19.06.2013 Views

Curs 2 Proprietatile remarcabile ale enzimelor Enzimele sunt cei ...

Curs 2 Proprietatile remarcabile ale enzimelor Enzimele sunt cei ...

Curs 2 Proprietatile remarcabile ale enzimelor Enzimele sunt cei ...

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

<strong>Curs</strong> 2<br />

<strong>Proprietatile</strong> <strong>remarcabile</strong> <strong>ale</strong> <strong>enzimelor</strong><br />

<strong>Enzimele</strong> <strong>sunt</strong> <strong>cei</strong> mai performanti, precisi, stereospecifici catalizatori din toate grupele<br />

de catalizatori. <strong>Enzimele</strong> (“en”-in, “zima”-drojdie) <strong>sunt</strong> proteine care au capacitatea de a<br />

interactiona cu o substanta chimica numita substrat si proprietatea de a mari viteza de<br />

transformare a acestuia in produsi de reactie, dupa care acestea se refac si pot fi utilizate<br />

intr-un nou ciclu catalitic. S-a estimat faptul ca exista circa 25000 de enzime. Pana in<br />

prezent s-au caracterizat aproximativ 3000 de enzime din care 300 s-au obtinut in stare<br />

cristalina prin tehnici diferite si pot fi achizitionate de la companiile specializate in<br />

vanzarea de produse biochimice.<br />

<strong>Enzimele</strong> au cateva proprietati <strong>remarcabile</strong> in comparatie cu alte tipuri de catalizatori.<br />

Dintre acestea trei proprietati importante <strong>sunt</strong>: marea lor putere catalitica, specificitatea si<br />

gradul in care activitatea lor catalitica poate fi controlata de o serie de compusi naturali.<br />

Puterea catalitica<br />

<strong>Enzimele</strong> pot creste viteza de reactie cu pana la 17 ordine de magnitudine (Ex: orotidin<br />

5’-fosfat decarboxilaza - Radzicka & Wolfenden,Science,1995). In cele mai multe cazuri<br />

o comparatie intre viteza unei reactii catalizate enzimatic si necatalizata este greu de<br />

realizat. Pentru ultima reactie (in absenta catalizatorului, enzimei) vitezele pot fi foarte<br />

mici si ca atare greu de cuantificat. Cand aceasta comparatie este posibila cresterile<br />

vitezei de reactie pot fi mai mari de 4 (creatin kinaza), 8 (alcool dehidrogenaza), 9<br />

(triozfosfat izomeraza), 10 (hexokinaza), 11 (fosforilaza) ordine de magnitudine. In unele<br />

situatii activitatea enzimatica poate fi masurata la temperatura mai mica (datorita<br />

stabilitatii reduse a enzimei) comparativ cu reactia necatalizata.<br />

Un exemplu il constituie ureaza, prima enzima (din fasole Canavalia ensiformis) care a<br />

fost cristalizata in stare pura. Existenta enzimei a fost raportata inca din secolul XIX.<br />

Experimentele initi<strong>ale</strong> au fost efectuate de catre chimistul suedez Jon Jakob Berzelius,<br />

cercetatorul care a introdus termenul de activitate catalitica. In schimb pana in 1926 nu se<br />

stia exact daca ureaza era obtinuta in stare pura. Acest fapt a fost demostrat de catre<br />

James B. Sumner de la Universitatea Cornell. Sumner a reusit sa izoleze enzima si sa o<br />

cristalizeze si din acest motiv a fost recompensat cu premiul Nobel in 1947.<br />

Ureea este o molecula foarte stabila, care in mod normal hidrolizeaza foarte incet<br />

obtinandu-se acidul izocianic si amoniac. Durata reactiei necatalizate este de 3,6 ani la 38<br />

C. Activitatea catalitica a enzimei determina o crestere a vitezei de reactie (in mediu<br />

acid) de aproape 14 ordine de magnitudine. In timp ce reactia necatalizata implica o<br />

eliminare directa a moleculei de amoniac, enzima probabil catalizeaza o reactie<br />

hidrolitica a ionului carbamat (intermediar).


Specificitatea<br />

Majoritatea <strong>enzimelor</strong> au specificitate ridicata atat pentru substrat(e) cat si asupra reactiei<br />

pe care o acesta/acestia o catalizeaza. Exista insa si cazuri in care enzimele au<br />

specificitate scazuta (anumite peptidaze, fosfataze si esteraze)-utilizeaza o gama larga de<br />

substrate care contin legaturile respective (legatura peptidica, gruparea fosfoesterica,<br />

gruparea esterica). Aceste enzime au rol degradativ (digestie, ex chimotripsina) si nu de<br />

biosinteza.<br />

Specificitatea scazuta a chimotripsinei –scindarea legaturilor amidice si esterice<br />

Exista insa si alte exceptii, cand una si aceeasi enzima poate prezenta activitati catalitice<br />

diferite. Un exemplu <strong>sunt</strong> reactiile catalizate de preparatele enzimatice din muschiul<br />

cardiac de porc, bumbac, sau din N. crassa: prima reactie este cea de conversie a oxaloacetatului<br />

la malat, iar cea de-a doua reactie este o reactie de transfer a gruparii amino.<br />

Aceste enzime contin cel putin doi centri activi, specificitatea pentru fiecare substrat fiind<br />

o caracteristica a unui singur situs catalitic.


Exista si enzime care prezinta o specificitate de grup.<br />

Din aceasta categorie fac parte hexokinaza, o enzima<br />

care catalizeaza fosforilarea unei p<strong>ale</strong>te largi de<br />

aldohexoze (zaharuri). Fosforilarea glucozei<br />

determina o incapacitate de transport a moleculei de<br />

monozaharida in/inafara celulei. Oricum, majoritatea<br />

<strong>enzimelor</strong> au specificitate aproape absoluta. Un<br />

exemplu este ureaza care catalizeaza reactia cu ureea<br />

sau cu analogi (la o viteza mult mai redusa). O grupa<br />

de enzime intens studiata in ultimele decenii este cea<br />

a endonucleazelor (enzime de restrictie). Aceste<br />

enzime recunosc o secventa de 4-6 perechi de baze<br />

(secventa palindromica) din cadrul ADNului si<br />

cliveaza legaturile fosfodiesterice din ambele lanturi.<br />

Exista cel putin 400 de endonucleaze care difera prin<br />

specificitatea lor. In acest sens, fiecare endonucleaza<br />

are specificitate absoluta pentru regiunea substratului<br />

care este in contact cu situsul catalitic, desi poate<br />

actiona asupra mai multor secvente de ADN in cazul<br />

in care motivul “substratului” se repeta. De exemplu,<br />

EcoR I (E. Coli Restriction Endonuclease I) poate<br />

scinda intre nucleotidele G si A, iar Stu I scindeaza<br />

intre nucleotidele G si C (taietura enzimatica a ADNului duplex este dreapta)<br />

O trasatura distincta a multor reactii<br />

catalizate de enzime este<br />

stereospecificitatea, capacitatea acestora<br />

de a recunoaste numai un izomer<br />

geometric sau optic. In majoritatea<br />

cazurilor, enzimele recunosc unul dintre<br />

<strong>cei</strong> doi enantiomeri. Din acest motiv in<br />

organism se intalnesc cu precadere Laminoacizi<br />

si D-monozaharuri.<br />

D-aminoacid-oxidazele (sursa: rinichiul de porc), enzime specifice aminoacizilor din<br />

seria D, <strong>sunt</strong> capabile sa converteasca acesti compusi in cetoacizi.


L-aminoacid-oxidazele (enzime din veninul de sarpe) catalizeaza conversia L-aminoacizilor<br />

la cetoacizi.<br />

Exista insa si alte situatii in care specificitatea este dictata de sursa din care enzima este<br />

izolata. De exemplu, lactat dehidrogenaza din muschi este activa fata de L(+)-lactat, pe<br />

cand cea din Lactobacillus plantarum converteste D(+)-lactatul la piruvat.<br />

Un exemplu este cel al NAD + - si NADP + - dehidrogenazelor. A fost demonstrat, prin<br />

marcarea substratului cu izotopi radioactivi, faptul ca transferul hidrogenului are loc de la<br />

substrat la o fata particulara (notata A sau B) a dehidrogenazelor.<br />

Formele reduse pentru nicotin adenin dinucleotid (NADH)<br />

si nicotin adenin dinucleotid fosfat (NADPH)<br />

Mai mult, majoritatea dehidrogenazelor actioneaza asupra NAD + -ului (alcool-, lactat-,<br />

m<strong>ale</strong>at-, glicerol-3-fosfat-, 3-hidroxibutirat-, glucoz-, gliceraldehid dehidrogenaza si<br />

citocrom b5 -reductaza) sau NADP + -ului (3-oxiacil-reductaza, homoserin si glucoz-6fosfat<br />

dehidrogenaza).<br />

Exista cazuri de prochiralitate (substratul nu are un centru chiral de reactie) in reactiile<br />

catalizate de enzime. Un exemplu este cel a reactiei catalizate de fumarat hidrataza<br />

(localizata in mitocondrii si intervine in ciclul acidului citric), reactie in care fumaratul<br />

este convertit in malat. Reactia poate fi demonstrata prin utilizarea apei tritilate ( 3 H2O).<br />

Aceasta permite marcarea atomului de hidrogen care este atasat la substrat. Un caz<br />

asemanator este cel al aconitazei enzima care catalizeaza interconversia citratului la<br />

izocitrat, compusul intermediar fiind aconitat, in cadrul ciclului acidului citric (ciclul<br />

Krebs).


Fumarat hidraza catalizeaza conversia m<strong>ale</strong>atului in fumarat<br />

Aconitaza catalizeaza conversia citratului in izocitrat<br />

Pentru a intra in ciclul Krebs propionil-CoA trebuie sa fie convertita in succinil-<br />

CoA. O prima etapa a acestui lant de reactii il constituie o sinteza prochirala in care prin<br />

carboxilarea propionil-CoA (optic inactiva) se formeaza metil-malonil-CoA optic activa.<br />

La polul opus se afla racemazele, enzime care actioneaza asupra ambilor<br />

enantiomeri cu formarea de amestecuri racemice. De exemplu, alanil-racemaza poate<br />

actiona asupra ambilor izomeri optici ai alaninei, reactie care conduce intotdeauna la un<br />

racemic.<br />

Un alt aspect al specificitatii <strong>enzimelor</strong> a fost evidentiat in cazul sintezei<br />

proteinelor si replicarii ADNului. Cercetatorii au demostrat ca rata erorilor la replicarea


ADNului in “vivo” este de o greseala la 10 8 -10 10 nucleotide polimerizate si faptul ca<br />

eroarea la transcriptie si translatie (ARNm in secventa proteica) este de aproximativ 1<br />

aminoacid la 1000 de resturi. Aminoacil ARNt sintetaza recunoaste atat aminoacidul<br />

(selectivitate scazuta datorita dimensiunilor mai mici) cat si ARNt-ul (enzima are<br />

selectivitate ridica datorita dimensiunilor mai mari <strong>ale</strong> ARNt-ului). Enzima are si un situs<br />

catalitic care hidrolizeaza aminoacizii din complexul aminoacil-adenilat.<br />

Influenta unor anumiti factori asupra activitatii catalitice<br />

Activitatea catalitica a <strong>enzimelor</strong> poate fi controlata de o serie de factori: pH, tarie<br />

ionica, temperatura, de ioni sau de alte molecule.<br />

Influenta pHului<br />

Activitatea unei enzime depinde de pHul din mediu din doua motive: prezenta in<br />

centrul activ al enzimei de grupe donoare sau acceptoare de protoni si mentinerea<br />

amsamblului structural enzimatic. Grupele acceptoare de protoni pot fi titrate,<br />

dependentele activitatii enzimatice cu pHul au in majoritatea cazurilor o forma de clopot,<br />

cu un maxim la pHul optim. Cel mai adesea expunerea enzimei la valori extreme de pH<br />

poate conduce la schimbari structur<strong>ale</strong> ireversibile (scadere a activitatii enzimatice).<br />

Majoritatea <strong>enzimelor</strong> au un pH optim in mediu neutru. <strong>Enzimele</strong> care prefera conditii<br />

extreme, ca pepsina si fosfataza alcalina, trebuie testate in domeniul de pH adecvat.<br />

Deoarece activitatea enzimatica este influentata de schimbarile de pH, valoarea acestui<br />

parametru trebuie mentinuta constanta in decursul determinarii. Pe de alta parte,<br />

componentele din amestecul de testat sau solutia enzimei pot schimba pHul. In unele<br />

situatii reactia enzimatica poate determina un salt/o scadere a pHului si din acest motiv<br />

valoarea finala a acestuia la sfarsitul reactiei trebuie masurata.<br />

Taria ionica si solutiile tampon<br />

Taria ionica potrivita pentru masurarea activitatii enzimatice este dictata de<br />

molaritatea solutiei tampon utilizate. Cel mai frecvente se foloseste o concentratie de<br />

0,1 M, valoare care reprezinta o tarie ionica mica comparativ cu aceea intalnita in celula.<br />

O tarie ionica ridicata (1 M) poate conduce la inactivarea enzimei, cu unele exceptii<br />

(organismele termofile si halofile). Natura ionilor din solutia tampon poate fi un factor<br />

determinant pentru inactivarea sau destabilizarea <strong>enzimelor</strong>. Solutiile tampon avand in<br />

componenta substante de natura organica pot fi mai stabile, dar in majoritatea cazurilor<br />

trebuie cautat tamponul potrivit pentru fiecare enzima. De exemplu, in cazul folosirii<br />

fosfatului de potasiu trebuie sa se stie faptul ca tamponul are capacitate de legare pentru<br />

cationi. Tris, un alt compus folosit la prepararea solutiilor tampon, poate uneori dezactiva<br />

enzimele. Alaturi de compatibilitatea tampon-enzima trebuie sa se considere si<br />

capacitatea de tamponare optima (intre 1-2 unitati de pH).<br />

Temperatura<br />

Ca si in cazul pHului nu se poate postula o temperatura ideala pentru toate<br />

enzimele. De obi<strong>cei</strong>, pentru o enzima se va masura activitatea la diferite valori <strong>ale</strong><br />

temperaturii, mentinand pHul constant (si in domeniul optim). De fapt, in acest caz<br />

intervin doua procese. Odata cu cresterea temperaturii, viteza miscarii moleculelor<br />

(vitezei de reactie) creste cu un factor de 2-3 la fiecare 10 grade. In schimb, odata cu<br />

cresterea temperaturii apare tendinta proteinelor de a se denatura si implicit a se<br />

dezactiva. Procesul de denaturare a <strong>enzimelor</strong> depinde de doi factori: temperatura si timp.<br />

La temperaturi inalte are loc o inactivare rapida, insa si la temperaturi moderate poate<br />

avea loc o inactivare mai lenta. De exemplu, alcool dehidrogenaza poate fi inactivata si la


o temperatura de 37 ºC. Din acest motiv activitatea poate fi influentata de timpul scurs<br />

pana la masurarea activitatii. In majoritatea cazurilor se va incerca scurtarea timpului de<br />

procesare a unui extract enzimatic in scopul pastrarii activitatii. In general se utilizeaza 3<br />

temperaturi (25, 30 si 37 ºC)<br />

Cofactorii<br />

Cofactorii metalici<br />

Studiile cristalografice au dovedit faptul ca enzimele <strong>sunt</strong> proteine cu lanturi de<br />

100-2500 de aminoacizi. Enzime ca chimiotripsina sau triozfosfat izomeraza (enzima<br />

care catalizeaza interconversia compusilor difosforilati cu 3 atomi de carbon) <strong>sunt</strong> active<br />

fara a avea nevoie de alti compusi/ioni. In general, pentru o activitate corespunzatoare,<br />

enzimele au nevoie de o componenta neproteica (cofactor). Un grup de cofactori <strong>sunt</strong><br />

ionii metalici. In cele mai multe cazuri ionii metalici stabilizeaza conformatia enzimei in<br />

forma catalitic activa. Un exemplu il constituie fosforilaza, enzima care catalizeaza prima<br />

etapa de clivare a glicogenului din muschii scheletici. Aceasta enzima permite degradarea<br />

rezervelor de carbohidrati. Contractia muschilor scheletici este o consecinta a expulzarii<br />

Ca 2+ din reticulul sarcoplasmatic fapt care duce la activarea fosforilazei (poate fi dictata<br />

si de hormoni-adrenalina) si implicit la producerea ATPului.<br />

Fenomenul de inhibitie feedback este comun pentru diferite cai de biosinteza. De<br />

exemplu, c<strong>ale</strong>a metabolica de sinteza a nucleotidelor pirimidinice conduce la UTP si<br />

CTP. Acesti produsi inhiba primele enzime (carbamoil-fosfat sintazei si aspartat carbamoil<br />

transferazei) din cadrul sintezei metabolice determinand controlul biosintezei<br />

metabolitilor.<br />

Carboxipeptidazele, enzime care catalizeaza scindarea legaturii peptidice la<br />

capatul C-terminal al substratului, necesita zinc pentru activitatea catalitica. Indepartarea<br />

zincului (prin complexare cu EDTA) poate avea drept consecinta inactivarea enzimei.<br />

Activitatea poate fi redobandita la adaugarea ionilor de zinc. Aldolaza si anhidraza<br />

carbonica necesita de asemenea ioni de zinc pentru o activitate catalitica corespunzatoare.<br />

Kinazele, enzime care transfera o grupare -fosforil de la ATP la o molecula acceptor,<br />

necesita ionii de magneziu care se leaga, in acest caz, de substrat (ATP) si nu de enzima.


Nucleaza stafilococala, enzima care hidrolizeaza ADNul si ARNul, leaga Ca 2+ un<br />

ion esential pentru reactia enzimatica. Si ureaza contine ioni de nichel, fapt care a fost<br />

dovedit la 50 de ani de la cristalizarea enzimei.<br />

Necesitatea prezentei acestor cofactori explica de ce<br />

organismele au nevoie de cantitati mici din aceste<br />

molecule (ioni) in dieta lor. Natura metalo-<strong>enzimelor</strong><br />

poate explica uneori efectele toxice <strong>ale</strong> met<strong>ale</strong>lor grele<br />

asupra unor plante/organisme. De exemplu, Cd 2+ si<br />

Hg 2+ poate inlocui Zn 2+ din situsul catalitic al aceleiasi<br />

enzime (din ARN polimeraza) determinand pierderea<br />

activitatii acesteia.<br />

Exista si alte exemple in care ionii metalici <strong>sunt</strong><br />

indispensabili <strong>enzimelor</strong> (Tabelul 2)<br />

Tabel 2. Exemple de ioni metalici necesari unor enzime<br />

Metalul Enzima<br />

Na -D-glucohidrolaza din intestin<br />

K Piruvat kinaza<br />

Mg Hexokinaza, Piruvat-kinaza, Adenozintrifosfataza<br />

Fe Catalza, Peroxidaza, Nitrogenaza<br />

Zn Alcooldehidrogenaza, Carboxipeptidaza<br />

Mo Xantinoxidaza, Nitrogenaza<br />

Cu Citocrom c oxidaza, Amin-oxidaza<br />

Ni Ureaza<br />

Cofactorii organici<br />

A doua clasa de cofactori este reprezentata de cofactorii organici (marea partea<br />

<strong>sunt</strong> derivati ai vitaminelor B) ce interactioneaza slab cu apoenzimele. Intre cele doua<br />

componente se formeaza legaturi slabe de tipul puntilor de hidrogen, interactiuni<br />

hidrofobe.<br />

Cofactorii legati strans (prin legaturi cov<strong>ale</strong>nte) poarta denumirea de grupari<br />

prostetice. O enzima care contine un cofactor sau o grupare prostetica poarta numele de<br />

holoenzima, iar una in care cofactorul este indepartat apoenzima. Daca din holoenzima<br />

este indepartat cofactorul dispare activitatea catalitica. Moleculele mici sau speciile care<br />

se leaga reversibil la o enzima se numesc liganzi (acest termen general poate include<br />

substratul, compusi analogi cu structura asemanatoare substratului, inhibitorul sau<br />

ionul/ionii metalici).<br />

Asadar, cofactorii se pot lega necov<strong>ale</strong>nt sau cov<strong>ale</strong>nt de apoenzime. De exemplu FADul<br />

este o grupare prostetica pentru lipoamid-dehidrogenaza si coenzima pentru D-aminoacid-oxidaza.<br />

Din punct de vedere structural enzimele se impart in 4 clase: coenzime de natura<br />

alifatica, coenzime de natura aromatica si coenzime cu structura nucleozidica sau<br />

nucleotidica.


Princip<strong>ale</strong>le coenzime de natura alifatica <strong>sunt</strong> glutationul, acidul lipoic si acidul ascorbic.<br />

O enzima dependenta de glutation este glutation-homocistin-transdehidrogenaza si<br />

permite formarea puntilor disulfidice prin conversia cisteinei in cistina. Glutationul redus<br />

(G-SH) poate fi oxidat reversibil sub actiunea glutation-reductazei.<br />

Decarboxilarea oxidativa a acidului piruvic din tesuturile anim<strong>ale</strong> este realizata cu<br />

ajutorul unui complex enzimatic. Una dintre enzime este dihidrolipo-transacetilaza care<br />

contine amida acidului lipoic drept cofactor.<br />

Conversia DOP-aminei in noradrenalina este catalizata de DOP-amin-hidroxilaza care<br />

necesita acid ascorbic, O2 si ioni de cupru. Tirozina poate fi metabolizata la acid<br />

homogentizinic care se elimina pe c<strong>ale</strong> renala. Ultima etapa a acestei secvente metabolice<br />

este catalizata de o enzima specifica care este dependenta de ascorbat.<br />

Astfel majoritatea carboxilazelor, enzime implicate in incorporarea CO2, necesita biotina,<br />

care este atasata printr-o legatura de tip amidic de enzima (intre gruparea –COOH a<br />

biotinei si o grupare -amino din catena laterala a unei lizine din secventa polipeptidica).<br />

Propionil-CoA-carboxilaza este o enzima care este dependenta de biotina ce catalizeaza<br />

transformarea propionil-CoA in metil-malonil-CoA. Tiamin difosfatul joaca rol de<br />

coenzima pentru transcetolaza, enzima care intervine in metabolismul glucidic (catalizeza<br />

transferul unui fragment de doi atomi de carbon din molecula fructozo-6-fosfatului pe<br />

scheletul hidrocarbonat al glicerinaldehid-3-fosfatului). Decarboxilarea aminoacizilor,<br />

reactie din care rezulta aminele, se realizeaza cu ajutorul unor enzime specifice care <strong>sunt</strong><br />

dependente de piridoxal fosfat. Histidin-decarboxilaza este o enzima care converteste<br />

histidina la histamina, substanta cu proprietati vasopresoare si care regleaza secretia de<br />

HCl din stomac prin stoparea secretiei de gastrina. Ornitin- decarboxilaza catalizeaza<br />

reactia de decarboxilare a ornitinei cu formare de putres<strong>cei</strong>na (precusorul poliamidelor<br />

spermidina si spermina esenti<strong>ale</strong> pentru reglarea celulara si pentru interactiunile dintre<br />

acizii nucleici). Aminotransferazele, enzime care intervin in c<strong>ale</strong>a metabolica de<br />

degradare a aminoacizilor, contin piridoxal-fosfatul in calitate de coenzima. Serindezaminaza<br />

si serin-hidroximetil-transferaza , enzime care converstesc serina la piruvat,<br />

respectiv glicocol, au piridoxalfosfatul in calitate de cofactor (este legat de enzima sub<br />

forma unei baze Schiff).<br />

Pteroenzimele folosesc drept cofactor acidul tetrahidrofolic pentru transferarea gruparilor<br />

formil, hidroximetil.<br />

Nucleozid-fosfatii indeplinesc rol de cofactori in reactiile de transfosforilare, enzimele ce<br />

catalizeaza aceste procese fiind denumite kinaze. Nucleozidfosfatii contin in molecula<br />

atat baze purinice cat si pirimidinice.<br />

Piridoxal-fosfat biotina


Acid lipoic<br />

Tiamin difosfat<br />

Unii cofactori <strong>sunt</strong> atasati tranzitoriu la diverse enzime si astfel joaca rol de cosubstrat.<br />

Nicotin adenin dinucleotidul (NAD + ) si nicotin adenin dinucleotid fosfatul (NADP + ) <strong>sunt</strong><br />

exemple de cosubstrate. De exemplu, NAD + este un agent de oxidare in reactia catalizata<br />

de alcool dehidrogenaza (ADH):<br />

Nomenclatura <strong>enzimelor</strong><br />

Clasificare generala<br />

In general denumirea unei enzime se face prin adaugarea sufixului –aza la numele<br />

substratului asupra caruia actioneaza (ureaza) sau are legatura cu reactia catalizata (lactat<br />

dehidrogenaza catalizeaza dehidrogenarea lactatului cu obtinerea piruvatului).<br />

Denumirea <strong>enzimelor</strong> se face pe trei paliere.<br />

Primul palier cuprinde o denumire uzuala, mai putin stiintifica, se bazeaza pe denumirile<br />

trivi<strong>ale</strong> <strong>ale</strong> <strong>enzimelor</strong> (enzima “galbena”, catalaza, papaina, tripsina, rodanaza-o enzima<br />

mitocondriala care converteste ionul cianura in ionul tiocianat) si are in vedere evolutia in<br />

timp a cunostintelor legate de enzimele respective. Oricum, multe enzime (ex. catalaza<br />

care mediaza descompunerea apei oxigenate) au nume care nu <strong>sunt</strong> in concordanta cu<br />

functia pe care acestea o manifesta in decursul reactiei enzimatice.<br />

Al doilea palier se bazeaza pe tipul reactiei catalizate de enzime. Astfel, exista 6 tipuri<br />

majore de reactii enzimatice:<br />

1. reactii de oxido-reducere catalizate de oxidoreductaze;<br />

2. reactii de transfer a unor grupe (grupari fosfat, resturi de peptide), catalizata de<br />

transferaze;<br />

3. reactii hidrolitice (hidroliza esterilor, hidroliza legaturilor C-X, aditia apei la<br />

legatura dubla) catalizata de hidrolaze;<br />

4. reactii de eliminare in care legatura dubla este formata, catalizata de liaze;<br />

5. reactii de izomerizare, catalizate de izomeraze;


6. reactiile de formare a unor legaturi chimice (C-C), pe baza energiei consumate de<br />

o sursa de energie (uzual ATP), catalizata de ligaze (sintetaze).<br />

Numele complet al unei enzime nu descrie numai tipul reactiei catalizate, insa<br />

descrie substratul asupra caruia enzima actioneaza si alte informatii.<br />

1. Oxidoreductazele<br />

Oxidoreductazele <strong>sunt</strong> enzime implicate in procese de oxidare biologica si<br />

catalizeaza reactii bimoleculare:<br />

A ox + B red<br />

A red + B ox<br />

Denumirea <strong>enzimelor</strong> din aceasta clasa se realizeaza prin includerea denumirii<br />

donorului si acceptorului de hidrogen urmate de termenul oxidoreductaza<br />

(donor:acceptor-oxidoreductaza). In situatia in care acceptorul de hidrogen este oxigenul<br />

se apeleaza la termenul de oxidaza. Astfel, denumirea sistematica a alcooldehidrogenazei,<br />

enzima care catalizeaza reactia de oxidare reversibila a etanolului, este alcool:NAD + -<br />

oxidoreductaza (alcoolul = acceptor, NAD + = donor). Alcool dehidrogenaza joaca un rol<br />

important in procesele de fermentatie alcoolica. In biochimia clinica aceasta enzima se<br />

utilizeaza la estimarea concentratiei de alcool etilic in sange sau urina. Denumirea<br />

sistematica a catalazei este H2O2: H2O2-oxidoreductaza.<br />

Denumirea sistematica a lactat dehidrogenazei, L-lactat: NAD + -oxidoreductaza,<br />

arata ca L-lactatul actioneaza drept donor de electroni iar NAD + este acceptorul de<br />

electroni. Reactia este intalnita in fermetatiile lactice precum si in procesele anaerobe de<br />

degradare a glucidelor in cadrul procesului de glicoliza. Determinarea activitatii acestei<br />

enzime din sange este folosita la diagnosticarea infarctului miocardic, a hepatitei vir<strong>ale</strong>, a<br />

anemiei pernicioase.<br />

In metabolismul glucidic actioneaza si gliceraldehidfosfat-dehidrogenaza (Dgliceraldehid-3-fosfat:NAD<br />

+ -oxidoreductaza fosforilanta) care concomitet cu procesul<br />

redox fosforileaza si substratul:<br />

Aceasta subclasa cuprinde si superoxid-dismutaza (superoxid:superoxid –<br />

oxidoreductaza, metaloproteina-eritrocupreina, hemocupreina sau citocupreina) ce<br />

catalizeaza reactia de dismutatie a radicalilor superoxidici:<br />

Eliminarea CO2 de la acidul izocitric, din cadrul ciclului Krebs, se realizeaza prin<br />

intermediul izocitrat:dehidrogenazei (izocitrat:NAD + O<br />

-oxidoreductaza decarboxilanta)<br />

produsul de reactie fiind acidul –ceto-glutaric.<br />

2- + O2- + 2H + O2 + H2O2


O alta enzima din ciclul Krebs este succinat dehidrogenaza (succinat:acceptoroxidoreductaza),<br />

o flavoproteina care contine fier si sulf. Reactia catalizata de aceasta<br />

enzima consta in dehidrogenarea acidului succinic cu formarea de acid fumaric.<br />

Malat-dehidrogenaza (L-malat:NAD + -oxidoreductaza) intervine in ultima etapa a<br />

ciclului Krebs prin oxidarea acidului L-malic la acid oxalil-acetic.<br />

In fosforilarea oxidativa (oxidarea hidrogenului in apa) are loc reducerea<br />

co<strong>enzimelor</strong> (FAD sau NAD + ). Regenerarea acestor cofactori (la forma oxidata) se poate<br />

realiza prin actiunea transdehidrogenazei (NADPH:NAD + -oxidoreductaza). Enzima s-a<br />

izolat din mitocondriile din inima bovinelor sau bacterii. Sursa de energie a acestei reactii<br />

o constituie potentialul de membrana (din fluxul membranar de protoni) si din acest<br />

motiv aceasta enzima este o pompa protonica. Transdehidrogenaza mitocondriala este<br />

inglobata in structura membranei interne (prin intermediul a 14 segmente membranare) a<br />

mitocondriei sub forma unui dimer. De asemenea enzima poseda un motiv <br />

caracteristic domeniului care leaga nucleotide. Cele doua dinucleotide substrat (NADPH<br />

si NAD + respectiv NADH si NADP + ) se leaga la doua situsuri adiacente, diferite, fapt<br />

care face posibil transferul protonului de la un substrat la celalalt.<br />

UDP-glucozo-dehidrogenazei (UDP-glucoza:NAD + -6-oxidoreductaza), enzima din<br />

hepatocite, tesuturi si microorganisme, participa la formarea acidului UDP-glucuronic<br />

(un precursor al zaharurilor acide) din alcoolul corespunzator. Enzima din hepatocite


contine 6 monomeri. Oxidarea UDP-glucozei la UDP-glucuronat este acompaniata cu<br />

reducerea a doi moli de NAD + .<br />

Enzima formeaza intr-o prima etapa lagaturi cov<strong>ale</strong>nte (o baza Schiff) cu o grupare<br />

-amino a unui rest de lizina din centrul activ. In a doua etapa gruparea –SH apartinand<br />

unui rest de cisteina formeaza un tioester.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!