19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

ределенных атомных характеристик внутри фрагмента. Другой пример - это<br />

рассматриваемые в рамках данной диссертационной работы псевдофрагментные<br />

дескрипторы (см. раздел 5.4), которые более тесно связаны с фрагментными<br />

дескрипторами по сравнению с типичными топологическими индексами.<br />

2.2.4, Классификация по типам дескрипторных наборов<br />

Набор фрагментных дескрипторов, рассчитанных для химического соединения,<br />

может быть организован тремя основными способами, а именно, в<br />

виде: (а) векторов фиксированного размера; (б) списков; и (в) хеш-таблиц.<br />

Чаще всего набор значений фрагментных дескрипторов, рассчитанный<br />

для химического соединения, помещают в одномерный массив фиксированного<br />

размера (т.е. вектор), каждая ячейка (элемент) которого соответствует определенному<br />

подструктурному фрагменту, а содержащееся в ней значение – значению<br />

соответствующего фрагментного дескриптора. Вектор, содержащий бинарные<br />

значения фрагментных дескрипторов, называется набором структурных<br />

ключей (structural keys), которые в контексте работы с базами данных называются<br />

также скринами (screans) (см. Рис. 18). Поскольку структурные ключи<br />

хранятся в памяти компьютера в виде битовых строк, все операции с ними<br />

осуществляются очень эффективно, и именно это обуславливает популярность<br />

их использования для работы с базами химических данных, поиска по подобию,<br />

построения моделей SAR/QSAR, а также для осуществления с их помощью<br />

виртуального скрининга.<br />

91

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!