Tentamen Introduktion till Bioteknik och Bioinformatik 5hp 1MB101

a) Beskriv hur du går tillväga, sätt in begreppen i sitt sammanhang, förklara vilka
enzym som behövs och vad som sker i de olika stegen (6p).
Svar: Man startar med att preparera DNA från mango. Detta DNA klyvs med
restriktionsenzym och fragmentet separeras i gel elektrofores. Fragmentet som
innehåller genen av intresse kan identifieras med hjälp av DNA hybridisering där
man använder en probe som känner igen fragmentet/genen man vill isolera.
Det intressanta genfragmentet sätts in i en vektor/plasmid via DNA ligering
(DNA ligas) och plasmiden transformeras (transformation) in i en bakterie för
överproduktion av genen eller proteinet. Man kan dubbelkontrollera sitt
fragment med PCR amplifiering som enbart amplifierar det fragment man är
intresserad av. Man kan också använda PCR för att hitta den bakterieklon som
innehåller rätt fragment, men det är förmodligen inte den bästa metoden om man
har dålig effektivitet på sin kloningsprocedur för då får man göra väldigt mycket
PCR experiment. (6p)
b) Beskriv ett eller flera sätt som man kan undersöka hur man kan veta att man har
fått fram rätt protein i sitt experiment(2p)?
Svar: DNA nivå: man kan kolla med DNA sekvensering, med DNA hybridisering
med en prob som är specifik för den gen man vill överuttrycka.
Proteinnivå: Man kan undersöka proteinets egenskaper som storlek, eventuella
enzymatiska egenskaper, laddning mm. Man kan även sekvensera sitt protein
eller använda massspektrometri. Microarray, storskaligt passar inte så bra här.
c) Vilken information behöver du ha innan du sätter igång dina experiment (2p)?
Svar: man behöver veta DNA sekvensen på genen som kodar för proteinet. Man
kan också använda sig av proteinsekvensen (aminosyrasekvensen) för att leta
efter genen.
Fråga 54
Bioteknikens utveckling har gjort att vi kan ställa frågor om liv och livets värde som vi
inte kunnat göra tidigare. Nobelpriset i medicin/fysiologi 2007 gick till Mario Capecchi
(USA), Martin Evans (Storbritannien) och Oliver Smithies (USA) som utvecklat teknik
med stamceller. Sedan dess har mycket resurser satsats på stamcellsforskningen i
Sverige och internationellt.
a) Vad är egentligen stamceller? (4p)
Svar: stamceller är odifferentierade celler som kan utvecklas till i princip vilken
celltyp som helst. Beroende på var stamcellerna tas ifrån definieras de som
embryonala eller adulta. De embryonala kan utvecklas till alla celltyper, medan
de adulta intehar riktigt samma möjligheter att kunna bli olika celler.
(Totipotenta/multipotenta) 4p)
b) Hur kan stamceller användas inom medicinen? (4p)
Svar: Man hoppas mycket på att stamceller ska kunna användas för att ersätta
celler i individer som inte fungerar, t.ex. insulinproducerande celler som kan
hjälpa patienter med diabetes eller att kunna tillföra nervceller till personer som
fått skador i hjärnan (4p). Andra sjukdomar som ni tar upp Alzheimers och
Parkinsons.
c) Vilka etiska problem har diskuterats i samband med användning av stamceller? (2p)