ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ... ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ...

library.cu.edu.tr
from library.cu.edu.tr More from this publisher
19.07.2013 Views

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ Şekil 4.95.’te görüldüğü gibi, UBC815 nolu ISSR primerinin 96 kayısı genotipi ile yapılan PCR amplifikasyonu sonucu oluşan ürünlerin ele alınan ilk 48 kayısı genotipini (Çizelge 3.1.) temsil eden jel resminde, elde edilen toplam 11 adet banttan 10’unun polimorfik olduğu belirlenmiş olup, bu primere ait polimorfik bantların büyüklüklerinin ise 730–1600 bp arasında değişim gösterdiği belirlenmiştir. 4.3.1.1 Kayısı Genotiplerinin ISSR Tekniği ile Karakterizasyonunda Polimorfizm ve Ayırma Gücü ISSR analizinde tarama işlemi sonucu elde edilen değerlere göre belirlenen 20 adet en polimorfik primer 96 genotipe uygulanmıştır. Elde edilen amplifikasyon ürünlerinden çok güçlü ve belirgin olanlar dikkate alınarak bantlar var (1) ve yok (0) şeklinde değerlendirilmiştir. Bu değerlendirme sonucu elde edilen toplam bant sayıları (TBS), polimorfik bant sayıları (PBS), polimorfizm oranı (PO), bu primerlerin polimorfizm bilgi içerikleri (PBİ) ve ayırma gücü (AG) değerleri Çizelge 4.290.’da verilmiştir. Çalışmada kullanılan 20 ISSR primeri değerlendirildiğinde; toplam 164 adet bant elde edilmiş, bunların 145 adedi polimorfik bulunmuştur. Primer başına düşen toplam bant sayısı 5–16 (ortalama 8.20) arasında değişmiş, primer başına düşen polimorfik bant sayısı ise 5–14 (ortalama 7.25) arasında değişim göstermiştir. Toplam bant sayısı açısından UBC818 ve UBC825 nolu primerler en düşük (5 adet) bant sayısını üretmiş olup, UBC873 nolu primer ise en fazla (16 adet) bandı vermiştir. Polimorfik bant sayısı bakımından ise, UBC812, UBC814, UBC818, UBC825, UBC843, UBC847, UBC868 ve UBC891 nolu primerler en düşük sayıda (5 adet) bant üretirken, UBC827 nolu ISSR primerinden ise en yüksek sayıda (14 adet) bant elde edilmiştir. Primerlerin polimorfizm oranı %88 olarak bulunmuştur. UBC873 nolu primerden en düşük (%69) polimorfizm oranı elde edilirken, UBC807, UBC818, UBC825, UBC827, UBC840, UBC876 ve UBC888 nolu ISSR primerlerinden ise en yüksek (%100) polimorfizm oranı elde edilmiştir. 286

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ Çizelge 4.290. Kayısı genotiplerinde ISSR primerlerinin amplifikasyonu sonucu elde edilen toplam bant sayıları (TBS), polimorfik bant sayıları (PBS), polimorfizm oranı (PO), polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) ve primerin No Primer ayırma gücü (AG) değerleri Toplam Bant Sayısı Polimorfik Bant Sayısı 287 Polimorfizm Oranı (%) Polimorfizm Bilgi İçeriği Ayırma Gücü 1 UBC807 8 8 100 0.531 1.315 2 UBC812 6 5 83 0.378 1.542 3 UBC814 6 5 83 0.730 0.800 4 UBC815 11 10 91 0.593 1.133 5 UBC817 7 6 86 0.835 0.608 6 UBC818 5 5 100 0.742 1.004 7 UBC825 5 5 100 0.398 1.525 8 UBC827 14 14 100 0.807 0.839 9 UBC829 7 6 86 0.448 1.340 10 UBC835 8 7 88 0.435 1.411 11 UBC840 12 12 100 0.641 1.059 12 UBC841 7 6 86 0.453 1.306 13 UBC843 6 5 83 0.584 1.208 14 UBC847 6 5 83 0.385 1.504 15 UBC868 7 5 71 0.586 1.167 16 UBC873 16 11 69 0.508 1.288 17 UBC876 13 13 100 0.690 0.941 18 UBC888 6 6 100 0.423 1.403 19 UBC890 8 6 75 0.490 1.278 20 UBC891 6 5 83 0.629 1.183 Toplam 164 145 - - 23.85 Ortalama 8.20 7.25 88 0.564 - ISSR primerlerinin polimorfizm bilgi içeriği (PBİ) ve ayırma güçleri de bu çalışmada değerlendirilmiştir. Ortalama polimorfizm bilgi içeriği değeri 0.564 olarak bulunmuştur. En düşük polimorfizm bilgi içeriği değerleri 0.378 ile UBC812 ve 0.398 ile de UBC825 nolu primerlerden, en yüksek polimorfizm bilgi içeriği değerleri ise 0.835 ile UBC817 ve 0.807 ile de UBC827 nolu primerlerden elde edilmiştir (Çizelge 4.290.). Primerlerin ayırma gücü (AG) değerleri incelendiğinde ise; toplam ayırma gücü değeri 23.85 olarak belirlenmiş olup; en düşük (0.608) ayırma gücü değeri UBC 817 nolu primerden elde edilirken, en yüksek (1.542) ayırma gücü değeri ise UBC 812 nolu primerden elde edilmiştir (Çizelge 4.290.).

4. BULGULAR ve TARTIŞMA Kadir Uğurtan YILMAZ<br />

Şekil 4.95.’te görüldüğü gibi, UBC815 nolu ISSR primerinin 96 kayısı<br />

genotipi ile yapılan PCR amplifikasyonu sonucu oluşan ürünlerin ele alınan ilk 48<br />

kayısı genotipini (Çizelge 3.1.) temsil eden jel resminde, elde edilen toplam 11 adet<br />

banttan 10’unun polimorfik olduğu belirlenmiş olup, bu primere ait polimorfik<br />

bantların büyüklüklerinin ise 730–1600 bp arasında değişim gösterdiği belirlenmiştir.<br />

4.3.1.1 Kayısı Genotiplerinin ISSR Tekniği ile Karakterizasyonunda<br />

Polimorfizm ve Ayırma Gücü<br />

ISSR analizinde tarama işlemi sonucu elde edilen değerlere göre belirlenen<br />

20 adet en polimorfik primer 96 genotipe uygulanmıştır. Elde edilen amplifikasyon<br />

ürünlerinden çok güçlü ve belirgin olanlar dikkate alınarak bantlar var (1) ve yok (0)<br />

şeklinde değerlendirilmiştir. Bu değerlendirme sonucu elde edilen toplam bant<br />

sayıları (TBS), polimorfik bant sayıları (PBS), polimorfizm oranı (PO), bu<br />

primerlerin polimorfizm bilgi içerikleri (PBİ) ve ayırma gücü (AG) değerleri Çizelge<br />

4.290.’da verilmiştir.<br />

Çalışmada kullanılan 20 ISSR primeri değerlendirildiğinde; toplam 164<br />

adet bant elde edilmiş, bunların 145 adedi polimorfik bulunmuştur. Primer başına<br />

düşen toplam bant sayısı 5–16 (ortalama 8.20) arasında değişmiş, primer başına<br />

düşen polimorfik bant sayısı ise 5–14 (ortalama 7.25) arasında değişim göstermiştir.<br />

Toplam bant sayısı açısından UBC818 ve UBC825 nolu primerler en düşük (5 adet)<br />

bant sayısını üretmiş olup, UBC873 nolu primer ise en fazla (16 adet) bandı<br />

vermiştir. Polimorfik bant sayısı bakımından ise, UBC812, UBC814, UBC818,<br />

UBC825, UBC843, UBC847, UBC868 ve UBC891 nolu primerler en düşük sayıda<br />

(5 adet) bant üretirken, UBC827 nolu ISSR primerinden ise en yüksek sayıda (14<br />

adet) bant elde edilmiştir.<br />

Primerlerin polimorfizm oranı %88 olarak bulunmuştur. UBC873 nolu<br />

primerden en düşük (%69) polimorfizm oranı elde edilirken, UBC807, UBC818,<br />

UBC825, UBC827, UBC840, UBC876 ve UBC888 nolu ISSR primerlerinden ise en<br />

yüksek (%100) polimorfizm oranı elde edilmiştir.<br />

286

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!