Doktora - Fen Bilimleri Enstitüsü - Erciyes Üniversitesi

ERCĐYES ÜNĐVERSĐTESĐ 

FEN BĐLĐMLERĐ ENSTĐTUSÜ 

BĐYOMEDĐKAL MÜHENDĐSLĐĞĐ 

ANABĐLĐMDALI 

I. GENEL BĐLGĐLER 

Ders Adı 

Yapay Organ Tasarımı 

Dönemi: Güz Dili: Türkçe 

Kredisi (T-P-K) : 3-0-3 ECTS Kredisi: 7.0 

Öğretim Üyesi Öğr. Gör. Dr. Gülşen AKDOĞAN 

Görüşme Saatleri Pzt. /Salı /Çrş. /Prş./Cuma: 14.00-14.30 

E posta: akdogang@erciyes.edu.tr WEB: 

Fakülte iletişim adresi: 

Erciyes Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomedikal Bölümü, 38039 Kayseri/TÜRKĐYE 

Tel: 90 352 437 40 01 Dahili 32982 

Faks: 90 352 437 57 84 

II. DERS BĐLGĐLERĐ 

Ders Tipi ve Seviyesi 

Zorunlu: 

Seçmeli: Evet 

Esas: Đlgili: Evet Yan dal: 

Başlangıç: Orta: Đleri: Evet Uzmanlık: 

Dersin Amacı Yapay organlar konusunda bilgi kazandırmak ve organ tasarım 

kabiliyetini geliştirmek. 

Ders Đçeriği Yapay organlara giriş, Kütle transferi ve akışkanlar mekaniğinin 

temel prensipleri, Biyolojik sistemlerdeki kimyasal reaksiyonlar, 

Biyomalzeme bilimi, Yapay organ tasarımının (biyomimetiğin) 

temel prensipleri. Yapay organların toplum sağlığının geliştirilmesi 

üzerine etkileri. Biyolojik modeller (protezler, yapay organlar). 

Vücut içi ve vücut dışı yardımcı (asist) cihazlar. Hemodiyalizör, 

Yapay kan, Biyoyapay karaciğer, Intraaortik balon pompası, Kalp 

destek aygıtları, Oksijenatör (yapay akciğer), Damar protezleri 

(yapay kan damarları). 

Öğretim Metodu Sınıf dersleri, Problem çözümü, Sunumlar 

Öğrenciden Đstenilen Derslere katılım, Ödevlerin yapılması, Kitap&Makale okuma 

Gereklilikler 

Başarı Notunun 

Hesaplanması 

Ara sınav notunun %40’ı Final sınavının %60’ı alınarak ham puan 

hesaplanır. Sisteme göre bu not harf notuna dönüştürülür. 

Önerilen Kaynaklar, 

Araç ve Gereçler 

The Biomedical Engineering Handbook, Third Edition - 3 Volume 

Set: Tissue Engineering and Artificial Organs - Hardcover (May 1, 

2006) by Joseph D. Bronzino 

Haftalara Göre Ders Planı 

Haftalar 

Konular 

1. Hafta Yapay organlara giriş 

2. Hafta Kütle transferi ve akışkanlar mekaniğinin temel prensipleri 

3. Hafta Biyolojik sistemlerdeki kimyasal reaksiyonlar 

4. Hafta Biyomalzeme bilimi 

5. Hafta Yapay organ tasarımının (biyomimetiğin) temel prensipleri 

6. Hafta Yapay organların toplum sağlığının geliştirilmesi üzerine etkileri 

7. Hafta Biyolojik modeller (protezler, yapay organlar) 

8. Hafta Vücut içi ve vücut dışı yardımcı (asist) cihazlar 

9. Hafta Hemodiyalizör, Yapay kan 

10. Hafta Biyoyapay karaciğer






Ders Adı 

Doku ve Hücre Mühendisliği 



Öğretim Üyesi Öğr. Gör.Dr. Gülşen AKDOĞAN 





Tel: 90 352 437 40 01 Dahili 32982 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 


Esas: Evet Đlgili: Yan dal: 


Dersin Amacı Doku ve hücre mühendisliği konusunda bilgi kazandırmak ve tasarım 

kabiliyetini geliştirmek. 

Ders Đçeriği Ekstrasellüler matriks analogları, ekstrasellüler matriks, sentetik 

polimerler, doğal polimerler, hücre fonksiyonları ve düzenlenmesi, 

kök hücreler, hücre yapışması, hücre-biyomateryal etkileşimi, 

hücresel hareketler ve metabolizma, doku geliştirilmesi, doku 

modellenmesi, hücre ve doku içinde kütle transfer özellikleri, doku 

yenilenmesi, damar gelişimi, ilaç salımı, bağışıklığın koruması, 

iltihaplanma, doku mühendisliği yaklaşımları, doku indüksiyonu 

(deri, sinir, kan damarı, kas bağlantıları, bağcıkları, kemik), hücre 

transplantasyonu, biyohibrid , organlar, kan oluşumu, gen terapisi, 

doku mühendisliği ürünleri; patentler, kurallar. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Stem Cell and Tissue Engineering by Song Li, Nicolas L'Heureux 

and Jennifer Elisseeff 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Ekstrasellüler matriks analogları, ekstrasellüler matriks 

2. Hafta Sentetik polimerler, doğal polimerler 

3. Hafta Hücre fonksiyonları ve düzenlenmesi 

4. Hafta Kök hücreler, Hücre yapışması 

5. Hafta Hücre-biyomateryal etkileşimi 

6. Hafta Hücresel hareketler ve metabolizma 

7. Hafta Doku geliştirilmesi, Doku modellenmesi 

8. Hafta Hücre ve doku içinde kütle transfer özellikleri, Doku yenilenmesi 

9. Hafta Damar gelişimi, ilaç salımı 

10. Hafta Bağışıklığın koruması, iltihaplanma






Ders Adı 

Biyomedikal Enstrumantasyonda Analog Devreler 

Dönemi: Bahar Dili: Türkçe 


Öğretim Üyesi Yrd. Doç. Dr. Mahmut TOKMAKÇI 


E posta: tokmakci@erciyes.edu.tr 

WEB: 



Tel: 90 352 437 49 01 Dahili 32980 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Biyomedikal Enstrümantasyonda kullanılan devre uygulama ve 

analizleri hakkında bilgi kazandırmak 

Ders Đçeriği Biyomedikal sinyal kaynakları ve özellikleri, Analog elektronik 

sistemlerde kullanılan yarıiletken elemanlar için modeller, Fark 

kuvvetlendiricisi, Elektronik tek döngülü geribesleme sistemlerinin 

genel özellikleri, Geri besleme, Frekans cevabı ve Kuvvetlendirici 

karalılığı, Đşlemsel kuvvetlendiriciler ve analog aktif filtreler, 

Enstrumantasyon ve tıbbi izolasyon kuvvetlendiricileri, Gürültü ve 

biyomedikal uygulamalar için düşük gürültülü kuvvetlendiricilerin 

tasarımı, Sayısal arabağlaşımlar, Biyomedikal sinyallerin 

modülasyonu ve demodülasyonu, Biyomedikal enstrumantasyonda 

özel analog devreler ve sistemler hakkında örnek uygulamalar 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Analysis and Application of Analog Electronic Circuits to 

Biomedical Instrumentation (Biomedical Engineering) -by Robert B. 

Northrop 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Biyomedikal sinyal kaynakları ve özellikleri 

2. Hafta Analog elektronik sistemlerde kullanılan yarıiletken elemanlar için modeller 

3. Hafta Fark kuvvetlendiricisi 

4. Hafta Elektronik tek döngülü geribesleme sistemlerinin genel özellikleri 

5. Hafta Geri besleme, Frekans cevabı ve Kuvvetlendirici karalılığı 

6. Hafta Đşlemsel kuvvetlendiriciler ve analog aktif filtreler 

7. Hafta Enstrumantasyon ve tıbbi izolasyon kuvvetlendiricileri 

8. Hafta Enstrumantasyon ve tıbbi izolasyon kuvvetlendiricileri 

9. Hafta Gürültü ve biyomedikal uygulamalar için düşük gürültülü kuvvetlendiricilerin

tasarımı 

10. Hafta Gürültü ve biyomedikal uygulamalar için düşük gürültülü kuvvetlendiricilerin 

tasarımı 

11. Hafta Sayısal arabağlaşımlar 

12. Hafta Biyomedikal sinyallerin modülasyonu ve demodülasyonu 

13. Hafta Biyomedikal enstrumantasyonda özel analog devreler ve sistemler hakkında 

örnek uygulamalar 

14. Hafta Biyomedikal enstrumantasyonda özel analog devreler ve sistemler hakkında 

örnek uygulamalar






Ders Adı 

Göze Ait Elektrofizyolojik Sinyaller ve Görüntüler 



Öğretim Üyesi Yrd. Doç. Dr. Ayşegül GÜVEN 


E posta: aguven@erciyes.edu.tr 

WEB: 



Tel: 90 352 437 57 55 Dahili 32979 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Öğrencilere göze ait biyomedikal mühendisliği bilgileri verilecektir 

Ders Đçeriği Göz ve gözün yapısı, gözde elektriksel iletim, retina üzerinde oluşan 

elektrofizyolojik sinyaller, gözün uyarılara karşı verdiği cevaplar, 

EOG, ERG, PERG ve VEP sinyalleri, ultrasonografik Doppler 

tekniğinin gözde kullanılması, göze ait sinyallerin yapıları ve ölçüm 

teknikleri, Göze ait görüntüler; renkli fundus görüntüleme, florasans 

anjiyografi ile fundus görüntüleme, gözde lazer uygulamaları ve 

diğer göz bilimine ait enstrumanlar incelenecektir. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Digital Signal and Image Processing - Hardcover (Nov. 12, 2003) 

by Tamal Bose 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Göz ve gözün yapısı 

2. Hafta Gözde elektriksel iletim 

3. Hafta Gözde elektriksel iletim 

4. Hafta Retina üzerinde oluşan elektrofizyolojik sinyaller 

5. Hafta EOG, ERG, PERG ve VEP sinyalleri, 

6. Hafta EOG, ERG, PERG ve VEP sinyalleri, 

7. Hafta Ultrasonografik Doppler tekniğinin gözde kullanılması 

8. Hafta ARA SINAV 

9. Hafta Retina görüntüleri 

10. Hafta Retina görüntüler 

11. Hafta Renkli fundus görüntüleme ve florasans anjiyografi 

12. Hafta Renkli fundus görüntüleme ve florasans anjiyografi 

13. Hafta Gözde lazer uygulamaları 

14. Hafta Gözde lazer uygulamaları






Ders Adı 

Tıpta Manyetik Rezonans Görüntüleme 



Öğretim Üyesi 


E posta: 

WEB: 



Tel: 90 352 Dahili 

Faks: 90 352 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Manyetik rezonans görüntülemenin tıpta kullanımı hakkında bilgi 

kazandırmak. 

Ders Đçeriği Manyetik rezonans görüntülemeye giriş, referans çerçeveleri 

döndürme ve rezonans, eksen sapması-eksitasyonunun ve ısıl 

ekilibriyum-boylamsal relaksasyonun quantum mekanizması 

temelleri, sinyal tespit kavramları, görüntülerin yeniden oluşturulma 

oranı, işaret, kontrast ve gürültü, radyo frekans darbeleri, su/yağ 

ayırım teknikleri, MR anjiyografi ve akış ölçme, dokuların manyetik 

özellikleri, sekans tasarımı, terminoloji, MRI sargıları ve magnetleri. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Magnetic Resonance Imaging: Physical and Biological Principles by 

Stewart C. Bushong 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Manyetik rezonans görüntülemeye giriş 

2. Hafta Tek bir çekirdeğin manyetik alana klasik cevabı 

3. Hafta Referans çerçeveleri döndürme ve rezonans 

4. Hafta Eksen sapması ve eksitasyonunun quantum mekanizması temelleri 

5. Hafta Isıl ekilibriyum ve boylamsal relaksasyonun quantum mekanizması temelleri 

6. Hafta Sinyal tespit kavramları 

7. Hafta Görüntülerin yeniden oluşturulma oranı 

8. Hafta Đşaret, kontrast ve gürültü 

9. Hafta Radyo frekans darbeleri 

10. Hafta Su/Yağ ayırım teknikleri 

11. Hafta MR anjiyografi ve akış ölçme 

12. Hafta Dokuların manyetik özellikleri 

13. Hafta Sekans tasarımı, yapımı ve terminoloji

14. Hafta MRI sargılarına ve magnetlerine giriş






Ders Adı 

Biyomedikalde Olasılık Teorisi ve Stokastik Prosesler 



Öğretim Üyesi Prof. Dr. Musa Hakan ASYALI 


E posta: asyali@erciyes.edu.tr 

WEB: 



Tel: 90 352 437 49 01 Dahili 32975 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Mühendislikle ilgili uygulamalarla birlikte, öğrencinin teoriyi 

kullanarak stokastik prosesleri nasıl modelleyeceğini bilmesini 

sağlamak. 

Ders Đçeriği Olasılığın anlamı, Olasılık aksiyomları, tekrar edilen denemeler, 

rastlantı değişkeni kavramı, raslantı değişkeninin fonksiyonları, iki 

raslantı değişkeni, iki raslantı değişkeninin fonksiyonları, rastlantı 

değişkenleri dizileri, stokastik proseslerde genel kavramlar, durağan 

proseslerin güç spektrumu ve korelasyonu, doğrusal ortalama-karesel 

kestirim, durağan olmayan prosesler, stokastik girişli doğrusal 

sistemlerden geçişler, stokastik proseslerin harmonik analizi, durağan 

ve durağan olmayan normal prosesler, Markoff prosesleri, Poisson 

prosesi. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Basic Probability Theory for Biomedical Engineers (Synthesis 

Lectures on Biomedical Engineering) by John Enderle 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Olasılık teoremi 

2. Hafta Olasılık teoremi 

3. Hafta Tekrar edilen denemeler, rastlantı değişkeni kavramı, fonksiyonları 

4. Hafta Tekrar edilen denemeler, rastlantı değişkeni kavramı, fonksiyonları 

5. Hafta Đki raslantı değişkeni, fonksiyonları, dizileri, 

6. Hafta Đki raslantı değişkeni, fonksiyonları, dizileri, 

7. Hafta Stokastik proseslerde genel kavramlar 


9. Hafta Stokastik proseslerde genel kavramlar 

10. Hafta Durağan olmayan prosesler

11. Hafta Stokastik girişli doğrusal sistemlerden geçişler 

12. Hafta Stokastik girişli doğrusal sistemlerden geçişler 

13. Hafta Markoff prosesleri, Poisson prosesi 

14. Hafta Markoff prosesleri, Poisson prosesi






Ders Adı 

Biyomedikalde Sayısal Filtre Tasarımı 





E posta: 

WEB: 




Faks: 90 352 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Sayısal filtre tasarımı konusunda ileri bilgi kazandırmak 

Ders Đçeriği Lineer ayrık zamanlı sistem, frekans cevabı ve filtreleme 

kavramlarının tanımı, dijital filtereler için yaklaşım ve gerçekleştirme 

problemlerinin tanımlanması (FIR ve IIR filtreler dahil), FIR filtrenin 

özellikleri, lineer faz için yaklaşım problemi, kompleks tasarımlar ve 

belirli nokta hesabıyla FIR filtrelerin gerçekleştirilmesi, IIR filtrelerin 

gerçekleştirilmesi, tasarımı ve özellikleri 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Ultra Low-Power Biomedical Signal Processing: An Analog Wavelet 

Filter Approach for Pacemakers (Analog Circuits and Signal 

Processing) - Hardcover (Apr. 28, 2009) by Sandro Augusto Pavlik 

Haddad and Wouter A. Serdijn 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Sayısal filtrelere giriş 

2. Hafta Sonlu impuls-cevap filtreler (FIR) 

3. Hafta Lineer- faz sonlu impuls- cevap tasarımı 


5. Hafta Sonlu kayıt uzunluğunun etkileri 

6. Hafta Minimum faz ve kompleks yaklaşım 

7. Hafta Sonlu impuls-cevap filtrelerin gerçekleştirilmesi 


9. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin özellikleri 

10. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin tasarımı 


12. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin gerçekleştirilmesi 

13. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin gerçekleştirilmesi

14. Hafta Biyomedikal Uygulamaları

11. Hafta Doku mühendisliği yaklaşımları, doku indüksiyonu (deri, sinir, kan damarı, kas 

bağlantıları, bağcıkları, kemik) 

12. Hafta Hücre transplantasyonu, biyohibrid , organlar 

13. Hafta Kan oluşumu, gen terapisi, doku mühendisliği ürünleri 

14. Hafta Patentler, kurallar






Ders Adı 

Biyomedikalde Sayısal Filtre Tasarımı 





E posta: 

WEB: 




Faks: 90 352 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Sayısal filtre tasarımı konusunda ileri bilgi kazandırmak 

Ders Đçeriği Lineer ayrık zamanlı sistem, frekans cevabı ve filtreleme 

kavramlarının tanımı, dijital filtereler için yaklaşım ve gerçekleştirme 

problemlerinin tanımlanması (FIR ve IIR filtreler dahil), FIR filtrenin 

özellikleri, lineer faz için yaklaşım problemi, kompleks tasarımlar ve 

belirli nokta hesabıyla FIR filtrelerin gerçekleştirilmesi, IIR filtrelerin 

gerçekleştirilmesi, tasarımı ve özellikleri 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Ultra Low-Power Biomedical Signal Processing: An Analog Wavelet 

Filter Approach for Pacemakers (Analog Circuits and Signal 

Processing) - Hardcover (Apr. 28, 2009) by Sandro Augusto Pavlik 

Haddad and Wouter A. Serdijn 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Sayısal filtrelere giriş 

2. Hafta Sonlu impuls-cevap filtreler (FIR) 



5. Hafta Sonlu kayıt uzunluğunun etkileri 

6. Hafta Minimum faz ve kompleks yaklaşım 



9. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin özellikleri 



12. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin gerçekleştirilmesi 

13. Hafta Sonsuz impuls-cevap filtrelerinin gerçekleştirilmesi

14. Hafta Biyomedikal Uygulamaları






Ders Adı 

Đleri Matris Analizi ve Lineer Cebir 






WEB: 



Tel: 90 352 437 49 01 Dahili 32975 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Öğrenciler matris analizi ve lineer cebir konularını öğrenecekler 

Ders Đçeriği Lineer eşitlikler, vektörler ve matrisler, simetrik matrisler için 

köşegenleştirme ve kanonik formlar, genel simetrik matrislerin 

köşegen forma indirgenmesi, matrislerin fonksiyonları, karakteristik 

köklerin değişik (varyasyonel) tanımı, matrisler ve diferansiyel 

denklemler, Markov ve stokastik matrisler, pozitif matrisler, Perron 

teoremi, 



Gereklilikler 


Hesaplanması 



Önerilen Kaynaklar, Matrix Analysis for Scientists and Engineers by Alan J. Laub 



Haftalar 

Konular 

1. Hafta Lineer eşitlikler 

2. Hafta Lineer eşitlikler 

3. Hafta Rectangular sistemler ve echelon formlar 

4. Hafta Rectangular sistemler ve echelon formlar 

5. Hafta Matris cebri 

6. Hafta Matris cebri 

7. Hafta Vektör uzayı 


9. Hafta Normlar, iç üretimler ve orthagonality 

10. Hafta Normlar, iç üretimler ve orthagonality 

11. Hafta Determinantlar 

12. Hafta Eigen-değerleri ve eigen-vektörleri 

13. Hafta Eigen-değerleri ve eigen-vektörleri 

14. Hafta Perron teoremi






Ders Adı 

Đleri Biyomateryaller ve Biyomekanik 



Öğretim Üyesi Öğr. Gör. Dr. Gülşen AKDOĞAN 





Tel: 90 352 437 40 01 Dahili 32982 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Đleri Biyomalzemeler / Biyomekanik konusunda bilgi ve problem 

çözme kabiliyeti kazandırmak. 

Ders Đçeriği Biyomateryalin tanımı, Biyomekaniğin çalışma alanları, 

Biyomateryalin çalışma alanları, Materyallerin yapısı ve özellikleri. 

Metaller. Polimerler. Seramikler. Kompozitler. Doğal, emilen (absorb 

olabilen) ve diğer malzemeler, bunların biyolojik dokularda 

kullanımı, değişik dokulardaki kullanımı. Deri, çene implantları, tüm 

eklem cerrahisi, diş hekimliğindeki uygulamaları. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Advanced Biomaterials: Fundamentals, Processing, and Applications 

- Hardcover (Oct. 5, 2009) by Bikramjit Basu, Dhirendra S. Katti and 

Ashok Kumar 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Biyomateryalin tanımı, 

2. Hafta Biyomekaniğin çalışma alanları 

3. Hafta Biyomekanik problem örnekleri 

4. Hafta Biyomekanik problemlerin çözüm yöntemleri 

5. Hafta Biyomateryalin çalışma alanları, 

6. Hafta Biyomateryallerin yapısı ve özellikleri. 

7. Hafta Metaller 

8. Hafta Polimerler 

9. Hafta Seramikler 

10. Hafta Kompozitler 

11. Hafta Doğal malzemeler 

12. Hafta Emilen (absorb olabilen) ve diğer malzemeler 

13. Hafta Malzemelerin biyolojik dokularda kullanımı

14. Hafta Deri, çene implantları, tüm eklem cerrahisi, diş hekimliğindeki uygulamaları






Ders Adı 

Hesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik 





E posta: 

WEB: 




Faks: 90 352 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Hesaplamalı biyoloji ve biyoinformatik konularında ileri düzeyde 

bilgi kazandırmak. 

Ders Đçeriği Biyoinformatiğe giriş, bilginin doğası, bilginin iletimi, takımlar ve 

combinatorics, olasılık, rastgelelik ve karmaşıklık, sistemler, 

networkler ve devreler, algoritmalar, bilişimsel biyolojiye giriş, canlı 

doğası, yaşam molekülleri, genom bilimi, protein bilimi, 

interactomics:etkileşim ve düzenleyici networkler, metabolimics ve 

metabonomics, tıp uygulamaları, bilginin organizasyonu. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and 

Bioconductor (Statistics for Biology and Health) by Robert 

Gentleman, Vincent Carey, Wolfgang Huber and Rafael 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Biyoinformatiğe ve hesaplamalı biyolojiye giriş 

2. Hafta Bilginin doğası 

3. Hafta Bilginin iletimi 

4. Hafta Olasılık 

5. Hafta Rastgelelik ve karmaşıklık 

6. Hafta Sistemler, networkler ve devreler 

7. Hafta Algoritmalar 

8. Hafta Canlı doğası 

9. Hafta Yaşam molekülleri 

10. Hafta Genom bilimi ve Protein bilimi 

11. Hafta Interactomics :Etkileşim ve düzenleyici networkler 

12. Hafta Metabolimics and Metabonomics 

13. Hafta Tıp uygulamaları

14. Hafta Bilginin organizasyonu






Ders Adı 

Nonlineer Đşaret Đşleme 



Öğretim Üyesi Yrd.Doç.Dr. Fatma LATĐFOĞLU 


E posta: flatifoglu@erciyes.edu.tr 

WEB: 



Tel: 90 352 437 57 55 Dahili 32977 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Nonlineer işaret işleme konusunda bilgi sağlayarak bu konuda ufuk 

geliştirmek. 

Ders Đçeriği Dinamik sistemler ve kaos, Dinamik sistemlerin karakterize edilmesi, 

Otokorelasyon fonksiyonu, Güç spektrumu, Farklı boyut yaklaşımları 

(fraktal, enformasyon ve korelasyon boyutu), Faz uzayı, Gecikme 

zamanının seçilmesi, Faz uzayının boyutunun belirlenmesi, Kaosun 

ölçülmesi, Lyapunov üstelleri, Bifurcation diyagramı, Surrogate data 

analizi, Kaotik zaman serileri analizi. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Nonlinear Signal Processing: A Statistical Approach - Hardcover 

(Nov. 8, 2004) by Gonzalo R. Arce 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Dinamik sistemler ve kaos 

2. Hafta Dinamik sistemlerin karakterize edilmesi 

3. Hafta Dinamik sistemlerin karakterize edilmesi 

4. Hafta Otokorelasyon fonksiyonu 

5. Hafta Güç spektrumu 

6. Hafta Farklı boyut yaklaşımları (fraktal, enformasyon ve korelasyon boyutu) 

7. Hafta Farklı boyut yaklaşımları (fraktal, enformasyon ve korelasyon boyutu) 

8. Hafta Faz uzayı 

9. Hafta Gecikme zamanının seçilmesi 

10. Hafta Faz uzayının boyutunun belirlenmesi 

11. Hafta Kaosun ölçülmesi, Lyapunov üstelleri 

12. Hafta Bifurcation diyagramı 

13. Hafta Surrogate data analizi 

14. Hafta Kaotik zaman serileri analizi






Ders Adı 

Đleri Biyomedikal Görüntü Analizi 






WEB: 



Tel: 90 352 437 49 01 Dahili 32975 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Öğrenciler görüntü işleme ve analiz metotları ve algoritmalarının 

biyomedikal uygulamalarını öğrenecekler 

Ders Đçeriği Sayısal Görüntü Analizi, Görüntü Bölütleme ve Dengeleme, 

Görüntülerin Katlanması, Görüntülerin Süzgeçlenmesi, Kenar 

Algılama, Görüntü Dönüşümü, Tıpta Görüntü Đşleme ve Gürültünün 

Azaltılması, Tıbbi Görüntülerin Arşivlenmesi ve Đletilmesi. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Advanced Biomedical Image Analysis - Hardcover (Dec. 28, 2010) 

by Mark Haidekker 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta 2- boyutlu sinyal işleme 

2. Hafta 2- boyutlu sinyal işleme 

3. Hafta Görüntü işleme teknikleri 

4. Hafta Görüntü işleme teknikleri 

5. Hafta Görüntü filtre dizayn ve uygulamaları 

6. Hafta Görüntü filtre dizayn ve uygulamaları 

7. Hafta ROC analizi 


9. Hafta Programlama uygulamaları 

10. Hafta Programlama uygulamaları 

11. Hafta Gerçek ve yapay görüntü performansları 

12. Hafta Tıbbi uygulamalar 

13. Hafta Tıbbi uygulamalar 

14. Hafta Görüntü arşivleme ve iletimi






Ders Adı 

Uygulamalı Matematik Modelleri 






WEB: 



Tel: 90 352 437 57 55 Dahili 32977 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Uygulamalı matematik modelleri konusunda bilgi sağlamak ve bu 

konuda karşılaşılan problemlere çözüm yolları üretmek. 

Ders Đçeriği Gama, Beta ve hata fonksiyonları, Fourier Serileri, Legendre 

Polinomları, Bessel Fonksiyonları, Ortogonal fonksiyonlar, Kısmi 

diferansiyel denklemler, Kompleks değişken fonksiyonlar, Đntegral 

dönüşümleri, olasılık kavramı. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 






Haftalar 

Konular 

1. Hafta Gama, Beta ve hata fonksiyonları 

2. Hafta Fourier Serileri 

3. Hafta Fourier Serileri 

4. Hafta Legendre Polinomları 

5. Hafta Legendre Polinomları 

6. Hafta Bessel Fonksiyonları 

7. Hafta Ortogonal fonksiyonlar 

8. Hafta Ortogonal fonksiyonlar 

9. Hafta Kısmi diferansiyel denklemler 

10. Hafta Kısmi diferansiyel denklemler 

11. Hafta Kompleks değişken fonksiyonlar 

12. Hafta Kompleks değişken fonksiyonlar 

13. Hafta Đntegral dönüşümleri 

14. Hafta Olasılık kavramı






Ders Adı 

Đleri Biyomedikal Đşaret Analizi 



Öğretim Üyesi Yrd.Doç.Dr. Semra ĐÇER 


E posta: ksemra@erciyes.edu.tr 

WEB: 



Tel: 90 352 437 49 01 Dahili 32978 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Biyomedikal işaret analizi konusunda ileri bilgi kazandırmak 

Ders Đçeriği Biyomedikal Đşaretlere Giriş; Eş Zamanlı, Kuplajlı ve Đlişkili 

Süreçler, Artefaktların Süzgeçlenmesi, Aktivite Belirleme; Dalgaşekli 

ve Dalga-formu karmaşıklığı, Frekans Domeni 

Karakterizasyonu, Biyomedikal işaretlerdeki gürültünün eliminasyon 

yöntemleri, Öznitelik çıkarma yöntemleri, Biyomedikal Đşaretlerin 

Modellenmesi, Durağan Olmayan Đşaretlerin Analizi; Pattern 

Sınıflandırma ve Teşhis Kararı 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Signal Processing for Neuroscientists, A Companion Volume: 

Advanced Topics, Nonlinear Techniques and Multi-Channel Analysis 

(Elsevier Insights) - Hardcover (Sept. 10, 2010) by Wim van 

Drongelen 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Biyomedikal Đşaretlere Giriş 

2. Hafta Eş Zamanlı, Kuplajlı ve Đlişkili Süreçler 

3. Hafta Artefaktların Süzgeçlenmesi 

4. Hafta Aktivite Belirleme 

5. Hafta Dalga-şekli ve Dalga-formu karmaşıklığı 

6. Hafta Frekans Domeni Karakterizasyonu 

7. Hafta Biyomedikal işaretlerdeki gürültünün eliminasyon yöntemleri 

8. Hafta Öznitelik çıkarma yöntemleri 

9. Hafta Öznitelik çıkarma yöntemleri 

10. Hafta Biyomedikal Đşaretlerin Modellenmesi 

11. Hafta Durağan Olmayan Đşaretlerin Analizi 

12. Hafta Durağan Olmayan Đşaretlerin Analizi

13. Hafta Pattern Sınıflandırma ve Teşhis Kararı 

14. Hafta Pattern Sınıflandırma ve Teşhis Kararı






Ders Adı 

Tıbbi Cihazlarda Kalite Güvence 






WEB: 



Tel: 90 352 437 57 55 Dahili 32977 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Tıbbi cihazlarda kalite güvence kavramı ve yönetim sistemleri 

konusunda bilgi kazandırmak 

Ders Đçeriği Kalite kavramı, Đstatistiksel proses kontrol, Biyomedikal cihazların 

dizaynı ve kalite fonksiyonlarının işletilmesi, Risk analizi, 

Biyomedikal cihazlarda CE işareti, TS EN ISO 9001 standardı, TS 

EN ISO 13485 standardı. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Medical Device Quality Assurance and Regulatory Compliance - 

Hardcover (Aug. 1, 1998) by Richard C. Fries 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Kalite kavramı 

2. Hafta Đstatistiksel proses kontrol 

3. Hafta Đstatistiksel proses kontrol 

4. Hafta Biyomedikal cihazların dizaynı ve kalite fonksiyonlarının işletilmesi 

5. Hafta Biyomedikal cihazların dizaynı ve kalite fonksiyonlarının işletilmesi 

6. Hafta Risk analizi 

7. Hafta Risk analizi 

8. Hafta Biyomedikal cihazlarda CE işareti 

9. Hafta Biyomedikal cihazlarda CE işareti 

10. Hafta TS EN ISO 9001 standardı 




14. Hafta TS EN ISO 13485 standardı






Ders Adı 

Ultrason Görüntüleme ve Doppler Tekniği 



Öğretim Üyesi Yrd.Doç.Dr. Semra ĐÇER 


E posta: ksemra@erciyes.edu.tr 

WEB: 



Tel: 90 352 437 49 01 Dahili 32978 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Ultrasonik görüntüleme ve Doppler konusunda bilgi kazandırmak. 

Ders Đçeriği Giriş, kan akışı, Ultrasonik dalgaların temel fiziğinin özeti, Doppler 

etkisi, Doppler sistemleri, Ultrasonik dönüştürücüler, Temel Doppler 

elektroniği ve sinyal işleme, Doppler sinyallerinin kaynağı, 

Dalgaformu analizi, Matlab uygulamaları. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Ultrasound of the Musculoskeletal System (Medical Radiology / 

Diagnostic Imaging) by Stefano Bianchi, Carlo Martinoli, I.F. 

Abdelwahab and A.L. Baert 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Giriş 

2. Hafta Kan akışı 

3. Hafta Ultrasonik dalgaların temel fiziğinin özeti 

4. Hafta Doppler etkisi 

5. Hafta Doppler sinyallerinin kaynağı 

6. Hafta Doppler sistemleri 

7. Hafta Doppler sistemleri 

8. Hafta Ultrasonik dönüştürücüler 

9. Hafta Temel Doppler elektroniği ve sinyal işleme 

10. Hafta Temel Doppler elektroniği ve sinyal işleme 

11. Hafta Dalgaformu analizi. 

12. Hafta Dalgaformu analizi. 

13. Hafta Matlab uygulamaları 

14. Hafta Matlab uygulamaları






Ders Adı 

Biyofotonik 





E posta: 

WEB: 




Faks: 90 352 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Biyofotonik konusunda ileri bilgi kazandırmak. 

Ders Đçeriği Tıpta kullanılan lazerler ve optik prensipler, biyolojik dokular ile 

ışınım etkileşimi ve tıbta optik uygulamalar. Tıpta elektromanyetik 

dalgalar ve ışığın doğası, geometrik optikler, optik enstrümanlar, 

incoherent ışık kaynakları, temel lazer teorisi, fiber optikler, biyolojik 

materyaller ile ışığın etkileşimi, laser Doppler flowmetre, 

kalorimetre, flame fotometre, spectrofotometre, optik akış cytometre, 

ultraviyole ve görülebilir absorbsiyon spektroskobu, infrared 

spektroskop, optik tomografi. 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Biophotonics (Biological and Medical Physics, Biomedical 

Engineering) by Lorenzo Pavesi and Philippe M. Fauchet 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Tıpta kullanılan lazerler ve optik prensipler 

2. Hafta Biyolojik dokular ile ışınım etkileşimi 

3. Hafta Tıbta optik uygulamalar 

4. Hafta Tıpta elektromanyetik dalgalar ve ışığın doğası 

5. Hafta geometrik optikler 

6. Hafta optik enstrümanlar 

7. Hafta incoherent ışık kaynakları, 

8. Hafta temel lazer teorisi, fiber optikler. 

9. Hafta biyolojik materyaller ile ışığın etkileşimi, 

10. Hafta laser Doppler flowmetre, 

11. Hafta kalorimetre, flame fotometre 

12. Hafta spectrofotometre, optik akış cytometre 

13. Hafta ultraviyole ve görülebilir absorbsiyon spektroskobu,

14. Hafta infrared spektroskop, optik tomografi






Ders Adı 

Biyomedikal Zaman Serileri Analizi 






WEB: 



Tel: 90 352 437 57 55 Dahili 32977 

Faks: 90 352 437 57 84 



Zorunlu: 




Dersin Amacı Biyomedikal zaman serileri ve uygulamaları konusunda bilgi 

kazandırmak 

Ders Đçeriği Biyolojik sinyaller(EEG, EMG, ECG, EGG), Hücre aksiyon 

potansiyeli, Ayrık zamanlı random processler, Deterministik ve 

stokastik lineer sinyal modelleme, Wiener ve Kalman filtreleme, 

Parametrik, parametrik olmayan ve eigen tabanlı metodlar 

kullanılarak spektrum belirleme, LMS kullanarak adaptif filtreleme, 

Biyolojik sinyal uygulamaları 



Gereklilikler 


Hesaplanması 





Mathematical Methods in Time Series Analysis and Digital Image 

Processing (Understanding Complex Systems) by Rainer Dahlhaus, 

Jürgen Kurths, Peter Maass and Jens Timmer 


Haftalar 

Konular 

1. Hafta Biyolojik sinyaller(EEG, EMG, ECG, EGG) 

2. Hafta Biyolojik sinyaller(EEG, EMG, ECG, EGG) 

3. Hafta Hücre aksiyon potansiyeli 

4. Hafta Ayrık zamanlı random processler 

5. Hafta Ayrık zamanlı random processler 

6. Hafta Deterministik ve stokastik lineer sinyal modelleme 

7. Hafta Deterministik ve stokastik lineer sinyal modelleme 

8. Hafta Wiener ve Kalman filtreleme 

9. Hafta Wiener ve Kalman filtreleme 

10. Hafta Parametrik, parametrik olmayan ve eigen tabanlı metodlar kullanılarak spektrum 

belirleme 

11. Hafta Parametrik, parametrik olmayan ve eigen tabanlı metodlar kullanılarak spektrum 

belirleme

12. Hafta LMS kullanarak adaptif filtreleme 

13. Hafta LMS kullanarak adaptif filtreleme 

14. Hafta Biyolojik sinyal uygulamaları

11. Hafta Intraaortik balon pompası 

12. Hafta Kalp destek aygıtları 

13. Hafta Oksijenatör (yapay akciğer) 

14. Hafta Damar protezleri (yapay kan damarları)

Doktora - Fen Bilimleri Enstitüsü - Erciyes Üniversitesi

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?