19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

CRC [317]. (см. Рис. 19). После этого фрагмент помещается в определенную<br />

ячейку (bin) молекулярной голограммы, положение которой (bin ID) вычисляется<br />

как остаток от деления хеш-кода (fragment integer ID) на размер (т.е. количество<br />

ячеек) молекулярной голограммы. Каждый раз при нахождении очередного<br />

вхождения фрагмента в химическую структуру заселенность соответствующей<br />

ячейки молекулярной голограммы увеличивается на единицу. В отличие от<br />

стандартных хеш-таблиц, в молекулярных голограммах столкновения данных<br />

не устранены, и поэтому несколько разных фрагментов могут отобразиться на<br />

одну ячейку молекулярной голограммы. Следовательно, в результате анализа<br />

химической структуры общая заселенность ячейки молекулярной голограммы<br />

оказывается равной сумме целочисленных значений дескрипторов, соответствующим<br />

фрагментам, на нее отображаемым. Молекулярные голограммы легли<br />

в основу голографического QSAR (holographic QSAR - HQSAR) [153], в котором<br />

заселенности ячеек молекулярной голограммы выступают в качестве дескрипторов,<br />

корреляция которых с числовым значением биологической активности<br />

строится при помощи метода частичных наименьших квадратов PLS.<br />

Molecular Structure<br />

O<br />

Fragment<br />

Generation<br />

Fragments<br />

Fragment Integer IDs 12 5 9 ...<br />

O<br />

...<br />

CRC<br />

Algorithm<br />

3 6 2 0 5 13 0 7 1 8<br />

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10<br />

Molecular Hologram<br />

Bin IDs<br />

Рис. 19. Генерация молекулярной голограммы<br />

По своей природе молекулярные голограммы очень близки к хешированным<br />

молекулярным отпечаткам пальцев (hashed molecular fingerprints) (или<br />

просто молекулярным отпечаткам пальцев (molecular fingerprints)), однако построены<br />

на основе бинарных фрагментных дескрипторов, показывающих лишь<br />

94

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!