Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
CRC [317]. (см. Рис. 19). После этого фрагмент помещается в определенную<br />
ячейку (bin) молекулярной голограммы, положение которой (bin ID) вычисляется<br />
как остаток от деления хеш-кода (fragment integer ID) на размер (т.е. количество<br />
ячеек) молекулярной голограммы. Каждый раз при нахождении очередного<br />
вхождения фрагмента в химическую структуру заселенность соответствующей<br />
ячейки молекулярной голограммы увеличивается на единицу. В отличие от<br />
стандартных хеш-таблиц, в молекулярных голограммах столкновения данных<br />
не устранены, и поэтому несколько разных фрагментов могут отобразиться на<br />
одну ячейку молекулярной голограммы. Следовательно, в результате анализа<br />
химической структуры общая заселенность ячейки молекулярной голограммы<br />
оказывается равной сумме целочисленных значений дескрипторов, соответствующим<br />
фрагментам, на нее отображаемым. Молекулярные голограммы легли<br />
в основу голографического QSAR (holographic QSAR - HQSAR) [153], в котором<br />
заселенности ячеек молекулярной голограммы выступают в качестве дескрипторов,<br />
корреляция которых с числовым значением биологической активности<br />
строится при помощи метода частичных наименьших квадратов PLS.<br />
Molecular Structure<br />
O<br />
Fragment<br />
Generation<br />
Fragments<br />
Fragment Integer IDs 12 5 9 ...<br />
O<br />
...<br />
CRC<br />
Algorithm<br />
3 6 2 0 5 13 0 7 1 8<br />
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10<br />
Molecular Hologram<br />
Bin IDs<br />
Рис. 19. Генерация молекулярной голограммы<br />
По своей природе молекулярные голограммы очень близки к хешированным<br />
молекулярным отпечаткам пальцев (hashed molecular fingerprints) (или<br />
просто молекулярным отпечаткам пальцев (molecular fingerprints)), однако построены<br />
на основе бинарных фрагментных дескрипторов, показывающих лишь<br />
94