19.11.2014 Views

На правах рукописи

На правах рукописи

На правах рукописи

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

какой-то мере были бы связаны с величинами вкладов фрагментов в прогнозируемое<br />

свойство, Мы также предлагаем использовать для этого особую категорию<br />

фрагментных дескрипторов, значения которых вычисляются путем комбинирования<br />

свойств присутствующих в этих фрагментах атомов. Дескрипторы<br />

такого рода мы будем называть псевдофрагментными дескрипторами, чтобы их<br />

отличать от «настоящих» фрагментных дескрипторов, имеющих в качестве<br />

значения числа встречаемости либо индикаторы наличия тех или иных фрагментов<br />

в структурах химических соединений. В качестве свойств атомов для<br />

прогнозирования физико-химических свойств органических молекул можно,<br />

например, использовать атомную массу, число электронов, ковалентный радиус,<br />

электроотрицательность, потенциал ионизации и т.д., поскольку предполагается,<br />

что от них зависят величины вкладов фрагментных дескрипторов в прогнозируемое<br />

свойство. Важно также, чтобы используемые комбинации свойств<br />

имели ясный физический смысл, поскольку в этом случае возрастают шансы<br />

наличия корреляции их значений с величинами вкладов фрагментов, При такой<br />

корреляции небольшое число псевдофрагментных дескрипторов начинает входить<br />

в статистические модели вместо многочисленных «настоящих» фрагментных<br />

дескрипторов, в том числе и потенциально редких, выступая тем самым в<br />

качестве сжатого обобщения последних. Это в значительной степени и решает<br />

проблему редких фрагментов, если псевдофрагментные дескрипторы строятся<br />

на основе часто встречающихся фрагментов, состоящих из отдельных атомов<br />

или небольших цепочек из произвольных атомов, которые присутствуют практически<br />

во всех молекулах.<br />

В качестве первого примера псевдофрагментного дескриптора рассмотрим<br />

конструкцию<br />

a i=<br />

1<br />

N<br />

1 a<br />

3<br />

p1 _ AR3<br />

= ∑ Ri<br />

. В качестве атомного свойства здесь вы-<br />

N<br />

ступает атомный радиус. Очевидно, что куб атомного радиуса пропорционален<br />

«объему» атома. Поскольку суммирование идет по атомам, то они и выступают<br />

в качестве базового фрагмента для вычисления дескриптора. Физический смысл<br />

всего дескриптора – средний объем атома. Можно предположить, что он будет<br />

играть существенную роль при прогнозировании волюметрических свойств<br />

192

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!