19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

21<br />

01<br />

12<br />

12<br />

21<br />

01<br />

Рис. 17. Реакция Дильса-Адлера и соответствующий реакционный граф<br />

Первые аналоги частичных реакционных графов, содержащие только связи,<br />

подвергающиеся изменению (т.е. разрывающиеся, образующиеся и меняющие<br />

свою кратность) в результате реакции, ранее были использованы для классификации<br />

и перечисления типов органических реакций в рамках матричного формализма<br />

Уги-Дугунджи (Ugi-Dugundji) [306] и формально-логического подхода<br />

Н.С. Зефирова и С.С. Трача [307, 308]. Владуц (Vladutz) [309] объединил структуры<br />

реагентов и продуктов реакции в единый граф, содержащий специальные<br />

метки для обозначения связей, подвергающихся изменению в результате реакции.<br />

Результирующий реакционный граф, называемый суперпозиционным графом<br />

реакционного скелета (Superimposed Reaction Skeleton Graph) может также<br />

содержать связи (вместе со смежными им атомами), не подвергающиеся изменениям<br />

в результате реакции. Сходные реакционные графы были также предложены<br />

Фуджитой (Fujita) [310, 311] и названы им мнимыми переходными состояниями<br />

(imaginary transition states), которые были использованы автором<br />

для классификации и перечисления типов органических реакций.<br />

Следующий этап в развитии концепции реакционных графов был направлен<br />

на разработку фрагментных дескрипторов, которые могли бы быть использованы<br />

для кодирования и предсказания реакций органических соединений. Ю.<br />

Бородина с соавт. предложили расширение дескрипторов MNA, получившее<br />

название RMNA (Reacting Multilevel Neighborhood of Atom), для кодирования<br />

метаболических превращений молекул [312]. В этом подходе отдельные описания<br />

субстратов и продуктов реакций при помощи MNA-дескрипторов дополнены<br />

информацией о связях, подвергающихся изменениям в результате трансформации.<br />

Дескрипторы RMNA были успешно применены для предсказания<br />

сайтов метаболического гидроксилирования с участием цитохрома-P450 [312].<br />

89

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!