13.06.2014 Views

Proslogodisnja ispitna pitanja s rjesenjima

Proslogodisnja ispitna pitanja s rjesenjima

Proslogodisnja ispitna pitanja s rjesenjima

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

NPR DSI_2g Ispit 2012.03.28 Student<br />

Napredna primjena računala<br />

1. Objasnite što su PubChem i EBI.<br />

2. Što su Matlab i GNU Octave i čemu služe?<br />

3. Objasni u koju formu treba prevesti nelinearnu funkciju y=f(x) da bi se mogao<br />

naći korjen funkcije metodom jednostavne iteracije.<br />

4. Koristeći metodu najmanjih kvadrata (N je broj eksperimentalnih točaka):<br />

N N<br />

2 eksperiment model<br />

<br />

<br />

y 2<br />

i<br />

yi<br />

i1 i1<br />

a. Izvedite jednadžbe za optimizaciju pravca.<br />

b. Izvedite jednadžbe za optimizaciju funkcije y = ae -kt (t je nezavisna vrijabla, a<br />

i k su parametri)<br />

5. Napišite kako teče informacija u stanici (skicirajte središnju dogmu molekularne<br />

biologije).<br />

6. Napišite Bayes-ov teorm, definirajte članove u izrazu i objasnite čemu služi<br />

7. Ako različitim stranama novčića pripišemo vrijednosti 0 i 1, te bacamo<br />

istovremeno dva ispravna novčića i jednu neispravnu kocku s vjerojatnošću<br />

pojave broja 1 od 20% i broja 2 od 80% kako izgleda distribucija vjerojatnosti<br />

svih mogućih stanja (zbrojeva)?<br />

8. Objasnite razliku između srednje vrijednosti i medijana.<br />

9. Imate problem za čiju analizu treba riješti sustav linearnih jednadžbi. Opišite<br />

slučaj u kojem to nije moguće i kako se može prepoznati?.<br />

10. Definirajte pravila za množenje matrica i objasnite zašto množenje matrica u<br />

principu nije komutativno. Navedite primjer matrica čije množenje jest<br />

komutativno.


NPR DSI_2g Ispit 2012.03.28 Student<br />

Rješenja<br />

1. Objasnite što su PubChem i EBI<br />

PubChem je slobodna baza kemijskih podataka u skolopu NCBI za spojeve,<br />

supstance i testove od medicinskog i biološkog interesa. EBI je European<br />

Bioinformatics Institute.<br />

2. Što su Matlab i GNU Octave i čemu služe?<br />

Jmol je program za molekularnu grafiku koji služi za prikazivanje<br />

trodimenzionalne strukture molekula. R je sistem za statističku obradu podataka.<br />

Oba su slobodni, otvoreni kod.<br />

3. Objasni u koju formu treba prevesti nelinearnu funkciju y=f(x) da bi se mogao<br />

naći korjen funkcije metodom jednostavne iteracije?<br />

Da bi mogli upotrebiti metodu jednostavne iteracije za nalaženje korjena<br />

nelinearne funkcije y=f(x) funkciju treba prevesti u formu x=g(x) koja daje<br />

iterativnu formulu x n+1 = g(x n )<br />

4. Koristeći metodu najmanjih kvadrata (N je broj eksperimentalnih točaka):<br />

N N<br />

2 eksperiment model<br />

<br />

<br />

y 2<br />

i<br />

yi<br />

i1 i1<br />

a. Izvedite jednadžbu za optimizaciju pravca<br />

N<br />

<br />

N<br />

2 eksperimentalni teorijski<br />

2<br />

i <br />

yi yi<br />

i1 i1<br />

N N<br />

2<br />

2<br />

i<br />

yi<br />

axb<br />

i1 i1<br />

N<br />

N<br />

2<br />

i<br />

2yi<br />

axbx0<br />

a<br />

i1 i1<br />

N<br />

N<br />

2<br />

i<br />

2yi<br />

axb0<br />

b<br />

i1 i1<br />

N N N<br />

2<br />

yx i i<br />

axi bxi<br />

0<br />

i1 i1 i1<br />

N<br />

<br />

N<br />

<br />

y a x bN<br />

0<br />

i<br />

i1 i1<br />

i<br />

b. Izvedite jednadžbe za optimizaciju funkcije y = ae -kt


NPR DSI_2g Ispit 2012.03.28 Student<br />

N<br />

<br />

N<br />

2 eksperimentalni teorijski<br />

i <br />

yi yi<br />

i1 i1<br />

N<br />

<br />

N<br />

2<br />

i<br />

<br />

i1 i1<br />

<br />

a<br />

<br />

k<br />

y<br />

N<br />

<br />

N<br />

2<br />

i<br />

i1 i1<br />

N<br />

<br />

N<br />

2<br />

kti<br />

i i i<br />

i1 i1<br />

N<br />

N<br />

kti<br />

i<br />

<br />

i1 i1<br />

N<br />

N<br />

kti<br />

i i<br />

<br />

i1 i1<br />

i<br />

ae<br />

kti<br />

2kti<br />

<br />

2<br />

kti<br />

kti<br />

2 y ae e 0<br />

i<br />

kti<br />

2 y ae te 0<br />

ye a e<br />

yte a te<br />

0<br />

2kti<br />

i<br />

0<br />

<br />

<br />

5. Napišite kako teče informacija u stanici (skicirate središnju dogmu molekularne<br />

biologije)<br />

<br />

2<br />

DNA RNA protein<br />

DNA služi kao permanentni repozitorij podataka (baza podataka), mRNA je<br />

program za kontrolu sinteze proteina, a proteini su strukturalni elementi ili mašine<br />

koje obavljaju specifične zadatke u stanici.<br />

6. Napišite Bayes-ov teorm, definirajte članove u izrazu i objasnite čemu služi<br />

Bayes-ov teorem: Teorem o relaciji izmedu dvije opozite uvjetne vjerojatnosti.<br />

Aposteriorna vjerojatnost (posterior probability) hipoteze H nakon observacije E<br />

ovisno o apriornoj vjerojatnosti (prior probability) H i uvjetnoj vjerojatnosti E uz<br />

zadano H.<br />

PE|<br />

HPH<br />

PH | E<br />

P E<br />

<br />

<br />

7. Ako različitim stranama novčića pripišemo vrijednosti 0 i 1, te bacamo<br />

istovremeno dva ispravna novčića i jednu neispravnu kocku s vjerojatnošćcu<br />

pojave broja 1 od 20% i broja 2 od 80% kako izgleda distribucija vjerojatnosti<br />

svih mogućih stanja (zbrojeva)?<br />

Prebrojavanjem mogućih ishoda i pripadnih vjerojatnosti dolazimo do distribucije<br />

vjerojatnosti:


NPR DSI_2g Ispit 2012.03.28 Student<br />

k \ n 00 01 10 11<br />

1 1 2 2 3<br />

2 2 3 3 4<br />

ishod vjerojatnost<br />

k \ n pk<br />

00 01 10 11<br />

1 0.05<br />

0.2 0.2 0.2 0.2<br />

1 0.2 2 0.30<br />

4 4 4 4<br />

3 0.45<br />

0.8 0.8 0.8 0.8<br />

2 0.8<br />

4 4 4 4<br />

4 0.20<br />

8. Objasnite razliku između srednje vrijednosti i medijana<br />

Srednja vrijednost je mjera centralne tendencije. Izračunava se tako da se zbroj<br />

podjeli s brojem elemenata<br />

x <br />

N<br />

<br />

i1<br />

N<br />

x<br />

i<br />

Medijan je središnji element niza. Da bi odredili medijan niza, potrebno je<br />

sortirati elemente niza i izabrati središnji element sortiranog niza


NPR DSI_2g Ispit 2012.03.28 Student<br />

9. Imate problem za čiju analizu treba riješti sustav linearnih jednadžbi. Opišite<br />

slučaj u kojem to nije moguće i kako se može prepoznati?.<br />

Ako je matrica sustava singularna, problem nema rješenja. To se može vidjeti iz<br />

determinante matrice sustava ili njenih vlastitih vrijednosti.<br />

10. Definirajte pravila za množenje matrica i objasnite zašto množenje matrica u<br />

principu nije komutativno. Navedite primjer matrica čije množenje jest<br />

komutativno<br />

C=AB.Množenje matrica zahtjeva da broj stupaca u prvoj matrici (A) bude jednak<br />

broju redova u drugoj matrici (B). Rezultantna matrica (C) ima jednak broj redova<br />

kao prva matrica (A) i broj stupaca kao druga matrica (B). Elementi matrice C su<br />

skalarni produkti pripadajućih redaka matrice A i stupaca matrice B. Ako su<br />

matrice A i B dijagonalne, množenje je komutativno. Ako je jedna od matrica<br />

inverzna matrica od druge, množenje je komutativno. Ako je jedna matrica<br />

jedinična matrica I, množenje je također komutativno.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!