Fluorescencija - TehniÄki fakultet u Rijeci
Fluorescencija - TehniÄki fakultet u Rijeci
Fluorescencija - TehniÄki fakultet u Rijeci
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Medicinska dijagnostika I<br />
Željko Jeričević, dr. sc.<br />
Zavod za računarstvo, Tehnički <strong>fakultet</strong> &<br />
Zavod za biologiju i medicinsku genetiku, Medicinski <strong>fakultet</strong><br />
51000 Rijeka, Croatia<br />
Phone: (+385) 51-651 594<br />
E-mail: zeljko.jericevic@riteh.hr<br />
http://www.riteh.uniri.hr/~zeljkoj/Zeljko_Jericevic.html<br />
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 2<br />
1
<strong>Fluorescencija</strong><br />
1. Udžbenici<br />
2. Povijest fluorescencije<br />
3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />
4. Fluorescentni spektrometar<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 3<br />
1. Udžbenici<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 4<br />
2
Ukratko<br />
1. Udžbenici<br />
2. Povijest fluorescencije<br />
3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />
4. Fluorescentni spektrometar<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 5<br />
Povijest<br />
metode:<br />
William<br />
Herschel<br />
On a case of superficial colour presented by a<br />
homogeneous liquid internally colourless. By Sir<br />
John<br />
Frederick William Herschel, Philosophical Translation<br />
of the Royal Society of London (1845) 135:143–145.<br />
Received January 28, 1845 — Read February 13, 1845<br />
“Though perfectly transparent and colorless when held between<br />
the eye and the light, or a white object, it yet exhibits in certain<br />
aspects, and under certain incidences of the light, an extremely<br />
vivid and beautiful celestial blue color, which, from the<br />
circumstances of its occurrence, would seem to originate in<br />
those strata which the light first penetrates in entering the<br />
liquid, and which, if not strictly superficial, at least exert their<br />
peculiar power of analyzing the incident rays and dispersing<br />
those which compose the tint in question, only through a very<br />
small depth within the medium.”<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 6<br />
3
Povijest<br />
metode:<br />
George<br />
Stokes<br />
On the Change of Refrangibility of Light. By G. G.<br />
Stokes, M.A., F.R.S., Fellow of Pembroke College,<br />
and Lucasian Professor of Mathematics in the<br />
University of Cambridge. Phil. Trans. Royal<br />
Society of London (1852) pp. 463-562.<br />
Received May 11, — Read May 27, 1852.<br />
“It appears from the experiments of Sir John Herschel that<br />
the blue color comes only from a stratum of fluid of small<br />
but finite thickness adjacent to the surface by which the<br />
light enters. After passing through this stratum, the<br />
incident light, though not sensibly enfeebled nor coloured,<br />
has lost the power of producing the same effect, and<br />
therefore may be considered as in some way or other<br />
qualitatively different from the original light."<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 7<br />
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 8<br />
4
Povijest metode:<br />
Aleksandar Jablonski<br />
Professor Alexander Jablonski, who is regarded<br />
as the father of fluorescence spectroscopy<br />
because of his many accomplishments, including<br />
descriptions of concentration depolarization and<br />
defining the term "anisotropy" to describe the<br />
polarized emission from solutions<br />
2010.05.26 9<br />
Povijest metode:<br />
Aleksandar Jablonski<br />
His work continued beyond his retirement in<br />
1968. Professor Jablonski created a<br />
spectroscopic school of thought that persists<br />
today through his numerous students, who<br />
now occupy positions at universities in Poland<br />
and elsewhere. Professor Jablonski died on<br />
September 9, 1980.<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 10<br />
5
Pitanja<br />
1. Ko je prvi opisao fenomen fluorescencije?<br />
2. Što je Stokesov efekt?<br />
3. Što je Jablonski dijagram?<br />
Ponovite prethodni materijal ako ne možete<br />
odgovoriti na pitanja<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 11<br />
Ukratko<br />
1. Udžbenici<br />
2. Povijest fluorescencije<br />
3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />
4. Fluorescentni spektrometar<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 12<br />
6
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 13<br />
Elektronski prelazi<br />
Frack-Condonov dijagram:<br />
Slika prikazuje apsorpciju<br />
zračenja iz osnovnog<br />
elektronskog stanja (E 0 ) u<br />
drugo vibracijsko stanje<br />
(v'=2) pobuñenog<br />
elektronskog stanja (E 1 ).<br />
Emisija fotona je iz (v'=0) u<br />
drugo vibracijsko stanje<br />
osnovnog elektronskog<br />
stanja (v”=2).<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 14<br />
(from Wikipedia)<br />
7
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 15<br />
<strong>Fluorescencija</strong><br />
Singlet state: All electrons in the molecule are spin-paired<br />
Triplet state: One set of electron spins is unpaired<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 16<br />
8
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 17<br />
Beer-Lambertov zakon<br />
l<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 18<br />
9
Beer-Lambertov zakon<br />
dI<br />
dz<br />
= − Iσ<br />
N<br />
Promjena intenziteta svijetla po dubini dI/dz<br />
proporcionalna je intenzitetu upadnog svijetla I,<br />
udarnom presjeku σ i broju molekula N po cm 3<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 19<br />
Beer-Lambertov zakon<br />
dI<br />
I<br />
I<br />
I0 0<br />
I<br />
log<br />
ln = − σ Nl<br />
log<br />
b<br />
x =<br />
I<br />
log<br />
0<br />
I<br />
log x<br />
( − log e)ln = σ Nl log e ln x =<br />
I<br />
log e<br />
I<br />
log<br />
I<br />
= −σ<br />
N dz<br />
0<br />
l<br />
dI<br />
du<br />
= − σ N dz = ln u + C<br />
I<br />
u<br />
∫ ∫ ∫<br />
= εlc<br />
= A<br />
2009.05.28 0<br />
Zeljko Jericevic, Ph.D. 20<br />
k<br />
k<br />
x<br />
b<br />
10
A<br />
T<br />
Beer-Lambertov zakon<br />
0<br />
= log = ε<br />
=<br />
I<br />
I<br />
0<br />
I<br />
I<br />
=10<br />
-A<br />
lc<br />
A je apsorbancija<br />
(ekstinkcija | optička<br />
gustoća)<br />
ε je molarni koeficijent<br />
apsorbancije<br />
c je koncentracija<br />
T je transmitacija<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 21<br />
Ograničenja za Beer-Lambertov<br />
zakon<br />
Beer-Lambertov zakon vrijedi za<br />
koncentracije kod kojih je meñusobna<br />
interakcija molekula zanemariva<br />
(c < 0.01 mol/l)<br />
Raspršenje svijetla smatra se zanemarivim<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 22<br />
11
Pitanja<br />
1. Objasni razliku izmedu tripleta i singleta<br />
2. Što je Franck-Condonov princip?<br />
3. Izvedi Beer-Lambertov zakon<br />
4. Što je apsorbancija a što transmitacija?<br />
5. Koje su limitacije Beer-Lambertova zakona?<br />
Ponovite prethodni materijal ako ne možete<br />
odgovoriti na pitanja<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 23<br />
Instrumentacija za fluorescenciju<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 24<br />
12
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 25<br />
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 26<br />
13
Tipični fluorofori<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 27<br />
Apsorpcija i emisija<br />
(zrcalna simetrija A&E)<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 28<br />
14
Apsorpcija i emisija<br />
(izuzeci zrcalne simetrije)<br />
HPTS<br />
1-hydroxypyrene-3,6,8-trisulfonate)<br />
U pobuñenom stanju<br />
ionizacija OH grupe je<br />
favorizirana<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 29<br />
Apsorpcija i emisija<br />
(izuzeci zrcalne simetrije)<br />
Stvaranje “charge transfer<br />
complex” izmeñu antracena i<br />
anilina dovodi do promjene<br />
emisionog spektra<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 30<br />
15
Apsorpcija i emisija<br />
(izuzeci zrcalne simetrije)<br />
Stvaranje “charge<br />
transfer complex”<br />
izmedu molekula pirena<br />
dovodi do promjene<br />
emisionog spektra<br />
(6x10 -3 do 9x10 -5 M)<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 31<br />
Kvantno iskorištenje<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 32<br />
16
Kvantno iskorištenje<br />
Γ<br />
Q = Γ + k<br />
Q<br />
Γ<br />
k<br />
nt<br />
nt<br />
je kvantno iskoristenje<br />
je konstanta brzine depopulacije pobudenog stanja emisijom fotona<br />
je konstanta brzine depopulacije pobudenog stanja nefotonskim procesima<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 33<br />
Kvantno iskorištenje i vrijeme<br />
života<br />
Teški atomi<br />
poput I tipično<br />
rezultiraju u<br />
kraćem<br />
vremenu života<br />
i nižem<br />
kvantnom<br />
iskorištenju<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 34<br />
17
Kvantno iskorištenje i vrijeme<br />
života<br />
1<br />
τ = Γ + k<br />
τ<br />
nt<br />
je vrijeme zivota pobudenog stanja<br />
1<br />
=<br />
Γ<br />
za k = 0<br />
τ<br />
τ<br />
n<br />
=<br />
Q<br />
τ τ postaje prirodno vrijeme zivota τ<br />
n nt n<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 35<br />
<strong>Fluorescencija</strong><br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 36<br />
18
Fluorofori, kvantno<br />
iskorištenje<br />
• Compound Solvent Exc Em QYield<br />
• Acridine_Orange Ethanol 493 535 0.46<br />
• Benzene Ethanol 248 300-350 0.04<br />
• Chlorophyll-A Ethanol 440 685 0.23<br />
• Eosin Water 521 544 0.16<br />
• Fluorescein Water 437 515 0.92<br />
• Rhodamine-B Ethanol 555 627 0.97<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 37<br />
Gašenje fluorescencije<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 38<br />
19
Osjetljivost fluorofora na okoliš<br />
Tyr (slobodni)<br />
_______<br />
Tyr u kalmodulinu & Ca -----------<br />
Tyr u kalmodulinu, no Ca ………...<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 39<br />
Osjetljivost fluorofora na okoliš<br />
Apomioglobin (ima<br />
hidrofobni džep za hem)<br />
Model membrane DMPC<br />
dimyristoyl-l-α-phosphatidylcholine<br />
Voda<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 40<br />
20
Osjetljivost<br />
fluorofora na okoliš<br />
Dostupnost florofora<br />
molekulama koje gase<br />
fluorescenciju. Q je ion I -<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 41<br />
Pitanja<br />
1. Što su florofori?<br />
2. Što je kvantno iskoristenje?<br />
3. Što je vrijeme života florofora?<br />
4. Što je spektralno prekrivanje?<br />
Ponovite prethodni materijal ako ne možete<br />
odgovoriti na pitanja<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 42<br />
21
Fluorescentna anizotropija<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 43<br />
Fluorescentna anizotropija<br />
Efekt asocijacije<br />
proteinskih molekula i<br />
mikroviskoziteta<br />
membrane na<br />
anizotropiju<br />
fluorescencije<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 44<br />
22
Fluorescentna anizotropija i<br />
polarizacija<br />
r<br />
=<br />
I<br />
|| ⊥<br />
I||<br />
+ 2I⊥<br />
I||<br />
− I⊥<br />
P I I<br />
=<br />
||<br />
− I<br />
+<br />
⊥<br />
anizotropija<br />
polarizacija<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 45<br />
RET<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 46<br />
23
RET<br />
1<br />
Efikasnost =<br />
⎛ r ⎞<br />
1+ ⎜ ⎟<br />
⎝ R0<br />
⎠<br />
Tyr-heme 2.5<br />
Trp-heme 2.8<br />
Tyr-DNS<br />
2.0<br />
Trp-DNS 2.0<br />
Trp-ANS 2.2<br />
DNS-DNS 0.9<br />
DNS-heme 6.0<br />
Tyr-NADH 2.5<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. Trp-NADH 2.5 47<br />
Flu-Rho<br />
4.5<br />
6<br />
Donor-Acceptor R 0 nm<br />
Phe-Phe<br />
0.6<br />
Phe-Tyr<br />
1.4<br />
Tyr-Tyr<br />
0.8<br />
Tyr-Trp<br />
1.5<br />
Trp-Trp<br />
0.6<br />
RET<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 48<br />
24
RET<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 49<br />
RET<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 50<br />
25
Stacionarna fluorescencija i<br />
fluorescencija u vremenu<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 51<br />
<strong>Fluorescencija</strong> u vremenu (kinetika 1 reda)<br />
dF( t)<br />
− = F( t)<br />
k<br />
dt<br />
F<br />
dF( t)<br />
F( t)<br />
F (0) 0<br />
du<br />
= − k dt = ln u + C<br />
u<br />
F( t)<br />
ln F( t) − ln F(0) = ln = −kt<br />
F(0)<br />
F( t) = F(0)<br />
e −<br />
t<br />
∫ ∫ ∫<br />
kt<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 52<br />
26
<strong>Fluorescencija</strong> u vremenu (kinetika 1<br />
reda)<br />
Vrijeme života τ=1/k<br />
Svojstveno vrijeme života τ 0 =1/k (pretpostavlja Q=1)<br />
F<br />
( τ ) =<br />
F<br />
(0)<br />
e<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 53<br />
Biokemijski flurofori<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 54<br />
27
Kovalentno vezani<br />
flurofori<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 55<br />
Flurescentni indikatori<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 56<br />
28
Asocijacija<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 57<br />
Multifotonska pobuda<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 58<br />
29
Ukratko<br />
1. Udžbenici<br />
2. Povijest fluorescencije<br />
3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />
4. Fluorescentni spektrometar<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 59<br />
Zadatak:<br />
Povući i pročitati poglavlje 2 iz:<br />
Joseph R. Lakowicz<br />
“Principles of Fluorescence Spectroscopy”<br />
3rd ed., 2006, XXVI, 954 p. 1255 illus., 1210 in<br />
color., ISBN: 978-0-387-31278-1<br />
http://www.springer.com/chemistry/analytical/book<br />
/978-0-387-31278-1<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 60<br />
30
Shema fluorescentnog spektroskopa<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 61<br />
Instrumenti za tehnike visoke<br />
učintkovitosti<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 62<br />
31
Idealni spektrometar<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 63<br />
Izvori pobude<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 64<br />
32
Izvori pobude<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 65<br />
Izvori pobude<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 66<br />
33
Optički filteri<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 67<br />
Fotomultiplikator kao detektor<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 68<br />
34
Materijali za<br />
fotomultiplikator<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 69<br />
Fotomultiplikator<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 70<br />
35
Fotomultiplikat<br />
or<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 71<br />
Polarizacija<br />
svjetla<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 72<br />
36
Greške kod<br />
mjerenja<br />
2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 73<br />
37