Mikrobiyoloji Pratiği - Düzen Laboratuvarlar Grubu
Mikrobiyoloji Pratiği - Düzen Laboratuvarlar Grubu
Mikrobiyoloji Pratiği - Düzen Laboratuvarlar Grubu
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
MİKROBİYOJİ PRATİĞİ<br />
XXII <strong>Düzen</strong> Klinik Laboratuvar Günleri<br />
12-14 Ekim 2012<br />
Dr. Uğur Çiftçi<br />
<strong>Düzen</strong> <strong>Laboratuvarlar</strong> <strong>Grubu</strong>
Hasta 1 yaşında kız, 38.5 ºC ateş akut ishal<br />
nedeniyle dışkı örneği laboratuvara getiriliyor,<br />
gaita kültürü, gaitada parazit, rotavirus ve<br />
adenovirus yönünden inceleme yapıldı.<br />
• Rotavirus<br />
• Adenovirus<br />
• Gaitada parazit<br />
OLGU 1<br />
Sonuç<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
Negatif
Gaita Kültürü<br />
• Salmonella<br />
• Shigella<br />
• Aeromonas<br />
• Plesiomonas<br />
• Vibrio<br />
• E.coli O157<br />
OLGU 1<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
POZİTİF(Serolojik olarak doğrulandı)
Laboratuvar ne yapmalı ?<br />
Hasta Nasıl Takip<br />
Edilmeli?
Bildirimi Zorunlu Enfeksiyon Etkenleri<br />
GRUP D<br />
• Campylobacter jejuni<br />
• Chlamydia trachomatis<br />
• Cryptosporidium sp<br />
• Entamoeba histolytica<br />
• Enterohemorajik E.coli<br />
• Giardia intestinalis<br />
• Salmonella sp.<br />
• Shigella sp.<br />
• Listeria monocytogenes
• İl Sağlık Müdürlüğü’ne bildirim yapılması<br />
gerekir.<br />
• Hastanın aile fertlerinin taranması<br />
gerektiği bilgisi verilir.<br />
• HUS gelişimi yönünden kan ve idrar<br />
tetkikleri yapılmalıdır.
Pirinç suyu görünümünde dışkı, ateş, kusma<br />
belirtileri ile gelen 6 aylık çocuktan yapılan<br />
Gaita Kültürü;<br />
• Salmonella<br />
• Shigella<br />
• Plesiomonas<br />
• Aeromonas<br />
• Vibrio<br />
Sonuçlandı.<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
Negatif<br />
Aeromonas hydrophila/caviae üredi<br />
Negatif<br />
OLGU 2
OLGU 2<br />
Hastada üreyen Aeromonas<br />
hydrophila/caviae bakterisi etken bakteri<br />
midir?
Aeromonas hydrophila bakterileri daha<br />
ziyade yaz aylarında ve 2 yaşından küçük<br />
çocuklarda ve immuno kompromize<br />
hastalarda ateş, abdominal kramp ve kusma<br />
ile seyreden ishale neden olan bir<br />
mikroorganizmadır. Bazı vakalarda pirinç<br />
suyu görünümünde ishal, bazı vakalarda kan<br />
ve mukusla seyreden dizanteri tarzında bir<br />
tablo görülebilmektedir.<br />
OLGU 2
OLGU 3<br />
Hasta 26 yaşında kadın, erkek arkadaşında<br />
gonorrhoeae saptandığı için muayene edilmiş.<br />
Muayenede beyaz renkli çok hafif bir akıntı<br />
görülmüş ve kültür örneği alınmış. Doğrudan<br />
mikroskobi ve kültür istenmiş.
OLGU 3<br />
Hastanın örneğinden hazırlanan doğrudan mikroskobide<br />
görüntüdeki mikroorganizma nedir?
YANIT: Trichomonas vaginalis
OLGU 3<br />
Bu mikroorganizma nasıl bulaşır? Kadında nasıl<br />
bir klinik tablo oluşturur?
Trichomonas vaginalis cinsel ilişki ile bulaşır.<br />
Kadınlar trichomonas vaginalis ile enfekte<br />
olduklarında genellikle yanma ve kaşıntı<br />
eşliğinde vaginal akıntı görülür, bazen<br />
asemptomatik enfeksiyonlar görülebilir.
OLGU 3<br />
Bu mikroorganizma erkekte nasıl bir klinik tablo<br />
oluşturur.
Trichomonas vaginalis<br />
Erkeklerde genellikle asemptomatiktir.<br />
Nadiren üretral akıntı görülebilir. Bazen<br />
prostatı da enfeksiyon kaplayabilir.
Bu mikroorganizma laboratuvarda nasıl<br />
teşhis edilir?
Trichomonas vaginalis<br />
Trichomonas vaginalis, idrar, vaginal sıvılar ve prostat<br />
sekresyonlarında nativ muayene ile mikroskopta<br />
belirlenebilir. Hareketi tipik olduğu için hareketli<br />
olduğu sürece kolayca tespit edilebilir. Ancak<br />
beklemiş numunelerde direk muayenede lokositlerden<br />
ayırmak mümkün değildir. Hematoxylen boyası ile<br />
boyanırsa ayırt edilebilir.<br />
Laboratuvar imkanları el verirse trichomonas<br />
yönünden mikroskobi yanında kültür yapılması<br />
izolasyon oranını artırmaktadır.
Vaginal Kültür Sonucu<br />
Hasta örneğinden vaginal kültür sonucu<br />
• Neisseria gonorrhoeae üremedi.<br />
• Candida üremedi.<br />
• Trichomonas vaginalis üredi.
OLGU 3<br />
Bu hastanın tedaviden sonra tekrar enfekte<br />
olmaması için nasıl bir önlem alınmalıdır?
Trichomonas vaginalis<br />
Hastanın eşi de tedavi olmalıdır.<br />
(Pinpon topu fenomeni)
OLGU 4<br />
Hasta 58 yaşında erkek bir aydır öksürük, ateş ve<br />
gece terlemeleri yakınması ile kliniğe başvuruyor.<br />
Göğüs grafisi çekiliyor, PPD (+) bulunuyor,<br />
balgamından Ziehl –Neelsen boyalı preparatı<br />
yapılıyor.
OLGU 4<br />
Ziehl –Neelsen boyalı preparatın görüntüsü<br />
a) Mycobacterium<br />
tuberculosis bakterisi<br />
b) Gram negatif basil<br />
c) Atipik mikobakteri<br />
d) Aside dirençli basil
OLGU 4<br />
Ziehl –Neelsen boyalı preparatın görüntüsü<br />
a) Mycobacterium<br />
tuberculosis bakterisi<br />
b) Gram negatif basil<br />
c) Atipik mikobakteri<br />
d) Aside dirençli basil
Doktor muayene bulguları ve eldeki sonuçlara<br />
göre hastaya tüberküloz teşhisi kondu ve<br />
tedaviye başladı. Aynı çatı altında yaşayan<br />
hastanın 48 yaşındaki karısı kontrole alındı.<br />
• Genel durumu iyi semptom yok<br />
• Akciğer grafisi normal<br />
OLGU 4<br />
• Ziehl-Neelsen preparatı ARB (-)<br />
• PPD +/- (sonuç alınamadı) hastanın alerjik<br />
reaksiyonu var.
OLGU 4<br />
Hekim tatmin olmadı Quantiferon testi istedi<br />
Quantiferon testi sonucu POZİTİF geldi.<br />
a) Aktif tüberküloz enfeksiyonu vardır.<br />
b) Latent tuberküloz enfeksiyonu vakasıdır.<br />
c) Tbc ile enfekte değildir.<br />
d) Mycobacterium tuberculosis ile enfekte<br />
olmuştur ancak bu test aktif veya latent<br />
tüberkuloz ayırımını yapmaz.
OLGU 4<br />
Hekim tatmin olmadı Quantiferon testi istedi<br />
Quantiferon testi sonucu POZİTİF geldi.<br />
a) Aktif tüberküloz enfeksiyonu vardır.<br />
b) Latent tuberküloz enfeksiyonu vakasıdır.<br />
c) Tbc ile enfekte değildir.<br />
d) Mycobacterium tuberculosis ile enfekte<br />
olmuştur ancak bu test aktif veya latent<br />
tüberkuloz ayırımını yapmaz.
OLGU 5<br />
Kan bağışı için kan bankasına giden 25 yaşında erkek anti<br />
HCV pozitifliği nedeniyle doğrulama için laboratuvara<br />
yönlendiriliyor. Laboratuvarda tekrarlanan anti HCV<br />
(Abbott) testi 6.0 S/Co (signal/cut-off) değeri ile pozitif<br />
olarak teyit ediliyor.<br />
HCV enfeksiyon varlığı için en doğru yanıt hangisidir?<br />
a) Test sonucu yeterli kanıttır.<br />
b) RIBA ile doğrulamak gerekir.<br />
c) HCV RNA ile doğrulamak gerekir.<br />
d) ALT ile doğrulamak gerekir.
OLGU 5<br />
Kan bağışı için kan bankasına giden 25 yaşında erkek anti<br />
HCV pozitifliği nedeniyle doğrulama için laboratuvara<br />
yönlendiriliyor. Laboratuvarda tekrarlanan anti HCV<br />
(Abbott) testi 6.0 S/Co (signal/cut-off) değeri ile pozitif<br />
olarak teyit ediliyor.<br />
HCV enfeksiyon varlığı için en doğru yanıt hangisidir?<br />
a) Test sonucu yeterli kanıttır.<br />
b) RIBA ile doğrulamak gerekir.<br />
c) HCV RNA ile doğrulamak gerekir.<br />
d) ALT ile doğrulamak gerekir.
Hasta klinik değerlendirmeye alınıyor, hikayesinde<br />
hepatit olgusu yok, hekimi HCV RNA istiyor, HCV RNA<br />
Cobas Taqman (Roche) sistemi ile Negatif (
Hasta klinik değerlendirmeye alınıyor, hikayesinde<br />
hepatit olgusu yok, hekimi HCV RNA istiyor, HCV RNA<br />
Cobas Taqman (Roche) sistemi ile Negatif (
Bir laboratuvar çalışanı kontrol amacıyla anti HCV<br />
testi yaptırıyor ve Negatif bulunuyor. Birkaç gün sonra<br />
bir laboratuvar kazası sonucu HCV pozitif bir hastanın<br />
kanının alındığı enjektör iğnesi elini çiziyor. Kontrol<br />
için laboratuvarımıza geliyor.<br />
Öncelikle hangi testi yapmalıyız?<br />
a) Anti HCV<br />
b) HCV RNA<br />
c) RIBA<br />
d) ALT<br />
OLGU 6
Bir laboratuvar çalışanı kontrol amacıyla anti HCV<br />
testi yaptırıyor ve Negatif bulunuyor. Birkaç gün sonra<br />
bir laboratuvar kazası sonucu HCV pozitif bir hastanın<br />
kanının alındığı enjektör iğnesi elini çiziyor. Kontrol<br />
için laboratuvarımıza geliyor.<br />
Öncelikle hangi testi yapmalıyız?<br />
a) Anti HCV<br />
b) HCV RNA<br />
c) RIBA<br />
d) ALT<br />
OLGU 6
HCV RNA testini ne zaman yapmalıyız?<br />
En doğru cevap hangisidir?<br />
a) Hemen<br />
b) 2 hafta sonra, negatif ise 1 ay sonra tekrar<br />
c) 3 ay sonra<br />
d) 6 ay sonra<br />
OLGU 6
HCV RNA testini ne zaman yapmalıyız?<br />
En doğru cevap hangisidir?<br />
a) Hemen<br />
b) 2 hafta sonra, negatif ise 1 ay sonra tekrar<br />
c) 3 ay sonra<br />
d) 6 ay sonra<br />
OLGU 6
OLGU 7<br />
Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />
hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda<br />
Beta hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />
Streptococcus agalactica (B grubu Streptokok) olarak<br />
identifiye ediyor.<br />
a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />
b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />
c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />
olmayabilir.<br />
d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.
OLGU 7<br />
Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />
hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda<br />
Beta hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />
Streptococcus agalactica (B grubu Streptokok) olarak<br />
identifiye ediyor.<br />
a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />
b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />
c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />
olmayabilir.<br />
d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.
OLGU 8<br />
Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />
hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda Beta<br />
hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />
Streptococcus dysgalactiae spp. olarak identifiye ediliyor.<br />
a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />
b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />
c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />
olmayabilir.<br />
d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.
OLGU 8<br />
Hasta 7 yaşında çocuk, boğaz ağrısı ve ateş nedeniyle<br />
hekim boğaz kültürü istiyor. Boğaz kültürü sonucunda Beta<br />
hemolitik Streptokok ürüyor, MALDI-TOF MS ile<br />
Streptococcus dysgalactiae spp. olarak identifiye ediyor.<br />
a) İzolat boğazdaki enfeksiyonun etkenidir.<br />
b) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni değildir.<br />
c) Boğazdaki enfeksiyonun etkeni olabilir veya<br />
olmayabilir.<br />
d) Sonuç yanlıştır, testi tekrar etmek gerekir.
OLGU 9 (A)<br />
Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />
olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />
sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />
antijen testi çalışıldı.<br />
Strep A Antijen Testi : Pozitif bulundu<br />
a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />
yapmaya gerek yoktur.<br />
b) Muhtemel Strep A olarak değerlendirilir. Boğaz<br />
kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />
c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />
d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />
yapılmalıdır.
OLGU 9 (B)<br />
Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />
olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />
sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />
antijen testi çalışıldı.<br />
Strep A Antijen Testi : Negatif bulundu<br />
a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />
yapmaya gerek yoktur.<br />
b) Boğaz kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />
c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />
d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />
yapılmalıdır.
OLGU 9<br />
American Hearth Association<br />
American Academy of Pediatrists<br />
• Semptomatik vakalarda direkt Strep A antijen<br />
testi pozitif çıkması halinde ayrıca kültürle<br />
doğrulamaya gerek yoktur.<br />
• Semptomatik vakalarda direkt Strep A antijen<br />
testi negatif çıkması halinde kültürle<br />
doğrulamak gerekir.
OLGU 9 (A)<br />
Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />
olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />
sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />
antijen testi çalışıldı.<br />
Strep A Antijen Testi : Pozitif bulundu<br />
a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />
yapmaya gerek yoktur.<br />
b) Muhtemel Strep A olarak değerlendirilir. Boğaz<br />
kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />
c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />
d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />
yapılmalıdır.
OLGU 9 (B)<br />
Üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları<br />
olan 2 yaşında çocuktan alınan boğaz<br />
sürüntüsü örneğinde doğrudan Strep A<br />
antijen testi çalışıldı.<br />
Strep A Antijen Testi : Negatif bulundu<br />
a) Sonuç tanı için yeterlidir. Boğaz kültürü<br />
yapmaya gerek yoktur.<br />
b) Boğaz kültürü ile doğrulanmalıdır.<br />
c) Sonuç güvenilir değildir tekrar edilmelidir.<br />
d) Bu test gereksizdir, yalnızca boğaz kültürü<br />
yapılmalıdır.
OLGU 10<br />
Hasta 32 yaşında kadın, kadın-doğum hekimi muayene<br />
sonrası vaginal kültür örneği alıyor.<br />
Laboratuvarımızda yapılan kültürde;<br />
Thayer-Martin besiyerinde üreme<br />
gözleniyor.
OLGU 10<br />
Gram boyalı preparat görüntüsü<br />
Oksidaz reaksiyonu (+)<br />
Ne düşünürsünüz?
Hikayenin devamı<br />
OLGU 10<br />
• Doğrulamak amacıyla Vitek 2 compact<br />
sisteminde bakteri test edildi ve N. meningitidis<br />
olarak identifiye edildi.<br />
• API : N. meningitidis<br />
• PCR : N. gonorrhoeae Negatif
OLGU 10<br />
??? !!!
Literatür tarandı<br />
Çok nadir olarak servikal, üretral ve anal<br />
bölgeler gibi olağan dışı örneklerden N.<br />
meningitidis izole edildiği, kadın genital<br />
bölgesinde akıntı ve pelvik ağrısı gibi<br />
semptom oluşturabildiği görüldü.<br />
The Brazilian Journal of Infectious Diseases 2006;10(2):154-155.<br />
Malaysian J Path01 2002; 24(2) : 103 - 105<br />
Genitourin Med. 1990 August; 66(4): 305–306.<br />
Aust. N.Z. J- Med., 1976, 6, pp. 487–489<br />
OLGU 10
Hasta 74 yaşında Ca tanısı almış, kemoterapi görüyor.<br />
Laboratuvardan balgam kültürü istenmiş.<br />
Balgam örneğinin doğrudan Gram boyalı<br />
Preparatından görüntü<br />
OLGU 11
Kültürde kanlı agar besiyerinde 48 saat sonra<br />
oluşan koloniler<br />
OLGU 11
OLGU 11<br />
Kültür plağında yapılan Gram boyalı preparat<br />
Bu bakteri ne olabilir?
Nocardia spp.<br />
Nocardia cinsi bakteriler Gram-pozitif, katalaz<br />
pozitif çomak, dallanan flamanlar şeklinde görülen<br />
bakterilerdir. (Dallanma nedeniyle fungus gibi görülür<br />
ancak gerçek bakterilerdir) Aerobikdir. Kanlı agar gibi<br />
seçici olmayan besiyerlerinde kuru koloniler<br />
görünümünde ürer ancak üremesi yavaştır. (3-5 gün)<br />
Hastalık tablosu özellikle immunokompromize veya<br />
İmmunosüprese hastalarda pnömoni, ensefalit/beyin<br />
absesi formları olarak görülebilir.
OLGU 12<br />
Gebelik nedeniyle kontrol olarak toksoplazma IgG ve<br />
IgM antikorları çalışılan hastada;<br />
Toksoplazma IgG : Negatif<br />
Toksoplazma IgM : Kuvvetli Pozitif bulundu.<br />
2 Hafta sonra testler tekrarlandı ayni sonuçlar bulundu<br />
Nasıl değerlendirirsiniz?<br />
A. Akut dönemde bir toksoplazma enfeksiyonu<br />
şüphesi vardır.<br />
a) Toksoplazma avidite testi öneririz.<br />
b) Toksoplazma PCR testi öneririz.<br />
B. Hasta toksoplazma ile enfekte değildir. İlave<br />
test yapmaya gerek yoktur.
OLGU 12<br />
Gebelik nedeniyle kontrol olarak toksoplazma IgG ve<br />
IgM antikorları çalışılan hastada;<br />
Toksoplazma IgG : Negatif<br />
Toksoplazma IgM : Kuvvetli Pozitif bulundu.<br />
2 Hafta sonra testler tekrarlandı ayni sonuçlar bulundu<br />
Nasıl değerlendirirsiniz?<br />
A. Akut dönemde bir toksoplazma enfeksiyonu<br />
şüphesi vardır.<br />
a) Toksoplazma avidite testi öneririz.<br />
b) Toksoplazma PCR testi öneririz.<br />
B. Hasta toksoplazma ile enfekte değildir. İlave<br />
test yapmaya gerek yoktur.