29.03.2015 Views

PowerPoint Sunusu

PowerPoint Sunusu

PowerPoint Sunusu

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

MİKROBİYOLOJİ<br />

LABORATUVARINDA<br />

UYULMASI GEREKEN<br />

KURALLAR


Kurallar<br />

• Laboratuvar saatinde geç kalan öğrenciler, eğitim<br />

başladıktan sonra laboratuvara alınmayacaktır.<br />

Laboratuvarlar devamlılık arzettiği için ilk saate<br />

gelmeyen öğrenci ikinci saate alınmayacaktır.<br />

• Laboratuvarda uygun ve temiz önlükler<br />

giyilecektir.<br />

• Laboratuvara yiyecek veya içecek<br />

getirilmemelidir.<br />

• Masalara kişisel eşyalar konulmamalıdır.<br />

• Alev kaynağı ve mikroorganizmalar ile temasın<br />

önlenmesi için uzun saçlar toplanmalıdır


Kurallar<br />

• Özeler kullanımdan önce ve sonra sterilize<br />

edilmelidir.<br />

• Sıvı besiyerleri sporlara konmalıdır<br />

• Çalışma alanı kontamine olursa alkol ile<br />

temizlenmelidir.<br />

• Masalar, mikroskoplar ve kullanılan diğer<br />

gereçler çalışma bittikten sonra<br />

temizlenmelidir.<br />

• Laboratuvardan ayrılmadan önce eller<br />

yıkanmalıdır.


Kurallar<br />

• Her bir laboratuvar için öğrenci<br />

gördüklerini yazarak ve çizerek<br />

kaydetmelidir.


Klinik Örneklerin Ekimi ve<br />

Kültürlerin Değerlendirilmesi<br />

1. gün


Klinik<br />

örnek<br />

Yanlış<br />

besiyerine<br />

ekim<br />

Laboratuvar<br />

hataları<br />

Yanlış<br />

sonuç<br />

Test<br />

tekrarı<br />

Gereksiz<br />

antibiyotik<br />

kullanımı


Toplama Kapları<br />

Falcon tüpü<br />

Balgam,<br />

idrar...<br />

Steril kap<br />

idrar,balgam...<br />

Steril olmayan kap<br />

dışkı...


Taşıma besiyeri<br />

Kullanıma hazır<br />

Kullanılmış


Anaerobik Taşıma Sistemi<br />

tablet sıvı pamuk pamuk sıvı pamuk<br />

eküvyon


Mikrobiyolojik inceleme<br />

• Makroskopik incelenmesi<br />

• Mikroskopik inceleme<br />

• Kültür<br />

– Besiyerinin seçimi<br />

– Ekim<br />

– İnkübasyon<br />

– Değerlendirme (Varsa direkt yayma ile birlikte)<br />

• Kolonilerin makroskopik incelemesi<br />

• Kolonilerin mikroskopik incelemesi<br />

• Manuel testler<br />

• Otomatize veya yarı-otomatize sistem<br />

• Antibiyotik duyarlılık<br />

• Raporlama


Makroskopik inceleme<br />

• İdrar<br />

– Renk<br />

– Bulanıklık<br />

• Dışkı<br />

– Kan, mukus varlığı<br />

– Sulu dışkı<br />

• Püy<br />

– Kan<br />

• Boğaz<br />

– .<br />

• Balgam<br />

– Kan, mukus, pürülan materyal


Mikroskopik inceleme<br />

• Örnekten direkt preparat<br />

hazırlanması<br />

– Islak preparat<br />

• Boyasız inceleme<br />

• Lugol ile boyama<br />

• Çini mürekkebi ile boyama<br />

• …<br />

– Tespit edilmiş preparat<br />

• Gram boyama<br />

• Metilen mavisi ile boyama<br />

• Giemsa ile boyama<br />

• …


Kültür<br />

– Besiyerinin seçimi<br />

– Ekim<br />

– İnkübasyon<br />

– Değerlendirme (Varsa direkt preparat<br />

ile birlikte)<br />

• Kolonilerin makroskopik incelemesi<br />

• Kolonilerin mikroskopik incelemesi<br />

• Manuel testler<br />

• Otomatize veya yarı-otomatize ticari<br />

tanımlama -/+ antibiyogram sistemleri<br />

• Antibiyotik duyarlılık


Besiyeri seçimi<br />

Klinik örneğe göre uygun besiyeri seçilir.<br />

• Adi agar<br />

• Zenginleştirilmiş: Kanlı agar, çikolata agar<br />

• Seçici: MacConkey, EMB agar<br />

• Ayırdettirici:<br />

– Kanlı agar: Hemoliz<br />

– MacConkey agar,EMB agar: Laktoz kullanımı<br />

– SS agar: Laktoz kullanımı, H 2 S oluşumu


Örneğe göre besiyeri seçimi<br />

• İdrar: Kanlı agar, EMB agar<br />

• Boğaz: Kanlı agar<br />

• Balgam , BAL, DTA: Kanlı agar, EMB agar, çikolata agar<br />

• Dışkı: EMB agar, SS agar<br />

• Kan: Kan kültürü şişesi<br />

• BOS: Kanlı agar, EMB agar, çikolata agar<br />

• Steril vücut sıvıları: Kanlı agar, EMB agar<br />

• Püy, yara: Kanlı agar, EMB agar<br />

• Doku, ameliyat materyali: Kanlı/EMB agar, örnek sıvı besiyeri<br />

içine<br />

• Vajen: Kanlı agar, EMB agar, çikolata agar, antibiyotikli<br />

Columbia agar<br />

• Üretral akıntı: Koyun kanlı/EMB agar, çikolata agar


İstenen kültüre göre besiyeri<br />

seçimi<br />

• Anaerob kültür: Schaedler, fenil etanol, BBE agar,<br />

tiyoglukolatlı buyyon, ek olarak kanlı/EMB ve çikolata<br />

agarlara aerob kültür<br />

• Tüberküloz kültürü: Loewenstein-Jensen besiyeri,<br />

Middlebrook besiyeri<br />

• Difteri: Loeffler besiyeri, tellüritli kanlı agar<br />

• Boğmaca: Bordet-Gengou besiyeri<br />

• Kolera: TCBS agar, alkalen peptonlu su<br />

• EHEC: Sorbitollü MacConkey agar<br />

• Yersinia: CIN agar<br />

• Helicobacter<br />

• Campylobacter<br />

• Vankomisin dirençli enterokok<br />

• ………….


Zenginleştirilmiş besiyerleri<br />

• Temel besiyerlerine kan, yumurta,<br />

serum gibi besleyici maddelerin<br />

eklenmesiyle elde edilen, ve çoğu<br />

mikroorganizmanın üreyebildiği<br />

besiyerleri<br />

– Kanlı agar<br />

– Çikolata agar


Seçici besiyerleri<br />

• İçlerinde belli bir mikrooganizma<br />

dışındakilerin üremesini engelleyen maddeler<br />

içeren besiyerleri<br />

– EMB veya MacConkey agar<br />

– Antibiyotikli çikolata agar (Thayer-Martin agar)


Ayırdedici besiyerleri<br />

• İçerdikleri ayıraçlar sayesinde, benzer<br />

bakterilerin farklı koloniler oluşturmasını<br />

sağlayan besiyerleri<br />

– Kanlı agar<br />

– EMB veya MacConkey agar


• Sıvı örnek<br />

– Tek koloni ekim:<br />

• Dışkı<br />

• Balgam<br />

– Kantitatif ekim<br />

• İdrar<br />

• BAL, DTA<br />

• Kateter<br />

• Sürüntü<br />

– Tek koloni ekim<br />

• Püy<br />

• Boğaz<br />

• Doku<br />

Ekim


• Üreyebilen<br />

her çeşit<br />

bakteriden<br />

tek koloni<br />

elde<br />

edilmeye<br />

çalışılır.<br />

Tek koloni ekim yöntemi


Kantitatif ekim<br />

• Belirli miktarda sıvı<br />

besiyerine<br />

konmalıdır.<br />

– İdrar için 10µL (bir<br />

öze dolusu)<br />

• Sonrasında, üreyen<br />

koloniler sayılarak<br />

mililitredeki bakteri<br />

sayısı belirlenir.


İdrar<br />

• Besiyeri: Kanlı agar, MacConkey agar<br />

• Ekim:<br />

– Kanlı agar kantitatif ekim: 10μL (bir öze dolusu)<br />

– EMB agar tek koloni ekim: 10μL (bir öze dolusu)<br />

• İnkübasyon: Normal atmosfer, 36-/+2ºC, bir<br />

gece


Dışkı<br />

• Besiyeri: MacConkey agar, SS agar<br />

• Ekim: Tek koloni ekim<br />

• İnkübasyon: Normal atmosfer, 36-/+2ºC,<br />

bir gece


Püy, yara, doku, dren mayi,<br />

ameliyat materyali<br />

• Besiyeri: Kanlı agar, MacConkey agar,<br />

• Ekim: Tek koloni ekim<br />

• İnkübasyon: Normal atmosfer, 36-/+2ºC,<br />

bir gece


• Besiyeri: Kanlı agar<br />

Boğaz<br />

• Ekim: Tek koloni ekim, besiyerine yarık<br />

açılarak<br />

• İnkübasyon: Normal atmosfer, 36-/+2ºC,<br />

bir gece


Balgam (2. gün gösterilecek)<br />

• Besiyeri: Kanlı agar, MacConkey agar,<br />

çikolata agar<br />

• Yayma: 2 adet<br />

• Ekim: Tek koloni<br />

• İnkübasyon: Mumlu kavanoz


İnkübasyon<br />

• Uygun sıcaklık<br />

– 35-37°C’de<br />

• Uygun atmosfer<br />

– Aerop (etüv)<br />

– %5 CO 2 ’li (mumlu kavanoz veya CO 2 ’li etüv)<br />

– Anaerop<br />

– Mikroaerofilik<br />

• Uygun süre<br />

– 16-18 saat (bir gece)<br />

– 24 saat<br />

– 48 saat<br />

– 7 gün<br />

– …


1. gün<br />

• Ön masa<br />

– Toplama kapları<br />

• Steril idrar kabı<br />

• Steril olmayan dışkı<br />

kabı<br />

• Steril falcon tüp<br />

• Taşıma besiyeri<br />

• Her masa<br />

– Klinik örnekler<br />

• İdrar: Kanlı ve MacConkey<br />

agar<br />

• Dışkı: MacConkey ve SS agar<br />

• Püy: Kanlı ve MacConkey agar<br />

• Boğaz: Kanlı agar<br />

– Ekim yapılacak besiyerleri<br />

• Kanlı agar<br />

• MacConkey agar<br />

• SS agar


Klinik Örneklerin Ekimi ve<br />

Kültürlerin<br />

Değerlendirilmesi<br />

2. gün


Kültürlerin değerlendirilmesi<br />

• Enfeksiyon etkeni olan<br />

mikroorganizmanın üretilmesi<br />

• Mikroorganizmanın tanımlanması<br />

• -/+ antibiyotik duyarlılık


Evaluation of direct smear


Evaluation of direct smear


Evaluation of direct smear


Evaluation of direct smear


Kültür plağının<br />

değerlendirilmesi<br />

• Örnek nedir? Steril bir örnek mi, florası olan<br />

bir vücut bölgesinden mi alınmış?<br />

• Üreme var mı?<br />

• Üreyen koloni sayısı ne kadar? (Kantitatif<br />

ekimler için)<br />

• Kaç çeşit?<br />

• Belirli bir patojen aranıyorsa üreyen<br />

koloniler arasında özellikleri ona uyan var mı?


Kültürlerin değerlendirilmesi<br />

• Kolonilerin makroskopik incelemesi<br />

• Kolonilerin mikroskopik incelemesi<br />

• Manuel testler<br />

• Otomatize veya yarı-otomatize ticari<br />

tanımlama<br />

• Antibiyotik duyarlılık


Kolonilerin makroskopik<br />

incelemesi<br />

• Koloni morfolojisi<br />

• Besiyerinin ayırt<br />

ettirici özellikleri<br />

– Kanlı agar:<br />

Hemoliz<br />

– MacConkey agar:<br />

Laktozu kullanma<br />

– SS agar: H2S<br />

oluşumu


Hemoliz<br />

• Kanlı agar<br />

– Alfa-hemoliz<br />

– Beta-hemoliz<br />

– Gama hemoliz


Laktoz Kullanımı<br />

• Mac Conkey agar<br />

– Laktoz pozitif<br />

– Laktoz negatif


H2S oluşumu<br />

• SS agar:<br />

– H2S pozitif<br />

– H2S negatif


Kolonilerin mikroskopik<br />

• Gram boyama<br />

incelemesi


Manuel testler<br />

• Katalaz<br />

• Koagülaz<br />

• Oksidaz<br />

• CAMP testi<br />

• %6,5 tuzlu besiyerinde üreme<br />

• Safralı ve eskülinli besiyerinde üreme<br />

• Optokin duyarlılığı<br />

• Basitrasin duyarlılığı<br />

• Biyokimyasal testler:<br />

– Üç şekerli demirli besiyeri<br />

– IMVIC<br />

– Üreli besiyeri<br />

– …


Ticari tanımlama sistemleri


Antibiyotik duyarlılık testleri


2. gün<br />

• Ön masa<br />

– Balgam yayması<br />

örnekleri<br />

– Balgam kültürü<br />

plakları<br />

• Her masa<br />

– Kültür plaklarının<br />

değerlendirilmesi<br />

– Gram boyama


Gram boyama<br />

• Kristal viyole (1 dk)<br />

• Su ile yıka<br />

• Lugol (1 dk)<br />

• Su ile yıka<br />

• Alkol (30 sn)<br />

• Su ile yıka<br />

• Sulu fuksin (30 sn)<br />

• Su ile yıka

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!