19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

тему опубликовано несколько концептуальных статей и мини-обзоров [110,<br />

111, 113-116, 171]. Рассмотрим основные принципы классификации фрагментных<br />

дескрипторов.<br />

2.2. Типы фрагментных дескрипторов<br />

Структурные фрагменты и соответствующие фрагментные дескрипторы<br />

могут быть классифицированы: по типам молекулярных графов, по типам молекулярных<br />

структур, по типам значений дескрипторов, по типам дескрипторных<br />

наборов, по связанности фрагментов, по уровням детализации молекулярных<br />

графов и т.д.<br />

2.2.1. Классификация по типам молекулярных графов<br />

Структурные фрагменты, применяемые в исследованиях «структурасвойство»,<br />

могут быть отнесены ко множеству типов молекулярных графов. В<br />

частности, можно выделить: простые фиксированные типы молекулярных графов;<br />

фрагменты WLN и SMILES; центрированные на атомах фрагменты; центрированные<br />

на связях фрагменты; фрагменты на основе максимальных общих<br />

подграфов; атомные пары и топологические мультиплеты; заместители и молекулярные<br />

остовы; фрагменты на основе базисных подграфов; фрагменты на основе<br />

«добытых» (mined) подграфов; библиотечные фрагменты и др. Рассмотрим<br />

каждый из вышеперечисленных типов.<br />

2.2.1.1. Простые фиксированные типы молекулярных графов<br />

Древнегреческий атомизм, согласно которому все вещества состоят из<br />

атомов, приводит к простейшему типу структурных фрагментам – атомам, т.е.<br />

вершинам молекулярных графов. Существует по крайней мере одно свойство,<br />

молекулярный вес, значение которого для всех химических соединений могут<br />

быть точно, если не принимать во внимание пренебрежительно малые реляти-<br />

67

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!