pomnoženih fragmentov je bila različna in odvisna od količine in kvalitete
izolirane DNA (glej Tabela 3). V ostalih vzorcih nismo uspeli pomnožiti COI. V
vzorcih smo pomnožili tudi nespecifične produkte. COI smo pomnožili pri pogojih:
temperatura naleganja 40º C, koncentracija MgCl 2 1,5 mM, koncentracija začetnih
oligonukleotidov 0,5 µM.
38