Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи Ðа пÑÐ°Ð²Ð°Ñ ÑÑкопиÑи
100 50 Prediction, ppm 0 -50 -100 -150 -200 -200 -150 -100 -50 0 50 100 Experiment, ppm Рис. 37. Диаграмма разброса при прогнозировании химических сдвигов в 31 P ЯМР спектрах замещенных монофосфинов Наиболее значимыми для описания исследуемого свойства являются приведенные на Рис. 38 фрагменты с “выделенным” атомом P a . Первые три фрагмента отражают σ-индукционное влияние алкильных заместителей на атом фосфора, четвертый – эффект сопряжения с ароматическим ядром, пятый – влияние расположенного в орто-положении атома фтора. 1 2 a P C a P CH 3 3 a P C C 4 5 a P C a P C H CH C Рис. 38. Наиболее важные фрагменты для химического сдвига в 31P ЯМР спектрах замещенных монофосфинов. F Данный пример иллюстрирует возможность использовать фрагментные дескрипторы с «выделенными» атомами для прогнозирования локальных свойств химических соединений, которые можно приписать определенным атомам или группам атомов внутри молекулы. В этом случае использование це- 186
почечных фрагментов с терминальными «выделенными» атомами позволяет получать легко интерпретируемые модели, наглядно показывающие пути влияния отдельных атомов или групп внутри молекулы на изучаемое свойство. 5.3.2. Прогнозирование способности аналогов 1-[(2-гидроксиэтокси)-метил]– 6(фенилтио)тимина (HEPT) ингибировать обратную транскриптазу вируса ВИЧ-1 Ингибирующую активность в отношении обратной транскриптазы вируса ВИЧ-1, представленную эффективной концентрацией соединений, необходимой для достижения 50% защиты клеток линии МТ-4 от цитотоксического действия вируса (log 1/EC 50 ), мы исследовали для однородной выборки производных HEPT [396]. На Рис. 39 приведены общий структурный элемент соединений выборки и фрагменты заместителей R 1 , R 2 и R 3 , которые соответственно связаны с анкерными атомами общего фрагмента, маркированными метками “b”, ”c” и ”d”, и которые вносят наибольший вклад в лучшую комбинированную модель: X N C a Csp 3 b 1 Csp 3 in d N R 2 3 c d C R 3 in d R 1 C C R 1 d O d R 1 2 C c S in c R 2 C 4 H 2 C H 2 C in b R 3 b O CH 3 Рис. 39. Наиболее важные фрагменты для ингибирования обратной транскриптазы ВИЧ-1 производными HEPT 187
- Page 135 and 136: R3 R2 R5 R6 Общая формул
- Page 137 and 138: ко, эта разница все
- Page 139 and 140: переставленными эк
- Page 141 and 142: лей приведен в рабо
- Page 143 and 144: деленными» атомами
- Page 145 and 146: 5.1.2. Иерархическая
- Page 147 and 148: водородного соседа
- Page 149 and 150: Атом кислорода в со
- Page 151 and 152: PA1 -PH 2 Атом фосфора,
- Page 153 and 154: Br2 -Br= Формально нез
- Page 155 and 156: то в дальнейшем буд
- Page 157 and 158: После нахождения п
- Page 159 and 160: 5.2.1. Прогнозировани
- Page 161 and 162: зей, а также учитыв
- Page 163 and 164: Эксперимент 50 40 30 20
- Page 165 and 166: Построение QSPR-моде
- Page 167 and 168: работе [268], но с при
- Page 169 and 170: ляются удобным инс
- Page 171 and 172: чета этого свойств
- Page 173 and 174: База 2 (88 соединений
- Page 175 and 176: «редких фрагментов
- Page 177 and 178: пользовании 25 деск
- Page 179 and 180: Tf расч. о С, Tf calc. o C 30
- Page 181 and 182: На первом этапе раб
- Page 183 and 184: 0,935; s = 0,76 кДж·моль -1
- Page 185: пример использован
- Page 189 and 190: ской структуры «ре
- Page 191 and 192: 1 O O OH C C a O C H 2 O H + C C a
- Page 193 and 194: веществ, например,
- Page 195 and 196: до 28.0 (MAE DCV ). Повыше
- Page 197 and 198: Таким образом, псев
- Page 199 and 200: цепочки длиной до д
- Page 201 and 202: алканов, см 3 /моль 7
- Page 203 and 204: свое преимущество
- Page 205 and 206: 6.3.1. Общая методоло
- Page 207 and 208: бирался оптимальны
- Page 209 and 210: 0,25 Результаты полу
- Page 211 and 212: При анализе дескри
- Page 213 and 214: 414]). Следует также о
- Page 215 and 216: d расч., г/куб.см 4,0 3,0
- Page 217 and 218: Табл. 15. Корреляция
- Page 219 and 220: Табл. 16. Усредненны
- Page 221 and 222: Как видно из Табл. 16
- Page 223 and 224: нием ошибки примен
- Page 225 and 226: NASAWIN (см. раздел 8.2) н
- Page 227 and 228: ГЛАВА 7. РАЗРАБОТКА
- Page 229 and 230: ного моделирования
- Page 231 and 232: ля и даже более сов
- Page 233 and 234: ного цианинового к
- Page 235 and 236: Значения констант
почечных фрагментов с терминальными «выделенными» атомами позволяет<br />
получать легко интерпретируемые модели, наглядно показывающие пути влияния<br />
отдельных атомов или групп внутри молекулы на изучаемое свойство.<br />
5.3.2. Прогнозирование способности аналогов 1-[(2-гидроксиэтокси)-метил]–<br />
6(фенилтио)тимина (HEPT) ингибировать обратную транскриптазу вируса<br />
ВИЧ-1<br />
Ингибирующую активность в отношении обратной транскриптазы вируса<br />
ВИЧ-1, представленную эффективной концентрацией соединений, необходимой<br />
для достижения 50% защиты клеток линии МТ-4 от цитотоксического действия<br />
вируса (log 1/EC 50 ), мы исследовали для однородной выборки производных<br />
HEPT [396]. На Рис. 39 приведены общий структурный элемент соединений<br />
выборки и фрагменты заместителей R 1 , R 2 и R 3 , которые соответственно<br />
связаны с анкерными атомами общего фрагмента, маркированными метками<br />
“b”, ”c” и ”d”, и которые вносят наибольший вклад в лучшую комбинированную<br />
модель:<br />
X<br />
N<br />
C<br />
a<br />
Csp 3<br />
b<br />
1<br />
Csp 3 in d<br />
N R 2<br />
3<br />
c<br />
d C<br />
R 3<br />
in d R 1<br />
C C<br />
R 1<br />
d<br />
O<br />
d<br />
R 1<br />
2<br />
C<br />
c S<br />
in c R 2<br />
C<br />
4<br />
H 2<br />
C<br />
H 2<br />
C<br />
in b R 3<br />
b<br />
O<br />
CH 3<br />
Рис. 39. Наиболее важные фрагменты для ингибирования обратной транскриптазы<br />
ВИЧ-1 производными HEPT<br />
187
Change language