Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici

More documents

Recommendations

Info

Slika 8: DNA izolacija iz velikega klobučnjaka s DNeasy Blood & Tissue Kit ( QIAGEN). Prva steza: velikostni standard λ marker (5 µl), sledijo vzorci (od leve proti desni): 11/06RH7/1, 11/06RH7/2, 11/06RH1/1, 11/06RH1/2, 11/06RH2/1, 11/06RH2/2, 11/06RH3/1, 11/06RH3/2, 12/06/RH1/1, 12/06/RH1/2, 12/06/RH2/1, 12/06/RH2/2, 12/06/RH3/1, 12/06/RH3/2, 14/07/RH11/1, 14/07/RH11/2, 14/07/RH12/1, 14/07/RH12/2, 14/07/RH14/1, 14/07/RH14/2, 14/07/RH15/1, 14/07/RH15/2, 14/07/RH16/1, 14/07/RH16/2. Na vsako stezo smo nanesli 5 µl vzorca. Veliko količino DNA smo izolirali iz vzorcev 13/07/RH1 in 13/07/RH2, ki so bili nabrani v Tržaškem zalivu (glej Sliko 9). Izmerjena količina DNA je bila največja med vsemi vzorci in sicer 2000 ng/µl v vzorcu 13/07/RH1 in 2210 ng/µl v vzorcu 13/07/RH2. Izolirana DNA je bila delno razgrajena, a še vedno dovolj kvalitetna za nadaljnje manipulacije. 26
Slika 9: DNA izolacija iz velikega klobučnjaka s DNeasy Blood & Tissue Kit ( QIAGEN). Prva steza: velikostni standard λ marker (5 µl) sledijo vzorci (od leve proti desni): 07/05/RH1, 07/05/RH2, 07/05/RH3, 07/05/RH4, 07/05/RH5, 07/05/RH6, 07/05/ RH7,vzorci iz Koprskega zaliva: 13/07/RH1, 13/07/RH2. Na vsaki stezi je nanešeno 5 µl vzorca. Slika 9 je sestavljena iz dveh slik. 4.1.2. Izolacija DNA iz vzorcev nabranih v Črnem morju Manj uspešna je bila izolacija DNA iz vzorcev, ki so bili nabrani v Črnem morju in so bili shranjeni dlje časa (nabrani v septembru 2005) v 20% DMSO nasičenem z NaCl. Za izolacijo DNA smo uporabili tkivo z roba klobuka. Kadar je tkivo shranjeno v tem konzervansu dlje časa, postane bolj tekoče (Dawson in sod., 1998), zato smo ga morali odpipetirati v epico, v kateri je potekala izolacija DNA. DNA zelo dobre kvalitete smo izolirali iz vzorcev 07/05/RH1 in 07/05/RH5 (Slika 9). Izolacija DNA ni uspela iz vzorcev 07/05/RH2 in 07/05/RH3, kar smo potrdili tudi z spektrofotometričnimi meritvami. Koncentracija DNA je bila v razponu 15 ng/µl do 55 ng/µl, kar so bile najnižje izmerjene vrednosti izolirane DNA. 27
Page 1: UNIVERZA V NOVI GORICI FAKULTETA ZA
Page 5 and 6: POVZETEK Meduze velikega klobučnja
Page 7 and 8: OKRAJŠAVE IN SIMBOLI A............
Page 9 and 10: KAZALO VSEBINE ZAHVALA.............
Page 11 and 12: KAZALO SLIK Slika 1: Osnovna zgradb
Page 13 and 14: 1. UVOD Klobučnjaki (Scyphozoa) so
Page 15 and 16: 2. TEORETIČNE OSNOVE 2.1. Ožigalk
Page 17 and 18: spremembe v daljšem časovnem obdo
Page 19 and 20: sod., 2005). Na osnovi primerjalne
Page 21 and 22: 2.5. Uporaba mitohondrijske DNA v f
Page 23 and 24: starejšimi morfološkimi študijam
Page 25 and 26: nanesemo na gel, ki je pripravljen
Page 27 and 28: 10-krat koncentrirani PCR-pufer (Fe
Page 29 and 30: Black Sea Adriatic Sea Mediterranea
Page 31 and 32: smo si gel ogledali na transilumina
Page 33 and 34: GenBank. Za iskanje podobnih nukleo
Page 35 and 36: DATUM VZORČENJA MESTO VZORČENJA O
Page 37: Slika 7: DNA izolacija iz velikega
Page 41 and 42: Priporočena količina tkiva za izo
Page 43 and 44: Najprej smo pripravili ustrezne red
Page 45 and 46: Slika 11: Pomnoževanje COI s PCR v
Page 49 and 50: COI smo uspešno pomnožili (glej s
Page 53 and 54: 4.2.1. Reamplifikacija PCR Pri vzor
Page 55 and 56: COI smo uspešno pomnožili (glej s
Page 57 and 58: 11 98 RH805 RH811 RH807 RH808 RH703
Page 59 and 60: 5. ZAKLJUČKI Od leta 2003 so v Tr
Page 61 and 62: Dawson M.N., 2003. Macro-morphologi
Page 63 and 64: Lynam C.P., Gibbons M.J., Axelsen B
Page 65: PRILOGE 53
Page 68 and 69: tttaaacttncagggtgaccaaaaaatcaaaataa
Page 71: Priloga B: Poravnava nukleotidnih z
Page 75 and 76: Priloga D: Podobnost med nukleotidn

Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?