Zbirka rijesenih zadataka - PBF - Sveučilište u Zagrebu
Zbirka rijesenih zadataka - PBF - Sveučilište u Zagrebu Zbirka rijesenih zadataka - PBF - Sveučilište u Zagrebu
Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i automatizacija 2007/2008 14 Zadatak 6. Kinetika enzimske reakcije mjeri se spektrometrijski u kiveti tijekom 28 sekundi od početne koncentracije supstrata od 100 mmol L -1 . Vrijednosti koncentracije zapisivani su u vremenskim razmacima od 2 sekunde i prikazani su grafički a numeričke vrijednosti su dane u tablici. c s Redni broj eksperimentalnog podatka Slika. 1. Grafički prikaz eksperimentalnih podataka mjerene koncentracije t/s 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 c S 100 96,3 92,5 88,5 84,4 80,1 75,6 70,8 65,8 60,4 54,5 48,1 41 32,5 22,4 Raspodjela koncentracije tijekom eksperimenta pokazuje sporu promjenu u početku za velike koncentracije supstrata, a zatim nagli pad koncentracije u području manjih koncentracija. Na osnovu ovog zapažanja pretpostavljeno je da se radi o kinetici s inhibicijom supstratom i zadatak je procijeniti kinetičke parametre u izrazu: ( c ) = ⋅ s v s vm 2 cs K S + cs + K I a) Lineariziraje kinetički model i definirajte matrice podataka za procjenu parametara primjenom metode najmanjih kvadrata. b) Procijenite parametre lineariziranog modela i izračunajte kinetičke parametre. c) Usporedite rezultate procjene s eksperimentalnim podacima. c Rješenje: AD a) Kinetički model lineariziramo odreñivanjem recipročne brzine reakcije (Lineweaver-Burk-ov pravac): 1 v ( c ) s 1 = v m K + v s m 1 ⋅ c s + K S 1 ⋅ K I ⋅ c s odnosno kao linearnu funkciju redefiniranih varijabli i parametara. Linearna funkcija glasi:
Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i automatizacija 2007/2008 15 y = b sa slijedećim definiranim varijablama: i novim parametrima: 0 + b1 ⋅ x1 + b2 ⋅ x2 y 1 1 = c = x1 = x2 v( cs ) cs s b 0 1 = v m b 1 = K v S m b 2 = K S 1 ⋅ K I AD b) Na osnovu lineariziranog modela definiramo slijedeće matrice podataka ⎛ y ⎞ ⎛ 1 1 ⎜ ⎟ ⎜ ⎜ y ⎟ ⎜ 1 2 ⎜ ⎟ = ... ⎜... ⎜ ⎟ ⎜ ⎝ y15 ⎠ ⎝ 1 x x x 1,1 2,1 ... 16,1 x x x 1,2 2,2 ... 16,2 ⎞ ⎟ ⎛b ⎟ ⎜ ⎟ ⋅⎜ b ⎟ ⎜ ⎝b ⎠ 0 1 2 ⎞ ⎟ ⎟ ⎟ ⎠ Uvrstimo izmjerene podatke i dobijemo: Parametri se procijene metodom najmanjih kvadrata: b = T −1 T ( X ⋅ X) ⋅ X ⋅ Y Za izračunavanje matričnih operacija najbolje je upotrijebiti računalni program, na primjer kao što su Mathematica ili MatLab. Prvo izračunamo produkt transponirane matrice ulaznih podataka
- Page 1 and 2: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 3 and 4: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 5 and 6: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 7 and 8: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 9 and 10: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 11 and 12: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 13: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 17 and 18: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 19 and 20: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 21 and 22: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 23 and 24: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 25 and 26: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 27 and 28: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 29 and 30: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 31 and 32: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 33 and 34: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 35 and 36: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 37 and 38: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 39 and 40: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 41 and 42: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 43 and 44: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 45 and 46: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 47 and 48: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 49 and 50: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 51 and 52: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 53 and 54: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
- Page 55: Ž. Kurtanjek: PBF Mjerenja i autom
Ž. Kurtanjek: <strong>PBF</strong> Mjerenja i automatizacija 2007/2008 14<br />
Zadatak 6.<br />
Kinetika enzimske reakcije mjeri se spektrometrijski u kiveti tijekom 28<br />
sekundi od početne koncentracije supstrata od 100 mmol L -1 . Vrijednosti<br />
koncentracije zapisivani su u vremenskim razmacima od 2 sekunde i prikazani su<br />
grafički a numeričke vrijednosti su dane u tablici.<br />
c s<br />
Redni broj eksperimentalnog podatka<br />
Slika. 1. Grafički prikaz eksperimentalnih podataka mjerene koncentracije<br />
t/s 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28<br />
c S 100 96,3 92,5 88,5 84,4 80,1 75,6 70,8 65,8 60,4 54,5 48,1 41 32,5 22,4<br />
Raspodjela koncentracije tijekom eksperimenta pokazuje sporu promjenu u početku<br />
za velike koncentracije supstrata, a zatim nagli pad koncentracije u području manjih<br />
koncentracija. Na osnovu ovog zapažanja pretpostavljeno je da se radi o kinetici s<br />
inhibicijom supstratom i zadatak je procijeniti kinetičke parametre u izrazu:<br />
( c )<br />
=<br />
⋅<br />
s<br />
v<br />
s<br />
vm<br />
2<br />
cs<br />
K<br />
S<br />
+ cs<br />
+<br />
K<br />
I<br />
a) Lineariziraje kinetički model i definirajte matrice podataka za procjenu<br />
parametara primjenom metode najmanjih kvadrata.<br />
b) Procijenite parametre lineariziranog modela i izračunajte kinetičke parametre.<br />
c) Usporedite rezultate procjene s eksperimentalnim podacima.<br />
c<br />
Rješenje:<br />
AD a) Kinetički model lineariziramo odreñivanjem recipročne brzine reakcije<br />
(Lineweaver-Burk-ov pravac):<br />
1<br />
v<br />
( c )<br />
s<br />
1<br />
=<br />
v<br />
m<br />
K<br />
+<br />
v<br />
s<br />
m<br />
1<br />
⋅<br />
c<br />
s<br />
+<br />
K<br />
S<br />
1<br />
⋅ K<br />
I<br />
⋅ c<br />
s<br />
odnosno kao linearnu funkciju redefiniranih varijabli i parametara. Linearna<br />
funkcija glasi: