19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

му типу биологической активности. Гиллер [2], Голендер и Розенблит [130,<br />

131], Пирузян, Авидон и др. [131], Крамер (Cramer) [132], Бруггер (Brugger),<br />

Стюпер (Stuper) и Джурс (Jurs) [133, 134] и Хоудс (Hodes) и др. [135] были первопроходцами<br />

в этой области.<br />

Современные методологии применения фрагментных дескрипторов в исследованиях<br />

QSAR и QSPR (Quantitative Structure-Property Relationships – количественные<br />

соотношения структура-свойство) не требуют введения явных ограничений<br />

на типы химических структур и прогнозируемых для них свойств, и<br />

поэтому их можно считать универсальными. Первый такой универсальный подход<br />

к использованию фрагментных дескрипторов в исследованиях QSAR/QSPR<br />

был разработан в 70-ые годы прошлого века Адамсоном (Adamson) с соавт.<br />

[136, 137]. Суть этого подхода заключается в расчете фрагментных дескрипторов<br />

для выборки химических соединений исходя из структур их молекулярных<br />

графов путем подсчета числа вложений в них простейших типов подграфов<br />

(порой получаемых напрямую из строк линейной нотации Висвессера [138]) с<br />

последующим введением этих дескрипторов в статистический анализ (обычно<br />

осуществляемый по методу множественной линейной регрессии) для поиска<br />

корреляций с экспериментальными значениями биологической активности<br />

[138, 139], физико-химических свойств [140] либо реакционной способности<br />

[141].<br />

Важный класс фрагментных дескрипторов, т.н. скрины (или структурные<br />

ключи, отпечатки пальцев), также был разработан в 70-ые годы [142-146]. Их<br />

наборы образуют битовые строки, которые могут эффективно храниться и обрабатываться<br />

на компьютерах. Хотя первоначально им предназначалась лишь<br />

роль инструмента, позволяющего осуществлять подструктурный поиск в больших<br />

химических базах данных, в настоящее время они также активно используются<br />

при поиске по подобию (similarity searching) [147, 148], кластеризации<br />

больших баз данных, содержащих химические структуры, [149, 150], оценки их<br />

разнородности (diversity) [151], а также при проведении исследований SAR<br />

[152] и QSAR [153].<br />

65

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!