Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
ниях QSPR/QSAR/SAR. И действительно, на их использовании основана работа<br />
таких компьютерных программ, предназначенных для проведения исследований<br />
QSPR/QSAR/SAR, как: CASE [156-159] Клопмана (Klopman); MULTICASE<br />
(MultiCASE, MCASE) [191, 192] Клопмана (Klopman); дескрипторный блок<br />
FRAGMENT [193] (см. разделы 5.1 и 8.3), входящий в состав программного<br />
комплекса NASAWIN [194] (см. раздел 8.2), разработанного под руководством<br />
Н.С.Зефирова на химическом факультете МГУ; программа BIBIGON [195], созданная<br />
М.И.Кумсковым с соавт.; программные комплексы TRAIL [196, 197] и<br />
ISIDA [114], разработанные В.П.Соловьевым и А.Варнеком (Varnek).<br />
Помимо многочисленных приложений, связанных с использованием вышеупомянутых<br />
программ, цепочечные фрагменты под разными именами встречаются<br />
в ряде других исследованиях. В этой связи можно упомянуть молекулярные<br />
пути (molecular pathways) Гакха (Gakh) с соавт. [198], молекулярные<br />
маршруты (molecular walks) Рюкера (Rücker) [199] и др.<br />
В отличие от цепочек, циклические и полициклические фрагменты относительно<br />
редко в явном виде используются в исследованиях QSAR/QSPR. Похоже,<br />
что вышеупомянутый дескрипторный блок FRAGMENT [193] является<br />
единственной программой, систематически работающей с фрагментными дескрипторами<br />
этого типа. Тем не менее, в неявном виде циклические фрагменты<br />
вовлечены во многочисленные исследования посредством: (а) введения специальных<br />
«циклических» и «ароматических» типов атомов и связей; (б) «сворачивания»<br />
целых циклов и даже полициклических систем в «фармакофорные»<br />
псевдоатомы; (iii) генерации циклических фрагментов как частного случая других<br />
более общих типов фрагментов, в частности, фрагментов на основе максимальных<br />
общих подграфов (см. пункт 2.2.1.5), заместителей и молекулярных<br />
остовов (см. пункт 2.2.1.7), фрагментов на основе базисных (см. пункт 2.2.1.8),<br />
«добытых» (см. пункт 2.2.1.9) и случайных (см. пункт 2.2.1.10) подграфов, а<br />
также библиотечных фрагментов (см. пункт 2.2.1.11). Кроме того, циклические<br />
фрагменты широко используются в качестве скринов при работе с химическими<br />
базами данных [200, 201].<br />
71
Change language