Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
2.2.5. Классификация по связности фрагментов<br />
Фрагменты, используемые во фрагментных дескрипторах, могут быть<br />
связными (connected) и несвязными (disconnected). В абсолютном большинстве<br />
работ используются связные фрагменты. Оказывается, значения дескрипторов,<br />
построенных на несвязных фрагментах, всегда может быть выражено через<br />
значения дескрипторов, построенных на базе их компонент связности [259].<br />
Следовательно, дескрипторы, построенные на основе несвязных фрагментов,<br />
являются избыточными, поскольку не содержат дополнительной информации<br />
по сравнению дескрипторами, построенными на основе связных фрагментов.<br />
Тем не менее, дескрипторы построенные на несвязных фрагментах, могут<br />
в ряде случаев оказаться полезными, поскольку уравнения SAR/QSAR/QSPR с<br />
их участием могут оказаться более простыми. В частности, нелинейные<br />
QSAR/QSPR-модели с целочисленными дескрипторами на основе связных<br />
фрагментов могут быть заменены линейными моделями на основе несвязных<br />
фрагментов, поскольку числа встречаемости несвязных подграфов в молекулярном<br />
графе нелинейно выражаются через числа встречаемости связных подграфов.<br />
Таким образом, использование несвязных фрагментов можно рассматривать<br />
как неявный способ введения нелинейности в модели QSAR/QSPR, построенных<br />
на основе целочисленных фрагментных дескрипторов. То же самое<br />
касается бинарных фрагментных дескрипторов, но только в случае с ними нелинейные<br />
выражения заменяются логическими операциями конъюнкции. Таким<br />
образом, в случае бинарных дескрипторов несвязные фрагменты в неявном<br />
виде вводят логическую операцию конъюнкции в модели SAR.<br />
Идея применения дескрипторов, основанных на несвязных фрагментах,<br />
лежит в основе концепции компаунд-дескрипторов (определяемых как комбинации<br />
несвязанных между собой фрагментов в молекулярной структуре), была<br />
недавно введена В.А. Тарасовым с соавт. [318]. В цитируемой работе было показано,<br />
что компаунд-дескрипторы существенно улучшают качество SAR модели,<br />
позволяющей прогнозировать мутагенность на основе Байесовского вероятностного<br />
подхода. Кроме того, дескрипторы на основе несвязных фрагментов<br />
96
Change language