Sborník příspěvků z workshopu MICROMYCO 2008 - Ústav půdní ...

Diversita houbových společenstev zasolených a kyselých půd Národní
přírodní rezervace Soos
MARTINA HUJSLOVÁ, MIROSLAV KOLAŘÍK, ALENA KUBÁTOVÁ, MILADA CHUDÍČKOVÁ
HUJSLOVÁ, M., KOLAŘÍK, M., KUBÁTOVÁ, A., CHUDÍČKOVÁ, M.: Diversity of fungal communities in saline
and acidic soils in National Natural Reserve Soos, Czech Republic.
Proceedings from the MICROMYCO 2008, Nováková, A. (Ed.): pp. 25-26. ISB BC AS CR, v.v.i., 2008. ISBN
978-80-86525-12-9
During 2003-2005 the diversity of soil culturable filamentous microfungi in saline and acidic soils of
National Natural Reserve Soos (Czech Republic) was studied and the growth response of the selected strains to
different salinities and pH values was determined. Altogether 28 soil samples were obtained from four sampling
sites. Two different cultivation methods and isolation media and, three incubation temperatures were used.
Taxonomic identification of fungal isolates was based on morphological characteristics. In addition three rDNA
regions and b-tubulin gene were used to characterize the selected morphologically undeterminable strains.
Altogether 92 taxa, representing 38 genera were obtained from 28 soil samples. The prevailing genus was
Penicillium (18 species). The majority of species were recorded scarcely. Only one species Penicillium sp. 1 was
found at a frequency exceeding 50 % of all samples. Several taxa belong to fungal groups known from similar
sites worldwide, however the observed fungal spectrum is rather unique, in comparison to similar studies.
Comparing four sampling sites, their fungal communities differ considerably. The results of the growth tests
indicate high adaptability of all tested species to the extreme conditions of the studied substrate.
Keywords: filamentous microfungi, saline and acid soils, NNR Soos
Martina Hujslová, Alena Kubátová, Department of Botany, Faculty of Science, Charles University, Benátská 2,
128 01 Praha 2, Czech Republic. E-mail: pinkponk@seznam.cz, kubatova@natur.cuni.cz
Miroslav Kolařík, Milada Chudíčková, Institute of Microbiology CAS, 142 20 Praha 4, Czech Republic. E-mail:
mkolarik@biomed.cas.cz, chudickova@seznam.cz
∗ Presented at workshop MICROMYCO 2008, České Budějovice, Czech Republic, September 2-3, 2008.
Národní přírodní rezervace Soos je unikátní lokalitou, která v našich klimatických
podmínkách nemá obdobu. Půdy vyskytující se na území rezervace jsou charakteristické
výrazným zasolením a místy extrémně nízkými hodnotami pH (1-2). V letech 2003 – 2005
byla v substrátu NPR Soos zkoumána diverzita saprotrofních mikroskopických půdních hub.
Pro izolaci hub byly použity dvě izolační metody (přímá inokulace, zřeďovací metoda), dvě
kultivační media (SL2, SEA) a tři inkubační teploty (5, 24 a 37°C). Získané izoláty byly
determinovány na základě morfologických znaků. V případě morfologicky obtížně
určitelných kmenů byly navíc použity molekulárně taxonomické metody (charakterizace
pomocí r-DNA (ITS, SSU a LSU) a genu pro β-tubulin). Součástí studie bylo rovněž srovnání
houbových společenstev čtyř studovaných odběrových ploch lišících se množstvím
rostlinného pokryvu, zasolením substrátu, hodnotami pH a půdní vlhkostí. U vybraných
dominantních a případných nových druhů byl v souvislosti se specifickými půdními
podmínkami studovaného substrátu testován jejich růst na médiích (MEA) o různém pH (1-8)
a různé salinitě (0M, 0,25M, 0,5M Na 2 SO 4 ).
Z celkového počtu 28 půdních vzorků bylo izolováno celkem 799 kmenů, z nichž bylo
získáno 92 taxonů půdních mikromycetů patřících do 38 určených rodů. Celkem 150 izolátů
bylo typováno pomocí RAPD a 67 z nich dále charakterizováno sekvencemi r-DNA a β-
tubulinu. Největší počet zástupců patřil do rodu Penicillium (18 druhů). Převážná většina
druhů byla zaznamenána vzácně (s frekvencí výskytu nepřesahující 12,5 % všech vzorků) a
nelze ji tedy se studovaným substrátem přímo spojovat. V případě několika málo druhů
izolovaných s vyšší frekvencí výskytu se naopak dá předpokládat, že tvoří základ houbového
25