19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

кроме того, они снова стали использоваться для прогнозирования биологической<br />

активности органических соединений [194, 240, 241].<br />

2.2.1.6. Атомные пары и топологические мультиплеты<br />

Этот тип фрагментных дескрипторов был специально разработан для<br />

проведения исследований SAR для фармакологически важных свойств органических<br />

соединений. В его основе лежит понятие о дескрипторных центрах, под<br />

которыми подразумеваются атомы либо группы атомов, которые могли бы<br />

служить центрами межмолекулярных взаимодействий. Обычно в качестве дескрипторных<br />

центров берутся гетероатомы, ненасыщенные связи и ароматические<br />

циклы. Вторым важным элементом в спецификации этого типа дескрипторов<br />

является расстояние между дескрипторными центрами, под которым<br />

обычно подразумевают топологическое расстояние между атомами в химической<br />

структуре, либо кратчайшее расстояние между атомами, принадлежащими<br />

двум группам. В этом контексте, атомная пара определяется как пара дескрипторных<br />

центров вместе с расстоянием между ними. По аналогии с этим, топологический<br />

мультиплет определяется как мультиплет (обычно триплет) дескрипторных<br />

центров наряду с набором расстояний для каждой из их пар. Дескрипторы,<br />

относящиеся к этой категории, принимают обычно бинарные значения,<br />

указывающие на присутствие либо отсутствие соответствующих фрагментов<br />

в химической структуре. Таким образом, атомные пары являются частным<br />

случаем топологических мультиплетов. С позиций теории графов, атомные пары<br />

представляют собой цепочки со специфицированными типами терминальных<br />

вершин и обобщенными типами внутренних вершин и ребер в молекулярном<br />

графе. Топологические мультиплеты, однако, требуют более сложного<br />

описания с позиций теории графов.<br />

Атомные пары впервые были введены в практику проведения исследований<br />

SAR В.В. Авидоном и названы им фрагментарными кодами суперпозиции<br />

подструктур (ФКСП) [131, 242]. В дальнейшем сходные дескрипторы были<br />

предложены Кархартом (Carhart) с соавт. [243], которые их использовали для<br />

77

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!