Fragment based drug design
Fragment based drug design Fragment based drug design
Thrombin fragment identification Novel hits S1 Neutral Fragment • S2/S4 fragment potency 10μM •Linked S1 and S2/S4 fragment: new hybrid compound potency 200nM Novel binding sites S2-S4 Fragment
S4-pocket Inhibitory trombinu O Melagatran O NH N NH OH N H 2 O NH S2-pocket S1-pocket O Ximelagatran Exanta (AZ) • Hledají se nové, ne-peptidické inhibitory, které nemají silně zásadité funkční skupiny O NH N HO NH OEt N H O NH
- Page 1 and 2: Cdk6 Fragment based drug design FGF
- Page 3 and 4: Tradiční design léčiv • Tradi
- Page 5 and 6: Pravidlo 5 • Ne více než 5 vod
- Page 7 and 8: High-Throughput Screening Je potře
- Page 9 and 10: Genomika • „Human genome projec
- Page 11 and 12: Strukturní biologie a objevy léč
- Page 13 and 14: Definice fragmentu • Menšíslou
- Page 15 and 16: Screening Screening fragmentů prot
- Page 17 and 18: Strukturní screening fragmentů R1
- Page 19 and 20: X-ray screening Screening:
- Page 21 and 22: Definice X-ray procesu •Potřeba
- Page 23 and 24: Krystalizační protokol (PixSys)
- Page 25: Spojování a optimalizace fragment
- Page 29 and 30: S4-pocket IC 50 = 330 μM N N N N C
- Page 31 and 32: S4-pocket MeO IC 50 = 3.4 nM IC 50
- Page 33: Výhody FBDD • Malý fragment má
S4-pocket<br />
Inhibitory trombinu<br />
O<br />
Melagatran<br />
O<br />
NH<br />
N<br />
NH<br />
OH<br />
N<br />
H 2<br />
O<br />
NH<br />
S2-pocket<br />
S1-pocket<br />
O<br />
Ximelagatran<br />
Exanta (AZ)<br />
• Hledají se nové, ne-peptidické inhibitory, které nemají<br />
silně zásadité funkční skupiny<br />
O<br />
NH<br />
N<br />
HO<br />
NH<br />
OEt<br />
N<br />
H<br />
O<br />
NH
Change language