Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
2.2.1.2. Фрагменты WLN и SMILES<br />
Фрагменты WLN и SMILES соответствуют подстрокам (обычно длиной в<br />
один символ) строк WLN (Wiswesser Line Notation – линейная нотация Висвессера)<br />
[202] либо SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) [203,<br />
204], которые активно используются для кодирования структур органических<br />
соединений. В структурном плане, односимвольные фрагменты WLN и<br />
SMILES представляют собой атомы либо простейшие группы, и поэтому основная<br />
отличительная особенность этого типа структурных фрагментов заключается<br />
в способах его обработки на компьютере. Поскольку простейшие операции<br />
над строками значительно более эффективны по сравнению с операциями<br />
на графах, использование дескрипторов WLN было вполне оправдано в 1970-ые<br />
годы в эпоху медленных компьютеров. В это время Адамсон (Adamson) и Бауден<br />
(Bawden) опубликовали целый ряд работ, в которых фрагментные дескрипторы<br />
WLN использовались в исследованиях QSAR и QSPR в сочетании со статистическим<br />
анализом при помощи аппарата множественной линейной регрессии<br />
[138, 140, 141, 205, 206]. Эти же авторы применили фрагментные дескрипторы<br />
WLN для проведения иерархического кластерного анализа и автоматической<br />
классификации химических структур [207]. В дальнейшем линейная нотация<br />
Висвессера была существенно усовершенствована, и на ее основе Ку (Qu) с<br />
соавт. разработал новую линейную нотацию AES (Advanced Encoding System),<br />
специально предназначенную для того, чтобы быть использованной в качестве<br />
химического языка для кодирования информации специально для методов<br />
групповых вкладов. Таким образом, хотя фрагментные дескрипторы WLN (как<br />
и сама линейная нотация Висвессера) сейчас могут казаться устаревшими, они<br />
сыграли важную историческую роль в развитии методологии исследований<br />
QSAR/QSPR, основанных на применении фрагментных дескрипторов.<br />
Тем не менее, интерес к дескрипторам, построенных на основе линейных<br />
нотаций, полностью не исчез с приходом мощных компьютеров и со снижением<br />
интереса к нотации Висвессера как таковой. Работы, основанные на использовании<br />
фрагментных дескрипторов SMILES, все еще продолжают появляться.<br />
72
Change language