13.06.2014 Views

Fluorescencija - Tehnički fakultet u Rijeci

Fluorescencija - Tehnički fakultet u Rijeci

Fluorescencija - Tehnički fakultet u Rijeci

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Medicinska dijagnostika I<br />

Željko Jeričević, dr. sc.<br />

Zavod za računarstvo, Tehnički <strong>fakultet</strong> &<br />

Zavod za biologiju i medicinsku genetiku, Medicinski <strong>fakultet</strong><br />

51000 Rijeka, Croatia<br />

Phone: (+385) 51-651 594<br />

E-mail: zeljko.jericevic@riteh.hr<br />

http://www.riteh.uniri.hr/~zeljkoj/Zeljko_Jericevic.html<br />

<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 2<br />

1


<strong>Fluorescencija</strong><br />

1. Udžbenici<br />

2. Povijest fluorescencije<br />

3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />

4. Fluorescentni spektrometar<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 3<br />

1. Udžbenici<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 4<br />

2


Ukratko<br />

1. Udžbenici<br />

2. Povijest fluorescencije<br />

3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />

4. Fluorescentni spektrometar<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 5<br />

Povijest<br />

metode:<br />

William<br />

Herschel<br />

On a case of superficial colour presented by a<br />

homogeneous liquid internally colourless. By Sir<br />

John<br />

Frederick William Herschel, Philosophical Translation<br />

of the Royal Society of London (1845) 135:143–145.<br />

Received January 28, 1845 — Read February 13, 1845<br />

“Though perfectly transparent and colorless when held between<br />

the eye and the light, or a white object, it yet exhibits in certain<br />

aspects, and under certain incidences of the light, an extremely<br />

vivid and beautiful celestial blue color, which, from the<br />

circumstances of its occurrence, would seem to originate in<br />

those strata which the light first penetrates in entering the<br />

liquid, and which, if not strictly superficial, at least exert their<br />

peculiar power of analyzing the incident rays and dispersing<br />

those which compose the tint in question, only through a very<br />

small depth within the medium.”<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 6<br />

3


Povijest<br />

metode:<br />

George<br />

Stokes<br />

On the Change of Refrangibility of Light. By G. G.<br />

Stokes, M.A., F.R.S., Fellow of Pembroke College,<br />

and Lucasian Professor of Mathematics in the<br />

University of Cambridge. Phil. Trans. Royal<br />

Society of London (1852) pp. 463-562.<br />

Received May 11, — Read May 27, 1852.<br />

“It appears from the experiments of Sir John Herschel that<br />

the blue color comes only from a stratum of fluid of small<br />

but finite thickness adjacent to the surface by which the<br />

light enters. After passing through this stratum, the<br />

incident light, though not sensibly enfeebled nor coloured,<br />

has lost the power of producing the same effect, and<br />

therefore may be considered as in some way or other<br />

qualitatively different from the original light."<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 7<br />

<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 8<br />

4


Povijest metode:<br />

Aleksandar Jablonski<br />

Professor Alexander Jablonski, who is regarded<br />

as the father of fluorescence spectroscopy<br />

because of his many accomplishments, including<br />

descriptions of concentration depolarization and<br />

defining the term "anisotropy" to describe the<br />

polarized emission from solutions<br />

2010.05.26 9<br />

Povijest metode:<br />

Aleksandar Jablonski<br />

His work continued beyond his retirement in<br />

1968. Professor Jablonski created a<br />

spectroscopic school of thought that persists<br />

today through his numerous students, who<br />

now occupy positions at universities in Poland<br />

and elsewhere. Professor Jablonski died on<br />

September 9, 1980.<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 10<br />

5


Pitanja<br />

1. Ko je prvi opisao fenomen fluorescencije?<br />

2. Što je Stokesov efekt?<br />

3. Što je Jablonski dijagram?<br />

Ponovite prethodni materijal ako ne možete<br />

odgovoriti na pitanja<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 11<br />

Ukratko<br />

1. Udžbenici<br />

2. Povijest fluorescencije<br />

3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />

4. Fluorescentni spektrometar<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 12<br />

6


<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 13<br />

Elektronski prelazi<br />

Frack-Condonov dijagram:<br />

Slika prikazuje apsorpciju<br />

zračenja iz osnovnog<br />

elektronskog stanja (E 0 ) u<br />

drugo vibracijsko stanje<br />

(v'=2) pobuñenog<br />

elektronskog stanja (E 1 ).<br />

Emisija fotona je iz (v'=0) u<br />

drugo vibracijsko stanje<br />

osnovnog elektronskog<br />

stanja (v”=2).<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 14<br />

(from Wikipedia)<br />

7


<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 15<br />

<strong>Fluorescencija</strong><br />

Singlet state: All electrons in the molecule are spin-paired<br />

Triplet state: One set of electron spins is unpaired<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 16<br />

8


<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 17<br />

Beer-Lambertov zakon<br />

l<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 18<br />

9


Beer-Lambertov zakon<br />

dI<br />

dz<br />

= − Iσ<br />

N<br />

Promjena intenziteta svijetla po dubini dI/dz<br />

proporcionalna je intenzitetu upadnog svijetla I,<br />

udarnom presjeku σ i broju molekula N po cm 3<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 19<br />

Beer-Lambertov zakon<br />

dI<br />

I<br />

I<br />

I0 0<br />

I<br />

log<br />

ln = − σ Nl<br />

log<br />

b<br />

x =<br />

I<br />

log<br />

0<br />

I<br />

log x<br />

( − log e)ln = σ Nl log e ln x =<br />

I<br />

log e<br />

I<br />

log<br />

I<br />

= −σ<br />

N dz<br />

0<br />

l<br />

dI<br />

du<br />

= − σ N dz = ln u + C<br />

I<br />

u<br />

∫ ∫ ∫<br />

= εlc<br />

= A<br />

2009.05.28 0<br />

Zeljko Jericevic, Ph.D. 20<br />

k<br />

k<br />

x<br />

b<br />

10


A<br />

T<br />

Beer-Lambertov zakon<br />

0<br />

= log = ε<br />

=<br />

I<br />

I<br />

0<br />

I<br />

I<br />

=10<br />

-A<br />

lc<br />

A je apsorbancija<br />

(ekstinkcija | optička<br />

gustoća)<br />

ε je molarni koeficijent<br />

apsorbancije<br />

c je koncentracija<br />

T je transmitacija<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 21<br />

Ograničenja za Beer-Lambertov<br />

zakon<br />

Beer-Lambertov zakon vrijedi za<br />

koncentracije kod kojih je meñusobna<br />

interakcija molekula zanemariva<br />

(c < 0.01 mol/l)<br />

Raspršenje svijetla smatra se zanemarivim<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 22<br />

11


Pitanja<br />

1. Objasni razliku izmedu tripleta i singleta<br />

2. Što je Franck-Condonov princip?<br />

3. Izvedi Beer-Lambertov zakon<br />

4. Što je apsorbancija a što transmitacija?<br />

5. Koje su limitacije Beer-Lambertova zakona?<br />

Ponovite prethodni materijal ako ne možete<br />

odgovoriti na pitanja<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 23<br />

Instrumentacija za fluorescenciju<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 24<br />

12


<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 25<br />

<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 26<br />

13


Tipični fluorofori<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 27<br />

Apsorpcija i emisija<br />

(zrcalna simetrija A&E)<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 28<br />

14


Apsorpcija i emisija<br />

(izuzeci zrcalne simetrije)<br />

HPTS<br />

1-hydroxypyrene-3,6,8-trisulfonate)<br />

U pobuñenom stanju<br />

ionizacija OH grupe je<br />

favorizirana<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 29<br />

Apsorpcija i emisija<br />

(izuzeci zrcalne simetrije)<br />

Stvaranje “charge transfer<br />

complex” izmeñu antracena i<br />

anilina dovodi do promjene<br />

emisionog spektra<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 30<br />

15


Apsorpcija i emisija<br />

(izuzeci zrcalne simetrije)<br />

Stvaranje “charge<br />

transfer complex”<br />

izmedu molekula pirena<br />

dovodi do promjene<br />

emisionog spektra<br />

(6x10 -3 do 9x10 -5 M)<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 31<br />

Kvantno iskorištenje<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 32<br />

16


Kvantno iskorištenje<br />

Γ<br />

Q = Γ + k<br />

Q<br />

Γ<br />

k<br />

nt<br />

nt<br />

je kvantno iskoristenje<br />

je konstanta brzine depopulacije pobudenog stanja emisijom fotona<br />

je konstanta brzine depopulacije pobudenog stanja nefotonskim procesima<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 33<br />

Kvantno iskorištenje i vrijeme<br />

života<br />

Teški atomi<br />

poput I tipično<br />

rezultiraju u<br />

kraćem<br />

vremenu života<br />

i nižem<br />

kvantnom<br />

iskorištenju<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 34<br />

17


Kvantno iskorištenje i vrijeme<br />

života<br />

1<br />

τ = Γ + k<br />

τ<br />

nt<br />

je vrijeme zivota pobudenog stanja<br />

1<br />

=<br />

Γ<br />

za k = 0<br />

τ<br />

τ<br />

n<br />

=<br />

Q<br />

τ τ postaje prirodno vrijeme zivota τ<br />

n nt n<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 35<br />

<strong>Fluorescencija</strong><br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 36<br />

18


Fluorofori, kvantno<br />

iskorištenje<br />

• Compound Solvent Exc Em QYield<br />

• Acridine_Orange Ethanol 493 535 0.46<br />

• Benzene Ethanol 248 300-350 0.04<br />

• Chlorophyll-A Ethanol 440 685 0.23<br />

• Eosin Water 521 544 0.16<br />

• Fluorescein Water 437 515 0.92<br />

• Rhodamine-B Ethanol 555 627 0.97<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 37<br />

Gašenje fluorescencije<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 38<br />

19


Osjetljivost fluorofora na okoliš<br />

Tyr (slobodni)<br />

_______<br />

Tyr u kalmodulinu & Ca -----------<br />

Tyr u kalmodulinu, no Ca ………...<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 39<br />

Osjetljivost fluorofora na okoliš<br />

Apomioglobin (ima<br />

hidrofobni džep za hem)<br />

Model membrane DMPC<br />

dimyristoyl-l-α-phosphatidylcholine<br />

Voda<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 40<br />

20


Osjetljivost<br />

fluorofora na okoliš<br />

Dostupnost florofora<br />

molekulama koje gase<br />

fluorescenciju. Q je ion I -<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 41<br />

Pitanja<br />

1. Što su florofori?<br />

2. Što je kvantno iskoristenje?<br />

3. Što je vrijeme života florofora?<br />

4. Što je spektralno prekrivanje?<br />

Ponovite prethodni materijal ako ne možete<br />

odgovoriti na pitanja<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 42<br />

21


Fluorescentna anizotropija<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 43<br />

Fluorescentna anizotropija<br />

Efekt asocijacije<br />

proteinskih molekula i<br />

mikroviskoziteta<br />

membrane na<br />

anizotropiju<br />

fluorescencije<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 44<br />

22


Fluorescentna anizotropija i<br />

polarizacija<br />

r<br />

=<br />

I<br />

|| ⊥<br />

I||<br />

+ 2I⊥<br />

I||<br />

− I⊥<br />

P I I<br />

=<br />

||<br />

− I<br />

+<br />

⊥<br />

anizotropija<br />

polarizacija<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 45<br />

RET<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 46<br />

23


RET<br />

1<br />

Efikasnost =<br />

⎛ r ⎞<br />

1+ ⎜ ⎟<br />

⎝ R0<br />

⎠<br />

Tyr-heme 2.5<br />

Trp-heme 2.8<br />

Tyr-DNS<br />

2.0<br />

Trp-DNS 2.0<br />

Trp-ANS 2.2<br />

DNS-DNS 0.9<br />

DNS-heme 6.0<br />

Tyr-NADH 2.5<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. Trp-NADH 2.5 47<br />

Flu-Rho<br />

4.5<br />

6<br />

Donor-Acceptor R 0 nm<br />

Phe-Phe<br />

0.6<br />

Phe-Tyr<br />

1.4<br />

Tyr-Tyr<br />

0.8<br />

Tyr-Trp<br />

1.5<br />

Trp-Trp<br />

0.6<br />

RET<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 48<br />

24


RET<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 49<br />

RET<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 50<br />

25


Stacionarna fluorescencija i<br />

fluorescencija u vremenu<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 51<br />

<strong>Fluorescencija</strong> u vremenu (kinetika 1 reda)<br />

dF( t)<br />

− = F( t)<br />

k<br />

dt<br />

F<br />

dF( t)<br />

F( t)<br />

F (0) 0<br />

du<br />

= − k dt = ln u + C<br />

u<br />

F( t)<br />

ln F( t) − ln F(0) = ln = −kt<br />

F(0)<br />

F( t) = F(0)<br />

e −<br />

t<br />

∫ ∫ ∫<br />

kt<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 52<br />

26


<strong>Fluorescencija</strong> u vremenu (kinetika 1<br />

reda)<br />

Vrijeme života τ=1/k<br />

Svojstveno vrijeme života τ 0 =1/k (pretpostavlja Q=1)<br />

F<br />

( τ ) =<br />

F<br />

(0)<br />

e<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 53<br />

Biokemijski flurofori<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 54<br />

27


Kovalentno vezani<br />

flurofori<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 55<br />

Flurescentni indikatori<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 56<br />

28


Asocijacija<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 57<br />

Multifotonska pobuda<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 58<br />

29


Ukratko<br />

1. Udžbenici<br />

2. Povijest fluorescencije<br />

3. Fizikalni i kemijski procesi u fluorescenciji<br />

4. Fluorescentni spektrometar<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 59<br />

Zadatak:<br />

Povući i pročitati poglavlje 2 iz:<br />

Joseph R. Lakowicz<br />

“Principles of Fluorescence Spectroscopy”<br />

3rd ed., 2006, XXVI, 954 p. 1255 illus., 1210 in<br />

color., ISBN: 978-0-387-31278-1<br />

http://www.springer.com/chemistry/analytical/book<br />

/978-0-387-31278-1<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 60<br />

30


Shema fluorescentnog spektroskopa<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 61<br />

Instrumenti za tehnike visoke<br />

učintkovitosti<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 62<br />

31


Idealni spektrometar<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 63<br />

Izvori pobude<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 64<br />

32


Izvori pobude<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 65<br />

Izvori pobude<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 66<br />

33


Optički filteri<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 67<br />

Fotomultiplikator kao detektor<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 68<br />

34


Materijali za<br />

fotomultiplikator<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 69<br />

Fotomultiplikator<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 70<br />

35


Fotomultiplikat<br />

or<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 71<br />

Polarizacija<br />

svjetla<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 72<br />

36


Greške kod<br />

mjerenja<br />

2009.05.28 Zeljko Jericevic, Ph.D. 73<br />

37

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!