ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...
ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ... ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...
4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ bildirdikleriyle benzer olduğunu belirtmiştir. Dolayısıyla yapılan bu çalışmadan elde edilen sonuçlar da öteki araştırmacılarınkine benzer bulunmuştur. Hormaza (2002) yaptığı çalışmada kullandığı SSR primerleri ile kayısı genotiplerinin tümünü ayırabilmesine karşın, 96 genotip kayısı ile yapılan bu çalışmada kullanılan primer çiftleri Sakıt-1, Sakıt-2 ve Dörtyol-1 ile 07-K-01 ve 07- K-09 kayısıları arasındaki farklılıkları ortaya çıkaramamıştır. 4.3.3.2. Kayısı Genotiplerinin SSR Yöntemi ile Aralarındaki Genetik İlişkilerinin Belirlenmesi Kayısı genotipleri arasındaki benzerlik indeksini belirlemek amaçlı SSR verileri kullanılarak yapılan istatistiksel analizlere göre elde edilen Jaccard indeksi 0.20–1.00 arasında değişim göstermiştir. Tüm kayısı çeşit ve genotipleri arasındaki genetik benzerlik indeksleri Ek 7’de verilmiştir. SSR analizlerinde Sakıt-2 ile Dörtyol-1 (1.00), Sakıt-1 ile Dörtyol-1 (1.00), Sakıt-1 ile Sakıt-2 (1.00), 07-K-01 ile 07-K-09 (1.00) birbirinden ayırt edilememiştir. En yakın genotipler ise Şekerpare Iğdır ile Şekerpare Benzeri (0.97) ve Çanakkale ile Mehmet Yüksel 1860 (0.95) olmuştur. Genel olarak 96 kayısı genotipinden elde edilen değerlere göre, sırasıyla genetik olarak en uzak genotiplerin başında 92-23-01 ile İmrahor (0.20), Alyanak ile İri Bitirgen (0.23), Paşa Mişmişi ile İmrahor (0.23), Kayısı Eriği ile Sivas (PA) (0.23), Şam ile İmrahor (0.24), Turfanda İzmir ile GÜ-8 (0.24) ve Sivas (PA) ile 92- 23-01 (0.24) gelmektedir (Ek 7). Elde edilen soyağacına göre 96 kayısı genotipi farklı gruplara ayrılmıştır. Soyağacında küçüklü büyüklü 7 alt grup oluşmuştur (Ek 8). Kayısı Eriği bu alt grupların arasında fakat bu gruplardan ayrı bir yerde bulunurken Sivas (PA) genotipi grupların dışında kalmıştır. Ülkemizin önemli kurutmalık çeşitleri Hacıhaliloğlu, Kabaaşı, Çataloğlu, Soğancı gibi kayısılar birinci alt grup içinde yer almışlardır. Iğdır’ın önemli kayısı çeşitlerinden Aprikoz ikinci alt grupta yer alırken, Geç Aprikoz ve Güz Aprikozu üçüncü alt grupta yer almışlardır. ISSR ve RAPD’e dikkat çeker bir şekilde hemen hemen aynı gruplarda yer alan Akdeniz Bölgesi kayısıları burada da daha çok ikinci ve dördüncü alt gruplarda yoğunlaşmışlardır. Öteki 300
4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ yöntemlerde de olduğu gibi en dikkat çekici sonuçlardan bir tanesi 07-K grubu kayısıların öteki yöntemlerde de olduğu gibi bir grupta toplanmış olmalarıdır. Soyağacında dikkat çeken önemli sonuçlardan birisi de Şekerpare, Şekerpare Iğdır ve Şekerpare Benzeri genotiplerinin RAPD’de olduğu gibi SSR’da da aynı grup içinde yer almalarıdır (Ek 8). Hormaza (2002) çalışmasında Watkins (1976)’in Prunus cinsini 5 alt grupta toplamasına rağmen günümüzde bunlardan en çok üçünün [Amygdalus (Şeftali ve Badem), Prunophora (Erik ve Kayısı) ve Cerasus (Vişne ve Kiraz)] göz önünde olduğunu, moleküler çalışmalarda Amygdalus ve Cerasus için geliştirilen primerlerin Prunophora içinde başarılı bir şekilde kullanılabileceğini belirtmiştir. 4.3.4. ISSR, RAPD ve SSR Verilerinin Birlikte Değerlendirilmesi ve Karşılaştırılması 4.3.4.1. ISSR, RAPD ve SSR Tekniklerinin Polimorfizm ve Ayırma Gücü Bakımından Karşılaştırılması ISSR, RAPD ve SSR tekniklerinin polimorfizm ve ayırma gücü bakımından karşılaştırılması Çizelge 4.293.’de verilmiştir. ISSR, RAPD ve SSR teknikleri polimorfizm ve ayırma gücü bakımından karşılaştırıldığında, ISSR tekniğinden toplam 164 bant elde edilmiş, bunlardan 145 adedi polimorfik olarak tespit edilmiştir. RAPD tekniğinde ise toplam 130 adet bant elde edilmiş, bunlardan ise 99 adedinin polimorfik olduğu saptanmıştır. SSR tekniğinde ise toplam 84 adet bant elde edilmiş, bunlardan ise 83 adedi polimorfik bant olarak saptanmıştır. Çalışmada 16 adet SSR primeri kullanılırken ISSR ve RAPD yöntemlerinde 20’şer adet primer kullanılmıştır. Bu bilgiler ışığında ISSR tekniği toplam ve polimorfik bant sayısı bakımından RAPD ve SSR tekniklerine göre daha iyi sonuç vermiştir (Çizelge 4.293.). 301
- Page 289 and 290: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 291 and 292: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 293 and 294: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 295 and 296: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 297 and 298: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 299 and 300: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 301 and 302: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 303 and 304: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 305 and 306: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 307 and 308: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 309 and 310: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 311 and 312: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 313 and 314: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 315 and 316: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 317 and 318: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 319 and 320: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 321 and 322: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 323 and 324: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 325 and 326: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 327 and 328: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 329 and 330: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 331 and 332: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 333 and 334: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 335 and 336: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 337 and 338: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 339: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 343 and 344: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 345 and 346: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 347 and 348: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 349 and 350: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 351 and 352: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 353 and 354: 5. SONUÇ ve ÖNERİLER Kadir Uğur
- Page 355 and 356: 5. SONUÇ ve ÖNERİLER Kadir Uğur
- Page 357 and 358: the Mediterranean Region for the Pr
- Page 359 and 360: ÇETİNER, S., 1981. Türkiye Bitki
- Page 361 and 362: di Estinzione. Atti del Congresso s
- Page 363 and 364: Turkey. ISHS Xth International Symp
- Page 365 and 366: Marker Systems for the Analysis of
- Page 367 and 368: Conditions. XIV. International Symp
- Page 369 and 370: of the Utility of SSR Loci as Molec
- Page 371 and 372: Random Amplified Polymorphic DNA An
- Page 373 and 374: 31-K-03 07-K-11 Dörtyol-4 Sakıt-3
- Page 375 and 376: 31-K-03 31-K-05 07-K-11 Dörtyol-4
- Page 377 and 378: 31-K-03 31-K-05 07-K-11 Dörtyol-4
- Page 379 and 380: TokalogluKonyaErMW Ek 4. 96 genotip
- Page 381 and 382: TokalogluKonyaErMW Ek 8. 96 genotip
4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ<br />
yöntemlerde de olduğu gibi en dikkat çekici sonuçlardan bir tanesi 07-K grubu<br />
kayısıların öteki yöntemlerde de olduğu gibi bir grupta toplanmış olmalarıdır.<br />
Soyağacında dikkat çeken önemli sonuçlardan birisi de Şekerpare, Şekerpare Iğdır ve<br />
Şekerpare Benzeri genotiplerinin RAPD’de olduğu gibi SSR’da da aynı grup içinde<br />
yer almalarıdır (Ek 8).<br />
Hormaza (2002) çalışmasında Watkins (1976)’in Prunus cinsini 5 alt<br />
grupta toplamasına rağmen günümüzde bunlardan en çok üçünün [Amygdalus<br />
(Şeftali ve Badem), Prunophora (Erik ve Kayısı) ve Cerasus (Vişne ve Kiraz)] göz<br />
önünde olduğunu, moleküler çalışmalarda Amygdalus ve Cerasus için geliştirilen<br />
primerlerin Prunophora içinde başarılı bir şekilde kullanılabileceğini belirtmiştir.<br />
4.3.4. ISSR, RAPD ve SSR Verilerinin Birlikte Değerlendirilmesi ve<br />
Karşılaştırılması<br />
4.3.4.1. ISSR, RAPD ve SSR Tekniklerinin Polimorfizm ve Ayırma Gücü<br />
Bakımından Karşılaştırılması<br />
ISSR, RAPD ve SSR tekniklerinin polimorfizm ve ayırma gücü bakımından<br />
karşılaştırılması Çizelge 4.293.’de verilmiştir.<br />
ISSR, RAPD ve SSR teknikleri polimorfizm ve ayırma gücü bakımından<br />
karşılaştırıldığında, ISSR tekniğinden toplam 164 bant elde edilmiş, bunlardan 145<br />
adedi polimorfik olarak tespit edilmiştir. RAPD tekniğinde ise toplam 130 adet bant<br />
elde edilmiş, bunlardan ise 99 adedinin polimorfik olduğu saptanmıştır. SSR<br />
tekniğinde ise toplam 84 adet bant elde edilmiş, bunlardan ise 83 adedi polimorfik<br />
bant olarak saptanmıştır.<br />
Çalışmada 16 adet SSR primeri kullanılırken ISSR ve RAPD yöntemlerinde<br />
20’şer adet primer kullanılmıştır. Bu bilgiler ışığında ISSR tekniği toplam ve<br />
polimorfik bant sayısı bakımından RAPD ve SSR tekniklerine göre daha iyi sonuç<br />
vermiştir (Çizelge 4.293.).<br />
301