Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
21<br />
01<br />
12<br />
12<br />
21<br />
01<br />
Рис. 17. Реакция Дильса-Адлера и соответствующий реакционный граф<br />
Первые аналоги частичных реакционных графов, содержащие только связи,<br />
подвергающиеся изменению (т.е. разрывающиеся, образующиеся и меняющие<br />
свою кратность) в результате реакции, ранее были использованы для классификации<br />
и перечисления типов органических реакций в рамках матричного формализма<br />
Уги-Дугунджи (Ugi-Dugundji) [306] и формально-логического подхода<br />
Н.С. Зефирова и С.С. Трача [307, 308]. Владуц (Vladutz) [309] объединил структуры<br />
реагентов и продуктов реакции в единый граф, содержащий специальные<br />
метки для обозначения связей, подвергающихся изменению в результате реакции.<br />
Результирующий реакционный граф, называемый суперпозиционным графом<br />
реакционного скелета (Superimposed Reaction Skeleton Graph) может также<br />
содержать связи (вместе со смежными им атомами), не подвергающиеся изменениям<br />
в результате реакции. Сходные реакционные графы были также предложены<br />
Фуджитой (Fujita) [310, 311] и названы им мнимыми переходными состояниями<br />
(imaginary transition states), которые были использованы автором<br />
для классификации и перечисления типов органических реакций.<br />
Следующий этап в развитии концепции реакционных графов был направлен<br />
на разработку фрагментных дескрипторов, которые могли бы быть использованы<br />
для кодирования и предсказания реакций органических соединений. Ю.<br />
Бородина с соавт. предложили расширение дескрипторов MNA, получившее<br />
название RMNA (Reacting Multilevel Neighborhood of Atom), для кодирования<br />
метаболических превращений молекул [312]. В этом подходе отдельные описания<br />
субстратов и продуктов реакций при помощи MNA-дескрипторов дополнены<br />
информацией о связях, подвергающихся изменениям в результате трансформации.<br />
Дескрипторы RMNA были успешно применены для предсказания<br />
сайтов метаболического гидроксилирования с участием цитохрома-P450 [312].<br />
89