Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici
Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici
Rhizostoma pulmo - Univerza v Novi Gorici
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
starejšimi morfološkimi študijami (Mayer, 1910; Hyman, 1940; Thiel, 1966). To<br />
hipotezo potrjujejo tudi študije primerjav majhne ribosomalne podenote (SSU)<br />
(Collins, 2002), kot tudi na veliki ribosomski podenoti (LSU). Izmed treh družin redu<br />
Semeostomeae - Cyaneidae, Ulmaridae in Pelagiidae naj bi se zadnja družina<br />
najprej ločila. Znotraj skupine Rhizostomeae obstajata dve glavni skupini taksonov:<br />
Cepheida in Rhizostomida (Stiasny, 1922; Thiel, 1970), za katere je Thiel (1970)<br />
predpostavil, da so se razvile iz predstavnikov znotraj skupine Semaeostomeae.<br />
Družini Cepheidae z rodovoma Cassiopea in Cotylorhiza ter<br />
<strong>Rhizostoma</strong>tidae z rodovoma Catostylus in Stomolophus tvorita monofiletsko<br />
skupino (Collins in sod., 2006). Filogenetska analiza je bila narejena na vrstah iz<br />
rodov, ki so omenjeni zgoraj.<br />
2.7. PCR reakcija<br />
Verižna reakcija s polimerazo, znana tudi pod angleško kratico PCR (Polymerase<br />
Chain Reaction), je metoda, ki omogoča pomnoževanje odsekov DNA z encimom<br />
DNA polimeraza. Metoda posnema pomnoževanje DNA v celici. Za vsak fragment<br />
DNA, ki ga želimo pomnožiti s PCR, je potrebno poznavanje nukleotidnega<br />
zaporedja na obeh koncih tarčne verige DNA ter pripraviti ustrezen specifičen par<br />
začetnih oligonukleotidov. Temperaturni profil PCR je sestavljen iz ločitve obeh verig<br />
DNA (toplotna denaturacija), naleganja začetnih nukleotidov ter podaljševanja verig<br />
DNA. Pri optimizaciji protokola je potrebno upoštevati tudi druge dejavnike kot so<br />
koncentracije soli in nukleotidov, število kopij tarčne DNA, število ciklov ter čas<br />
trajanja posameznih ciklov (Suzuki in Giovannoni, 1996; Polz in Cavanaugh, 1998).<br />
Produkti pomnoževanja se v PCR eksponentno kopičijo.<br />
Ključnega pomena za PCR reakcijo je encim Taq polimeraza. Kratica Taq pomeni<br />
Thermus aquaticus, bakterijo, ki preživi in se razmnožuje v vročem okolju, ki je za<br />
druge organizme smrtno. V nasprotju z drugimi polimerazami je encim, ki izvira iz<br />
omenjene bakterije (in danes narejen iz genetsko spremenjene bakterije), stabilen<br />
pri visokih temperaturah zaradi česar lahko pomnoževanje poteka pri visokih<br />
temperaturah.<br />
11
Change language