Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici

Najprej smo pripravili ustrezne redčine izoliranih DNA po naslednji shemi :5µl DNA +
45 µl sterilne vode (glej tabelo 3). Količine dodane matrične DNA v PCR reakciji so
razvidne iz Tabele 4. Vzorcev, kjer smo izolirali malo DNA, nismo redčili.
Pomnožili smo 700bp dolg fragment COI, ki smo ga uspeli pomnožiti v 16-ih vzorcih.
Pomnoževanje je bilo uspešno v slabi tretjini vzorcev (27 odstotkih). Velikost
pomnoženih produktov smo določili s primerjavo z velikostnim standardom
GeneRuler 100bp DNA Ladder ((100–1000 bp) Fermentas na agaroznem gelu.
Tabela 4: Količina dodane matrične DNA v posamezni PCR reakciji ter uspešnost
pomnoževanja COI.
OZNAKA
VZORCA
REDČITEV
MATRIČNE
DNA
KONCENTRACIJA
REDČENE DNA
(ng/µl)
KOLIČINA
MATRIČNE
DNA (µL)
KONCENTRACIJA
MATRIČNE DNA V
PCR (ng)
06/05/RH43 1:10 Ni izmerjena 15 - +
06/05/RH46 1:10 Ni izmerjena 15 - +
08/05/RH16 292 10 2920 +
08/05/RH B 1 10 18 +
08/05/RH H 4100 10 41000 +
08/05/RH N 970 10 9702 +
07/05/RH3 0 3 0 +
06/05/RH43 10 - -
06/05/RH46 10 - -
07/05/RH3 1:10 0 5 0 -
07/05/RH4 1:10 1 5 7 -
08/05/RH4 1:10 0 5 1 -
08/05/RH27 1:10 78 10 787 +
08/05/RH31 1:10 15 5 76 +
08/05/RH33 1:10 18 5 94 +
08/05/RH D 1:10 11 10 118 +
08/05/RH E 1:10 15 5 76 +
08/05/RH G 1:10 99 5 499 +
08/05/RH K 1:10 37 5 185 -
08/05/RH M 1:10 10 5 54 -
08/05/RH12 732 7 5128 -
08/05/RH13 920 10 9207 -
08/05/RH15 970 10 9702 -
08/05/RH16 292 5 1460 -
07/05/RH6 19 5 99 +
12/06/RH1 148 1 148 -
12/06/RH2 232 1 232 +
12/06/RH3 193 1 193 +
11/06/RH1 29 1 29 -
11/06/RH2 54 1 54 -
11/06/RH3 108 1 108 +
11/06/RH4 757 1 757 -
11/06/RH5 74 1 74 -
11/06/RH6 113 1 113 -
11/06/RH5
redčina
11/06/RH6
redčina
1:10 7 5 37 -
1:10 11 5 56 -
USPEŠNOST
POMNOŽEVAN
JA COI
31