ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ... ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...

library.cu.edu.tr
from library.cu.edu.tr More from this publisher
19.07.2013 Views

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ bildirdikleriyle benzer olduğunu belirtmiştir. Dolayısıyla yapılan bu çalışmadan elde edilen sonuçlar da öteki araştırmacılarınkine benzer bulunmuştur. Hormaza (2002) yaptığı çalışmada kullandığı SSR primerleri ile kayısı genotiplerinin tümünü ayırabilmesine karşın, 96 genotip kayısı ile yapılan bu çalışmada kullanılan primer çiftleri Sakıt-1, Sakıt-2 ve Dörtyol-1 ile 07-K-01 ve 07- K-09 kayısıları arasındaki farklılıkları ortaya çıkaramamıştır. 4.3.3.2. Kayısı Genotiplerinin SSR Yöntemi ile Aralarındaki Genetik İlişkilerinin Belirlenmesi Kayısı genotipleri arasındaki benzerlik indeksini belirlemek amaçlı SSR verileri kullanılarak yapılan istatistiksel analizlere göre elde edilen Jaccard indeksi 0.20–1.00 arasında değişim göstermiştir. Tüm kayısı çeşit ve genotipleri arasındaki genetik benzerlik indeksleri Ek 7’de verilmiştir. SSR analizlerinde Sakıt-2 ile Dörtyol-1 (1.00), Sakıt-1 ile Dörtyol-1 (1.00), Sakıt-1 ile Sakıt-2 (1.00), 07-K-01 ile 07-K-09 (1.00) birbirinden ayırt edilememiştir. En yakın genotipler ise Şekerpare Iğdır ile Şekerpare Benzeri (0.97) ve Çanakkale ile Mehmet Yüksel 1860 (0.95) olmuştur. Genel olarak 96 kayısı genotipinden elde edilen değerlere göre, sırasıyla genetik olarak en uzak genotiplerin başında 92-23-01 ile İmrahor (0.20), Alyanak ile İri Bitirgen (0.23), Paşa Mişmişi ile İmrahor (0.23), Kayısı Eriği ile Sivas (PA) (0.23), Şam ile İmrahor (0.24), Turfanda İzmir ile GÜ-8 (0.24) ve Sivas (PA) ile 92- 23-01 (0.24) gelmektedir (Ek 7). Elde edilen soyağacına göre 96 kayısı genotipi farklı gruplara ayrılmıştır. Soyağacında küçüklü büyüklü 7 alt grup oluşmuştur (Ek 8). Kayısı Eriği bu alt grupların arasında fakat bu gruplardan ayrı bir yerde bulunurken Sivas (PA) genotipi grupların dışında kalmıştır. Ülkemizin önemli kurutmalık çeşitleri Hacıhaliloğlu, Kabaaşı, Çataloğlu, Soğancı gibi kayısılar birinci alt grup içinde yer almışlardır. Iğdır’ın önemli kayısı çeşitlerinden Aprikoz ikinci alt grupta yer alırken, Geç Aprikoz ve Güz Aprikozu üçüncü alt grupta yer almışlardır. ISSR ve RAPD’e dikkat çeker bir şekilde hemen hemen aynı gruplarda yer alan Akdeniz Bölgesi kayısıları burada da daha çok ikinci ve dördüncü alt gruplarda yoğunlaşmışlardır. Öteki 300

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ yöntemlerde de olduğu gibi en dikkat çekici sonuçlardan bir tanesi 07-K grubu kayısıların öteki yöntemlerde de olduğu gibi bir grupta toplanmış olmalarıdır. Soyağacında dikkat çeken önemli sonuçlardan birisi de Şekerpare, Şekerpare Iğdır ve Şekerpare Benzeri genotiplerinin RAPD’de olduğu gibi SSR’da da aynı grup içinde yer almalarıdır (Ek 8). Hormaza (2002) çalışmasında Watkins (1976)’in Prunus cinsini 5 alt grupta toplamasına rağmen günümüzde bunlardan en çok üçünün [Amygdalus (Şeftali ve Badem), Prunophora (Erik ve Kayısı) ve Cerasus (Vişne ve Kiraz)] göz önünde olduğunu, moleküler çalışmalarda Amygdalus ve Cerasus için geliştirilen primerlerin Prunophora içinde başarılı bir şekilde kullanılabileceğini belirtmiştir. 4.3.4. ISSR, RAPD ve SSR Verilerinin Birlikte Değerlendirilmesi ve Karşılaştırılması 4.3.4.1. ISSR, RAPD ve SSR Tekniklerinin Polimorfizm ve Ayırma Gücü Bakımından Karşılaştırılması ISSR, RAPD ve SSR tekniklerinin polimorfizm ve ayırma gücü bakımından karşılaştırılması Çizelge 4.293.’de verilmiştir. ISSR, RAPD ve SSR teknikleri polimorfizm ve ayırma gücü bakımından karşılaştırıldığında, ISSR tekniğinden toplam 164 bant elde edilmiş, bunlardan 145 adedi polimorfik olarak tespit edilmiştir. RAPD tekniğinde ise toplam 130 adet bant elde edilmiş, bunlardan ise 99 adedinin polimorfik olduğu saptanmıştır. SSR tekniğinde ise toplam 84 adet bant elde edilmiş, bunlardan ise 83 adedi polimorfik bant olarak saptanmıştır. Çalışmada 16 adet SSR primeri kullanılırken ISSR ve RAPD yöntemlerinde 20’şer adet primer kullanılmıştır. Bu bilgiler ışığında ISSR tekniği toplam ve polimorfik bant sayısı bakımından RAPD ve SSR tekniklerine göre daha iyi sonuç vermiştir (Çizelge 4.293.). 301

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ<br />

yöntemlerde de olduğu gibi en dikkat çekici sonuçlardan bir tanesi 07-K grubu<br />

kayısıların öteki yöntemlerde de olduğu gibi bir grupta toplanmış olmalarıdır.<br />

Soyağacında dikkat çeken önemli sonuçlardan birisi de Şekerpare, Şekerpare Iğdır ve<br />

Şekerpare Benzeri genotiplerinin RAPD’de olduğu gibi SSR’da da aynı grup içinde<br />

yer almalarıdır (Ek 8).<br />

Hormaza (2002) çalışmasında Watkins (1976)’in Prunus cinsini 5 alt<br />

grupta toplamasına rağmen günümüzde bunlardan en çok üçünün [Amygdalus<br />

(Şeftali ve Badem), Prunophora (Erik ve Kayısı) ve Cerasus (Vişne ve Kiraz)] göz<br />

önünde olduğunu, moleküler çalışmalarda Amygdalus ve Cerasus için geliştirilen<br />

primerlerin Prunophora içinde başarılı bir şekilde kullanılabileceğini belirtmiştir.<br />

4.3.4. ISSR, RAPD ve SSR Verilerinin Birlikte Değerlendirilmesi ve<br />

Karşılaştırılması<br />

4.3.4.1. ISSR, RAPD ve SSR Tekniklerinin Polimorfizm ve Ayırma Gücü<br />

Bakımından Karşılaştırılması<br />

ISSR, RAPD ve SSR tekniklerinin polimorfizm ve ayırma gücü bakımından<br />

karşılaştırılması Çizelge 4.293.’de verilmiştir.<br />

ISSR, RAPD ve SSR teknikleri polimorfizm ve ayırma gücü bakımından<br />

karşılaştırıldığında, ISSR tekniğinden toplam 164 bant elde edilmiş, bunlardan 145<br />

adedi polimorfik olarak tespit edilmiştir. RAPD tekniğinde ise toplam 130 adet bant<br />

elde edilmiş, bunlardan ise 99 adedinin polimorfik olduğu saptanmıştır. SSR<br />

tekniğinde ise toplam 84 adet bant elde edilmiş, bunlardan ise 83 adedi polimorfik<br />

bant olarak saptanmıştır.<br />

Çalışmada 16 adet SSR primeri kullanılırken ISSR ve RAPD yöntemlerinde<br />

20’şer adet primer kullanılmıştır. Bu bilgiler ışığında ISSR tekniği toplam ve<br />

polimorfik bant sayısı bakımından RAPD ve SSR tekniklerine göre daha iyi sonuç<br />

vermiştir (Çizelge 4.293.).<br />

301

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!