30.04.2013 Views

CIKLUS CITRONSKE KISLINE (CCK) = KREBSOV CIKLUS ...

CIKLUS CITRONSKE KISLINE (CCK) = KREBSOV CIKLUS ...

CIKLUS CITRONSKE KISLINE (CCK) = KREBSOV CIKLUS ...

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

<strong>CIKLUS</strong> <strong>CITRONSKE</strong> <strong>KISLINE</strong><br />

(<strong>CCK</strong>)<br />

= <strong>KREBSOV</strong> <strong>CIKLUS</strong><br />

= <strong>CIKLUS</strong> TRIKARBOKSILNIH KISLIN<br />

Glavne metabolične poti oglj. hidratov pri rastlinah in živalih<br />

Riboza<br />

5-fosfat<br />

+<br />

NADPH+H +<br />

GLIKOGEN, ŠKROB<br />

katabolizem anabolizem<br />

fosfoglukonatna<br />

pot<br />

anaerobni metabolizem<br />

(živalska mišica)<br />

LAKTAT<br />

Glikoliza:<br />

GLUKOZA<br />

NADH+H +<br />

glikoliza +ATP glukoneogeneza<br />

PIRUVAT<br />

ACETIL CoA<br />

CO 2<br />

+NADH<br />

+FADH 2<br />

DISAHARIDI<br />

anaerobni metabolizem<br />

(npr. kvasovke)<br />

ADP + Pi<br />

oksidativna<br />

fosforilacija<br />

glukoza+ 2P i + 2 ADP + 2 NAD +<br />

2 piruvata + 2ATP+2NADH + 2H + +2H 2 O<br />

samo 7% celotne<br />

energije glukoze<br />

UVOD<br />

ETANOL<br />

ATP<br />

Če je prisoten kisik, piruvat vstopa v nadaljnje stopnje metabolizma<br />

in se popolnoma oksidira do CO 2 in H 2 O!<br />

Pri aerobnih organizmih glikoliza predstavlja 1. stopnjo metabolizma.<br />

O 2<br />

H 2O


KATABOLIZEM - FAZE<br />

Faza 1:<br />

Razgradnja makromolekul<br />

na enostavne podenote<br />

(hidroliza)<br />

Faza 2:<br />

Razgradnja enostavnih<br />

podenot do acetil CoA, ob<br />

iztočasni produkciji ATP<br />

in NADH<br />

Faza 3:<br />

Popolna oksidacija Ac-<br />

CoA do H 2 O in CO 2 ,<br />

tvorba NADH in ATP<br />

(elektronski transport)<br />

STOPNJE AEROBNEGA METABOLIZMA<br />

1. Stopnja: glikoliza (pretvorba glikoze do piruvata)<br />

2. Stopnja:<br />

- pretvorba piruvata v acetil-CoA (piruvat dehidrogenazni<br />

kompleks)<br />

- citratni ciklus: oksidacija CoA acetil-CoA do CO 2 ,<br />

pri čemer nastajajo energijsko bogate spojine (ATP, NADH,<br />

FADH 2 )<br />

- veriga za prenos elektronov in oksidativna<br />

fosforilacija<br />

VSTOP PIRUVATA V METABOLNE POTI<br />

Piruvat<br />

-O 2 +O 2<br />

Mlečna<br />

fermentacija Alkoholna<br />

fermentacija<br />

V citosolu<br />

Vstop v aerobno<br />

razgradnjo<br />

V mitohondriju


ZGRADBA MITOHONDRIJA<br />

...<br />

Kriste<br />

Matriks<br />

.....<br />

.....<br />

Premer: 0.5 – 1 μm<br />

Dolžina: 10 μm<br />

V celici: okoli 1000 mitohondrijev<br />

Notranja membrana<br />

Zunanja membrana<br />

Ribosomi<br />

ZGRADBA MITOHONDRIJA<br />

Zunanja membrana:<br />

-prepustna za večino malih molekul in ionov<br />

Notranja membrana:<br />

-neprepustna za male molekule in ione<br />

-vsebuje: - verigo za prenos elektronov<br />

-ATP sintazo<br />

- ostale transportne proteine<br />

Matriks:<br />

- kompleks piruvat dehidrogenaze<br />

-encimi <strong>CCK</strong><br />

-encimi za β-oksidacijo maščobnih kislin<br />

- encimi za oksidacijo aminoksilin<br />

- DNA, ribosomi, ATP, ADP, Pi, Mg 2+ , Ca 2+ , K +<br />

- ostali encimi in topni intermediati<br />

OKSIDACIJA PIRUVATA<br />

Vstop iz citoplazme v mitohondrij:<br />

- difuzija (zunanja membrana)<br />

- piruvat-translokaza (notranja membrana)<br />

V matriksu mitohondrija:<br />

oksidacija piruvata na multiencimskem kompleksu piruvat-<br />

-dehidrogenaze do acetil-CoA:<br />

Vstop v ciklus citronske kisline<br />

Medmembranski<br />

prostor


PIRUVAT-DEHIDROGENAZNI KOMPLEKS<br />

NETO REAKCIJA<br />

piruvat + CoASH + NAD + acetilCoA + NADH + + H + + CO 2<br />

<strong>CIKLUS</strong> <strong>CITRONSKE</strong> <strong>KISLINE</strong> (<strong>CCK</strong>)<br />

Centralna pot aerobnega metabolizma (H. Krebs, 1937)<br />

Pomen <strong>CCK</strong>:<br />

1. Oksidacija C 2 -enot acetil-CoA do CO 2 , pri čemer se sproščena<br />

energija shranjuje v obliki ATP ali GTP, in reduciranih spojin<br />

(NADH in FADH 2 ).<br />

2. Zagotavljanje izhodnih spojin za biosintezo aminokislin in<br />

porfirinov, ter purinskih in pirimidinskih baz za nukleotide.<br />

Glikoliza poteka po linearni poti, <strong>CCK</strong> pa po ciklični poti!


Fumaraza<br />

C4<br />

Fumarat<br />

Sukcinat<br />

dehidrog.<br />

C4<br />

C4<br />

Sukcinat<br />

GTP<br />

Malat<br />

Iz glikolize<br />

Malat<br />

dehidrog.<br />

FADH 2<br />

Sukcinil-SCoA<br />

sintetaza<br />

GDP<br />

C4<br />

C2<br />

Piruvat<br />

Oksaloacetat<br />

NADH + H +<br />

Acetil-SCoA<br />

Citrat<br />

sintaza<br />

NADH + H +<br />

C3<br />

NADH + H +<br />

Iz β-oksidacije<br />

Citrat<br />

C6<br />

Akonitaza<br />

C4 C5<br />

Izocitrat<br />

Izocitrat<br />

dehidrogen.<br />

α-ketoglutarat<br />

α-KG<br />

dehidrogen.<br />

Sukcinil-SCoA<br />

C6


Vezava acetil-CoA na oksaloacetat<br />

(adicija C 2 -enote na ketoskupino C 4 -kisline – nastanek C 6 spojine)<br />

Encim = citrat-sintaza (alosterična inhibicija z NADH in sukcinil-CoA)<br />

Acetil-CoA<br />

Oksaloacetat<br />

<strong>CCK</strong> - 2. REAKCIJA<br />

<strong>CCK</strong> - 1. REAKCIJA<br />

Citril-SCoA Citrat<br />

ΔG 0’ = -31.4 kJ/mol<br />

<strong>CCK</strong> - 2. REAKCIJA<br />

Pretvorba citrata v izocitrat<br />

(eliminacija vode in nastanek dvojne vezi, nato adicija vode na<br />

dvojno vez)<br />

Encim = akonitaza (liaza), Fe-S kompleks kot prostetična skupina<br />

Citrat cis-akonitat Izocitrat<br />

Citrat cis-Akonitat Izocitrat substrat<br />

Pretvorba citrata v izocitrat<br />

Encim = akonitaza (liaza), Fe-S kompleks kot prostetična skupina<br />

<strong>CCK</strong> - 3. REAKCIJA Oksidacija izocitrata v α-ketoglutarat<br />

(oksidativna dekarboksilacija!)<br />

Encim = izocitrat-dehidrogenaza,<br />

(alosterična inhibicija z NADH in ATP,<br />

Izocitrat<br />

Izocitrat<br />

dehidrogenaza<br />

Oksalosukcinat α-ketoglutarat<br />

ΔG 0’ = -8.4 kJ/mol<br />

aktivacija z ADP).<br />

Povezava z metabolizmom dušikovih<br />

spojin in z elektronsko transportno<br />

verigo.


α-Ketoglutarat<br />

<strong>CCK</strong> - 4. REAKCIJA<br />

Oksidacija α-ketoglutarata v sukcinil-CoA<br />

(oksidativna dekarboksilacija)<br />

α-Ketoglutarat<br />

dehidrogenaza<br />

Sukcinil-SCoA<br />

Encim = α-ketoglutarat-dehidrogenaza (encimski kompleks zgrajen<br />

iz 3 encimov in koencimov)<br />

NAD kot akceptor elektronov.<br />

ΔG 0’ = -30 kJ/mol<br />

<strong>CCK</strong> - 5. REAKCIJA<br />

GTP<br />

Sukcinil-SCoA<br />

sintetaza<br />

Sukcinil-SCoA Sukcinat<br />

Pretvorba sukcinil-CoA v sukcinat<br />

(fosforilacija na ravni substrata, nastanek ATP (in/ali GTP))<br />

Encim: sukcinil CoA sintetaza<br />

<strong>CCK</strong> - 6. REAKCIJA<br />

Oksidacija sukcinata do fumarata (biosinteza dvojne vezi med oksidacijo)<br />

Encim: sukcinat-dehidrogenaza, Fe-S kompleks kot prostetična skupina<br />

Koencim: FAD<br />

Sukcinat<br />

(jantarjeva<br />

kislina)<br />

Sukcinat<br />

dehidrogenaza<br />

Fumarat


Fumarat<br />

<strong>CCK</strong> - 7. REAKCIJA<br />

Pretvorba fumarata v L-malat.<br />

(adicija vode na dvojno vez)<br />

Encim: fumarat-hidrataza (fumaraza)<br />

Pretvorba L-malata v oksaloacetat.<br />

(oksidacija hidroksilne skupine)<br />

Encim: malat-dehidrogenaza<br />

Koencim: NAD +<br />

Fumaraza<br />

<strong>CCK</strong> - 8. REAKCIJA<br />

Malat<br />

dehidrogenaza<br />

Malat<br />

(jabolčna kisl.)<br />

L-Malat Oksaloacetat<br />

<strong>CCK</strong> – NETO REAKCIJA<br />

acetil-CoA + 3 NAD + + FAD + ADP ali GDP + P i + 2 H 2 O<br />

2 CO 2 + 3NADH + 3 H + + FADH 2 + ATP ali GTP + CoA-SH<br />

1.Acetat, C 2 , vstopi kot acetil-CoA in dva ogljikova atoma zapustita ciklus v dveh<br />

ločenih reakcijah kot CO 2<br />

2.Tri molekule NAD + se reducirajo do NADH s pomočjo dehidrogenaz<br />

3.Ena molekula FAD se reducira do FADH 2<br />

4.Fosfoanhidridna vez v ATP in GTP nastane iz energije, ki je bila shranjena v<br />

tioestru CoA-SH.<br />

ΔG 0’ = -40 kJ/mol


<strong>CCK</strong> – ENERGETSKA BILANCA<br />

Reakcija: Bilanca ATP Bilanca NADH Bilanca FADH 2<br />

(GTP)<br />

(na en piruvat)<br />

Oksidacija piruvata<br />

Kompleks piruvat dehidrogenaza 0 +1 0<br />

Skupaj oksidacija piruvata 0 +1 0<br />

Citratni ciklus<br />

Izocitrat α-ketoglutarat 0 +1 0<br />

α-ketoglutarat sukcinil-CoA 0 +1 0<br />

Sukcinil-CoA sukcinat +1 0 0<br />

Sukcinat fumarat 0 0 +1<br />

L-malat oksalacetat 0 +1 0<br />

Skupaj citratni ciklus +1 +3 +1<br />

Skupaj vse +1 +4 +1<br />

GLIKOLIZA + <strong>CCK</strong><br />

– ENERGETSKA BILANCA NA 1 MOLEKULO<br />

GLUKOZE<br />

GLUKOZA + 10 NAD + + 2 FAD + 4 ADP + 4 P i + 2 H 2 O<br />

6CO 2 + 10 NADH + 10 H + + 2 FADH 2 + 4 ATP<br />

URAVNAVANJE <strong>CCK</strong><br />

V OKSIDATIVNO<br />

FOSFORILACIJO<br />

Koncentracije AMP, ADP, ATP, NAD + , NADH in acetil-CoA<br />

uravnavajo delovanje encimov, udeleženih<br />

v <strong>CCK</strong>.<br />

Aktivnost alosteričnih encimov (piruvat-dehidrogenaze, citrat-sintaze,<br />

izocitrat-dehidrogenaze in α-ketoglutarat-dehidrogenaze) je<br />

uravnavana z različnimi modulatorji.<br />

Katabolične reakcije se upočasnijo, ko ima celica dovolj metaboličnih<br />

produktov in visokoenergetskih spojin.


ANABOLIČNA VLOGA <strong>CCK</strong><br />

<strong>CCK</strong> ima amfiboličen značaj – deluje pri razgradnji in biosintezi<br />

<strong>CCK</strong> je pomemben vir izhodnih spojin za biosinteze, npr.:<br />

α -Ketoglutarat se transaminira v Glu (sinteza<br />

purinskih nukleotidov, Arg in Pro)<br />

Sukcinil-CoA: sinteza porfirinov (na pr.: hem)<br />

Fumarat in oksalacetat: sinteza aminokislin in<br />

pirimidinskih nukleotidov<br />

Oksaloacetat: transaminacija v Asp (sinteza<br />

nukleotidov), dekarboksilacija v PEP<br />

ANABOLIČNA VLOGA <strong>CCK</strong>


ANAPLEROTIČNE (OSKRBOVALNE)<br />

REAKCIJE<br />

Reakcije, s katerimi se nadomeščajo ključni intermediati <strong>CCK</strong>, ki<br />

se porabijo za biosintezo<br />

encim reakcija opombe<br />

piruvatkarboksilaza<br />

PEPkarboksikina<br />

za<br />

NADmalatni<br />

encim<br />

piruvat + CO 2 + ATP + H 2 O<br />

oksaloacetat + ADP + P i<br />

fosfoenolpiruvat + CO 2 + GDP<br />

oksaloacetat + GTP<br />

piruvat + CO 2 +NADH + H +<br />

malat + NAD +<br />

Je tudi izhodišče za<br />

glukoneogenezo.<br />

Obratna reakcija je<br />

pomembna<br />

pri glukoneogenezi.<br />

Poteka v rastlinah in<br />

mikroorganizmih.<br />

GLIOKSILATNI <strong>CIKLUS</strong><br />

Rastline in nekateri mikroorganizmi lahko sintetizirajo glukozo<br />

iz acetata, oz. uporabljajo acetat kot metabolično gorivo<br />

v glioksilatnem ciklusu.<br />

Glioksilatni ciklus: podoben <strong>CCK</strong>, 2 reakciji spremenjeni<br />

Pomen: ko je acetat edini ali glavni vir ogljika za organizem.<br />

Acetat + CoA + ATP AcetilCoA + AMP + PPi<br />

Acetil-CoA<br />

sintetaza<br />

PPi + H 2O 2Pi<br />

Pirofosfataza<br />

Sukcinat (C4)<br />

Oksaloacetat (C4)<br />

Glioksilat (C2)<br />

Acetil-SCoA (C2)<br />

AcCoA –<br />

alosterični aktivator<br />

GLIOKSILATNI <strong>CIKLUS</strong><br />

NAD +<br />

Malat<br />

(C4)<br />

NADH + H +<br />

Malat<br />

sintaza<br />

Acetil-SCoA (C2)<br />

Citrat (C6)<br />

Izocitrat<br />

liaza<br />

V mitohondrij<br />

Izocitrat (C6)


GLIOKSILATNI <strong>CIKLUS</strong><br />

(NETO REAKCIJA)<br />

2 acetil-CoA + NAD + + 2H 2 O → sukcinat + 2 CoA-SH + NADH + H +<br />

glioksisom<br />

Glioksilatni ciklus:<br />

2C 2<br />

C 4<br />

Nastanek 1 NADH na en obrat<br />

Ni pretvorbe energije v obliko fosfoanhidridnih vezi<br />

<strong>CCK</strong>:<br />

C2 2C<br />

Nastanek 3 NADH in 1 FADH2 na en obrat<br />

Nastanek 1 ATP (ali 1 GTP) na en obrat<br />

MAŠČOBNE <strong>KISLINE</strong><br />

Ac-CoA<br />

oksaloacetat<br />

malat<br />

Ac-CoA<br />

lamele<br />

celična stena<br />

GLIOKSILATNI <strong>CIKLUS</strong> (II)<br />

citrat<br />

glioksilat<br />

izocitrat<br />

fumarat<br />

sukcinat sukcinat<br />

GLIOKSISOM MITOHONDRIJ<br />

GLIOKSISOMI<br />

CITOPLAZMA<br />

malat malat<br />

oksaloacetat<br />

fosfoenolpiruvat<br />

GLUKOZA<br />

Specializirani celični organeli v semenih višjih rastlin, v katerih<br />

poteka tudi glioksilatni ciklus.<br />

Na ta način se acetil-CoA pretvori v ogljikove hidrate.<br />

Sukcinat se transportira v mitohondrij, pretvori v oksaloacetat in<br />

uporabi za glukoneogenezo.<br />

Glioksilatni cikel pomaga<br />

rastlinam pri rasti v temi!


Glavne metabolične poti oglj. hidratov pri rastlinah in živalih<br />

Riboza<br />

5-fosfat<br />

+<br />

NADPH+H +<br />

GLIKOGEN, ŠKROB<br />

katabolizem anabolizem<br />

fosfoglukonatna<br />

pot<br />

anaerobni metabolizem<br />

(živalska mišica)<br />

LAKTAT<br />

GLUKOZA<br />

NADH+H +<br />

glikoliza +ATP glukoneogeneza<br />

PIRUVAT<br />

ACETIL CoA<br />

CO 2<br />

+NADH<br />

+FADH 2<br />

DISAHARIDI<br />

anaerobni metabolizem<br />

(npr. kvasovke)<br />

ADP + Pi<br />

oksidativna<br />

fosforilacija<br />

PENTOZA-FOSFATNA POT (PFP)<br />

(FOSFOGLUKONATNA POT)<br />

ETANOL<br />

ATP<br />

Alternativna pot za metaboliziranje glukoze v nekaterih živalskih<br />

celicah (maščobno tkivo, mlečne žleze, jetra, skorja nadledvične žleze,<br />

eritrociti).<br />

Oksidacija glukoze (C6) do riboza 5-fosfata (C5) ob nastanku NADPH.<br />

Prekurzor za sintezo<br />

koencimov, nukleinskih kislin<br />

in nukleotidov<br />

Potreben za redukcijske<br />

reakcije v biosintezi<br />

Glukoza se pred vstopom v PFP aktivira z ATP:<br />

heksokinaza<br />

Glukoza + ATP glukoza 6-fosfat + ADP<br />

O 2<br />

H 2O


PENTOZA-FOSFATNA POT<br />

Glukoza 6-fosfat<br />

Fruktoza 6-fosfat<br />

H<br />

Eritroza 4-fosfat<br />

Fosfoglukoza<br />

izomeraza<br />

Glukoza 6-fosfat<br />

dehidrogenaza 6-fosfo glukonolakton<br />

transaldolaza<br />

Sedoheptuloza7-fosfat<br />

Gliceraldehid 3-fosfat<br />

PENTOZA-FOSFATNA POT<br />

- NETO REAKCIJA<br />

Ksiluloza 5-fosfat<br />

glukoza +ATP +2NADP + + H 2 O → riboza-5-fosfat + CO 2 + 2NADPH + 2H + + ADP<br />

PFP se v nekaterih tkivih konča pri riboza 5-fosfatu, v drugih se pa<br />

nadaljuje na neoksidativen način do glukoza 6-fosfata, ki povezuje<br />

PFP z glikolizo.<br />

H<br />

glukonolaktonaza<br />

transketolaza<br />

6-fosfoglukonat<br />

dehidrogenaza<br />

fosfopentoza<br />

epimeraza<br />

fosfopentozna<br />

izomeraza<br />

6-fosfo glukonat<br />

Ribuloza 5-fosfat<br />

Riboza 5-fosfat

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!