QST*R - Gen-Probe, Inc.

Elucigene ® QST*R ® -produkter 

Bruksanvisning 

ELUCIGENE är ett varumärke som tillhör Gen-Probe Life Sciences Ltd. 

QST*R är ett varumärke som tillhör Gen-Probe Life Sciences Ltd. 

Elucigene-satser utvecklas och tillverkas av Gen-Probe Life Sciences Ltd. inom 

kvalitetssystem som är ackrediterade enligt ISO9001:2008 och ISO13485:2003. 

Elucigene QST*R-satser utvecklas i samarbete med Guys and St Thomas’ NHS 

foundation Trust, London, Storbritannien. 

VIC, PET och GENEMAPPER är varumärken som tillhör Applied Biosystems LLC. 

NED, POP-6, POP-7 och Hi-Di är varumärken som tillhör Life Technologies 

Corporation. 

GeneMarker är ett varumärke som tillhör SoftGenetics Corporation. 

InstaGene är ett varumärke som tillhör Bio-Rad Laboratories Inc. 

Kommentar till köparen: Begränsad licens 

Polynukleotider som är märkta med VIC, NED och PET -färger och/eller deras 

användning kan vara skyddade av ett eller flera patent som ägs av Applied Biosystems, 

LLC. Inköpspriset för denna produkt innefattar begränsade, icke överförbara rättigheter 

enligt vissa anspråk i särskilda patent som ägs av Applied Biosystems, LLC: Köparen får 

endast använda denna mängd av produkten, och endast i syfte att detektera mål inom 

fältet för human diagnostik. Inga andra rättigheter överlåts. Mer information om inköp av 

licenser i samband med färgerna som nämns ovan kan erhållas genom att man kontaktar 

Director of Licensing, Applied Biosystems, 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, 

California, 94404, USA. 

Tillverkad av: 

Gen-Probe Life Sciences Ltd. 

Oaks Business Park 

Crewe Road 

Wythenshawe 

Manchester 

M23 9HZ, Storbritannien 

För försäljning, kundservice och teknisk support: 

Tfn: +49 (0) 6122 7076451 

Fax: +49 (0) 6122 7076155 

E-post: customerservice@gen-probe.eu 

E-post: technicalsupport@gen-probe.eu 

Copyright 2011 Gen-Probe Life Sciences Ltd. 

AN000BY001SV Rev.07/2012 Sida 1 av 36

Elucigene QST*R 

Elucigene QST*R-sortimentet med produkter är DNA-baserade multiplex-assayer för 

snabb prenatal bestämning av aneuploidistatuset för de tre vanligaste viabla autosomala 

trisomierna och könskromosomerna X och Y. Elucigene QST*R-satser är tillgängliga i 

formaten som anges nedan. Det finns mer information om satserna i QST*R-sortimentet 

på www.gen-probe.com/global/products-services/ 

Produkt Antal Artikelnummer 

Elucigene QST*Rplusv2 50 analyser AN0PLB2 

Elucigene QST*R 50 analyser AN003B2 

Elucigene QST*R-XYv2 50 analyser AN0XYB2 

Elucigene QST*R-13 10 analyser AN013BX 



Avsedd användning 

QST*Rplusv2 

För rutinmässig kvantitativ diagnos in vitro av de tre vanligaste viabla autosomala 

trisomierna: trisomi 13 (Pataus syndrom), trisomi 18 (Edwards syndrom) och trisomy 21 

(Downs syndrom). I satsen ingår även markörer för X- och Y-kromosomer och TAF9Lmarkören 

för könsbestämning. Metoden som används i satsen Elucigene QST*Rplusv2 

är tekniken QF-PCR (Quantitative Fluorescence-Polymerase Chain Reaction, kvantitativ 

fluorescent polymeraskedjereaktion). Produkterna är avsedda att användas på DNA som 

har extraherats ur prover från antingen amnionvätska eller korionvilli (CVS) som tagits 

under amniocentes. Den avsedda målgruppen är gravida kvinnor som bedöms löpa en 

hög risk för att bära på ett skadat foster, enligt diagnostiska biokemiska procedurer eller 

ultraljudsprocedurer, eller bedöms löpa en risk på grund av tidigare familjehistorik eller 

moderns ålder. Produkten är avsedd att användas tillsammans med andra diagnostiska 

procedurer för att ge stöd åt eller avskriva den förmodade kliniska diagnosen. 

Produkten är endast avsedd för yrkesmässig användning i en molekylär eller 

cytogenetisk laboratoriemiljö. 

QST*R 

För rutinmässig kvantitativ diagnos in vitro av de tre vanligaste viabla autosomala 

trisomierna: trisomi 13 (Pataus syndrom), trisomi 18 (Edwards syndrom) och trisomy 21 

(Downs syndrom). Metoden som används i satsen Elucigene QST*R är tekniken QF-PCR 

(Quantitative Fluorescence-Polymerase Chain Reaction, kvantitativ fluorescent 

polymeraskedjereaktion). Produkterna är avsedda att användas på DNA som har 

extraherats ur prover från antingen amnionvätska eller korionvilli (CVS) som tagits under 

amniocentes. Den avsedda målgruppen är gravida kvinnor som bedöms löpa en hög risk 

för att bära på ett skadat foster, enligt diagnostiska biokemiska eller ultraljudsprocedurer, 

eller bedöms löpa en risk på grund av tidigare familjehistorik eller moderns ålder. 

Produkten är avsedd att användas tillsammans med andra diagnostiska procedurer för att 

ge stöd åt eller avskriva den förmodade kliniska diagnosen. 



QST*R-XYv2 

För rutinmässig kvantitativ diagnos in vitro av könskromosomstatus inklusive de vanliga 

aneuploidierna Klinefelters syndrom och Turners syndrom. Metoden som används i 

satsen Elucigene QST*R-XYv2 är tekniken QF-PCR (Quantitative Fluorescence- 

Polymerase Chain Reaction, kvantitativ fluorescent polymeraskedjereaktion). 

Produkterna är avsedda att användas på DNA som har extraherats ur prover från 

antingen amnionvätska eller korionvilli (CVS) som tagits under amniocentes. Den 


avsedda målgruppen är gravida kvinnor som bedöms löpa en hög risk för att bära på ett 

skadat foster, enligt diagnostiska biokemiska eller ultraljudsprocedurer, eller bedöms löpa 

en risk på grund av tidigare familjehistorik eller moderns ålder. Produkten är avsedd att 

användas tillsammans med andra diagnostiska procedurer för att ge stöd åt eller avskriva 

den förmodade kliniska diagnosen. 



QST*R-13, QST*R-18, QST*R-21 

Kompletterande satser som innehåller ytterligare autosomala markörer, att användas 

tillsammans med QST*R eller QST*Rplusv2, för rutinmässig kvantitativ diagnos in vitro av 

de tre vanligaste viabla autosomala trisomierna: trisomi 13 (Pataus syndrom), trisomi 18 

(Edwards syndrom) respektive trisomi 21 (Downs syndrom). 

Dessa satser är tillgängliga för utvidgad kromosomanalys där det är nödvändigt eller för 

att bekräfta positiva resultat. Metoden som används i dessa satser är tekniken QF-PCR 

(Quantitative Fluorescence-Polymerase Chain Reaction, kvantitativ fluorescent 

polymeraskedjereaktion). Produkterna är avsedda att användas på DNA som har 

extraherats ur prover från antingen amnionvätska eller korionvilli (CVS) som tagits under 

amniocentes. Den avsedda målgruppen är gravida kvinnor som bedöms löpa en hög risk 

för att bära på ett skadat foster, enligt diagnostiska biokemiska eller ultraljudsprocedurer, 

eller bedöms löpa en risk på grund av tidigare familjehistorik eller moderns ålder. 

Produkten är avsedd att användas tillsammans med andra diagnostiska procedurer för att 

ge stöd åt eller avskriva den förmodade kliniska diagnosen. 



Sammanfattning och förklaring 

Downs syndrom, Edwards syndrom och Pataus syndrom är de tre vanligaste, viabla 

autosomala trisomierna. Incidenserna för levande födda är cirka 1 på 700, 1: 3 000 

respektive 1: 21 700. Turners syndrom hos flickor och Klinefelters syndrom hos pojkar är 

de vanligaste aneuploidierna i könskromosomerna. Den vanligaste orsaken till Turners 

syndrom är monosomin för X-kromosomen (45, X-karyotypen) och för Klinefelters 

syndrom är det en extra X-kromosom (47, XXY-karyotypen). Incidenserna för levande 

födda är mellan 1: 2 000 till 1:5 000 flickor för Turners syndrom och mellan 1: 500 och 

1:650 pojkar för Klinefelters syndrom. 

Risken att föda ett barn med Downs syndrom ökar signifikant med moderns ålder, från 

cirka 1:1 600 vid åldern 20–24, till 1:200 vid 35 års ålder och 1:19 vid 45 års ålder och 

äldre. Gravida kvinnor erbjuds som rutin screening för Downs syndrom under 

graviditetens första trimester. En standardanalys är så kallad ”OSCAR”, One Stop Clinical 

Assessment of Risk, (eller KUB, kombinerat ultraljud och biokemi) som utförs när det har 

gått mellan 10 och 13,5 veckor av graviditeten. I analysen kombineras två biokemiska 

markörer, fritt beta-hCG (humant koriongonadotropin) och PAPP-A (Pregnancy 

Associated Plasma Protein-A) med mätning av tjockleken på fostrets hals 

(nackuppklarning) (1). Kombinationen av resultaten av dessa tre analyser ger en total 

riskbild. Kvinnor som identifieras som utsatta för ökad risk för att föda ett barn med 

Downs syndrom erbjuds då en amniocentes för ett direkttest för avvikelsen. Amniocentes 

är ett invasivt test och innebär att en nål, vägledd med ultraljud, förs in i amnionsäcken 

som omger fostret. Ett litet prov, vanligtvis 10–20 ml, av amnionvätska som innehåller 

fosterceller sugs ut och analyseras. 

Downs syndrom uppkallades efter dr John Langdon Down år 1866 men det har beskrivits 

tidigare. Det orsakas av trisomi för hela eller delar av kromosom 21 (2). Förutom en 

kognitiv nedsättning av varierande grad brukar personer med Downs syndrom ha ett 

antal särdrag gemensamt, däribland hypotoni (dålig muskeltonus), en framstickande 


tunga, mandelformade ögon beroende på ett epikantusveck, uppåtvinklade palpebrala 

fissurer, ett enda veck i handflatan och onormalt korta extremiteter. De löper dessutom 

ökad risk för medfödda hjärtfel och att senare i livet utveckla en form av Alzheimers 

sjukdom. 

Edwards syndrom beskrevs först av dr John Edwards år 1960. Det orsakas av trisomi för 

hela eller delar av kromosom 18. Precis som för Downs syndrom ökar risken för att få ett 

barn med Edwards syndrom i relation till moderns ålder. Typiska kliniska särdrag 

innefattar låg födelsevikt, hjärtdefekter, missbildning i mag-tarmkanalen, urogenital 

missbildning, neurologiska problem och kraniofaciala avvikelser. Mediantid för livslängd 

är cirka 4 dagar. 

Pataus syndrom är uppkallat efter dr Klaus Patau som beskrev sjukdomen tillsammans 

med det kromosomala sambandet. Det orsakas av trisomi för hela eller delar av 

kromosom 13. Spädbarn med Pataus syndrom är svårt skadade med flera avvikelser. 

Typiska särdrag innefattar låg tillväxt i livmodern, låg födelsevikt, medfödda hjärtdefekter, 

mikrocefali, holoprosencefali med kluven gom och mikroftalmi, central apné, polydaktyli 

och kongenital vertikal talus. Mediantid för livslängd är cirka 2,5 dagar. 

Turners syndrom hos flickor orsakas av monosomi för X-kromosomen. Cirka 98 % av alla 

foster med Turners syndrom aborteras spontant. Överlevande barn uppvisar ett flertal 

typiska särdrag, däribland kortväxthet, primär amenorré, hudveck vid nacke och hals (på 

grund av cystiskt hygrom, en vätskefylld hinna, i livmodern). De brukar även lida av 

medfödd hjärtsjukdom och kan ha hästskoformade njurar. 

Klinefelters syndrom hos pojkar orsakas av en extra X-kromosom. Personer med 

Klinefelters syndrom är infertila och kan ha en lindrig kognitiv funktionsnedsättning. De 

brukar vara längre än genomsnittet, kan utveckla gynekomasti som kräver kirurgisk 

reduktion och löper ökad risk för att utveckla osteoporos på grund av sänkta 

testosteronnivåer. 

QST*Rplusv2 innefattar markörer för alla tre autosomerna och både X och Y. Den är 

utformad för att detektera hela kromosomaneuploidier i dessa kromosomer men 

detekterar inte balanserade strukturella rearrangemang och skiljer inte mellan aneuploidi 

som orsakas av ”non-disjunction” eller ett obalanserat rearrangemang. 

Metodprinciper 

Metoden som används i Elucigene QST*R-satser är tekniken QF-PCR (Quantitative 

Fluorescence-Polymerase Chain Reaction, kvantitativ fluorescent 

polymeraskedjereaktion) (3–7). Med användning av PCR-amplifiering riktas primrar som 

är märkta med fluorescent färg mot höggradigt polymorfa regioner i DNA-sekvensen som 

kallas STR (short tandem repeats) och som finns på kromosomerna som är av intresse. 

Varje mål-STR-markör är specifik för den kromosom på vilken den finns, och därför kan 

antalet STR-markörer vara diagnostiskt för antalet kromosomer. Informativa STRmarkörer 

har valts ut som uppvisar en hög heterogenitet så att det är lätt att bestämma 

antalet uppsättningar. Ett normalt diploid-prov har det normala komplementet två av varje 

av de somatiska kromosomerna, alltså bestäms två alleler av en kromosomspecifik STR 

med QF-PCR-tekniken som två toppar i en kvot på 1:1. Observationen av en extra STRallel 

som antingen ett mönster med tre toppar i en kvot på 1:1:1 eller ett mönster med två 

toppar i en kvot på 2:1 eller 1:2 är diagnostiskt för förekomsten av en extra sekvens vilket 

i sin tur kan representera en extra kromosom, så som är fallet vid en trisomi. 

Amplifierade produkter av QF-PCR-tekniken analyseras kvantitativt på en Genetic 

Analyzer med kapillärelektrofores för bestämningen av antalet uppsättningar av de 

analyserade STR-markörerna. 


Varningar och försiktighetsåtgärder 

1. Enbart för in vitro-diagnostiskt bruk. 

2. Den normala DNA-kontrollen som medföljer i satserna har genomgått en oberoende 

analys och har konstaterats vara negativ för hepatit B-virus (HBV), hepatit C-virus (HCV) 

samt humant immunbristvirus (HIV) 1 och 2. 

3. Försiktighet måste iakttas vid hantering av material av humant ursprung. Alla prover 

ska betraktas som potentiellt smittförande. Ingen analysmetod kan ge en fullständig 

garanti för att HBV, HCV, HIV eller andra smittförande agens inte förekommer. Hantering 

av prover och analyskomponenter, deras användning, förvaring och kassering ska utföras 

i enlighet med de procedurer som beskrivs i den relevanta nationella säkerhetsriktlinjen 

eller -föreskriften för biologiskt riskmaterial. 

4. Förvara alla komponenter under –20 °C. 

5. I linje med aktuell god laboratoriesed, ska laboratorier behandla sina egna interna 

QC-prover av känd typ vid varje assay, så att procedurens validitet kan bedömas. 


Symboler som används på etiketter 

Symboler som används på alla etiketter och allt emballage följer den harmoniserade 

standarden EN980. 

REF 

LOT 

X°C 

Tillverkare 

Antal analyser 

Se bruksanvisningen 

Förvara under angiven temperatur 

Använd före angivet datum 

Artikelnummer 

Batch- eller partinummer 


Tillhandahållen materiel 

Varje sats innehåller: 

(TA): 2 x 250 µl (50 analyser) eller 1 x 100 µl (10 analyser) av QST*R Reaction Mix 

(reaktionsblandning), innehållande primrar för att amplifiera ett antal markörer för STR 

(short tandem repeat). Se bilaga 2 för mer information om markörerna i respektive sats. 

QST*R-reaktionsblandningen innehåller även DNA-polymeras och 

deoxynukleotidtrifosfater i buffert. 

Sats 0,2 ml PCR-ampuller Nummer på 

komponentdel 

Elucigene QST*Rplusv2 Genomskinlig AN0PLTA 

Elucigene QST*R Orange AN003TA 

Elucigene QST*R-XYv2 Rosa AN0XYTA 

Elucigene QST*R-13 Grön AN013TA 

Elucigene QST*R-18 Violett AN018TA 

Elucigene QST*R-21 Gul AN021TA 

(DC): 1 x 50 µl-ampull, DNA-kontroll, diploid för markörerna som detekteras med 

Elucigene QST*R: 

Sats Nummer på komponentdel 

Elucigene QST*Rplusv2 CR001TX 

Elucigene QST*R CR001TX 

Elucigene QST*R-XYv2 CR001TX 

Elucigene QST*R-13 CR001TX 



50 (10) x 0,2 ml PCR-ampuller, färgkodade enligt ovan. 

Satsberedning och -förvaring 

När satsen öppnas bör reaktionsblandningen dispenseras i medföljande 0,2 ml PCRampuller 

(eller motsvarande) i volymer om 10 µl samt frysas vid –20 °C. Se till att 

ampullinnehållet tinas och blandas noga före dispensering. 


Nödvändigt material som inte tillhandahålls 

Allmänt 

Förbrukningsvaror på laboratoriet – handskar; pipettspetsar. 

Laboratorieutrustning – precisionspipetter (2 uppsättningar: 1 för hantering före 

amplifiering och 1 för hantering efter amplifiering:- helst pipetter med positiv förskjutning); 

skyddskläder; vortexblandare; mikrofug; centrifug med 96-brunnars mikrotiterplatta. 

DNA-extraktion 

DNA-beredning – InstaGene Matrix (Bio-Rad Laboratories, art.nr 732-6030), sterilt 

avjoniserat vatten. 

PCR-amplifiering 

Termisk cycler som rymmer 96-brunnars mikrotiterplattor eller 0,2 ml ampuller med en 

temperaturnoggrannhet på +/–1 °C mellan 33 °C och 100 °C och statisk 

temperaturenhetlighet på +/–1 °C. 

Kapillärelektrofores 

Kapillärelektrofores – GeneScan 500 LIZ-storleksstandard (ABI art.nr 4322682), 

GeneScan 600 LIZ (ABI art.nr 4366589) eller GeneScan 600v2 LIZ (ABI art.nr 4408399), 

DS-33 (färguppsättning G5) matrixstandard (ABI art.nr 4345833), POP-6 Polymer (ABI 

art.nr 4316357) eller POP-7 Polymer (ABI art.nr 4352759), 10x Genetic Analyzer-Buffer 

(ABI art.nr 402824) och Hi-Di-formamid (ABI art.nr 4311320). 

Applied Biosystems ABI 3130 och 3500 Genetic Analyzers (med GeneMapperprogramvara), 

36 cm kapilläruppställning (50 cm kapilläruppställning för 3500 Genetic 

Analyzer), 96-brunnars optiska plattor, 96-brunnars septa, 96-brunnars kassetter. 

Dataanalys 

Ett av följande programvarupaket för dataanalys krävs: GeneMapper 3.7 (Applied 

Biosystems Inc.) eller senare eller GeneMarker 1.65 (SoftGenetics LLC) eller senare. 

Extra Elucigene QST*R-dokumentation 

I denna Instructions for Use (bruksanvisning) ingår ett grundavsnitt om tolkning av de 

erhållna resultaten. En kompletterande Guide to Interpretation (Tolkningsvägledning) 

med exempel och ordlista och en Guide to Analysis (Analysvägledning) finns på 

webbplatsen för Gen-Probe: 

www.gen-probe.com/global/products-services/ 

Provtagning och provförvaring 

Prover på korionvilli (CV) eller amnionvätska (AF) ska användas. Ibland har det 

rapporterats att produkter för provtagning har skadat integriteten för vissa analyter och att 

de kan störa vissa metodtekniker. Vi rekommenderar att varje användare ser till att den 

valda produkten används enligt tillverkarens anvisningar och att både produkterna för 

provtagning och metoderna för DNA-beredning är kompatibla med denna analys. 


DNA-extraktion 

Elucigene QST*R-satser är validerade på InstaGene-matrixmetoden för DNA-extraktion 

och kan utföras i ett enda rör, vilket eliminerar behovet av överföringar rör-till-rör. Andra 

extraktionsmetoder har visat sig ge likvärdigt pålitliga resultat, t.ex. Qiagen QIAamp® - 

satser. 

InstaGene-metoden för DNA-extraktion beskrivs nedan. 

InstaGene-extraktionsmetoden 

Amnionvätska (AF) 

Cirka 1–2 ml amnionvätska ska användas. 

Korionvilli (CV) 

CV-prover ska rengöras noga så att all fastsittande decidua från modern avlägsnas. Det 

är viktigt att celler från mer än ett område av provet analyseras och att celler från 

mesenkymkärnan finns med. En liten alikvot av cellsuspensionen, som har beretts som 

vid konventionell cellodling, rekommenderas för QST*R-analys. Detta garanterar att 

QST*R-resultatet erhålls från samma cellpopulation som den som används för 

karyotypanalys. 

1. Resuspendera InstaGene-matrix i magnetomröraren och ställ in på medelhastighet i 

minst 5 minuter. 

2. Centrifugera provet (AF eller CV) vid 12 000 g i 1 minut för att pelletera cellerna. 

3. Avlägsna proverna från centrifugen och kontrollera pelleten visuellt avseende 

blodfärgning. Anteckna procentandelen blodfärgning, om sådan finns. 

4. Avlägsna och kassera försiktigt supernatanten från pelleten, och se till att pelleten inte 

rörs upp. Lämna kvar cirka 10–20 µl supernatant för att resuspendera pelleten. 

5. Vortexblanda provet noga. 

6. Om du observerar mer än 50 % blodfärgning fortsätter du till steg 7. Om du observerar 

mindre än 50 % blodfärgning fortsätter du till steg 8. 

7. Tillsätt 200 µl sterilt avjoniserat vatten till cellpelleten. Vortexblanda noga. Centrifugera 

vid 12 000 g i 1 minut och avlägsna supernatanten, men lämna kvar 10–20 µl av 

supernatanten för att resuspendera pelleten. 

Anm. Detta extra tvättsteg hjälper till att lysera de röda blodcellerna och avlägsna hem 

som skulle kunna hämma PCR. 

8. Tillsätt 200 µl InstaGene-matrix från steg 1 till proverna med en pipettspets med grov 

kaliber, t.ex. 1 000 µl. 

Anm. För att optimera extraktionsprotokollet kan den tillsatta volymen av InstaGenematrix 

(Chelex-100-resin) varieras med användning av 100 µl InstaGene-matrix för små 

AF-cellpelletar (knappt synliga), eller 300 µl för stora pelletar (som täcker rörets botten), 

CV- och vävnadsprover. Registrera mängden InstaGene-matrix som har tillsatts varje 

prov. 

9. Vortexblanda proverna noga och inkubera vid 100 °C i 8 minuter i ett värmeblock eller 

vattenbad. 


10. Vortexblanda noga igen vid hög hastighet i 10 sekunder. 

11. Centrifugera proverna vid 12 000 g i 3 minuter. Supernatanten innehåller det 

extraherade DNA:t. 

12. Fortsätt till PCR-förberedelserna eller förvara det extraherade DNA:t vid –20 °C tills 

det ska användas. 

DNA-koncentration 

Vi rekommenderar att alternativa metoder för DNA-extraktion och alternativa provtyper 

utvärderas noga med Elucigene QST*R-analysen innan resultaten används för 

diagnostik. 

Under optimala PCR-förhållanden och med användning av de rekommenderade 

inställningarna* för provinjektion som anges i kapillärkolonnkörningsmodulen (sid. 13), 

erhålls godtagbara resultat konsekvent med inmatade DNA-mängder på 1,25 ng till 

10 ng. 

*Anm. Inställningar för provinjektion kan ändras så att de passar mängden amplikon som 

produceras under PCR-reaktionen, vilken kan variera beroende på mängden inmatat 

genom-DNA som tillsatts. Mindre amplikon kan appliceras till kolonnen för analys genom 

att man reducerar injektionstiden. Omvänt kan mer amplikon appliceras till kolonnen för 

analys genom att man ökar antingen tiden eller spänningen för injektionen. Tidigare 

amplifierade prover kan återinjiceras flera gånger för ny analys. 

Analysprotokoll 

Amplifieringsprocedur 

Där prover har extraherats med användning av Instagene-metoden rekommenderar vi att 

outspädd supernatant används direkt i PCR-reaktionen. 

Anm. För att minimera risken för kontamination måste steg 3–5 utföras i ett område som 

är fritt från DNA. Dessutom ska steg vidtas för att undvika kontamination med PCRprodukt. 

1. Programmera den termiska cyclern för en enstegscykel för att aktivera DNApolymeraset 

vid 95 °C i 15 minuter kopplat till ett program för amplifieringscykling på 

30 sekunder vid 95 °C (denaturering), 1 minut och 30 sekunder vid 59 °C 

(primerbindning) och 1 minut och 30 sekunder vid 72 °C (förlängning) under 26 cykler. 

Detta ska kopplas till en 30-minuters tidsfördröjningsfil vid 72 °C (förlängning) i den sista 

cykeln. 


Enzymaktivering Cykling Slutlig förlängning 

95 °C 95 °C 

15 min 30 sek. 

59 °C 

Omgivande temperatur 1 min 30 sek. 

26 cykler 

72 °C 72 °C 

1 min 30 sek. 30 min 

2. En negativ (vatten) kontroll måste ingå i varje PCR-körning. Det kan även anses 

lämpligt att inkludera andra kontroller, t.ex. positiv normal (medföljande DNA-kontroll) och 

positiv trisomikontroll (DNA medföljer ej). 

3. Tina ett tillräckligt antal ampuller med QST*R-reaktionsblandning, som i förväg har 

delats upp i alikvoter, för antalet prover och kontroller som ska köras (se anteckning 

under Tillhandahållet material) och centrifugera ampullerna vid 12 000 g i 10 sekunder. 

4. Använd separata pipettspetsar och tillsätt 2,5 µl med analys-DNA till en provampull 

som innehåller 10 µl QST*R-reaktionsblandning och blanda genom att pipettera upp och 

ned. Gör detta för alla prover som ska analyseras. 

Tillsätt inte DNA till PCR-ampullen för den negativa kontrollen. Tillsätt istället 2,5 µl sterilt 

destillerat vatten. 

Anm. Var noga med att inte kontaminera PCR-reaktionen med något InstaGene-resin. 

5. Centrifugera ampullerna kortvarigt tills all vätska finns på botten av varje ampull. 

6. Placera alla ampullerna stadigt i blocket på den termiska cyclern. Starta 

aktiveringsprogrammet på 95 °C följt av amplifieringsprogrammet (se steg 1). 

7. När amplifieringsprogrammet är klart kan proverna förvaras vid rumstemperatur över 

natten eller vid 2–8 °C i upp till 7 dagar innan de analyseras med kapillärelektrofores. 


Kapillärelektrofores 

Vi rekommenderar att alla användare ser till att den utvalda utrustningen används i 

enlighet med tillverkarens anvisningar och är kompatibel med denna analys. I denna 

kontext är de viktigaste parametrarna polymeren och kapilläruppställningen. Optimala 

resultat kan erhållas med användning av följande förhållanden för kapillärelektrofores på 

en ABI3130 eller ABI3500 Genetic Analyzer. 

1. Kombinera 6,85 µl av storleksstandarden med 250 µl Hi-Di Formamide och blanda 

noga (blandningen räcker till 16 brunnar). Dispensera 15 µl av blandningen i det 

erforderliga antalet brunnar på en optisk platta med 96 brunnar. 

2. Tillsätt 3 µl av analysprovet med PCR-produkt till blandningen med storleksstandard 

(från steg 1) som redan är dispenserad i plattan och blanda med pipetten. Förslut plattan. 

3. Denaturera PCR-produkten som är dispenserad i den optiska plattan på en termisk 

cycler med användning av följande parametrar: 94 °C i 3 minuter kopplat till 4 °C i 30 

sekunder. 

4. Centrifugera plattan vid 1 000 g i 10 sekunder för att avlägsna bubblor i brunnarna och 

ladda på Genetic Analyzer. 


ABI3130 GENETIC ANALYZER 

Skapa ett provblad med användning av 3130-programvaran för datainsamling med 

följande inställningar: 

• Sample Name (Provnamn): detta måste vara samma provspecifika namn eller nummer. 

• Run owner (Körningsägare): välj laboratoriets standardägare. 

• Run Protocol (Körningsprotokoll): QSTR (innehåller QST*R 3130-körningsmodulen – se 

nedan)*. 

*Anm. Det är nödvändigt att skapa en körningsmodul som beskriver 

instrumentinställningarna och sedan tilldela denna till ett körningsprotokoll i vilket Dye set 

G5 (Färguppsättning G5) har valts. Det finns mer information om hur man skapar 

körningsmoduler i användarmanualen till instrumentet. 

3130 RUN MODULE (KÖRNINGSMODUL) 

FÖR POP7-POLYMER 

36 cm kapillärmodul: QSTR 

# Parameter Name Value Range 

1 Oven Temperature 60 int 18…65 Deg.C 

2 Poly_fill_Vol. 6500 6500…38000 steps 

3 Current Stability 5.0 int 0…2000 uAmps 

4 PreRun_Voltage 15.0 0…15 kvolts 

5 Pre_Run_Time 180 1…1000 sec. 

6 Injection_Voltage 3.0 1…15 kvolts 

7 Injection_Time 15 1…600 sec. 

8 Voltage_Number_of_Steps 20 1…100 nk 

9 Voltage_Step_Interval 15 1…60 sec. 

10 Data_Delay_Time 60 1…3600 sec. 

11 Run_Voltage 15.0 0…15 kvolts 

12 Run_Time 1200 300…14000 sec. 


ABI3130 GENETIC ANALYZER 

Ett QSTR-instrumentprotokoll måste skapas vilket sedan kan användas för varje QSTRkörning. 

Skapa QSTR-instrumentprotokollet via 3500-biblioteket för instrumentprotokoll. 

Se till att följande är valda: 

• Run Module (Körningsmodul): FragmentAnalysis50_POP7 

• Ange inställningarna som finns på bilden nedan: 

För att köra proverna skapar du en provplatta genom att klicka på ”Create Plate from 

Template” (Skapa platta från mall) i ”Dashboard” (Instrumentbord), och ser till att rätt 

Instrument Protocol (Instrumentprotokoll) för QSTR har tilldelats (se ovan). 


Analys och tolkning av resultat 

Vi rekommenderar att varje laboratorium utvecklar egna procedurer och kriterier för 

tolkning och rapportering. Riktlinjer för bästa praxis för QF-PCR har dokumenterats av 

Storbritanniens Clinical Molecular Genetics Society and Association of Clinical 

Cytogeneticists och är tillgängliga som referens på: 

www.cmgs.org.uk 

PCR-produkter observeras som ett märksystem med 5 färger med filteruppsättning G5. 

Filteruppsättning G5 detekterar fragment som är märkta med 6-FAM (blå), VIC (gröna), 

NED (gula) och PET (röda) plus markören Size Standard (Storleksstandard) som är 

märkt med LIZ (orange) på ett elektroferogram och i GeneMapper- eller GeneMarkerprogrammet. 

Software analysis guides (Vägledningar för programvaruanalys) för GeneMarker och 

GeneMapper är tillgängliga på webbplatsen för Gen-Probe: 


Vägledningen för GeneMapper-analys ger information om programvaruinställningar och 

anvisningar för import av analyserade data till en Excel-rapportmall. GeneMarker har en 

applikation för trisomianalys som är kompatibel med Elucigene QST*R. 

Viktig anmärkning: Olika kombinationer av instrument, polymer och storleksstandard 

kan göra att storleksanrop varierar något. Under validering av satsen ska användare 

kontrollera att standardinställningarna för ”bin” (”fack”) leder till korrekt toppmärkning och 

justera vid behov. Kontakta teknisk support för att få råd om det uppstår problem. 

Allmänna analysriktlinjer för alla QST*R-satser 

1. Den negativa kontrollen ska inte uppvisa några vassa toppar inom avläsningsintervallet 

på 100 till 510 bp. 

2. Den positiva kontrollen måste uppvisa de förväntade resultaten och alla toppar måste 

uppfylla kriterierna nedan. 

3. För analys av DNA-prover ska minst 1 topp observeras för varje analyserad markör. 

Det godtagbara intervallet för markörtoppar som analyseras på 3130 Genetic Analyzer 

ligger mellan 50 och 6 000 relativa fluorescerande enheter (rfu) och för 3500 Genetic 

Analyzers mellan 175 och 32 000 rfu. Topphöjder som hamnar utanför detta intervall ska 

inte analyseras. 

4. Elektroferogram av dålig kvalitet på grund av kraftig genomblödning mellan färger 

(även kallat ”pull-up”) eller ”elektroforesspikar” (vassa toppar som finns i mer än en färg) 

ska inte tolkas. PCR-produkterna ska återinjiceras och återanalyseras. 

5. Analys utförs genom bedömning av toppkvoter (A1/A2), där A1 är topparean för det 

kortare fragmentet och A2 är topparean för det längre fragmentet. Kvoten som blir 

resultatet är diagnostisk för antalet lokusuppsättningar. För disomiska kromosomer ska 

heterozygota markörer visa två toppar med liknande höjd. En fullständig analys av antalet 

kromosomuppsättningar utförs genom jämförelse av kvoter för toppareor. 

6. Heterozygota dialleliska (dvs. två alleler) markörer ska hamna inom ett kvotfönster på 

0,8 till 1,4. För två alleler som separeras med mer än 24 bp i storlek är dock en kvot på 

upp till 1,5 godtagbar. Alla värden som hamnar inom denna region benämns som om de 


hade en kvot på 1:1. Om kvotbalansen hamnar utanför detta fönster kan det bero på flera 

faktorer, t.ex.: 

Trisomi för hel kromosom 

Trisomi för partiell kromosom (inklusive submikroskopiska dupliceringar) 

Mosaicism 

Kontaminerande sekundär genotyp (t.ex. från modern, från en tvilling, extern) 

”Skuggor” (”stutters”) som orsakar förvrängning 

Preferentiell amplifiering av en allel vilket orsakar förvrängning 

Polymorfismer på primerställe 

Somatiska mikrosatellitmutationer 

I Guide to Interpretation (Tolkningsvägledning) finns exempel på typiska profiler för 

många av dessa. Homozygota markörer är icke-informativa eftersom en kvot inte kan 

bestämmas. 

7. För att ett resultat ska tolkas som avvikande (dvs. med trisomi), krävs minst två 

informativa markörer som är förenliga med en triallelisk genotyp med alla andra markörer 

som är icke-informativa. Ett resultat bör inte tolkas som avvikande baserat på information 

från endast en markör. Vid behov kan uppföljande analys med satserna för enkel 

kromosom (dvs. Elucigene QST*R-13, Elucigene QST*R-18, Elucigene QST*R-21) ge 

tillräckligt med information för tolkning. 

Trisomi bestäms antingen med: 

7.1. Två toppar med olika höjd beroende på att en av topparna representerar två alleler 

som är gemensamma för en eller båda föräldrarna. I detta fall klassas kvoten mellan de 

två topparna som 2:1 eller 1:2 så att A1/A2 ger ett resultat i området 1,8 till 2,4 när 

toppen som representerar den kortare allelen har en större area än toppen som 

representerar den längre allelen, eller där A1/A2 ger ett resultat i området 0,45 till 0,65 

när toppen som representerar den kortare allelen har en mindre area än toppen som 

representerar den längre allelen. 

7.2. Det finns tre toppar med jämförbar höjd. Kvoten för topparna klassas som 1:1:1 och 

deras värden hamnar inom det normala intervallet på 0,8–1,4 (men för alleler som är 

separerade med mer än 24 bp är en allelkvot på upp till 1,5 godtagbar). Om detta inte 

sker kan det bero på en av faktorerna som nämndes i steg 6. 

8. För att ett resultat ska tolkas som normalt, krävs minst två informativa markörer som är 

förenliga med en diallelisk genotyp med alla andra markörer som är icke-informativa. Ett 

normalt resultat indikerar det normala komplementet på två för de testade 

kromosomerna. 

9. Toppareakvoter som hamnar mellan intervallen för normala och avvikande klassas 

som osäkra. Osäkra resultat kan fastställas med hjälp av satserna för enkel kromosom. 

10. Om både normala och avvikande allelmönster erhålls för en enkel kromosom 

rekommenderas att uppföljande studier utförs för att identifiera orsaken till de avvikande 

resultaten innan några slutsatser dras. 

11. I sällsynta fall kan allelstorleksintervallen för markörer överlappa. Vid misstanke om 

detta kan en analys med satserna för enkel kromosom lösa problemet. 


Specifik för QST*R-XYv2 och könskromosommarkörerna i QST*Rplusv2 

1. AMEL-markören amplifierar icke-polymorfa sekvenser på kromosomerna X (104 bp) 

och Y (110 bp) och kan användas för att bestämma närvaron eller frånvaron av en Ykromosom 

och representerar den relativa mängden av X- till Y-sekvens. Observera att i 

sällsynta fall har amplifieringsfel på grund av mutation av AMEL-Y-sekvensen 

rapporterats. 

2. TAF9L är en invariant paralog markör med sekvenser på kromosomerna 3 och X. Den 

specifika toppen för kromosom 3 (116 bp, vilket representerar 2 uppsättningar av 

kromosom 3) kan därför användas som en referenstopp för att underlätta bestämningen 

av antalet X-kromosomer som finns (121 bp-topp). Vid analys i kombination med 

Amelogenin och de andra könskromosommarkörerna, är det särskilt användbart vid 

diagnosen av könskromosomaneuploidi, t.ex. Turners syndrom. Hos en normal flicka ska 

markörerna hamna inom ett kvotfönster på 0,8 till 1,4. Hos en normal pojke eller 

monosomi X ger markörerna en kvot på ≥ 1,8. Det finns mer information om tolkningen av 

TAF9L-markören i Guide to Interpretation (Tolkningsvägledning). 

3. De polymorfa STR-markörerna DXYS267 och DXYS218 finns på både X- och Ykromosomerna 

och representerar det totala antalet könskromosomer. För informativa 

manliga resultat är det inte möjligt att bestämma vilken allel som representerar X- eller Ykromosomen. 

4. De informativa X-specifika markörerna DXS981, DXS1187, XHPRT, DXS6807, 

DXS7423, DXS6803 och DXS6809 representerar antalet X-kromosomer. 

5. Den Y-specifika markören, SRY, ger en enstaka topp hos normala pojkar och 

amplifieras inte hos normala flickor. 

6. Den Y-specifika markören, DYS448, ger i de flesta fall en enstaka topp hos normala 

pojkar och amplifieras inte hos normala flickor. Det har observerats att denna markör i 

sällsynta fall kan uppvisa ett ärftligt dialleliskt mönster (submikroskopisk duplicering följt 

av replikationsglidning) eller inte uppvisa någon amplifiering (noll-allel). 

7. Ett resultat som inte uppvisar någon amplifiering för Y-specifika markörer och 

homozygot för alla andra markörer behöver inte nödvändigtvis vara diagnostiskt för 

Turners syndrom. Baserat på publicerade data är cirka 1 på 170 000 flickor homozygota 

för alla 7 x specifika polymorfa markörer. Detta ger en Bayesiansk sannolikhet av cirka 1 

på 1 400 att en profil som är homozygot för alla X-specifika markörer representerar en 

äkta monosomi X-genotyp snarare än en normal homozygot flicka. 


Prestandaegenskaper 

INTERN VALIDERING 

QST*Rplusv2 

98 prover analyserades blint med Elucigene QST*Rplusv2. Av dessa var 22 normala/XY, 

17 var normala/XX, 12 var trisomi 21/XY, 7 var trisomi 21/XX, 9 var trisomi 18/XY, 8 var 

trisomi 18/XX, 2 var trisomi 13/XY, 4 var trisomi 13/XX, 8 var normala/X0, 1 var 

normalt/XYY och 1 var triploid för alla kromosomer som analyserades. 

Ett prov gav ett icke-informativt resultat. Sex prover kunde inte tillhandahålla 

analyserbara resultat på grund av dålig provkvalitet. Alla analyserbara resultat visade 

100 % specificitet och sensitivitet med resultat som erhållits tidigare med en annan 

etablerad metod. 

QST*R 

312 prover analyserades blint med Elucigene QST*R. Av dessa var 286 normala, 2 

uppvisade trisomi 13, 7 uppvisade trisomi 18, 13 uppvisade trisomi 21 och 2 var triploida 

för alla de 3 analyserade kromosomerna. Ett prov var kontaminerat med celler från 

modern vilket förhindrade analys och ett prov kunde inte ge något tolkningsbart resultat 

trots upprepad amplifiering. Totalt sett gav 310 prover analyserbara resultat. Alla 

analyserbara prover uppvisade 100 % specificitet och sensitivitet med resultat som 

erhållits tidigare med karyotypning. 

QST*R-XYv2 

321 prover analyserades blint med Elucigene QST*R. Av dessa var 160 normala pojkar, 

147 var normala flickor, 3 uppvisade monosomi X, 2 uppvisade XXY, 2 visade XYY och 1 

visade XXX. Sex prover kunde inte tillhandahålla något tolkningsbart resultat trots 

upprepad amplifiering. Totalt sett gav 315 prover analyserbara resultat. Alla analyserbara 

prover uppvisade 100 % specificitet och sensitivitet med resultat som erhållits tidigare 

med karyotypning. 

QST*R-13 

152 prover analyserades blint med Elucigene QST*R-13. Av dessa var 144 normala och 

2 uppvisade trisomi 13. Sex prover kunde inte tillhandahålla något tolkningsbart resultat 

trots upprepad amplifiering. Alla analyserbara prover uppvisade 100 % specificitet och 

sensitivitet med resultat som erhållits tidigare med karyotypning. 



4 uppvisade trisomi 18. Fem prover kunde inte tillhandahålla något tolkningsbart resultat 





2 uppvisade trisomi 21. Två prover kunde inte tillhandahålla något tolkningsbart resultat 




BILAGA 1: EXEMPEL 

Elucigene QST*Rplusv2 

Markörerna är märkta på följande sätt: 

6-FAM VIC NED PET 

DXS6803 DXS1187 AMEL D21S1409 

D21S1435 D21S1446 TAF9L D13S252 

D21S11 XHPRT D18S978 D21S1442 

D21S1437 D18S386 SRY D18S819 

D13S634 D13S305 D13S800 

D18S535 D18S390 

D13S628 

Se bilaga 2 för mer information om STR-markörerna inklusive storleksintervall. 


Elucigene QST*Rplusv2 – GENEMAPPER 

Ett exempel på en normal manlig QST*Rplusv2-profil som uppvisar det relativa läget för 

de detekterade markörerna. 


Elucigene QST*R 



D21S1435 D18S391 D18S978 D21S1409 

D21S11 D18S325 D21S1411 D13S252 

D21S1437 D18S386 D18S390 D18S819 

D13S634 D13S305 D13S628 

D18S535 



Elucigene QST*R – GENEMAPPER 

Ett exempel på en normal QST*R-profil som uppvisar det relativa läget för de detekterade 

markörerna. 


Elucigene QST*R-XYv2 



DXS6803 DXS1187 AMEL DXYS267 

DXS981 XHPRT SRY DYS448 

DXS6807 DXS7423 DXS6809 

DXYS218 



Elucigene QST*R-XYv2 – GENEMAPPER 

Ett exempel på en normal manlig QST*R-XYv2-profil som uppvisar det relativa läget för 

de detekterade markörerna. 


Elucigene QST*R-21 



D21S1435 D21S1446 D21S1411 D21S1409 

D21S11 D21S1442 

D21S1437 



Elucigene QST*R-21 – GENEMAPPER 

Ett exempel på en normal QST*R-21-profil som uppvisar det relativa läget för de 

detekterade markörerna. 





D18S847 D18S391 D18S978 D18S977 

D18S1002 D18S386 D18S390 D18S9819 

D18S535 










D13S797 D13S325 D13S800 D13S252 

D13S762 D13S305 D13S628 

D13S634 







BILAGA 2: TABELL MED ANVÄNDA MARKÖRER 

Anm. NED-färgen som används i satserna identifieras spektralt som en gul färg. Den 

visas konventionellt i svart för tydlighets skull. 

Observerade heterozygositeter är baserade på antalet alleler som observeras med Gen- 

Probe-valideringspanelen. Dessa siffror kan därför skilja sig från publicerade data och 

kan även variera i enlighet med den analyserade populationen. 

Tabell 1. Markörer i Elucigene QST*Rplusv2 

Markör Plats Observerad 

heterozygositet* 

Storleksintervall 

för allel (bp) 

Markörfärgens 

kulör 

D13S252 13q12.2 0,74 274-311 röd 

D13S305 13q13.3 0,79 424-466 grön 

D13S634 13q21.33 0,84 380-428 blå 

D13S800 13q22.1 0,72 284-320 gul 

D13S628 13q31.1 0,75 426-465 gul 

D18S819 18q11.2 0,73 400-425 röd 

D18S535 18q12.3 0,77 466-498 blå 

D18S978 18q12.3 0,71 207-223 gul 

D18S386 18q22.1 0,92 332-405 grön 

D18S390 18q22.3 0,69 356-394 gul 

D21S11 21q21.1 0,82 228-279 blå 

D21S1437 21q21.1 0,76 307-347 blå 

D21S1409 21q21.2 0,74 191-239 röd 

D21S1442 21q21.3 0,85 332-389 röd 

D21S1435 21q21.3 0,74 167-204 blå 

D21S1446 21q22.3 0,76 205-235 grön 

AMEL Xp22.22/Yp11.2 n/a 104/110 gul 

TAF9L 3p24.2/Xq21.1 n/a 116/121 gul 

DXS6803 Xq21.31 0,86 131-153 blå 

XHPRT Xq26.2 0,72 266-298 grön 

DXS1187 Xq26.2 0,73 123-165 grön 

SRY Yp11.31 n/a 248 gul 


Tabell 2. Markörer i Elucigene QST*R 






kulör 

D13S252 13q12.2 0,74 274-311 röd 

D13S305 13q13.3 0,79 424-466 grön 

D13S325 13q14.11 0,80 272-309 grön 

D13S634 13q21.33 0,84 380-428 blå 

D13S628 13q31.1 0,75 426-465 gul 

D18S391 18p11.31 0,70 205-225 grön 

D18S819 18q11.2 0,73 400-425 röd 

D18S535 18q12.3 0,77 466-498 blå 

D18S978 18q12.3 0,71 207-223 gul 

D18S386 18q22.1 0,92 332-405 grön 

D18S390 18q22.3 0,69 356-394 gul 

D21S11 21q21.1 0,82 228-279 blå 

D21S1437 21q21.1 0,76 307-347 blå 

D21S1409 21q21.2 0,74 191-239 röd 

D21S1435 21q21.3 0,74 167-204 blå 

D21S1411 21q22.3 0,83 283-344 gul 


Tabell 3. Markörer i Elucigene QST*R-XYv2 






kulör 

DXYS218 Xp22.32/Yp11.3 0,74 376-392 blå 

AMEL Xp22.22/Yp11.2 n/a 104-110 gul 

DXYS267 Xq21.31/Yp11.31 0,75 240-280 röd 

DXS6807 Xp22.3 0,66 326-351 blå 

DXS981 Xq13.1 0,73 226-260 blå 

DXS6803 Xq21.31 0,86 131-153 blå 

DXS6809 Xq21.33 0,78 392-436 gul 

DXS1187 Xq26.2 0,73 123-165 grön 

XHPRT Xq26.2 0,72 266-298 grön 

DXS7423 Xq28 0,67 360-388 grön 

SRY Yp11.31 n/a 248 gul 

DYS448 Yq11.223 n/a 349-372 röd 

Tabell 4. Markörer i Elucigene QST*R-21 






kulör 

D21S11 21q21.1 0,82 228-279 blå 

D21S1437 21q21.1 0,76 307-347 blå 

D21S1409 21q21.2 0,74 191-239 röd 

D21S1442 21q21.3 0,85 290-349 grön 

D21S1435 21q21.3 0,74 167-204 blå 

D21S1411 21q22.3 0,83 283-344 gul 

D21S1446 21q22.3 0,76 205-235 grön 








kulör 

D18S391 18p11.31 0,70 205-225 grön 

D18S1002 18q11.2 0,76 337-365 blå 

D18S819 18q11.2 0,73 400-425 röd 

D18S847 18q12.1 0,71 204-232 blå 

D18S535 18q12.3 0,77 466-498 blå 

D18S978 18q12.3 0,71 207-223 gul 

D18S977 18q21.31 0,70 248-285 röd 

D18S386 18q22.1 0,92 332-405 grön 

D18S390 18q22.3 0,69 356-394 gul 







kulör 

D13S252 13q12.2 0,74 274-311 röd 

D13S305 13q13.3 0,79 424-466 grön 

D13S325 13q14.11 0,80 272-309 grön 

D13S634 13q21.33 0,84 380-428 blå 

D13S800 13q22.1 0,72 284-320 gul 

D13S628 13q31.1 0,75 426-465 gul 

D13S762 13q31.3 0,75 302-331 blå 

D13S797 13q33.2 0,77 178-250 blå 


Begränsningar av proceduren 

Denna analys är utformad för att detektera specifika kromosomala trisomier och 

könskromosom-aneuploidier så som beskrivs i Instructions for Use (Bruksanvisningen). 

Med analysen detekteras eventuellt inte strukturella rearrangemang som berör de 

analyserade kromosomerna och den detekterar inte avvikelser i andra kromosomer. 

Mosaicism för de analyserade kromosomerna detekteras eventuellt inte. Ett QST*Rresultat 

kan bara tillämpas direkt på den analyserade vävnaden och behöver inte 

representera fosterkaryotypen. Kontamination av celler från modern (maternal cell 

contamination, MCC) och begränsad mosacisim i moderkakan (confined placental 

mosaicism, CPM) kan leda till diskrepanser mellan QST*R- och karyotypresultaten. 

Anm. Heterozygositeter för de använda markörerna härleddes ur en slumpmässig 

uppsättning prover som lämnats in för rutinanalys från en företrädesvis nordeuropeisk 

kaukasisk population. Alla beräkningar med användning av dessa heterozygositeter 

gäller strikt endast för den population som proverna tagits från. En liten studie med 

användning av lokalt härledda prover kan utföras som en del av en valideringsstudie för 

att fastställa heterozygositeter i populationen som ska analyseras. Populationsvariationen 

förväntas inte avsevärt förändra assayens totala informativitet. 

Friskrivning 

Resultat från denna och andra diagnostiska assayer ska tolkas tillsammans med andra 

laboratorie- och klinikdata som klinikern har tillgång till. 

Dessa Elucigene-reagenser tillhandahålls för diagnostiska analyser in vitro. 

Det finns mer information om Elucigene QST*R-produkter på: 



Referenser 

1. CG Antenatal Care: full guidelines (Corrected June 2008) UK National Institute for 

Health and Clinical Excellence 

2. O’Connor, C. (2008) Trisomy 21 Causes Down syndrome. Nature Education 1(1). 

3. Mansfield E S. Diagnosis of Down syndrome and other aneuploidies using quantitative 

polymerase chain reaction and small tandem repeat polymorphisms. Human 

Molecular Genetics 1993 2(1): 43-50 

4. Mann K, Fox SP, Abbs SJ, Yau SC, Scriven PN, Docherty Z, Mackie Ogilvie C. 

Development and implementation of a new rapid aneuploidy diagnostic service within 

the UK National Health Service and implications for the future of prenatal diagnosis. 

The Lancet 2001 358 (9287): 1057-1061 

5. Mann K, Donaghue C, Fox SP, Docherty Z, Mackie Ogilvie C. Strategies for the rapid 

prenatal diagnosis of chromosome aneuploidy. European Journal of Human Genetics 

2004 12: 907-915 

6. Mackie Ogilvie C, Donaghue C, Fox SP, Docherty Z, Mann K. Rapid prenatal 

diagnosis of an aneuploidy using Quantitative Fluorescence-PCR (QF-PCR). Journal 

of Histochemistry and Cytochemistry 2005 53(3): 285-288 

7. Deutsch S, Choudhury U, Merla G, Howald C, Sylvan A, Antonarakis SE. Detection of 

aneuploidies by paralogous sequence quantification. Journal of Medical Genetics 

2004 41: 908-915

QST*R - Gen-Probe, Inc.

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?