На Ð¿Ñ€Ð°Ð²Ð°Ñ Ñ€ÑƒÐºÐ¾Ð¿Ð¸ÑÐ¸

ле 5.1.1. В тех случаях, когда возможно несколько вариантов кодирования, из
них выбирается лексикографически минимальный.
Пример 1. Фрагмент O
O имеет код p4.OD_CD3CD3OD_.212.
Здесь код типа фрагмента p4, тип атомов кислорода OD_, тип атомов углерода
CD3, типы связей - 2, 1 и 2.
Пример 2. Фрагмент
N O может быть закодирован двумя способами:
p4.ND2CD3CD3OD_.212 и p4.OD_CD3CD3ND2.212. Из этих двух вариантов
выбирается лексикографически наименьший код:
p4.ND2CD3CD3OD_.212
Для задания маски, соответствующей целой группе фрагментов, можно
также пользоваться подстановочным символом ‘*’, который может соответствовать
любому символу в коде фрагмента.
Пример 3. Рассмотрим две маски: p1.*** и p2.******.* . В этом случае
программа Fragment сгенерирует все возможные фрагменты с одним и двумя
неводородными атомами.
5.1.4. Генерация кодов фрагментов с обобщенными типами атомов
Программа Fragment позволяет автоматически добавлять к каждому коду
фрагмента ряд его вариантов с различными уровнями обобщения типов атомов.
Эти обобщенные варианты рассматриваются как самостоятельные дескрипторы.
В настоящей версии программы предусмотрено 4 способа обобщения: 1)
генерация кодов фрагментов с учетом только максимально подробного уровня
классификации (none); 2) генерация кодов фрагментов, при которой изменение
уровня классификации для всех атомов происходит одинаковым образом
(level1); 3) генерация кодов фрагментов с учетом разных уровней классификации
для атомов (level2); 4) генерация кодов фрагментов с учетом всех возможных
уровней классификации (full). Например, если программа находит фрагмент
NH 2 CH=O с кодом
p3.NA1CD2OD_.12,
154