MEME KANSERLİ HASTALARDA CYP19 GENİ KODON 39 Trp/Arg ...

39. kodon T allelinin amplifikasyonu için Çizelge 3’de verilen baz dizisi üzerinde de
gösterilmiş olan aşağıdaki primerler kullanılmıştır;
TT Genotipi (kodon 39=TGG → Triptofan):
Forward primer (F2): 5′-GGCCTTTTTCTCTTGGTGT-3′
Reverse primer (R2): 5′-CTCCAAGTCCTCATTTGCT-3′
Çizelge 3: T alleli amplifikasyonu için kullanılan primerler ve 200 bç’lik amplifikasyon bölgesini
gösteren nükleotid dizisi. Dizide amplifikasyon bölgesi koyu harflerle, primerler altı çizili, kodon 39
büyük harflerle gösterilmiştir.
5’…………………………………………………………………………………….……
1141 ccatgccagt cctgctcctc actggccttt ttctcttggt gTGGaattat gagggcacat
1201 cctcaatacc aggtaagtca gtcatttatt tctgtatcta aggagattat ttacttggga
1261 ttttggtcca tcatggtaaa gaaaaatttt gcaaaaagga caaaaagcaa acctggaaag
1321 atctctgaag actatgtctg tgttagcaaa tgaggacttg gagaaatttc agaccaatta
……………………………………………………………………...…………..……….3’
39. kodon C alleli amplifikasyonu için, Çizelge 4’de verilen baz dizisi üzerinde
de gösterilmiş olan aşağıdaki primerler kullanılmıştır;
CC Genotipi (kodon 39=CGG → Arjinin):
Forward primer (F1): 5′-ATCTGTACTGTACAGCACC-3′
Reverse primer (R1): 5′-ATGTGCCCTCATAATTCCG-3′
Çizelge 4: C alleli amplifikasyonu için kullanılan primerler ve 264 bç’lik amplifikasyon bölgesini
gösteren nükleotid dizisi. Dizide amplifikasyon bölgesi koyu harflerle, primerler altı çizili, kodon 39
büyük harflerle gösterilmiştir.
5’…………………………………………………………………………………….……
901 cctaaatgtc tgatcacatt ataaaacagt aagtgaatct gtactgtaca gcaccctctg
961 aagcaacagg agctatagat gaacctttta ggggattctg taatttttct gtccctttga
1021 tttccacagg actctaaatt gccccctctg aggtcaagga acacaagatg gttttggaaa
1081 tgctgaaccc gatacattat aacatcacca gcatcgtgcc tgaagccatg cctgctgcca
1141 ccatgccagt cctgctcctc actggccttt ttctcttggt gCGGaattat gagggcacat
……………………………………………………………………...…………..……….3’
22