ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...
ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ... ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...
4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ ISSR yönteminde de morfolojik değerlendirmelerde olduğu gibi 02-K-15, 07 grubu içerisinde yer almıştır. Bu sonuç da aslında bu genotipin 07-K-15 tipi olduğunu, bu tipin Genetik Kaynaklar Parseli’nde hem tabelasının yanlış yazıldığı hem de parsel planına yanlışlıkla 02-K-15 olarak işlendiği belirlenmiştir (Ek 4). 4.3.2. RAPD Analizleri Bu çalışmada RAPD tekniği 96 kayısı genotipini karakterize etme ve aralarındaki genetik ilişkiyi ortaya çıkarma amacı ile kullanılan bir diğer yöntemdir. Bu teknikte kayısı genotipleri için en polimorfik RAPD primerlerini saptamak amacıyla ilk olarak 7 kayısı genotipinde toplam 160 adet OPERON serisi RAPD primeri test edilmiştir. Şekil 4.96. 48 kayısı genotipinde OPA07 nolu RAPD primerinin amplifikasyon ürünleri [sırasıyla 49’dan 96’ya kadar olan genotipler (Çizelge 3.1.)] Tarama işleminden sonra en polimorfik olarak saptanan 20 adet RAPD primeri 96 adet kayısı çeşit ve genotipinde test edilmiştir. OPA07 primerinin denemede yer alan bazı kayısı genotiplerindeki amplifikasyonu sonucu elde edilen ürünlerin gösterildiği jel görüntüleri Şekil 4.96.’da verilmiştir. Şekil 4.96.’da görüldüğü gibi, OPA07 RAPD primerinin 96 kayısı genotipi ile yapılan PCR amplifikasyonu sonucu oluşan ürünlerin 48 kayısı genotipini (49’dan 96’ya kadar olan genotipler) temsil eden jel resminde; 8 bandın 6’sının polimorfik olduğu tespit edilmiştir. Polimorfik bantların büyüklükleri ise 564–2000 bç arasında değişim göstermiştir. Bu büyüklükler dışında kalan bantlar değerlendirmeye 290 MA
4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ alınmamıştır. Gülşen ve Mutlu (2005), RAPD primerlerinin DNA zinciri üzerinde 200 ile 2000 bç mesafede farklı dizinlere yapışması gerektiğini, yapışmanın bu mesafeden daha uzun olması durumunda DNA zincirinin polimeraz enzimi tarafından güçlendirilemeyeceğinden bahsetmişlerdir. 4.3.2.1. Kayısı Genotiplerinin RAPD Tekniği ile Karakterizasyonunda Polimorfizm ve Ayırma Gücü RAPD analizinde tarama işlemi sonucu elde edilen değerlere göre belirlenen 20 adet en polimorfik primer 96 genotipe uygulanmıştır. Elde edilen amplifikasyon ürünlerinden çok güçlü ve belirgin olanlar dikkate alınarak bantlarda var (1) ve yok (0) değerlendirmesi yapılmıştır. Bu değerlendirme sonucu elde edilen toplam bant sayıları (TBS), polimorfik bant sayıları (PBS), polimorfizm oranı (PO) ve bu primerlerin polimorfizm bilgi içerikleri (PBİ) ve ayırma gücü (AG) değerleri aşağıdaki Çizelge 4.291.’de verilmiştir. Çalışmada kullanılan 20 RAPD primeri değerlendirildiğinde; toplam 130 adet bant elde edilmiş ve bunların 99 adedi polimorfik bulunmuştur. Primer başına düşen toplam bant sayısı 2–11 (ortalama 6.50) arasında değişim göstermiştir. Primer başına düşen polimorfik bant sayısı ise, 1–8 (ortalama 4.95) arasında olmuştur. Toplam bant sayısı açısından primerler değerlendirildiğinde, OPP10 nolu primer en düşük (2 adet) bant sayısını üretmiş olup, OPA02 nolu primer ise en fazla (11 adet) bandı vermiştir. Polimorfik bant sayısı bakımından ise OPP10 ve OPA03 nolu primerlerden en düşük (1 adet) bant sayısı elde edilirken, OPA02 ve OPC06 nolu RAPD primerlerinden en yüksek (8 adet) bant sayısı elde edilmiştir. Primerlerin polimorfizm oranı % 77 bulunmuştur. OPA03 nolu primerden en düşük (%13), OPB11, OPC05, OPC06, OPK14 ve OPN01 nolu RAPD primerlerinden en yüksek (%100) polimorfizm oranı elde edilmiştir. RAPD primerlerinin polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) ve ayırma güçleri de bu çalışmada değerlendirilmiştir. Ortalama polimorfizm bilgi içeriği değeri 0.542 olarak bulunmuştur. En düşük (0.208) polimorfizm bilgi içeriği değeri OPB11 nolu primerden, en yüksek (0.991) polimorfizm bilgi içeriği değeri ise OPA03 nolu primerden elde edilmiştir. 291
- Page 279 and 280: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 281 and 282: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 283 and 284: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 285 and 286: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 287 and 288: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 289 and 290: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 291 and 292: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 293 and 294: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 295 and 296: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 297 and 298: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 299 and 300: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 301 and 302: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 303 and 304: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 305 and 306: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 307 and 308: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 309 and 310: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 311 and 312: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 313 and 314: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 315 and 316: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 317 and 318: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 319 and 320: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 321 and 322: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 323 and 324: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 325 and 326: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 327 and 328: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 329: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 333 and 334: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 335 and 336: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 337 and 338: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 339 and 340: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 341 and 342: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 343 and 344: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 345 and 346: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 347 and 348: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 349 and 350: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 351 and 352: 4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğu
- Page 353 and 354: 5. SONUÇ ve ÖNERİLER Kadir Uğur
- Page 355 and 356: 5. SONUÇ ve ÖNERİLER Kadir Uğur
- Page 357 and 358: the Mediterranean Region for the Pr
- Page 359 and 360: ÇETİNER, S., 1981. Türkiye Bitki
- Page 361 and 362: di Estinzione. Atti del Congresso s
- Page 363 and 364: Turkey. ISHS Xth International Symp
- Page 365 and 366: Marker Systems for the Analysis of
- Page 367 and 368: Conditions. XIV. International Symp
- Page 369 and 370: of the Utility of SSR Loci as Molec
- Page 371 and 372: Random Amplified Polymorphic DNA An
- Page 373 and 374: 31-K-03 07-K-11 Dörtyol-4 Sakıt-3
- Page 375 and 376: 31-K-03 31-K-05 07-K-11 Dörtyol-4
- Page 377 and 378: 31-K-03 31-K-05 07-K-11 Dörtyol-4
- Page 379 and 380: TokalogluKonyaErMW Ek 4. 96 genotip
4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ<br />
alınmamıştır. Gülşen ve Mutlu (2005), RAPD primerlerinin DNA zinciri üzerinde<br />
200 ile 2000 bç mesafede farklı dizinlere yapışması gerektiğini, yapışmanın bu<br />
mesafeden daha uzun olması durumunda DNA zincirinin polimeraz enzimi<br />
tarafından güçlendirilemeyeceğinden bahsetmişlerdir.<br />
4.3.2.1. Kayısı Genotiplerinin RAPD Tekniği ile Karakterizasyonunda<br />
Polimorfizm ve Ayırma Gücü<br />
RAPD analizinde tarama işlemi sonucu elde edilen değerlere göre<br />
belirlenen 20 adet en polimorfik primer 96 genotipe uygulanmıştır. Elde edilen<br />
amplifikasyon ürünlerinden çok güçlü ve belirgin olanlar dikkate alınarak bantlarda<br />
var (1) ve yok (0) değerlendirmesi yapılmıştır. Bu değerlendirme sonucu elde edilen<br />
toplam bant sayıları (TBS), polimorfik bant sayıları (PBS), polimorfizm oranı (PO)<br />
ve bu primerlerin polimorfizm bilgi içerikleri (PBİ) ve ayırma gücü (AG) değerleri<br />
aşağıdaki Çizelge 4.291.’de verilmiştir.<br />
Çalışmada kullanılan 20 RAPD primeri değerlendirildiğinde; toplam 130<br />
adet bant elde edilmiş ve bunların 99 adedi polimorfik bulunmuştur. Primer başına<br />
düşen toplam bant sayısı 2–11 (ortalama 6.50) arasında değişim göstermiştir. Primer<br />
başına düşen polimorfik bant sayısı ise, 1–8 (ortalama 4.95) arasında olmuştur.<br />
Toplam bant sayısı açısından primerler değerlendirildiğinde, OPP10 nolu primer en<br />
düşük (2 adet) bant sayısını üretmiş olup, OPA02 nolu primer ise en fazla (11 adet)<br />
bandı vermiştir. Polimorfik bant sayısı bakımından ise OPP10 ve OPA03 nolu<br />
primerlerden en düşük (1 adet) bant sayısı elde edilirken, OPA02 ve OPC06 nolu<br />
RAPD primerlerinden en yüksek (8 adet) bant sayısı elde edilmiştir.<br />
Primerlerin polimorfizm oranı % 77 bulunmuştur. OPA03 nolu primerden<br />
en düşük (%13), OPB11, OPC05, OPC06, OPK14 ve OPN01 nolu RAPD<br />
primerlerinden en yüksek (%100) polimorfizm oranı elde edilmiştir.<br />
RAPD primerlerinin polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) ve ayırma güçleri de bu<br />
çalışmada değerlendirilmiştir. Ortalama polimorfizm bilgi içeriği değeri 0.542 olarak<br />
bulunmuştur. En düşük (0.208) polimorfizm bilgi içeriği değeri OPB11 nolu<br />
primerden, en yüksek (0.991) polimorfizm bilgi içeriği değeri ise OPA03 nolu<br />
primerden elde edilmiştir.<br />
291
Change language