ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ
allel üretmiş olup, pchgms-2 ile UDP 98-409 lokusu ise en fazla (7 adet) alleli
vermiştir.
Polimorfik bant sayısı bakımından primer çiftleri yine aynı değerlere sahip
olmuşlardır. Bu çalışmada UDP 96-008 SSR lokusu dışındaki tüm lokuslardaki
toplam allel sayısı ile polimorfik allel sayısı birbirinin aynısı olmuş yani 15 lokusun
polimorfizm oranı %100.0 olmuştur. UDP 96-008 lokusunda ise toplam allel sayısı 3
iken, polimorfik allel sayısı 2 olarak belirlenmiştir. SSR analizlerinde kullanılan
primer çiftlerinin polimorfizm oranı bu çalışmada % 98.0 olarak bulunmuştur.
Çizelge 4.292. SSR primerlerinin amplifikasyonu sonucu elde edilen toplam allel
sayıları (TAS), polimorfik allel sayıları (PAS), polimorfizm oranı
(PO), polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) ve primerin ayırma gücü (AG)
No Primer
değerleri
Toplam
Allel
Sayısı
Polimorfik
Allel
Sayısı
298
Polimorfizm
Oranı
(%)
Polimorfizm
Bilgi
İçeriği
Ayırma
Gücü
1 pchgms-1 5 5 100 0.598 1.138
2 pchgms-2 7 7 100 0.772 0.729
3 pchgms-3 3 3 100 0.594 1.153
4 pchgms-4 4 4 100 0.610 1.078
5 PS12A02 4 4 100 0.475 1.297
6 UDP 96-001 4 4 100 0.871 0.510
7 UDP 96-003 6 6 100 0.814 0.670
8 UDP 96-005 6 6 100 0.688 1.000
9 UDP 96-008 3 2 67 0.974 0.250
10 UDP 96-010 4 4 100 0.845 0.708
11 UDP 96-019 2 2 100 0.498 1.344
12 UDP 97-402 5 5 100 0.764 0.800
13 UDP 98-021 4 4 100 0.824 0.776
14 UDP 98-405 3 3 100 0.628 1.028
15 UDP 98-406 6 6 100 0.846 0.715
16 UDP 98-409 7 7 100 0.764 0.771
Toplam 84 83 - - 15.52
Ortalama 4.70 4.60 98 0.729 -
SSR lokuslarının polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) ve ayırma güçleri de bu
çalışmada değerlendirilmiştir. SSR analizlerinde ortalama polimorfizm bilgi içeriği
değeri 0.729 olarak bulunmuştur. En düşük (0.475) polimorfizm bilgi içeriği değeri
PS12A02 lokusundan, en yüksek (0.974) polimorfizm bilgi içeriği değeri ise UDP
96-008 lokusundan elde edilmiştir.