На правах рукописи
Share Embed Flag
Download ePaper

На правах рукописи

На правах рукописи На правах рукописи

cdn.scipeople.com
from cdn.scipeople.com More from this publisher
19.11.2014 Views

модели при помощи пошагового варианта множественной линейной регрессии и блок прогноза, которые совместно образуют программу «ЭММА» - головную программу комплекса), Д.Е.Петелин (дескрипторные блоки для расчета топологических индексов и физико-химических дескрипторов, в частности ETS, HB, HFORM, INDPAR, STERIC, VW и др.), О.Ломова (генератор химических структур GOLD [514, 515], который сейчас вполне обосновано можно назвать генератором виртуальных комбинаторных библиотек для виртуального скрининга) и А.Ю.Зотов (блок управления расчетом дескрипторов и некоторые дескрипторные блоки). Работы по созданию комплекса «ЭММА» проводились под руководством В.А.Палюлина и Н.С.Зефирова. В 1993-1995 гг. автором диссертационной работы (под руководством В.А.Палюлина и Н.С.Зефирова) была разработана для среды MS-DOS программа-эмулятор искусственных нейронных сетей, специально приспособленная для построения количественных моделей «структура-свойство», NASA (Neural Approach to Structure-Activity) [516]. При помощи этой программы были получены результаты, изложенные в подразделах 4.4.1 и 6.1 данной диссертационной работы. В 1996 г. автором диссертационной работы вместе с Н.М.Гальберштам (под руководством В.А.Палюлина и Н.С.Зефирова) была создана для среды Windows 3.1 первая версия программного комплекса NASAWIN (Neural Approach to Structure-Acivity for WINdows) [194, 517], и с тех пор он находится в постоянном развитии. Первоначально NASAWIN включала только эмулятор многослойной нейронной сети обратного распространения, перенесенный из программы NASA, и набор дескрипторных блоков, перенесенный из программного комплекса «ЭММА», при этом практически все перенесенные компоненты были перепрограммированы. Возможности дескрипторного блока FRAGMENT были существенно расширены по сравнению с версией, работавшей в комплексе «ЭММА» (работа по расширению возможностей этого блока велась вместе с Н.В.Артеменко). В ходе своего дальнейшего развития в NASAWIN было включено множество дополнительных методов статистического анализа, дескрипторных блоков, методов визуализации и архитектур нейронных сетей, в резуль- 296

тате чего NASAWIN превратился в мощный универсальный программный комплекс для построения моделей «структура-свойство» и прогнозирования свойств органических соединений. 8.2. Программный комплекс «NASAWIN» Отсутствие удобного для химика-органика инструмента, позволяющего получать, анализировать и использовать для прогноза нейросетевые модели зависимостей структура-свойство, побудило нас к разработке компьютерной программы, базирующейся на методологии искусственных нейронных сетей и ориентированной на работу с химической информацией. Программный комплекс «NASAWIN» позволяет: 1) загружать и просматривать базы данных, содержащие структуры химических соединений и их свойства; 2) вычислять наборы дескрипторов, описывающих химические структуры, и отбирать наиболее значимые; 3) выявлять и интерпретировать количественные зависимости между значениями дескрипторов и свойств химических соединений при помощи многослойной нейронной сети прямого распространения; 4) статистически оценивать полученные модели; 5) использовать полученные нейросетевые модели для прогнозирования свойств произвольных химических соединений. Программные коды написаны на языке С++ с использованием компилятора MVC++ 6.0. Программа содержит около 80000 строк. Наряду с общепринятыми алгоритмами работы с нейронными сетями, «NASAWIN» обладает множеством характерных черт, которые делают этот комплекс уникальным инструментом для исследования зависимости «структура-свойство» в химии. Рассмотрим основные возможности, которые предоставляет программа «NASAWIN» для получения нейросетевых моделей структура-свойство. 297

тате чего NASAWIN превратился в мощный универсальный программный комплекс<br />

для построения моделей «структура-свойство» и прогнозирования<br />

свойств органических соединений.<br />

8.2. Программный комплекс «NASAWIN»<br />

Отсутствие удобного для химика-органика инструмента, позволяющего<br />

получать, анализировать и использовать для прогноза нейросетевые модели зависимостей<br />

структура-свойство, побудило нас к разработке компьютерной программы,<br />

базирующейся на методологии искусственных нейронных сетей и ориентированной<br />

на работу с химической информацией.<br />

Программный комплекс «NASAWIN» позволяет:<br />

1) загружать и просматривать базы данных, содержащие структуры химических<br />

соединений и их свойства;<br />

2) вычислять наборы дескрипторов, описывающих химические структуры, и<br />

отбирать наиболее значимые;<br />

3) выявлять и интерпретировать количественные зависимости между значениями<br />

дескрипторов и свойств химических соединений при помощи многослойной<br />

нейронной сети прямого распространения;<br />

4) статистически оценивать полученные модели;<br />

5) использовать полученные нейросетевые модели для прогнозирования<br />

свойств произвольных химических соединений.<br />

Программные коды написаны на языке С++ с использованием компилятора<br />

MVC++ 6.0. Программа содержит около 80000 строк. Наряду с общепринятыми<br />

алгоритмами работы с нейронными сетями, «NASAWIN» обладает<br />

множеством характерных черт, которые делают этот комплекс уникальным инструментом<br />

для исследования зависимости «структура-свойство» в химии. Рассмотрим<br />

основные возможности, которые предоставляет программа<br />

«NASAWIN» для получения нейросетевых моделей структура-свойство.<br />

297

logo

products

Resources

Company

Terms of service
Privacy policy
Cookie policy
Cookie settings
Imprint
Change language
Made with love in Switzerland
© 2024 Yumpu.com all rights reserved

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!