05.12.2012 Views

Farklı Medikal Cihazlar ile Modellenmiş İnsan Proximal Femurların ...

Farklı Medikal Cihazlar ile Modellenmiş İnsan Proximal Femurların ...

Farklı Medikal Cihazlar ile Modellenmiş İnsan Proximal Femurların ...

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

6 th International Advanced Technologies Symposium (IATS’11), 16-18 May 2011, Elazığ, Turkey<br />

<strong>Farklı</strong> <strong>Medikal</strong> <strong>Cihazlar</strong> <strong>ile</strong> <strong>Modellenmiş</strong> <strong>İnsan</strong><br />

<strong>Proximal</strong> <strong>Femurların</strong> Karşılaştırılması ve FEM<br />

Analizleri<br />

Ö. Verim<br />

Afyon Kocatepe Üniversitesi, Afyonkarahisar, ozgurverim@hotmail.com<br />

Comparison of Human Proxiamal Femurs<br />

Modeled by Different Medical Devices and FEM<br />

Analysis<br />

Abstract—CAD (Computer Aided Design) and FEM (Finite<br />

Elements Method) are the systems that are used by human beings<br />

for the aim of forming better opinions in many of their fields of<br />

interest (biomechanics, clinical applications, design, production,<br />

etc.). In the recent years, CAD and FEM have had a widespread<br />

coverage in the field of medicine. In this study, human proximal<br />

Femurs have been modelled and compared according to the<br />

geometrical and FEM analysis results. As commonly known,<br />

many devices are being used for bone modelling and analysis<br />

activities. BT, laser scanners, optical scanners, MRI (Magnetic<br />

Resonance Imaging) and Photogrammetry are some of those<br />

devices. In this study, we have used BT, optical scanner and laser<br />

scanner devices. We have modelled the data we received from the<br />

devices via certain programmes and transformed the surfaces into<br />

NURBS (Non-Uniform Rational B-Spline) surface form. Then, by<br />

carrying out variance analysis on the models, we have realized the<br />

optimum mesh-modal transformation. In the FEM analysis, we<br />

have obtained the limit conditions adequate for the upright<br />

positioning of humans and maximum equivalent regression and<br />

deformation values in the modals prepared.<br />

Keywords—Biomechanics, Finite Element Method, Femur<br />

Bone.<br />

Keywords—Biomechanics, Finite Element Method, Tibia Bone<br />

I. GİRİŞ<br />

onlu elemanlar metodu son yıllarda dokuların davranışları,<br />

S<br />

implant tasarımı, kemik ve kasların etk<strong>ile</strong>şimi, klinik<br />

uygulamaları gibi biyomekanik dalının birçok alanında<br />

kullanılmaktadır. Sonlu elemanlar analizi, modelin gerçek<br />

geometrisi, uygulanan sınır şartları ve dokuların mekanik<br />

özellikleri gibi birçok değişken faktörlere bağlıdır[ 1 ]. BT<br />

(Bilgisayarlı Tomografi) verisi yumuşak doku ve kemik doku<br />

civarındaki yüksek kontrast’a dayanarak kemiğin uygun<br />

geometrik topolojisini oluşturmaktadır[ 2 ].<br />

Doku mühendisliğinin araştırılması ve geliştirilmesinde<br />

bilgisayar yardımlı teknoloj<strong>ile</strong>rin kullanılması Bilgisayar<br />

Destekli Doku Mühendisliği (CATE)’nin yeni bir alanının<br />

büyümesini geliştirmiştir. CATE Biyoloji, Biomedikal<br />

102<br />

Mühendisliği, İletişim Teknoloj<strong>ile</strong>rini ve Doku Mühendisliği<br />

uygulamaları için modern tasarım ve üretim alanlarını<br />

birleştirir. CATE mümkün kılınan Bilgisayar Destekli<br />

Teknoloj<strong>ile</strong>rde, Bilgisayar Destekli Tasarım (CAD)<br />

kapsamında, <strong>Medikal</strong> Resim İşlemesinde, Bilgisayar Destekli<br />

Üretimde, çok ölçekli biyolojik modeller için Katı Serbest<br />

Form İmalatta (SFF), Biyofiziksel analiz ve simülasyonlarda,<br />

organ ve dokuların tasarlanması ve üretiminde uygulanır[ 3 ].<br />

Bir cisim belirli yükler altında yüklenildiği zaman, malzeme<br />

içinde gerilmeler oluşmaktadır. Bu gerilmelerin dağılımı, yapı<br />

içerisindeki değerleri ve yönelimleri yalnızca yükleme<br />

konfigürasyonlara, malzemenin özelliklerine ve yapının<br />

geometrisine bağlı değildir. Ek olarak gerilmeler yapıların<br />

çevre koşulları (kinematik ve dinamik sınır şartları) <strong>ile</strong><br />

etk<strong>ile</strong>şiminden ve farklı malzemeler arasında bulunan<br />

sınırlardaki fiziksel şartlar tarafından etk<strong>ile</strong>nir[ 4 ].<br />

Literatürde sert veya yumuşak dokuların makro ve mikro<br />

yapıda modellenmesi <strong>ile</strong> ilgili birçok çalışma bulunmaktadır.<br />

Bunların FE modellenmesi <strong>ile</strong> ilgili genel kanı, dokuların dış<br />

ve içyapılarının birbirinden ayrı mekanik özelliklere sahip<br />

oldukları için farklı modellenmeleridir.<br />

Bu çalışmada modellenmek istenen insan proximal Femur’un<br />

analizindeki işlem basamakları şekil 1’de verilmektedir.<br />

Şekil 1:<strong>Proximal</strong> Femur’un analizindeki işlem basamakları<br />

Bu çalışmada 3 farklı yöntemle oluşturulan insan proximal<br />

Femur’un FE modelleri oluşturuldu ve bunlar kendi aralarında<br />

kıyaslandı.


<strong>Farklı</strong> <strong>Medikal</strong> <strong>Cihazlar</strong> <strong>ile</strong> <strong>Modellenmiş</strong> <strong>İnsan</strong> <strong>Proximal</strong> <strong>Femurların</strong>…<br />

II. MALZEME VE METOD<br />

Bu çalışmada FE modeli oluşturulan insan proximal<br />

Femur’un ana ver<strong>ile</strong>ri BT, Breuckmann 3D optik ve Metris<br />

lazer tarama sisteminden alınmıştır. Bu sistemlerin çalışma<br />

prensipleri birbirlerinden ayrıdır. Bu yüzden her sistem kendi<br />

tolerans değerlerine göre bir model çıkarmıştır. Bu makalede<br />

burada oluşturulan 3 farklı modelin birbirleri <strong>ile</strong> farkı<br />

incelenecektir. BT cihazı <strong>ile</strong> kemiğin içyapısı görülebildiği<br />

için kemiğin Kortikal, Trabeküler ve ilik kısımları<br />

modellenebilir. Fakat Breuckmann optik tarayıcı ve Metris<br />

lazer tarayıcısı <strong>ile</strong> kemiğin yalnızca dış kısmı<br />

modellenmektedir. Bu sistemlerle oluşturulan Femur<br />

modelinin içyapısındaki Trabeküler ve ilik kısmı BT<br />

tarafından elde ed<strong>ile</strong>n modelden alınmıştır.<br />

A. Bilgisayarlı Tomografi<br />

<strong>Medikal</strong> sektöründe birçok cihazdan modelleme işlemi için<br />

veri alınabilmektedir. Bu cihazlar Bilgisayarlı Tomografi,<br />

Manyetik Rezonans Görüntüleme, Optik Mikroskop, Mikro<br />

Bilgisayarlı Tomografi ve Ultrason olmak üzere çeşitlilik arz<br />

etmektedir. Bu çalışmada Bilgisayarlı Tomografi cihazından<br />

alınan ver<strong>ile</strong>r kullanılmıştır. BT cihazından 230 adet Dicom<br />

formatında veri alınmıştır. Bu ver<strong>ile</strong>rin elde edildiği BT cihazı<br />

SIEMENS - Sensation 40 marka, 120KV ve 65mAs<br />

değerlerine sahip olup Afyonkarahisar Devlet Hastanesinde<br />

bulunmaktadır. Resim çözünürlük değeri 512*512 pixel, pixel<br />

boyutu ise 0.488mm’dir.<br />

BT’den alınan Dicom formatı ver<strong>ile</strong>ri Mimics (Materialise,<br />

Leuven, Belgium) programında işlenerek .stl, .igs veya .point<br />

cloud formatına çevrilir. Dicom ver<strong>ile</strong>rinin Mimics<br />

programındaki görüntüsü şekil 2’de verilmektedir.<br />

Şekil 2: Mimics programının arayüz görüntüsü<br />

Burada sert ve yumuşak dokuların ayrım işlemi HU<br />

(Hounsfield) değeri <strong>ile</strong> gerçekleştirilir. Thresholding<br />

(eşikleme) işlemi <strong>ile</strong> kemiğin Kortikal, Trabeküler ve İlik<br />

kısımları birbirinden ayrılmıştır. Thresholding işleminde<br />

kemik bölümlerinin HU değerleri belirt<strong>ile</strong>rek birbirlerinden<br />

ayrışmaları sağlandı. <strong>Proximal</strong> Femurun Kortikal kısmı için<br />

103<br />

max 1988, min ise 662 HU değeri alındı. Trabeküler kısmı için<br />

max 661, min ise 148 HU değeri alındı. İlik bölümü ise<br />

bunların dışında kalan kısım olarak elde edildi.<br />

B. Breuckmann 3d Optik Tarama<br />

Breuckmann üç boyutlu sayısallaştırma teknoloj<strong>ile</strong>rinin<br />

çalışma prensibine göre, taranması istenen parçanın üzerine<br />

sistemdeki projektör yardımıyla ışık düşürülür ve parça<br />

yüksek çözünürlüklü bir dijital kamera veya kameralar <strong>ile</strong><br />

çekilir. Elde ed<strong>ile</strong>n görüntüler , sistemin kullandığı özel<br />

yazılımlar <strong>ile</strong> işlenir ve parça yüzeylerini oluşturan noktaların<br />

koordinatlarına ulaşılır [6]. Femur’un modellenmesi için<br />

kullanılan 3D optik tarama cihazı şekil 3’te gösterilmektedir.<br />

C. Metris Lazer Tarama<br />

Şekil 3: Breuckmann 3D optik tarayıcı<br />

Bu sistemde ışık gereksinimi yoktur. Problu veya uzaktan<br />

sinyal göndererek parça üzerindeki yüzeyin koordinatlarını<br />

çıkarmaktadır[7]. Bu makalede kullanılan Lazer tarama cihazı<br />

şekil 4’te verilmiştir.<br />

Şekil 4: Metris Lazer tarayıcı<br />

Standart sapma genel olarak niceliksel ölçekli sayılar için<br />

çok kullanılan ver<strong>ile</strong>rin ortalamaya göre yayılmasını gösteren<br />

bir istatistiksel ölçüdür. Bu çalışmada yukarıda belirt<strong>ile</strong>n<br />

yöntemlerle elde ed<strong>ile</strong>n nokta bulutu ver<strong>ile</strong>ri önce mesh<br />

yapısına, sonra ise yüzey formuna çevrilmiştir. Mesh<br />

yapısından yüzey formuna çevirdiğimiz modellerin sapma<br />

analizi sonuçları şekil 5’te verilmiştir.


Şekil 5: BT, Beuckmann ve metris modellerinin sapma analizleri<br />

Yukarıdaki şekilde beyazdan siyaha doğru değişen bir renk<br />

skalasında yüzeylerde meydan gelen renk dağılımları, mesh<br />

yapısının nasıl bir standart sapma <strong>ile</strong> yüzey formuna<br />

dönüştüğünü göstermektedir. Modellerin sapma analizinden<br />

elde ed<strong>ile</strong>n Sapma değerleri ver<strong>ile</strong>n modellerin minimum,<br />

maksimum, ortalama ve standart sapma değerleri tablo 1’de<br />

verilmiştir.<br />

Tablo 1: BT, Beuckmann ve metris modellerinin sapma değerleri<br />

Standart<br />

Sapma<br />

Analizi<br />

Maksimum<br />

Sapma<br />

Minimum<br />

Sapma<br />

Ortalama<br />

Sapma<br />

Standart<br />

Sapma<br />

BT 0.0990 -4.7125 -1.4606 1.6277<br />

Beuckmann 1.2309 -1.3407 0.0017 0.0155<br />

Metris 0.7825 -2.5189 0.0015 0.0182<br />

Yukarıdaki sapma değerleri göz önünde bulundurulduğu<br />

zaman Beuckmann cihazından elde ed<strong>ile</strong>n modelin daha uygun<br />

olduğu görülmektedir. Standart sapmasının küçük çıkmasıyla<br />

mesh yapısı <strong>ile</strong> yüzey formu arasındaki değişimlerin küçük ve<br />

birbirine yakın değerler olduğu anlaşılmaktadır.<br />

III. FEMURUN SONLU ELEMANLAR MODELLERİ<br />

Kemiğin Kortikal ve Trabeküler kısımlarının mekanik<br />

malzeme özellikleri HU değeri <strong>ile</strong> yoğunluk arasındaki<br />

bağıntılar yardımıyla elde edilmiştir[ 1,5 ]. Aşağıda<br />

malzemenin HU değerine bağlı etkin yoğunluk denklemi<br />

verilmiştir.<br />

Burada değeri etkin yoğunluk ve<br />

Kemiğin malzeme özellikleri<br />

yoğunluk değerine bağlıdır. Bu çalışmada kemik dokusu, özel<br />

yapısı ve özel mekanik davranışları <strong>ile</strong> Orthotropik malzeme<br />

olarak tanımlanmıştır. Kemiğin Orthotropik malzeme<br />

özellikleri aşağıda verilmiştir.<br />

104<br />

Ö. Verim<br />

C ve T indeksleri Kortikal ve Trabeküler kemiği<br />

belirtmektedir. ρ değeri etkin yoğunluk , E Young<br />

modülünü (MPa), G kayma modülünü (MPa), v ise Poisson<br />

oranını ve maksimum yoğunluğu göstermektedir.<br />

[1,2,5].<br />

Yukarıdaki denklemlerden yararlanarak Femur’a ait<br />

mekanik özellikler tablo 2’de çıkarılmıştır. Femur’un mekanik<br />

özellikleri yönlere göre değişiklik gösterdiği için Orthotropik<br />

malzeme seçilmiştir.<br />

<strong>Proximal</strong> Femur<br />

Mekanik<br />

Özellikleri<br />

Young<br />

Modul<br />

(MPa)<br />

Poisson<br />

Oranı<br />

Shear<br />

Modul<br />

(MPa)<br />

Tablo 2: Femura ait mekanik özellikler<br />

BT Breuckmann Metris<br />

K* T* K* T* K* T*<br />

E1 4911 1570 4911 1570 4911 1570<br />

E2 4911 1570 4911 1570 4911 1570<br />

E3 9081 2522 9081 2522 9081 2522<br />

v12 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4<br />

v23 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25<br />

v31 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25 0.25<br />

G12 4 4.7 4 4.7 4 4.7<br />

G23 5 5.8 5 5.8 5 5.8<br />

G31 4.6 5.4 4.6 5.4 4.6 5.4<br />

K* Kortikal, T* Trabeküler<br />

Her üç yöntemle elde ed<strong>ile</strong>n Femur kemiğine ait malzeme<br />

özellikleri <strong>ile</strong> oluşturulan FE modellerin düğüm ve eleman<br />

sayıları, modellerin boyut ve yüzeylerine göre değişiklikler<br />

göstermektedir. BT’den elde ed<strong>ile</strong>n model 15161 düğüm 7931<br />

elemandan, metris cihazından elde ed<strong>ile</strong>n model 21896 düğüm<br />

11675 elemandan ve Breuckmann cihazından elde ed<strong>ile</strong>n<br />

model ise 24082 düğüm 12859 elemandan oluşmaktadır. Elde<br />

ed<strong>ile</strong>n modeller kullanılan cihazların en hassas modlarına göre<br />

gerçekleştirilmiştir.<br />

Trabeküler, Kortikal ve ilik kısımlarından meydana gelen<br />

Femur kemiğin statik sonlu elemanlar analizi ANSYS V12<br />

programı <strong>ile</strong> gerçekleştirilmiştir. Femur alt kısmından<br />

sabitlenerek her üç yöne dönme ve doğrusal hareketleri<br />

engellenmiştir. Femur başına 20 derecelik açı <strong>ile</strong> 500N’luk<br />

yayılı yük şekil 6'da uygulanmıştır.<br />

Şekil 6: Femur'a uygulanan kuvvet ve sınır şartları


<strong>Farklı</strong> <strong>Medikal</strong> <strong>Cihazlar</strong> <strong>ile</strong> <strong>Modellenmiş</strong> <strong>İnsan</strong> <strong>Proximal</strong> <strong>Femurların</strong>…<br />

Bu işlemlerden sonra elde ed<strong>ile</strong>n FEM analizi sonuçlarından<br />

toplam deformasyon ve Von-Mises eşdeğer gerilmeleri<br />

çıkarılmıştır ve şekil 7’de verilmiştir. FEM analizi insanın<br />

ayakta duruş pozisyonuna göre gerçekleştirilmiştir.<br />

Şekil 7: a,b. BT, BREUCKMANN ve METRIS modellerinin<br />

deformasyon ve eşdeğer Von-Mises gerilmeleri<br />

Yukarıdaki şekilde görüldüğü üzere her üç cihazdan oluşan<br />

modellerin deformasyon dağılımları ve Von-Mises eşdeğer<br />

gerilme dağılımları benzerlik göstermektedir. Şekil 7 a’da<br />

ver<strong>ile</strong>n BT modelinin maksimum eşdeğer gerilmesi 37MPa,<br />

minimum eşdeğer gerilmesi 0.02MPa’dır. Breuckmann<br />

modelinin maksimum eşdeğer gerilmesi 42.3MPa, minimum<br />

eşdeğer gerilmesi 0.015MPa ve Metris modelinin maksimum<br />

eşdeğer gerilmesi 25MPa, minimum eşdeğer gerilmesi<br />

0.015MPa’dır. Şekilde belirt<strong>ile</strong>n modellerde kırmızı renkli<br />

yerler deformasyonun ve eşdeğer gerilmenin fazla olduğu<br />

yerlerdir. BT modelinin maksimum deformasyon miktarı<br />

4.97mm, Breuckmann modelinin maksimum deformasyon<br />

miktarı 5.4mm ve Metris modelinin maksimum deformasyon<br />

miktarı ise 4.9’dur.<br />

.<br />

IV. SONUÇ<br />

Bu çalışmada BT, Breuckmann ve Metris cihazlarından<br />

alınan ver<strong>ile</strong>r bir takım işlemlerden geçir<strong>ile</strong>rek 3D modelleri<br />

ve FE modelleri oluşturulmuştur. Solidworks programı <strong>ile</strong><br />

sapma analizi gerçekleştir<strong>ile</strong>rek uygun model belirlenmiştir.<br />

<strong>Cihazlar</strong>ın kendi toleransları dışında değerlendir<strong>ile</strong>n bu<br />

modelleme işleminde, Beuckmann cihazından alınan ver<strong>ile</strong>rin<br />

Solidworks programında son işlemden geçir<strong>ile</strong>rek elde ed<strong>ile</strong>n<br />

standart sapma değerleri diğerlerine göre daha uygun<br />

görülmüştür. Beuckmann ve metris cihazları femurun<br />

içyapısına temas etmedikleri için sapma analizi yalnızca<br />

femurun kortikal bölgesine uygulanmıştır. Modellerin sonlu<br />

elemanlar analizinde ise elde ed<strong>ile</strong>n hasar değerleri birbirlerine<br />

yakın bölgelerde görülmüştür.<br />

105<br />

KAYNAKLAR<br />

[1] Baca V., Horak Z., Mikulenka P., Dzupa V. Comparison of an<br />

inhomogeneous orthotropic and isotropic material models used for<br />

FE analyses, Medical Engineering & Physics, 30; 2008 pp.924-<br />

930.<br />

[2] Peng L, Bai J, Zeng X, ZhouY. Comparison of isotropic and<br />

orthotropic material property assignments on femoral finite<br />

element models under two loading conditions. Med Eng Phys<br />

2006;28:227–33<br />

[3] W. Sun, B.Starly, J.Nam, A.Darling, “ Bio-CAD modeling and its<br />

applications in computer-aided tissue engineering” Computer-<br />

Aided Design 37 (2005) 1097-1114<br />

[4] R. Huiskes, E. Y. S. Chao, A survey of finite element analysis in<br />

orthopedic biomechanics: the first decade, J. Biomechanics 16:<br />

385-409, 1983<br />

[5] E. M. M. Fonseca, M. J. Lima, L. M. S. Barreira, Human Femur<br />

assessment using isotropic and orthotropic materials dependent of<br />

bone density, 3rd International Conference on Integrity, Reliability<br />

and Failure, Porto/Portugal, Paper Ref: S1904_P0345, 20-24 July<br />

2009.<br />

[6] F. Taddei, S. Martelli, B. Reggiani, L. Cristofolini, and M.<br />

Viceconti, Finite-Element Modeling of Bones From CT Data:<br />

Sensitivity to Geometry and Material Uncertainties, IEEE<br />

Transactıons on Biomedical Engineering, 53, 2006<br />

[7] http://www.breuckmann.com/<br />

[8] http://www.metris.com/

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!