2002 - Instituto de Química - USP

Ana Claudia Rasera da SilvaLABORATÓRIO DE GENÔMICA EBIOLOGIA MOLECULAR DEFITOPATOGENOSO laboratorio mantém duas linhas de pesquisa,uma está relacionada ao sequenciamento degenomas completos de fitopatogenos e outra estárelacionada com a analise de genomas bacterianos.Dentro da primeira frente, participamos dosequenciamento das bacterias Xylella fastidiosa(causadora da clorose variagada dos citros),Xanthomonas axoponodis pv citri (causadora docancro citrico, figura 2) e Xanthomonas campestrispv campestris (causadora da podridão negra) e nomomento estamos sequenciando o genoma daXanthomonas axonopodis pv. aurantifolli B e C. Naparte de análise do genoma, estamos trabalhandocom comparação entre genomas, disrupçãodirecionada e aleatória de genes, determinação dainteração entre proteínas por duplo híbrido e análiseda expressão gênica por microrray de DNA.SummaryOur laboratory is involved in the sequencing ofwhole genome of phytopathogen. We are also involvedin the functional analysis of these genomesusing an extensive platform of genomic tools, suchas DNA microarray, two hybrid systems and randomgenomic mutagenesis by transposon insertion.Publicação:Van Sluys, M. A. et al. Comparative genomic analysis of plant associatedbacteria. Ann. Rev. Phytopathol. (2002), 40: 169-189Da Silva , A. C. R. et al. - Comparison of the genomes of two Xanthomonaspathogens with differing host specificities. Nature (2002), 417:459-463.Departamento de Química Bioquímica Fundamental11Instituto de Química - Pesquisa 2001 - 2002