Zbirka rijesenih zadataka - PBF - Sveučilište u Zagrebu

Zbirka rijesenih zadataka - PBF - Sveučilište u Zagrebu Zbirka rijesenih zadataka - PBF - Sveučilište u Zagrebu

16.05.2014 Views

Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i automatizacija 2007/2008 14 Zadatak 6. Kinetika enzimske reakcije mjeri se spektrometrijski u kiveti tijekom 28 sekundi od početne koncentracije supstrata od 100 mmol L -1 . Vrijednosti koncentracije zapisivani su u vremenskim razmacima od 2 sekunde i prikazani su grafički a numeričke vrijednosti su dane u tablici. c s Redni broj eksperimentalnog podatka Slika. 1. Grafički prikaz eksperimentalnih podataka mjerene koncentracije t/s 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 c S 100 96,3 92,5 88,5 84,4 80,1 75,6 70,8 65,8 60,4 54,5 48,1 41 32,5 22,4 Raspodjela koncentracije tijekom eksperimenta pokazuje sporu promjenu u početku za velike koncentracije supstrata, a zatim nagli pad koncentracije u području manjih koncentracija. Na osnovu ovog zapažanja pretpostavljeno je da se radi o kinetici s inhibicijom supstratom i zadatak je procijeniti kinetičke parametre u izrazu: ( c ) = ⋅ s v s vm 2 cs K S + cs + K I a) Lineariziraje kinetički model i definirajte matrice podataka za procjenu parametara primjenom metode najmanjih kvadrata. b) Procijenite parametre lineariziranog modela i izračunajte kinetičke parametre. c) Usporedite rezultate procjene s eksperimentalnim podacima. c Rješenje: AD a) Kinetički model lineariziramo odreñivanjem recipročne brzine reakcije (Lineweaver-Burk-ov pravac): 1 v ( c ) s 1 = v m K + v s m 1 ⋅ c s + K S 1 ⋅ K I ⋅ c s odnosno kao linearnu funkciju redefiniranih varijabli i parametara. Linearna funkcija glasi:

Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i automatizacija 2007/2008 15 y = b sa slijedećim definiranim varijablama: i novim parametrima: 0 + b1 ⋅ x1 + b2 ⋅ x2 y 1 1 = c = x1 = x2 v( cs ) cs s b 0 1 = v m b 1 = K v S m b 2 = K S 1 ⋅ K I AD b) Na osnovu lineariziranog modela definiramo slijedeće matrice podataka ⎛ y ⎞ ⎛ 1 1 ⎜ ⎟ ⎜ ⎜ y ⎟ ⎜ 1 2 ⎜ ⎟ = ... ⎜... ⎜ ⎟ ⎜ ⎝ y15 ⎠ ⎝ 1 x x x 1,1 2,1 ... 16,1 x x x 1,2 2,2 ... 16,2 ⎞ ⎟ ⎛b ⎟ ⎜ ⎟ ⋅⎜ b ⎟ ⎜ ⎝b ⎠ 0 1 2 ⎞ ⎟ ⎟ ⎟ ⎠ Uvrstimo izmjerene podatke i dobijemo: Parametri se procijene metodom najmanjih kvadrata: b = T −1 T ( X ⋅ X) ⋅ X ⋅ Y Za izračunavanje matričnih operacija najbolje je upotrijebiti računalni program, na primjer kao što su Mathematica ili MatLab. Prvo izračunamo produkt transponirane matrice ulaznih podataka

Ž. Kurtanjek: <strong>PBF</strong> Mjerenja i automatizacija 2007/2008 14<br />

Zadatak 6.<br />

Kinetika enzimske reakcije mjeri se spektrometrijski u kiveti tijekom 28<br />

sekundi od početne koncentracije supstrata od 100 mmol L -1 . Vrijednosti<br />

koncentracije zapisivani su u vremenskim razmacima od 2 sekunde i prikazani su<br />

grafički a numeričke vrijednosti su dane u tablici.<br />

c s<br />

Redni broj eksperimentalnog podatka<br />

Slika. 1. Grafički prikaz eksperimentalnih podataka mjerene koncentracije<br />

t/s 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28<br />

c S 100 96,3 92,5 88,5 84,4 80,1 75,6 70,8 65,8 60,4 54,5 48,1 41 32,5 22,4<br />

Raspodjela koncentracije tijekom eksperimenta pokazuje sporu promjenu u početku<br />

za velike koncentracije supstrata, a zatim nagli pad koncentracije u području manjih<br />

koncentracija. Na osnovu ovog zapažanja pretpostavljeno je da se radi o kinetici s<br />

inhibicijom supstratom i zadatak je procijeniti kinetičke parametre u izrazu:<br />

( c )<br />

=<br />

⋅<br />

s<br />

v<br />

s<br />

vm<br />

2<br />

cs<br />

K<br />

S<br />

+ cs<br />

+<br />

K<br />

I<br />

a) Lineariziraje kinetički model i definirajte matrice podataka za procjenu<br />

parametara primjenom metode najmanjih kvadrata.<br />

b) Procijenite parametre lineariziranog modela i izračunajte kinetičke parametre.<br />

c) Usporedite rezultate procjene s eksperimentalnim podacima.<br />

c<br />

Rješenje:<br />

AD a) Kinetički model lineariziramo odreñivanjem recipročne brzine reakcije<br />

(Lineweaver-Burk-ov pravac):<br />

1<br />

v<br />

( c )<br />

s<br />

1<br />

=<br />

v<br />

m<br />

K<br />

+<br />

v<br />

s<br />

m<br />

1<br />

⋅<br />

c<br />

s<br />

+<br />

K<br />

S<br />

1<br />

⋅ K<br />

I<br />

⋅ c<br />

s<br />

odnosno kao linearnu funkciju redefiniranih varijabli i parametara. Linearna<br />

funkcija glasi:

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!