Protein(3) 2007B.pdf
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膜 蛋 白 的 三 級 構 造 預 測 比 較 可 靠<br />
Hydropathic plot<br />
週 期 性 地 間 隔 出 現 疏 水 與 親 水 片 段<br />
Alberts et al (2002) Molecular Biology of the Cell (4e) p.701, 630<br />
直 接 由 一 級 構 造 的 胺 基 酸 序 列 , 來 推 測 蛋 白 質 的 立 體 構 造 , 是 非 常 不 容 易 ; 但 對 插 在 細 胞 膜<br />
上 的 蛋 白 質 , 卻 有 相 當 正 確 的 推 測 結 果 。 原 因 是 大 部 分 的 細 胞 膜 蛋 白 , 都 有 一 種 大 致 相 似 的<br />
摺 疊 規 律 。<br />
分 析 蛋 白 質 序 列 上 各 胺 基 酸 側 基 的 親 水 與 疏 水 性 質 , 就 可 以 得 到 hydropathic plot; 若 發 現 有<br />
週 期 性 地 間 隔 出 現 疏 水 與 親 水 性 片 段 , 就 有 可 能 是 細 胞 膜 蛋 白 質 。 然 後 , 便 可 推 測 其 立 體 構<br />
造 是 來 回 穿 梭 細 胞 膜 , 而 疏 水 性 片 段 就 鑲 在 細 胞 膜 中 , 親 水 性 片 段 則 分 別 分 布 在 細 胞 膜 兩<br />
側 。<br />
問 題 : 這 種 膜 蛋 白 貫 穿 細 胞 膜 , 其 餘 的 親 水 部 份 露 在 膜 外 的 兩 側 ( 上 圖 綠 色 片 段 ), 例 如 可 能<br />
是 在 高 爾 基 氏 體 的 lumen 側 或 者 細 胞 質 側 ( 如 上 面 右 圖 )。 請 問 能 否 預 測 某 片 段 是 落 在 那 一 側 ?<br />
■ 請 先 到 Lehninger Principles of Biochemistry (4e) p. 377 前 後 查 看 細 胞 膜 上 的 各 種 蛋 白 質 模 樣 。<br />
P3-18