Identificarea profilelor moleculare transcriptomice in cancerul de col ...

Nr proiect: 42-160/ 2008Titlul Proiect:“Identificarea profilelor molecularetranscriptomice in cancerul de col uterinavansat prin studii de genomica functionala.CERVIX-array .”Coordonator:Institutul Oncologic „ Prof Dr. Ion Chiricuta” Cluj-Napoca (IOCN)Director proiect:Dr. Ovidiu Balacescu

Componenta Consortiului de cercetare :CO- Institutul Oncologic „ Prof Dr. Ion Chiricuta” Cluj-Napoca (IOCN)P1- Universitatea de Medicina si Framacie „I. Hatieganu” Cluj Napoca (UMFCN)P2-Institutul de Sanatate Publica “Iuliu Moldovan„ Cluj-Napoca (ISPCN)Finanţare: buget de stat: 2.000.000 leiCofinantare 0 leiAdresa web: http://www.iocn.ro/CERCETARE/Pagini-Web-proiecte/CERVIXarray.html

Obiectiv: Realizarea unui model experimental, bazat pe studii de genomicafunctionala si genotipare HPV, ca factor de predictie in raspunsul la radiochimioterapiein cancerul de col uterin (IIB-IIIB).Rezultatul final al proiectului: O metoda moleculara de investigatie inmedicina pentru predictia la terapie in cancerul de col uterin.Elemente de noutate:Stabilirea unei semnaturi moleculare transcriptomice la nivelul intreguluigenom uman ca predictie a raspunsului la terapie functie de incarcaturavirala HPV.Originalitate:Combinarea analizei transcriptomice cu genotiparea HPV (37 subtipuri)Beneficiarii rezulatelor, potentialul de aplicare in economie• bolnavii oncologi care pot beneficia de un tratament individualizat;• sistemul de sanatate prin costurilor legate de eficientizarea tratamenteloroncologice;• tinerii doctoranzi –specializare in domenii de varf – genomica• comunitatea stiintifica internationala prin prezentarea datelor obtinute inurma studiului de cerectare.• companii farmaceutice interesate sa utilizeze informatiile genomice pentrustabilirea de teste de predictie si de medicamente mai eficiente.

Stadiul de realizare al proiectului in 2010Etapa a III-a (01.10.2008-15.02.2009 )Consolidarea Biobancii; Pregatirea studiului de GenomicaBuget de stat: 286.145 lei din 1.000.200 lei contractat pt etapa a III-a.cofinantare:0 RONActivitati realizate• Consolidarea Biobancii. Recoltarea si prelucrea probelor biologice– Procedee (Formulare de consimtamant informat); Chestionare de evaluare a factorilor derisc• Evaluare incaractura virala HPV risc crescut (43 de paciente)– Procedee (Raport) evaluare 37 subtipuri HPV• Sinteza de sonde microarray (Cy-cRNA)si evaluarea calitativa sicantitativa a acestora– Medode (Raport )de analiza evaluare sonde microarray prin nanotehnologie• Diseminare rezultate– Conferinte, publicatii• Achiziti realizatereactivi +consumabile reactivi procesare probe biologice, reactivi analiza genomica(microarray) kituri genotipare, consumabile birotica)

Participare tineri cercetatoriDomeniile de implicare:Evaluari clinice: Puscas Emil, Achimas PatriciuTerapie: Cainap Calin, Burz Claudia, Ioana BrieEvaluari de anatomie patologica: Fetica Bogdan, Buiga RaresEvaluari de biologie moleculara si genomica: Tudoran Oana,Gherman Claudia, Rus Meda, Dragla FlaviuEvaluari de bioinformatica: Balacescu LoredanaComun: redactari de lucrari stiintifice si participari la conferinte2010- lipsa fondurilor pentru specializari/stagii de formare pentrudoctorate, post-doc

Indicatori de rezultat realizati in cadrulproiectuluiProcedee (Formulare de consimtamant informat); Chestionare de evaluare afactorilor de risc.Procedee (Raport) evaluare 37 subtipuri HPVMedode (Raport ) de analiza evaluare sonde microarrayRaport studiu preliminar evaluare mecanism de angiogeneza (PCR array)

Indicatori de rezultat realizati in cadrulproiectuluiArticole trimise spre publicare:• O. Tudoran, O. Balacescu, O. Soritau, L. Balacescu, C. Braicu, M. Rus, C. Gherman, C.Burz, F.D. Irimie, I. Berindan Neagoe. Transcriptional mechanism of apoptosis induced byVEGFA inhibition in cervical cancer cells. Respinsa la European Journal of Pharmacology,este in modificari si urmeaza sa fie trimisa spre publicare in Apoptosis.• Challenge: The Gynecologic Cancers. September 30 – October 2, 2010. Cluj-Napoca. OanaTudoran, Olga Soritau, Ovidiu Balacescu, Loredana Balacescu, Cornelia Braicu, Meda Rus,Claudia Gherman, Florin Irimie, Ioana Berindan Neagoe. Early transcriptional pattern ofangiogenesis induced by EGCG treatment in cervical tumor cells - sub review la Journal ofCellular and Molecular Medicine.• Sorina IRIMIE, Mariana VLAD, Ileana Maria MIRESTEAN, Ovidiu BALACESCU, Rus Meda,#Loredana BALACESCU , Ioana BERINDAN-NEAGOE, Rares BUIGA, Oana TUDORAN,Viorica NAGY, Alexandru IRIMIE. Risk profile in a sample of patients with advancedcervical cancer. Trimisa in The Journal of Epidemiology and Community Health.Participare la conferinte si congrese:• Ovidiu Balacescu, Oana Tudoran, Meda Rus, Loredana Balacescu, Rares Buiga, VioricaNagy, Ioana Neagoe. Detection of HPV infection and its clinical utility. The 20th Congressof the Romanian Society for Radiotherapy and Medical Oncology. A Continuous

Activitati prevazute pt 2011:Perspective 2011Realizarea studiului de genomica (hibridarea sondelor microarray pelame WHG (4x44k); validarea rezultatelor microarray prin qRT-PCR;corelarea datelor de genomica cu subtipul viral HPV si raspunsul laterapie;Obiectivele preconizate a fi atinse:Realizarea unui model experimental, bazat pe studii de genomicafunctionala si genotipare HPV, ca factor de predictie in raspunsul laradio- chimioterapie in cancerul de col uterin (IIB-IIIB).Elemente de originalitate:Combinarea analizei transcriptomice cu genotiparea HPV (37 subtipuri)Necesar finantare pt 2011:Ramas din contractare: 1.533.355 leiAtingerea obiectivelor propuse initial: 650.000-700.000 lei

Perspective: HPV- genomica-genotipareName ofGeneCDH5FGFR3(VEGFR)KDRNOTCH4PLAUSTAB1THBS1Descriptioncadherin 5, type 2 (vascular endothelium)fibroblast growth factor receptor 3, mitogeneza sidiferentierekinase insert domain receptor (a type III receptortyrosine kinase); receptor for VEGFNotch homolog 4 (Drosophila), developementplasminogen activator, urokinase; involved indegradation of the extracellular matrix and possiblytumor cell migration and proliferationstabilin 1; function in angiogenesis, lymphocytehoming, cell adhesion, or receptor scavengingthrombospondin 1; angiogenesis, and tumorigenesisFold Up- or Down- regulationHPV16/HPV45, 58 p value3.22210.00050210.73810.0041662.6970.0143913.70120.001723.35120.0187631.58520.0283173.65870.037926