2002 - Instituto de Química - USP

Aline Maria da SilvaBIOQUÍMICA E FUNÇÃO DAFOSFORILAÇÃO REVERSÍVEL DEPROTEÍNASEventos biológicos controlados pela fosforilaçãoreversível de proteínas dependem do balanço deatividades de uma intrincada rede de componentesque incluem proteínas quinases e proteínasfosfatases. Temos como objetivo investigar a funçãoe os mecanismos de regulação de fosfatasesreponsáveis pela desfosforilação de resíduos defosfoserina/treonina. A diversidade funcional destasenzimas é atribuída às distintas subunidadesregulatórias que compõem a holoenzima conferindoespecificidade e modulando a atividade dasubunidade catalítica. Utilizamos técnicas bioquímicase de genética molecular para caracterização funcionalde subunidades regulatórias que interagem comsubunidades catalíticas das proteínas fosfatases naameba social Dictyostelium discoideum e no fungoNeurospora crassa.SummaryThere are two main research projects in my laboratory.One concerns to the molecular characterizationof serine/threonine protein phosphatases. Ourexperimental systems are Dictyostelium discoideumand Neurospora crassa. Our second project concernsto analysis of transcriptome by DNA microarraysin different cells and tissues. Using this approach weare seeking for pathogenesis genes in Xylellafastidiosa and for candidates biomarkers for prostatecancer.Também desenvolvemos projetos visando a análisedo transcritoma de tecidos e células em diferentessituações fisiológicas ou patológicas. Para estesestudos utilizamos a tecnologia de microarrays deDNA (chips de DNA) e ferramentas de bioinformáticaadequadas para identificação e anotação de genesexpressos. Estamos investigando os padrões deexpressão gênica global de cepas patogênicas e nãopatogênicas da bactéria Xylella fastidiosa, dediferentes tecidos da cana-de-açúcar e de tecidostumorais humanos, em particular do câncer depróstata.PublicaçõesMarques, MV et al. Genetic organization of plasmid pXF51 from theplant pathogen Xylella fastidiosa. Plasmid 45: 184-199, 2001.Camargo, AA et al. The contribution of 700,000 ORF sequence tags tothe definition of the human transcriptome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA98:12103-12108, 2001.Souza, GM et al. The sugar cane signal transduction (SUCAST) catalogue:prospecting signal transduction in sugarcane. Gen.Mol. Biol. 24:25-34, 2001.Instituto de Química - Pesquisa 2001 - 2002 10 Departamento Departamento de Química de FundamentalBioquímica