ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...

3. MATERYAL ve METOT Kadir Uğurtan YILMAZ
3.2.3.10. Morfolojik Özelliklere ve Pomolojik Analiz Sonuçlarına Ait Verilerin
Değerlendirilmesi
Çalışmada ele alınan kayısı genotiplerine ait morfolojik özelliklere ve
pomolojik analiz sonuçlarına ait verilerin istatistik analizlerinde, Temel Koordinatlar
Analizi (Principle Coordinate Analysis = PCoA), Temel Bileşenler Analizi (Principle
Component Analysis = PCA) ve pomolojik özellikler arasındaki korelasyon
hesaplamaları, SAS (SAS version 8.02, SAS Institute, Cary, NC) adlı bilgisayar
paket programı kullanılarak yapılırken, elde edilen verilerden morfolojik uzaklık
indekslerinin hesaplanmasında NTSYSpc 2.11V (Rohlf, 2004) adlı bilgisayar paket
programı kullanılmış, bu verilere ait soyağacının elde edilmesinde UPGMA
(Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) yöntemi uygulanmıştır.
3.2.4. Moleküler Genetik Çalışmalar
3.2.4.1. Yaprak Örneklerinin Toplanması
94 kayısı genotipine ait yaprak örnekleri 2004 yılının ilkbaharında Malatya
Meyvecilik Araştırma Enstitüsü Ulusal Kayısı Gen Kaynakları Parseli ve Battalgazi
İlçesi Alişar Köyü’nden toplanmıştır. Toplanan genç yapraklar ayrı ayrı kese
kağıtlarına konulduktan sonra buz kutusu içerisinde Adana’ya Çukurova
Üniversitesi’ne ulaştırılmıştır. Yaprak örnekleri önce çeşme suyu ve sonrasında da
%50’lik etil alkolle yıkandıktan ve ıslaklıkları giderilinceye kadar kurutulduktan
sonra sıvı azot (-196 o C) ile muamele edilerek DNA izolasyonu için –80 o C’lik derin
dondurucuda muhafazaya alınmıştır.
3.2.4.2. DNA İzolasyonu
DNA ekstraksiyonu için ön çalışma yapılmış ve Doyle ve Doyle (1987)’nin
geliştirdiği ve Kafkas ve Perl-Treves (2001) tarafından modifiye edilen CTAB
yöntemi oldukça iyi sonuç vermiştir. Bu nedenle, bu çalışmada laboratuarda rütin
olarak kullanılan ve aşağıda tarif edilen yöntem uygulanmıştır.
Bu yöntemde; 0.5 g genç yaprak örneği, içerisinde sıvı azot bulunan
havanda iyice ezilir ve 1.5 mililitrelik üç adet eppendorf tübe eşit olacak şekilde
41