08.09.2013 Views

Mikrobiyoloji Pratiği - Düzen Laboratuvarlar Grubu

Mikrobiyoloji Pratiği - Düzen Laboratuvarlar Grubu

Mikrobiyoloji Pratiği - Düzen Laboratuvarlar Grubu

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

MİKROBİYOJİ PRATİĞİ<br />

XXII <strong>Düzen</strong> Klinik Laboratuvar Günleri<br />

12-14 Ekim 2012<br />

Dr. Uğur Çiftçi<br />

<strong>Düzen</strong> <strong>Laboratuvarlar</strong> <strong>Grubu</strong>


Hasta 1 yaşında kız, 38.5 ºC ateş akut ishal<br />

nedeniyle dışkı örneği laboratuvara getiriliyor,<br />

gaita kültürü, gaitada parazit, rotavirus ve<br />

adenovirus yönünden inceleme yapıldı.<br />

• Rotavirus<br />

• Adenovirus<br />

• Gaitada parazit<br />

OLGU 1<br />

Sonuç<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

Negatif


Gaita Kültürü<br />

• Salmonella<br />

• Shigella<br />

• Aeromonas<br />

• Plesiomonas<br />

• Vibrio<br />

• E.coli O157<br />

OLGU 1<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

POZİTİF(Serolojik olarak doğrulandı)


Laboratuvar ne yapmalı ?<br />

Hasta Nasıl Takip<br />

Edilmeli?


Bildirimi Zorunlu Enfeksiyon Etkenleri<br />

GRUP D<br />

• Campylobacter jejuni<br />

• Chlamydia trachomatis<br />

• Cryptosporidium sp<br />

• Entamoeba histolytica<br />

• Enterohemorajik E.coli<br />

• Giardia intestinalis<br />

• Salmonella sp.<br />

• Shigella sp.<br />

• Listeria monocytogenes


• İl Sağlık Müdürlüğü’ne bildirim yapılması<br />

gerekir.<br />

• Hastanın aile fertlerinin taranması<br />

gerektiği bilgisi verilir.<br />

• HUS gelişimi yönünden kan ve idrar<br />

tetkikleri yapılmalıdır.


Pirinç suyu görünümünde dışkı, ateş, kusma<br />

belirtileri ile gelen 6 aylık çocuktan yapılan<br />

Gaita Kültürü;<br />

• Salmonella<br />

• Shigella<br />

• Plesiomonas<br />

• Aeromonas<br />

• Vibrio<br />

Sonuçlandı.<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

Negatif<br />

Aeromonas hydrophila/caviae üredi<br />

Negatif<br />

OLGU 2


OLGU 2<br />

Hastada üreyen Aeromonas<br />

hydrophila/caviae bakterisi etken bakteri<br />

midir?


Aeromonas hydrophila bakterileri daha<br />

ziyade yaz aylarında ve 2 yaşından küçük<br />

çocuklarda ve immuno kompromize<br />

hastalarda ateş, abdominal kramp ve kusma<br />

ile seyreden ishale neden olan bir<br />

mikroorganizmadır. Bazı vakalarda pirinç<br />

suyu görünümünde ishal, bazı vakalarda kan<br />

ve mukusla seyreden dizanteri tarzında bir<br />

tablo görülebilmektedir.<br />

OLGU 2


OLGU 3<br />

Hasta 26 yaşında kadın, erkek arkadaşında<br />

gonorrhoeae saptandığı için muayene edilmiş.<br />

Muayenede beyaz renkli çok hafif bir akıntı<br />

görülmüş ve kültür örneği alınmış. Doğrudan<br />

mikroskobi ve kültür istenmiş.


OLGU 3<br />

Hastanın örneğinden hazırlanan doğrudan mikroskobide<br />

görüntüdeki mikroorganizma nedir?


YANIT: Trichomonas vaginalis


OLGU 3<br />

Bu mikroorganizma nasıl bulaşır? Kadında nasıl<br />

bir klinik tablo oluşturur?


Trichomonas vaginalis cinsel ilişki ile bulaşır.<br />

Kadınlar trichomonas vaginalis ile enfekte<br />

olduklarında genellikle yanma ve kaşıntı<br />

eşliğinde vaginal akıntı görülür, bazen<br />

asemptomatik enfeksiyonlar görülebilir.


OLGU 3<br />

Bu mikroorganizma erkekte nasıl bir klinik tablo<br />

oluşturur.


Trichomonas vaginalis<br />

Erkeklerde genellikle asemptomatiktir.<br />

Nadiren üretral akıntı görülebilir. Bazen<br />

prostatı da enfeksiyon kaplayabilir.


Bu mikroorganizma laboratuvarda nasıl<br />

teşhis edilir?


Trichomonas vaginalis<br />

Trichomonas vaginalis, idrar, vaginal sıvılar ve prostat<br />

sekresyonlarında nativ muayene ile mikroskopta<br />

belirlenebilir. Hareketi tipik olduğu için hareketli<br />

olduğu sürece kolayca tespit edilebilir. Ancak<br />

beklemiş numunelerde direk muayenede lokositlerden<br />

ayırmak mümkün değildir. Hematoxylen boyası ile<br />

boyanırsa ayırt edilebilir.<br />

Laboratuvar imkanları el verirse trichomonas<br />

yönünden mikroskobi yanında kültür yapılması<br />

izolasyon oranını artırmaktadır.


Vaginal Kültür Sonucu<br />

Hasta örneğinden vaginal kültür sonucu<br />

• Neisseria gonorrhoeae üremedi.<br />

• Candida üremedi.<br />

• Trichomonas vaginalis üredi.


OLGU 3<br />

Bu hastanın tedaviden sonra tekrar enfekte<br />

olmaması için nasıl bir önlem alınmalıdır?


Trichomonas vaginalis<br />

Hastanın eşi de tedavi olmalıdır.<br />

(Pinpon topu fenomeni)


OLGU 4<br />

Hasta 58 yaşında erkek bir aydır öksürük, ateş ve<br />

gece terlemeleri yakınması ile kliniğe başvuruyor.<br />

Göğüs grafisi çekiliyor, PPD (+) bulunuyor,<br />

balgamından Ziehl –Neelsen boyalı preparatı<br />

yapılıyor.


OLGU 4<br />

Ziehl –Neelsen boyalı preparatın görüntüsü<br />

a) Mycobacterium<br />

tuberculosis bakterisi<br />

b) Gram negatif basil<br />

c) Atipik mikobakteri<br />

d) Aside dirençli basil


OLGU 4<br />

Ziehl –Neelsen boyalı preparatın görüntüsü<br />

a) Mycobacterium<br />

tuberculosis bakterisi<br />

b) Gram negatif basil<br />

c) Atipik mikobakteri<br />

d) Aside dirençli basil


Doktor muayene bulguları ve eldeki sonuçlara<br />

göre hastaya tüberküloz teşhisi kondu ve<br />

tedaviye başladı. Aynı çatı altında yaşayan<br />

hastanın 48 yaşındaki karısı kontrole alındı.<br />

• Genel durumu iyi semptom yok<br />

• Akciğer grafisi normal<br />

OLGU 4<br />

• Ziehl-Neelsen preparatı ARB (-)<br />

• PPD +/- (sonuç alınamadı) hastanın alerjik<br />

reaksiyonu var.


OLGU 4<br />

Hekim tatmin olmadı Quantiferon testi istedi<br />

Quantiferon testi sonucu POZİTİF geldi.<br />

a) Aktif tüberküloz enfeksiyonu vardır.<br />

b) Latent tuberküloz enfeksiyonu vakasıdır.<br />

c) Tbc ile enfekte değildir.<br />

d) Mycobacterium tuberculosis ile enfekte<br />

olmuştur ancak bu test aktif veya latent<br />

tüberkuloz ayırımını yapmaz.


OLGU 4<br />

Hekim tatmin olmadı Quantiferon testi istedi<br />

Quantiferon testi sonucu POZİTİF geldi.<br />

a) Aktif tüberküloz enfeksiyonu vardır.<br />

b) Latent tuberküloz enfeksiyonu vakasıdır.<br />

c) Tbc ile enfekte değildir.<br />

d) Mycobacterium tuberculosis ile enfekte<br />

olmuştur ancak bu test aktif veya latent<br />

tüberkuloz ayırımını yapmaz.


OLGU 5<br />

Kan bağışı için kan bankasına giden 25 yaşında erkek anti<br />

HCV pozitifliği nedeniyle doğrulama için laboratuvara<br />

yönlendiriliyor. Laboratuvarda tekrarlanan anti HCV<br />

(Abbott) testi 6.0 S/Co (signal/cut-off) değeri ile pozitif<br />

olarak teyit ediliyor.<br />

HCV enfeksiyon varlığı için en doğru yanıt hangisidir?<br />

a) Test sonucu yeterli kanıttır.<br />

b) RIBA ile doğrulamak gerekir.<br />

c) HCV RNA ile doğrulamak gerekir.<br />

d) ALT ile doğrulamak gerekir.


OLGU 5<br />

Kan bağışı için kan bankasına giden 25 yaşında erkek anti<br />

HCV pozitifliği nedeniyle doğrulama için laboratuvara<br />

yönlendiriliyor. Laboratuvarda tekrarlanan anti HCV<br />

(Abbott) testi 6.0 S/Co (signal/cut-off) değeri ile pozitif<br />

olarak teyit ediliyor.<br />

HCV enfeksiyon varlığı için en doğru yanıt hangisidir?<br />

a) Test sonucu yeterli kanıttır.<br />

b) RIBA ile doğrulamak gerekir.<br />

c) HCV RNA ile doğrulamak gerekir.<br />

d) ALT ile doğrulamak gerekir.


Hasta klinik değerlendirmeye alınıyor, hikayesinde<br />

hepatit olgusu yok, hekimi HCV RNA istiyor, HCV RNA<br />

Cobas Taqman (Roche) sistemi ile Negatif (


Hasta klinik değerlendirmeye alınıyor, hikayesinde<br />

hepatit olgusu yok, hekimi HCV RNA istiyor, HCV RNA<br />

Cobas Taqman (Roche) sistemi ile Negatif (


Bir laboratuvar çalışanı kontrol amacıyla anti HCV<br />

testi yaptırıyor ve Negatif bulunuyor. Birkaç gün sonra<br />

bir laboratuvar kazası sonucu HCV pozitif bir hastanın<br />

kanının alındığı enjektör iğnesi elini çiziyor. Kontrol<br />

için laboratuvarımıza geliyor.<br />

Öncelikle hangi testi yapmalıyız?<br />

a) Anti HCV<br />

b) HCV RNA<br />

c) RIBA<br />

d) ALT<br />

OLGU 6


Bir laboratuvar çalışanı kontrol amacıyla anti HCV<br />

testi yaptırıyor ve Negatif bulunuyor. Birkaç gün sonra<br />

bir laboratuvar kazası sonucu HCV pozitif bir hastanın<br />

kanının alındığı enjektör iğnesi elini çiziyor. Kontrol<br />

için laboratuvarımıza geliyor.<br />

Öncelikle hangi testi yapmalıyız?<br />

a) Anti HCV<br />

b) HCV RNA<br />

c) RIBA<br />

d) ALT<br />

OLGU 6


HCV RNA testini ne zaman yapmalıyız?<br />

En doğru cevap hangisidir?<br />

a) Hemen<br />

b) 2 hafta sonra, negatif ise 1 ay sonra tekrar<br />

c) 3 ay sonra<br />

d) 6 ay sonra<br />

OLGU 6


HCV RNA testini ne zaman yapmalıyız?<br />

En doğru cevap hangisidir?<br />

a) Hemen<br />

b) 2 hafta sonra, negatif ise 1 ay sonra tekrar<br />

c) 3 ay sonra<br />

d) 6 ay sonra<br />

OLGU 6


OLGU 7<br />

Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />

hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda<br />

Beta hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />

Streptococcus agalactica (B grubu Streptokok) olarak<br />

identifiye ediyor.<br />

a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />

b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />

c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />

olmayabilir.<br />

d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.


OLGU 7<br />

Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />

hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda<br />

Beta hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />

Streptococcus agalactica (B grubu Streptokok) olarak<br />

identifiye ediyor.<br />

a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />

b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />

c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />

olmayabilir.<br />

d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.


OLGU 8<br />

Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />

hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda Beta<br />

hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />

Streptococcus dysgalactiae spp. olarak identifiye ediliyor.<br />

a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />

b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />

c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />

olmayabilir.<br />

d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.


OLGU 8<br />

Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />

hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda Beta<br />

hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />

Streptococcus dysgalactiae spp. olarak identifiye ediyor.<br />

a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />

b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />

c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />

olmayabilir.<br />

d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.


OLGU 9 (A)<br />

Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />

olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />

sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />

antijen testi çalışıldı.<br />

Strep A Antijen Testi : Pozitif bulundu<br />

a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />

yapmaya gerek yoktur.<br />

b) Muhtemel Strep A olarak değerlendirilir. Boğaz<br />

kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />

c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />

d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />

yapılmalıdır.


OLGU 9 (B)<br />

Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />

olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />

sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />

antijen testi çalışıldı.<br />

Strep A Antijen Testi : Negatif bulundu<br />

a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />

yapmaya gerek yoktur.<br />

b) Boğaz kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />

c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />

d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />

yapılmalıdır.


OLGU 9<br />

American Hearth Association<br />

American Academy of Pediatrists<br />

• Semptomatik vakalarda direkt Strep A antijen<br />

testi pozitif çıkması halinde ayrıca kültürle<br />

doğrulamaya gerek yoktur.<br />

• Semptomatik vakalarda direkt Strep A antijen<br />

testi negatif çıkması halinde kültürle<br />

doğrulamak gerekir.


OLGU 9 (A)<br />

Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />

olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />

sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />

antijen testi çalışıldı.<br />

Strep A Antijen Testi : Pozitif bulundu<br />

a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />

yapmaya gerek yoktur.<br />

b) Muhtemel Strep A olarak değerlendirilir. Boğaz<br />

kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />

c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />

d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />

yapılmalıdır.


OLGU 9 (B)<br />

Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />

olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />

sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />

antijen testi çalışıldı.<br />

Strep A Antijen Testi : Negatif bulundu<br />

a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />

yapmaya gerek yoktur.<br />

b) Boğaz kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />

c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />

d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />

yapılmalıdır.


OLGU 10<br />

Hasta 32 yaşında kadın, kadın-doğum hekimi muayene<br />

sonrası vaginal kültür örneği alıyor.<br />

Laboratuvarımızda yapılan kültürde;<br />

Thayer-Martin besiyerinde üreme<br />

gözleniyor.


OLGU 10<br />

Gram boyalı preparat görüntüsü<br />

Oksidaz reaksiyonu (+)<br />

Ne düşünürsünüz?


Hikayenin devamı<br />

OLGU 10<br />

• Doğrulamak amacıyla Vitek 2 compact<br />

sisteminde bakteri test edildi ve N. meningitidis<br />

olarak identifiye edildi.<br />

• API : N. meningitidis<br />

• PCR : N. gonorrhoeae Negatif


OLGU 10<br />

??? !!!


Literatür tarandı<br />

Çok nadir olarak servikal, üretral ve anal<br />

bölgeler gibi olağan dışı örneklerden N.<br />

meningitidis izole edildiği, kadın genital<br />

bölgesinde akıntı ve pelvik ağrısı gibi<br />

semptom oluşturabildiği görüldü.<br />

The Brazilian Journal of Infectious Diseases 2006;10(2):154-155.<br />

Malaysian J Path01 2002; 24(2) : 103 - 105<br />

Genitourin Med. 1990 August; 66(4): 305–306.<br />

Aust. N.Z. J- Med., 1976, 6, pp. 487–489<br />

OLGU 10


Hasta 74 yaşında Ca tanısı almış, kemoterapi görüyor.<br />

Laboratuvardan balgam kültürü istenmiş.<br />

Balgam örneğinin doğrudan Gram boyalı<br />

Preparatından görüntü<br />

OLGU 11


Kültürde kanlı agar besiyerinde 48 saat sonra<br />

oluşan koloniler<br />

OLGU 11


OLGU 11<br />

Kültür plağında yapılan Gram boyalı preparat<br />

Bu bakteri ne olabilir?


Nocardia spp.<br />

Nocardia cinsi bakteriler Gram-pozitif, katalaz<br />

pozitif çomak, dallanan flamanlar şeklinde görülen<br />

bakterilerdir. (Dallanma nedeniyle fungus gibi görülür<br />

ancak gerçek bakterilerdir) Aerobikdir. Kanlı agar gibi<br />

seçici olmayan besiyerlerinde kuru koloniler<br />

görünümünde ürer ancak üremesi yavaştır. (3-5 gün)<br />

Hastalık tablosu özellikle immunokompromize veya<br />

İmmunosüprese hastalarda pnömoni, ensefalit/beyin<br />

absesi formları olarak görülebilir.


OLGU 12<br />

Gebelik nedeniyle kontrol olarak toksoplazma IgG ve<br />

IgM antikorları çalışılan hastada;<br />

Toksoplazma IgG : Negatif<br />

Toksoplazma IgM : Kuvvetli Pozitif bulundu.<br />

2 Hafta sonra testler tekrarlandı ayni sonuçlar bulundu<br />

Nasıl değerlendirirsiniz?<br />

A. Akut dönemde bir toksoplazma enfeksiyonu<br />

şüphesi vardır.<br />

a) Toksoplazma avidite testi öneririz.<br />

b) Toksoplazma PCR testi öneririz.<br />

B. Hasta toksoplazma ile enfekte değildir. İlave<br />

test yapmaya gerek yoktur.


OLGU 12<br />

Gebelik nedeniyle kontrol olarak toksoplazma IgG ve<br />

IgM antikorları çalışılan hastada;<br />

Toksoplazma IgG : Negatif<br />

Toksoplazma IgM : Kuvvetli Pozitif bulundu.<br />

2 Hafta sonra testler tekrarlandı ayni sonuçlar bulundu<br />

Nasıl değerlendirirsiniz?<br />

A. Akut dönemde bir toksoplazma enfeksiyonu<br />

şüphesi vardır.<br />

a) Toksoplazma avidite testi öneririz.<br />

b) Toksoplazma PCR testi öneririz.<br />

B. Hasta toksoplazma ile enfekte değildir. İlave<br />

test yapmaya gerek yoktur.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!