На Ð¿Ñ€Ð°Ð²Ð°Ñ Ñ€ÑƒÐºÐ¾Ð¿Ð¸ÑÐ¸

ренные атомы» [135]. Наряду с ними, Хоудс также предложил использовать
«ганглии-расширеные атомы» (ganglia augmented atoms), которые дополнительно
учитывают связи между атомами первой и второй оболочек [214] и поэтому
могут быть представлены как ЦАФ радиуса 2 с обобщенными атомами
во второй оболочке. ЦАФ радиуса 1 были в дальнейшем также интегрированы в
дескрипторный блок FRAGMENT [193] под названием «разветвленные фрагменты»
(branched fragments). ЦАФ произвольного радиуса были независимо
предложены и реализованы несколькими группами авторов: (а)
В.П.Соловьевым и Варнеком (Varnek) в программах TRAIL [196, 197] и ISIDA
[114] под именем «расширенные атомы» (augmented atoms); (б)
Д.А.Филимоновым, В.В.Поройковым с соавт. в программе PASS [215] под именем
«многоуровневые атомные окрестности» Multilevel Neighborhoods of Atoms
(MNA) [216]; (в) Ксингом (Xing) и Гленом (Glen) под именем «структурированные
по дереву отпечатки пальцев» (tree structured fingerprints) [217] (которые,
однако, в дальнейших публикациях Бендера (Bender), Глена (Glen) и др.
называются «атомными окрестностями» (atom environments) [218, 219] и
«циркулярными отпечатками пальцев» (circular fingerprints) [220-222], см. Рис.
12); (г) Фолоном (Faulon) под названием «молекулярные подписи» (molecular
signatures) [223-225].
NH 2
2
1
0
O
C
OH
Layers: 0 1 3
C.ar (sp 2 ) C.ar (sp 2 ) C.ar (sp 2 )
C.ar (sp 2 )
C.ar (sp 2 )
C (sp 2 ) N (sp 3 )
O (sp 2 )
O (sp 3 )
Рис. 12. «Циркулярные отпечатки пальцев» вместе с типами атомов, используемыми
в mol2-файлах программного комплекса Sybyl. Индивидуальный
фрагментный дескриптор вычисляется для каждого атома в молекуле с учетом
атомов, отстоящих от него не больше, чем на две связи
74