Sborník příspěvků z workshopu MICROMYCO 2008 - Ústav půdní ...

Travní druhy rzí s aecii na Ranunculus a Ficaria – molekulární analýza
MARKÉTA HEJNÁ, MIROSLAV KOLAŘÍK, JAROSLAVA MARKOVÁ
HEJNÁ, M., KOLAŘÍK, M., MARKOVÁ, J.: Molecular analysis of grass rust fungi having aecia on
Ranunculus and Ficaria.
Proceedings from the MICROMYCO 2008, Nováková, A. (Ed.): p. 24. ISB BC AS CR, v.v.i., 2008. ISBN
978-80-86525-12-9
Byla úspěšně izolována DNA z čerstvých aecií, uredií i telií a také z několika položek herbářových. Získaná
DNA byla použitelná pro PCR amplifikaci rDNA oblastí i další PCR metody. Byly amplifikovány ITS a LSU
oblasti rDNA. Celkem byly získány ITS sekvence 42 vzorků a LSU sekvence 30 vzorků.
Na základě analýzy ITS sekvencí byly vzorky aecií na Ranunculus a Ficaria rozčleněny do skupin a srovnáním se
sekvencemi z materiálu teliálního přiřazeny k jednotlivým druhům. Velmi výrazně se od ostatních odčlenil druh P.
magnusiana. Ostatní vzorky si byly více příbuzné, přesto se s vysokou bootstrapovou podporou rozčlenily do druhů
P. perplexans, U. dactylidis a U. poae. Všechny vzorky aecií z Ficaria verna byly na základě sekvencí přiřazeny k
druhu U. poae a všechny vzorky z Ranunculus acris byly přiřazeny k druhu P. perplexans. Aecia z Ranunculus
repens byla přiřazena buď k U. poae, P. magnusiana, nebo zůstala nepřiřazena.
Sekvence ITS oblastí studovaných druhů byly porovnány s publikovanými sekvencemi blízce příbuzných
druhů. Potvrdilo se, že druhy U. dactylidis, U. poae a P. perplexans patří do skupiny hnědých rzí. P. magnusiana
není zbylým druhům příbuzná, což odpovídá dosavadnímu taxonomickému hodnocení. Sekvence LSU oblasti byly
využity pro podporu rozdělení vzorků pomocí ITS. Také byly použity k ověření příbuznosti druhů U. poae a U.
ficariae (teorie tzv. correlated species). Bylo potvrzeno, že druhy nejsou blízce příbuzné.
V morfologii aeciospor byly nalezeny určité morfologické odlišnosti ve velikosti. Od ostatních se odlišovaly
zejména aeciospory druhu U. poae, které byly menší. V ornamentice povrchu aeciospor nebyla nalezena žádná
charakteristická mezidruhová odlišnost.
Keywords: ITS analysis, Puccinia perplexans, P. magnusiana, Uromyces dactylidis, U. poae
Markéta Hejná, Miroslav Kolařík, Jaroslava Marková, Department of Botany, Faculty of Science, Charles
University, Benátská 2, 128 01 Praha 2, Czech Republic. E-mail: marketahejna@seznam.cz
∗ Presented at workshop MICROMYCO 2008, České Budějovice, Czech Republic, September 2-3, 2008.
24