Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici

3.2.3. Velikostni standardi DNA:
• GeneRuler 100bp DNA Ladder (100-1000 bp, Fermentas)
• Lambda DNA/Hind III Marker, 2 (Fermentas); 23130 bp-125 bp
3.2.4. Aparature
- centrifuga (Sigma)
- ciklični termostat GeneAMP PCR system1400 (Perkin Elmer)
- vodna kopel
- napajalnik visoke napetosti za agarozno elektroforezo
- kadičke za agarozno gelsko elektroforezo
- modeli za agarozne gele
- spektrofotometer Bio Quest, CE 2501 (Cecil Instruments Limited, UK)
- detekcijski sistem za slikanje agaroznih gelov UVITEC (Cambridege, UK)
3.3. Vzorčenje na terenu
Opravili smo tri vzorčenja v Tržaškem zalivu v zimskem času (decembra 2006 in
februarja leta 2007). Za vzorčenje velikih klobučnjakov smo uporabljali povlečno
kočo, ki sta jo vlekli ribiški plovili Riba I in Riba II. Vzorčenje smo opravili tudi s
plovilom Sagita, ki je last Morske biološke postaje Nacionalnega inštituta za
biologijo. Pri vzorčenju s plovila Sagita smo si pomagali z mrežo za lovljenje meduz
na daljši palici.
Na plovilu smo vsako meduzo velikega klobučnjaka stehtali in izmerili premer
klobuka. Takoj, ko smo opravili meritve, smo meduzi odrezali košček tkiva z roba
klobuka in košček gonad s čisto pinceto in škarjami. Pinceto in škarje smo po
rezanju dobro sprali z morsko vodo, da smo preprečili kontaminacijo med vzorci.
Vsak košček tkiva smo shranili posebej v epici z konzervansom (20% DMSO
nasičen z NaCl ali v 96% alkoholu). Epico smo zaprli, ustrezno označili z imenom
vrste, datumom in lokacijo vzorčenja. Epice smo imeli ves čas v posodi z ledom,
dokler jih nismo shranili v tekočem dušiku. Za daljše obdobje smo epice nato shranili
globoko zamrznjene pri -80ºC. Pri vzorčenju smo si zaščitili roke z rokavicami iz
lateksa ali gume.
16